爬行動(dòng)物腸道微生物研究進(jìn)展

鐘春英 譚 茵 唐三淇 劉亞婷 武正軍*

(1.廣西師范大學(xué)，珍稀瀕危動(dòng)植物生態(tài)與環(huán)境保護(hù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，桂林，541006；2.廣西師范大學(xué)，廣西珍稀瀕危動(dòng)物生態(tài)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，桂林，541006)

腸道是動(dòng)物機(jī)體重要的消化吸收器官，其中棲息著一個(gè)數(shù)量龐大的微生物群落，稱為腸道微生物或腸道菌群[1]。據(jù)估計(jì)，成人腸道內(nèi)的微生物可達(dá)1012～1014數(shù)量級(jí)，遠(yuǎn)大于人體表面微生物和人體自身細(xì)胞數(shù)量[2]。腸道微生物極其多樣，具有獨(dú)特的功能特征，在宿主的免疫代謝[3-5]、營養(yǎng)吸收[6-7]、行為[8-10]等方面起著十分重要的作用。動(dòng)物腸道是一個(gè)動(dòng)態(tài)的生態(tài)系統(tǒng)，宿主本身和外界環(huán)境都會(huì)影響腸道微生物的組成和結(jié)構(gòu)。目前普遍認(rèn)為，宿主的飲食、生理狀態(tài)和宿主基因型是影響腸道菌群多樣性的重要原因，而宿主飲食對(duì)腸道微生物的群落結(jié)構(gòu)影響最大[11-12]。腸道微生物與宿主動(dòng)物相互作用、相互影響。

腸道微生物在脊椎動(dòng)物中的研究主要集中在哺乳動(dòng)物[11，13-17]，而非哺乳動(dòng)物研究占比不到10%[18]，爬行動(dòng)物的相關(guān)研究較少。爬行動(dòng)物作為較古老的動(dòng)物類群，具有復(fù)雜和多樣的生理生態(tài)和行為特征[19]，而作為外溫動(dòng)物，受環(huán)境影響較大。爬行動(dòng)物的這些特征使其腸道微生物的組成結(jié)構(gòu)和多樣性更具獨(dú)特性和復(fù)雜性。

1 腸道微生物的研究手段

巴斯德(L.Pasteur)和柯赫(R.Koch)提出的純培養(yǎng)法技術(shù)開啟了動(dòng)物腸道微生物的研究。腸道微生物的主要研究手段有：傳統(tǒng)培養(yǎng)方法，該法是一種非常有效的分離目的菌種的方法，即通過篩選菌種和觀察形態(tài)來達(dá)到研究目的；此外還有分子生物學(xué)方法，包括熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization，F(xiàn)ISH)；變性梯度凝膠電泳(denatured gradient gel electrophoresis，DGGE)；末端限制性片段長度多態(tài)性技術(shù)(terminal-restriction fragment length polymorphism，T-RFLP)；實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR，QRT-PCR)；生物芯片和正流行的高通量測序技術(shù)(high throughput sequencing)等。16S rRNA基因已被證明是細(xì)菌鑒定的快速、準(zhǔn)確的工具[20-21]。細(xì)菌16S rRNA基因和高通量測序技術(shù)的結(jié)合使腸道微生物研究得以快速發(fā)展。目前，該方法已成為免培養(yǎng)研究微生物的重要手段。腸道微生物研究主要基于宿主的糞便樣本和泄殖腔樣本，均為無損傷取樣，其中Colston等[22]對(duì)利用泄殖腔拭子對(duì)泄殖腔采樣的方法進(jìn)行了詳細(xì)介紹。

在早期，純培養(yǎng)技術(shù)是爬行動(dòng)物腸道微生物研究的主要手段。施曼玲等[23]通過平板培養(yǎng)分析各類微生物(細(xì)菌、霉菌、放線菌、酵母菌)在北草蜥(Takydromusseptentrionalis)和中國石龍子(Plestiodonchinensis)的消化器官中的數(shù)量分布；李能樹等[24]通過平板培養(yǎng)探討烏龜(Mauremysreevesii)排泄物對(duì)魚病病原菌的抑制作用。而后，分子生物學(xué)方法開始運(yùn)用到爬行動(dòng)物腸道微生物的研究中。Rawski等[25]運(yùn)用熒光原位雜交技術(shù)評(píng)估膳食益生菌對(duì)龜胃腸道微生態(tài)的影響；時(shí)云朵等[26]利用變性梯度凝膠電泳和實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析蛇的腸道菌群結(jié)構(gòu)。現(xiàn)階段爬行動(dòng)物腸道微生物最主要的研究手段是高通量測序，又稱為下一代測序(next generation sequencing，NGS)，其主流平臺(tái)有Roche 454和Illumina Miseq/Hiseq。Roche 454平臺(tái)的測序原理為焦磷酸測序(pyrosequencing)，該技術(shù)已被運(yùn)用在蛇類[22，27]、蜥蜴類[28]、龜類[29]和鱷類[30]的腸道微生物研究中。Illumina Miseq/Hiseq平臺(tái)的測序原理為邊合成邊測序(sequencing by synthesis，SBS)，研究者們對(duì)蛇類[31-33]、蜥蜴類[34-42]、龜類[43-53]和鱷類[54-56]腸道微生物的研究應(yīng)用了此種方法。由于Illumina Miseq/Hiseq平臺(tái)的測序費(fèi)用更低，且效果相差不大，因此得到了更多人的認(rèn)可。

2 爬行動(dòng)物腸道微生物的分布特點(diǎn)

一般來說，脊椎動(dòng)物的胃腸道主要由厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和變形菌門(Proteobacteria)組成，這是一個(gè)相對(duì)保守的細(xì)菌組合，其他菌門的相對(duì)豐度則較低[57]。目前，研究發(fā)現(xiàn)蛇類[22，26-27，31-33，58]、蜥蜴類[28，36-38，41-42，59-61]和龜鱉類[43-47，50-53]動(dòng)物腸道微生物的優(yōu)勢菌群也基本為這3個(gè)門。與哺乳動(dòng)物和其他爬行動(dòng)物不同，在鱷類[30，54-56]動(dòng)物腸道微生物菌群中，梭桿菌門(Fusobacteria)的占比明顯提高，占有重要地位(表1)。

表1 爬行動(dòng)物各類群腸道微生物的優(yōu)勢菌群

微生物在爬行動(dòng)物腸道的不同區(qū)段具有差異性。黑眉錦蛇(Elaphetaeniura)的腸道微生物菌群豐度沿腸道頭部向尾部方向呈現(xiàn)先增加后降低的趨勢[26]。野生紅脖頸槽蛇(Rhabdophissubminiatus)胃腸道上段(食管和胃)與胃腸道下段(大腸和泄殖腔)的微生物多樣性具有顯著差異[31]。對(duì)澳大利亞咸水鱷，即灣鱷(Crocodylusporosus)的研究結(jié)果也表明沿腸道縱向的微生物群落組成和結(jié)構(gòu)存在顯著差異[56]。美國短吻鱷(Alligatormississippiensis)同樣具有沿胃腸道縱向的異質(zhì)性微生物群，研究還揭示了其組成的差異與器官或組織以及飲食顯著相關(guān)[30]。但是，在野生虎斑頸槽蛇(Rhabdophistigrinus)的研究中，微生物的豐富度和多樣性在腸道不同區(qū)域(大腸、小腸和泄殖腔)并不存在顯著差異[32]。

3 爬行動(dòng)物腸道微生物的影響因素

3.1 生殖狀態(tài)和方式

生殖狀態(tài)和方式與腸道微生物密切相關(guān)。利用16S rRNA基因測序技術(shù)，Trevelline等[62]發(fā)現(xiàn)受精卵孕育晚期的蜥蜴(Sceloporusundulatus)腸道細(xì)菌豐富度比未懷卵雌性蜥蜴低，且隨著孕育期的延長，個(gè)體間變異程度越高，但是腸道細(xì)菌群落的這些變化在產(chǎn)卵后是否會(huì)恢復(fù)還未知。在人類中，母體腸道細(xì)菌群落的變化至少在產(chǎn)后一個(gè)月內(nèi)持續(xù)存在[63]，蜥蜴是否與人類一致？有研究表明，生殖期的蜥蜴免疫功能下降[64-65]，這是否與腸道微生物豐富度降低有關(guān)？這些問題都值得進(jìn)一步探究。研究發(fā)現(xiàn)，多個(gè)配偶的雌性蜥蜴的細(xì)菌多樣性比單個(gè)配偶的雌性高，這可能是多個(gè)配偶性傳播的細(xì)菌所導(dǎo)致，表明雌性交配策略影響泄殖腔細(xì)菌群落，這對(duì)雌性的健康存在潛在影響[66]。

一個(gè)多世紀(jì)以來，脊椎動(dòng)物胚胎被認(rèn)為是在無菌環(huán)境中發(fā)育的，通過出生后與母體和外部環(huán)境的接觸獲得原始的腸道微生物群[67]，而Trevelline等[68]發(fā)現(xiàn)鳥卵和蜥蜴卵含有彼此不同的細(xì)菌群落，且同窩蜥蜴卵的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)彼此更相似，而非無關(guān)個(gè)體，表明野生卵生脊椎動(dòng)物可能通過破殼前接種卵黃獲得了母體微生物群。

3.2 圈養(yǎng)、飲食和環(huán)境

腸道微生物常常受飲食和環(huán)境的影響，反過來，腸道微生物的組成也反映了宿主的飲食和生活環(huán)境[31]。而腸道和微生物群是高度動(dòng)態(tài)的，可以進(jìn)行靈活調(diào)整，以滿足生物體的需求[69]。

圈養(yǎng)和飲食對(duì)腸道微生物的影響一直受到重點(diǎn)關(guān)注。Kohl等[39]利用16S rRNA基因測序技術(shù)，探究飲食、環(huán)境和圈養(yǎng)等對(duì)蜥蜴腸道細(xì)菌群落組成的影響，研究發(fā)現(xiàn)性別和季節(jié)對(duì)細(xì)菌群落組成和結(jié)構(gòu)都沒有顯著影響，飲食類型(雜食性和草食性)和宿主物種對(duì)這2個(gè)指標(biāo)均有顯著影響；當(dāng)?shù)赝寥罉悠放c任何宿主物種腸道中發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌類群沒有明顯的重疊，圈養(yǎng)則顯著改變了宿主物種的細(xì)菌群落組成和結(jié)構(gòu)。關(guān)于北草蜥的研究也表明圈養(yǎng)對(duì)腸道微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性有顯著影響[42]。Jiang等[36]在比較野生與圈養(yǎng)鱷蜥(Shinisauruscrocodilurus)的糞便微生物時(shí)，發(fā)現(xiàn)喂養(yǎng)不同食物的蜥蜴的腸道微生物群有顯著差異，飲食改變了腸道中細(xì)菌群落豐富度和相對(duì)豐度。另一項(xiàng)對(duì)鱷蜥的研究表明，與野生同類相比，圈養(yǎng)增加了鱷蜥腸道微生物群的群落豐富度，研究還發(fā)現(xiàn)年齡對(duì)腸道微生物無影響[59]。飲食不僅對(duì)腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性產(chǎn)生影響，還能改變動(dòng)物腸道的結(jié)構(gòu)。Kohl等[35]以動(dòng)植物混合食物和高植物含量食物分別喂養(yǎng)一種自然雜食性蜥蜴(Liolaemusruibali)，結(jié)果表明2組腸道形態(tài)和腸道微生物群結(jié)構(gòu)均有差異，富含植物的飲食使蜥蜴含有更多樣化微生物群落，說明生理和微生物并不嚴(yán)格限制草食動(dòng)物從雜食祖先進(jìn)化，生態(tài)環(huán)境對(duì)食草動(dòng)物的進(jìn)化可能比生理限制更重要。

環(huán)境和飲食相互作用于動(dòng)物腸道微生物。不同的環(huán)境為動(dòng)物提供不同的食物，所以動(dòng)物處于不同環(huán)境中時(shí)其腸道微生物可能不同。綠海龜(Cheloniamydas)經(jīng)歷了從表層遠(yuǎn)洋分布和雜食性飲食向淺海分布和草食性飲食的明顯轉(zhuǎn)變。在遠(yuǎn)洋和淺海生境之間，亞成體綠海龜?shù)募?xì)菌群落存在顯著差異，這表明環(huán)境和飲食因素支持這些生境的綠海龜擁有不同的細(xì)菌群落[45]。對(duì)于取食藻類的海鬣蜥(Amblyrhynchuscristatus)和取食陸地植被的加拉帕戈斯陸鬣蜥(Conolophussubscristatus)，其飲食差異有助于腸道微生物群落的分化[28]。城市生活可以極大地影響蜥蜴?zhèn)€體的腸道微生物群，突出了腸道微生物可塑性在動(dòng)物對(duì)人類改變的景觀中所起的作用[41]。熱帶海龜?shù)奈⑸锒鄻有愿哂趤啛釒У貐^(qū)[47]。Ahasan等[44]調(diào)查并比較了野生捕獲和擱淺的綠海龜糞便細(xì)菌群落，結(jié)果顯示野生捕獲綠海龜?shù)募?xì)菌多樣性和豐富度高于擱淺海龜，群落組成差異顯著，這可能是因?yàn)閿R淺海龜通常只能吃到海草，它們虛弱的狀態(tài)使得條件致病菌在胃腸道內(nèi)繁殖和過度生長。通過對(duì)比入院前和康復(fù)后的海龜腸道微生物群落發(fā)現(xiàn)，不論海龜在入院前的微生物組成如何，所有康復(fù)后的綠海龜都表現(xiàn)出相似的細(xì)菌群落；入院前和康復(fù)后海龜腸道細(xì)菌群落的顯著差異表明康復(fù)過程中飲食、管理和環(huán)境變化對(duì)腸道微生物產(chǎn)生了影響[46]。同樣的，另一項(xiàng)研究也表明亞成體綠海龜?shù)募S便微生物群在康復(fù)過程中由于飲食變化而改變[51]。紅海龜(Carettacaretta)為食肉動(dòng)物，主要以底棲軟體動(dòng)物為食[70]。與系統(tǒng)發(fā)育相近但食草性海龜相比，紅海龜與食肉性海洋哺乳動(dòng)物的腸道微生物群特征更相似，這是腸道微生物群對(duì)飲食和環(huán)境適應(yīng)功能的體現(xiàn)[48]。

海拔和溫度也成為影響蜥蜴腸道微生物的重要因素。在高海拔地區(qū)，蜥蜴的飲食多樣性和數(shù)量急劇下降，有限的食物資源迫使蜥蜴開發(fā)其他食物資源，使其腸道微生物群具有降解能力和解毒能力[60]。Zhang等[37]利用16S rRNA基因測序技術(shù)，研究了生活在不同海拔高度的3個(gè)蜥蜴種群的腸道菌群，結(jié)果顯示不同海拔的種群的腸道微生物組成存在顯著差異，而缺氧可能是引起青海沙蜥(Phrynocephalusvlangalii)腸道菌群沿海拔梯度變化的主要因素。已經(jīng)有研究表明，高原動(dòng)物(青海沙蜥)的腸道質(zhì)量與海拔成正比[71]。Bestion等[38]采用半自然試驗(yàn)研究了溫度對(duì)野生蜥蜴腸道微生物區(qū)系的影響，發(fā)現(xiàn)溫度升高將導(dǎo)致微生物多樣性降低，升高2～3 ℃會(huì)導(dǎo)致34%的種群微生物多樣性喪失，對(duì)宿主的生存可能產(chǎn)生較大的負(fù)面影響，這也反映了全球變暖可能會(huì)對(duì)爬行動(dòng)物等變溫動(dòng)物產(chǎn)生不利影響。此外，Bestion的研究是采用直接升溫的方式，若換成緩慢升溫的方式，給予動(dòng)物適應(yīng)的過程，也許不會(huì)導(dǎo)致如此高的微生物多樣性喪失。

3.3 禁食行為

關(guān)于禁食，Kohl等[34]做了相關(guān)研究：使用16S rRNA基因測序記錄了5類脊椎動(dòng)物的代表動(dòng)物在4個(gè)時(shí)間點(diǎn)的結(jié)腸和盲腸微生物群的變化，發(fā)現(xiàn)禁食引起的微生物群在宿主物種和腸道區(qū)域之間的變化存在差異。魚類對(duì)禁食表現(xiàn)出最顯著的變化，而壁虎在禁食28 d內(nèi)可保持穩(wěn)定的群落。腸道微生物在禁食期間的穩(wěn)定性可能暗示宿主對(duì)微生物群落的高度控制。McCue等[72]對(duì)此進(jìn)行了更進(jìn)一步地研究，發(fā)現(xiàn)禁食導(dǎo)致的腸道末端微生物多樣性和群落結(jié)構(gòu)的變化與腸道末端結(jié)構(gòu)變化并不匹配。研究表明，一些蜥蜴物種似乎適應(yīng)了饑餓[73-74]，依靠尾巴中儲(chǔ)存的脂質(zhì)，能夠在饑餓100 d后存活下來[75]。

爬行動(dòng)物在禁食期間仍能保持穩(wěn)定的腸道微生物群，其內(nèi)在機(jī)理值得深入研究。大部分爬行動(dòng)物還會(huì)進(jìn)行冬眠，在冬眠期間具有禁食行為，若冬眠前后腸道微生物不發(fā)生變化，這將為爬行動(dòng)物出眠后保持身體一致性并直接捕食提供保證。爬行動(dòng)物腸道微生物與冬眠的關(guān)系還有許多值得探討之處，應(yīng)對(duì)其進(jìn)行更深一步地研究。

3.4 健康狀態(tài)

在不同健康狀態(tài)下，爬行動(dòng)物的腸道微生物具有差異性。此外，研究發(fā)現(xiàn)部分爬行動(dòng)物的腸道微生物存在條件致病菌或潛在致病菌。在耐藥性分析時(shí)，發(fā)現(xiàn)爬行動(dòng)物的糞便中含有耐藥性菌群和耐藥性基因。爬行動(dòng)物腸道微生物不僅具有耐藥性，同時(shí)具有抗腫瘤性和殺菌活性的成分。

腸道微生物與動(dòng)物健康息息相關(guān)。在同一養(yǎng)殖條件下，幾乎不患腸道疾病的王錦蛇(Elaphecarinata)糞便樣本中志賀氏菌(Escherichia-Shigella)的相對(duì)豐度高于其他2種錦蛇，這表明志賀氏菌含量可能與腸道健康相關(guān)[33]。湯文嬌等[32]在野生虎斑頸槽蛇腸道內(nèi)檢測到檸檬酸桿菌屬(Citrobacter)、明串珠菌屬(Trichococcus)和丹毒絲菌屬(Erysipelothrix)等潛在的致病菌。Tang等[31]也在野生紅脖頸槽蛇腸道中發(fā)現(xiàn)大量潛在致病菌。還有研究表明人工飼養(yǎng)的蜥蜴富集了一些人類或其他動(dòng)物的致病菌或條件致病菌[36]，這可能是人的近距離接觸所導(dǎo)致。Lin等[55]比較了健康和患有厭食癥的亞成體暹羅鱷(Crocodylussiamensis)的腸道微生物群落的組成和功能，發(fā)現(xiàn)厭食鱷魚腸道微生物多樣性明顯低于健康個(gè)體，鱷魚腸道細(xì)菌組成和功能的改變可能與厭食癥有關(guān)。為評(píng)估在臨床上應(yīng)用(包埋)噬菌體消除靶向腸道細(xì)菌作為廣譜抗生素(恩諾沙星)替代品的可行性，Ahasan等[49]分析了2種處理的海龜糞便樣品中腸道細(xì)菌群落，結(jié)果顯示噬菌體處理后的樣品細(xì)菌多樣性和組成無顯著差異，相比之下，抗生素處理的樣品在第15天后細(xì)菌多樣性顯著降低，表明噬菌體對(duì)海龜腸道細(xì)菌群落的組成和結(jié)構(gòu)的影響很小，研究為噬菌體治療概念提供了有力證據(jù)。Pace等[76]通過細(xì)菌培養(yǎng)法和FLOTAC寄生蟲學(xué)技術(shù)，提供了地中海地區(qū)紅海龜腸桿菌科(Enterobacteriaceae)和寄生蟲組成的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)：78.3%的糞便樣品都分離到了腸桿菌科，而復(fù)殖吸蟲(digenetic trematodes)是這些動(dòng)物中最常見的寄生蟲；47.8%的海龜只有腸桿菌科寄生，而30.4%的海龜同時(shí)有腸桿菌科和寄生蟲寄生。

爬行動(dòng)物腸道菌群具有耐藥性。Sala等[77]對(duì)從健康圈養(yǎng)蛇類群體微生物中分離出的銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)的患病率和抗生素耐藥性進(jìn)行評(píng)價(jià)，發(fā)現(xiàn)銅綠假單胞菌的患病率較高(59.9%)，其中35.5%為多重耐藥菌株。分析結(jié)果顯示養(yǎng)殖場規(guī)模、衛(wèi)生條件和蛇種類等與患病率相關(guān)。Nieto-Claudin等[78]通過對(duì)圣克魯斯島加拉帕戈斯象龜(Chelonoidisporteri)泄殖腔糞便進(jìn)行耐藥性基因(antimicrobial resistance gene，ARG)分析，發(fā)現(xiàn)100%的象龜糞便中都含有ARG，35.7%的象龜微生物群具有多重抗性；與許多其他野生動(dòng)物不同，陸龜通常與農(nóng)田重疊，增加了攝入和傳播耐藥性(antimicrobial resistance，AMR)的風(fēng)險(xiǎn)。從歐洲池塘圈養(yǎng)的海龜泄殖腔中分離出來的微生物對(duì)用于治療動(dòng)物和人類的主要抗菌類藥物也表現(xiàn)出廣泛的耐藥性，說明被圈養(yǎng)的歐洲池塘海龜是多抗細(xì)菌的載體[79]。

爬行動(dòng)物腸道微生物不僅具有耐藥性，同時(shí)具有抗腫瘤性和殺菌活性的成分。Soopramanien等[61]研究了以有機(jī)廢物和動(dòng)物尸體為食的圓鼻巨蜥(Varanussalvator)腸道細(xì)菌產(chǎn)生的代謝物的抗腫瘤特性，利用條件培養(yǎng)基和質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS)篩選和識(shí)別潛在的抗腫瘤分子，結(jié)果表明存在幾種具有抗腫瘤活性的分子。在另一項(xiàng)對(duì)圓鼻巨蜥的研究中，也發(fā)現(xiàn)其腸道微生物產(chǎn)生了具有顯著殺菌活性的分子[80]。圓鼻巨蜥的抗腫瘤性和殺菌活性可能與其長期的生活環(huán)境和食物有關(guān)。

4 其他相關(guān)研究

動(dòng)物在接觸有害物質(zhì)后，其腸道微生物也會(huì)受到影響。綠海龜接觸草甘膦后，其腸道細(xì)菌生長減少或存活率降低，說明草甘膦可能對(duì)海龜?shù)南驼w健康產(chǎn)生不利影響[81]。這是首個(gè)評(píng)估草甘膦除草劑對(duì)爬行動(dòng)物胃腸道菌群影響的研究，說明在沿海環(huán)境中使用草甘膦可能會(huì)通過皮膚接觸、海洋植物群落的變化或胃腸道微生物區(qū)系的改變對(duì)非目標(biāo)海洋物種產(chǎn)生有害影響。此外，腸道微生物組成的可預(yù)測變化可以為特定化學(xué)暴露提供一個(gè)易于分析的、無創(chuàng)的生物標(biāo)志物，為軍事設(shè)施的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估提供更有力的科學(xué)支持[40]，腸道微生物還可作為判斷圈養(yǎng)動(dòng)物放歸的參考條件[82]。馮定龍[54]的研究發(fā)現(xiàn)揚(yáng)子鱷(Alligatorsinensis)捕食期與非捕食期胃內(nèi)菌群差異性顯著，非捕食期胃內(nèi)微生物具有更高的豐富度和均勻度；剛孵化出的幼鱷其胃內(nèi)已存在大量細(xì)菌菌群，且具有很高的物種豐富度和均勻度。另有研究[25]表明膳食益生菌對(duì)龜?shù)纳L性能、殼礦化、十二指腸組織形態(tài)學(xué)和微生物區(qū)系有積極作用，說明益生菌在龜營養(yǎng)中是有用的。Scheelings等[53]嘗試探究微生物組成在確定平背龜(Natatordepressus)的一些血液參數(shù)方面的作用，發(fā)現(xiàn)腸道微生物組成與血液分析物沒有任何相關(guān)性。

5 結(jié)語與展望

研究表明，爬行動(dòng)物腸道微生物：現(xiàn)階段的研究手段以高通量測序?yàn)橹鳎辉谀c道的不同區(qū)段具有差異性；影響因素有寄主生殖狀態(tài)、圈養(yǎng)、飲食、環(huán)境和行為等；具有耐藥性和抗腫瘤性等特性；當(dāng)動(dòng)物在接觸有害物質(zhì)后，其腸道微生物也會(huì)受到影響?，F(xiàn)階段對(duì)爬行動(dòng)物腸道微生物的研究主要還是以菌群組成及多樣性分析為主，但近年來已經(jīng)開始深入到了菌群功能分析，且還涉及了很多其他的方面，然而對(duì)于腸道微生物與宿主間相互影響的作用機(jī)制還不明確。全球氣溫升高、生境喪失和破碎化、環(huán)境污染等人類干擾活動(dòng)，導(dǎo)致爬行動(dòng)物生存環(huán)境發(fā)生變化，可能使爬行動(dòng)物的腸道微生物發(fā)生相應(yīng)變化，從而使爬行動(dòng)物種群受到不利影響。所以，未來應(yīng)充分利用宏基因組、宏蛋白組和宏代謝組的高通量測序和分析技術(shù)，深度發(fā)掘和揭示腸道微生物和宿主之間的關(guān)系，加強(qiáng)人類干擾導(dǎo)致的爬行動(dòng)物腸道微生物發(fā)生變化的情況和機(jī)理方面的研究，以便有針對(duì)性地采取措施保護(hù)相應(yīng)物種。