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    毛竹NLP 轉(zhuǎn)錄因子鑒定及其響應(yīng)氮素的表達(dá)模式

    2021-12-29 09:26:54袁婷婷朱成磊李紫陽宋新章高志民
    林業(yè)科學(xué)研究 2021年5期
    關(guān)鍵詞:毛竹硝酸鹽饑餓

    袁婷婷,朱成磊,李紫陽,宋新章,高志民*

    (1.國際竹藤中心竹藤資源基因科學(xué)與基因產(chǎn)業(yè)化研究所,國家林業(yè)和草原局/北京市共建竹藤科學(xué)與技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100102;2.浙江農(nóng)林大學(xué),浙江 杭州 311300)

    氮素是植物生長發(fā)育必需的大量營養(yǎng)元素之一[1-2]。近些年,氮的利用效率倍受關(guān)注,涉及氮的吸收、運(yùn)輸與同化等方面,其中,氮的吸收轉(zhuǎn)運(yùn)已成為研究的熱點(diǎn)。研究表明,RWP-PK 家族中的NLP (NIN-like protein)轉(zhuǎn)錄因子在響應(yīng)氮饑餓、氮信號調(diào)節(jié)過程中處于中心地位[3]。NLP 家族成員都具有RWP-RK 和PB1 兩個典型的結(jié)構(gòu)域,RWPRK 結(jié)構(gòu)域具有與DNA 結(jié)合的功能,PB1 結(jié)構(gòu)域具有蛋白相互作用的功能[4]。擬南芥(Arabidopsis thaliana)中NLPs 與硝酸鹽順式作用元件NRE(Nitrate-responsive elements)結(jié)合調(diào)控硝酸鹽響應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá),進(jìn)而影響擬南芥的生長發(fā)育[5],如過表達(dá)擬南芥NLP7能夠通過增強(qiáng)氮和碳的同化,促進(jìn)植物生長[6],NLP8 則對于硝酸鹽促進(jìn)種子萌發(fā)至關(guān)重要[7]。過表達(dá)OsNLP1促進(jìn)水稻(Oryza sativaL.)生長,提高水稻氮素利用率和產(chǎn)量[8]。另外,在植物Nitrate-CPK-NLP (硝酸鹽-Ca2+傳感蛋白激酶-NLP)信號通路中,NLPs 協(xié)調(diào)植物對硝酸鹽信號的感知和對下游轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、碳氮代謝過程的調(diào)控[9],在氮饑餓、氮磷互作以及根系生長過程中發(fā)揮著重要作用[10]。

    隨著測序技術(shù)的快速發(fā)展,已經(jīng)對包括水稻[11]、擬南芥[7]、小麥(Triticum aestivumL.)[12]和玉米(Zea maysL.)[13]等多種植物中NLPs 進(jìn)行全基因組鑒定和功能研究。竹子作為禾本科(Gramineae)的特殊類群,尤其是木本竹,因其生長快、材性好,已成為緩解木材供給不足的重要替代材料。毛竹(Phyllostachys edulis(Carrière) J.Houz.)林占我國竹林總面積的72.96%[14],是最具代表性的木本竹種。氮肥顯著影響毛竹幼苗的生長[15]、筍的品質(zhì)和產(chǎn)量及其葉片生理特性[16],施用氮肥已成為竹林增產(chǎn)的重要手段。未施氮肥的情況下,氮沉降在很大程度上補(bǔ)充了土壤氮,提高了毛竹光合作用效率[17-18]、增加生物量、增強(qiáng)抗性[19]。然而,毛竹吸收轉(zhuǎn)運(yùn)氮的機(jī)制尚未見報(bào)道,其中,NLP 家族成員的調(diào)控作用更不清楚。本文以毛竹為研究對象,在全基因組水平系統(tǒng)分析NLP 分子特征的基礎(chǔ)上,研究在氮饑餓過程以及復(fù)氮后NLP基因的表達(dá)模式,以期為深入研究其功能提供參考。

    1 材料與方法

    1.1 植物材料培養(yǎng)與處理

    將毛竹種子播種于基質(zhì)(泥炭∶蛭石=7∶3)中,置于25℃的溫室中培養(yǎng),待實(shí)生苗生長至2 個月時(shí),選擇株高和長勢一致的植株,將種子去掉,根系用去離子水洗凈,置于全營養(yǎng)液中培養(yǎng)2 周,然后轉(zhuǎn)入缺氮木村B 營養(yǎng)液[20]中進(jìn)行氮饑餓處理,并于氮饑餓72 h 后,用6 mmol·L?1的硝酸鹽(KNO3和KCl 配置而成)進(jìn)行復(fù)氮處理。分別于氮饑餓處理以及復(fù)氮處理0、0.5、1、2、4、8、12 和24 h 取植株的根系,用液氮處理后保存于?80℃,用于RNA 提取,進(jìn)行定量PCR (qPCR)分析,氮饑餓0 h 和72 h 的植株分別作為對照,試驗(yàn)采用3 次生物學(xué)重復(fù)。

    1.2 毛竹NLP 全基因組鑒定

    分別從Rice Genome Annotation Project (http://rice.plantbiology.msu.edu/)和Tair (https://www.arabidopsis.org/index.jsp)數(shù)據(jù)庫下載水稻和擬南芥的NLP轉(zhuǎn)錄因子的CDS 和氨基酸序列[11,21],作為誘餌序列在毛竹基因組數(shù)據(jù)庫BambooGDB (http://bamboo.bamboogdb.org/)中 進(jìn) 行BlastP、BlastN (e-value=1 e?10)比對,獲取毛竹NLP的候選基因,對獲得的候選序列在PFAM 數(shù)據(jù)庫(http://pfam.xfam.org)逐條進(jìn)行蛋白保守結(jié)構(gòu)域的鑒定和分析,僅保留具有編碼完整保守結(jié)構(gòu)域的序列,并進(jìn)行基因命名。

    1.3 毛竹NLP 基因序列及其編碼蛋白序列分析

    使用TBtools 工具繪制毛竹NLP的基因結(jié)構(gòu)圖;使用ProtParam (http://web.expasy.org/prot-param/)和Plant-mPLoc 算法(http://www.csbio.sjtu.edu.cn)分析PeNLPs 編碼蛋白的基本理化特性及亞細(xì)胞定位;使 用MEME Version 5.1.0 (http://meme-suite.org/tools/meme)分析毛竹NLP 蛋白的保守基序。

    1.4 毛竹NLP 家族成員系統(tǒng)進(jìn)化分析與功能預(yù)測

    使用MEGA 7.0 軟件的Clustal W 對毛竹、水稻、擬南芥、玉米、毛果楊(Populus trichocarpa(Torr.&Gray))、二穗短柄草 (Brachypodium distachyon(L.) Beauv.)和蒺藜苜蓿 (Medicago truncatulaGaertn.)的NLP 蛋白序列[22]進(jìn)行同源比對分析,用鄰接法(Neighbor-joining method)、bootstrap 試驗(yàn)重復(fù)1000 次、其它參數(shù)設(shè)置為默認(rèn)值構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

    1.5 毛竹NLP 的表達(dá)分析

    利用本實(shí)驗(yàn)室的毛竹26 個不同組織轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)數(shù)據(jù)(NCBI 的SRA 號為:SRS 1847073、SRS1847072、SRS1847071、SRS1847070、SRS1847069、SRS1847068、SRS1847067、SRS 1847066、SRS1847065、SRS1847064、SRS1847063、SRS1847062、SRS1847061、SRS1847060、SRS 1847059、SRS1847058、SRS1847057、SRS1847056、SRS1847055、SRS1847054、SRS1847053、SRS 1847052、SRS1847051、SRS1847050、SRS1847049、SRS1847048)[23],構(gòu)建毛竹NLP基因的組織表達(dá)譜,以Log2(FPKM+1)的值進(jìn)行表達(dá)量熱圖繪制[24]。

    根據(jù)毛竹NLP基因序列,使用Primer Premier 5.0 軟件設(shè)計(jì)特異定量引物,由北京博邁德基因技術(shù)有限公司合成(表1)。用于qPCR 分析的cDNA是由1.1 節(jié)中經(jīng)過氮饑餓以及復(fù)氮處理不同時(shí)間的毛竹根系,通過TRIzol (Invitrogen)法從中提取RNA,用Promega 反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA。qPCR 實(shí)驗(yàn)在qTOWER2.2 系統(tǒng)上進(jìn)行,體系參照Roche Light Cycler?480 SYBR Green I Master kit 試劑盒,程序?yàn)?5℃預(yù)變性10 min;95℃變性10 s,60℃解鏈10 s,40 個循環(huán)。選擇PeTIP41作為內(nèi)參基因[25],相對表達(dá)量的數(shù)據(jù)處理用2?ΔΔCT法[26]。

    表1 qPCR 所用引物Table 1 Primers used in qPCR

    2 結(jié)果與分析

    2.1 毛竹NLP 家族基因的鑒定

    在毛竹新基因組數(shù)據(jù)[23]中共鑒定出10 個編碼完整NLP 蛋白的基因,命名為PeNLP1~PeNLP10。PeNLPs 的編碼區(qū)長度為2145~2892 bp,編碼蛋白長度為714~963 aa,分子量(Molecular weight,MW)為 77.41~105.08 kDa,理論等電點(diǎn)(Theoretical isoelectric point,pI)為5.36~6.25,亞細(xì)胞定位預(yù)測除PeNLP9 位于葉綠體外,其余成員均位于細(xì)胞核內(nèi)(表2)。

    表2 PeNLPs 編碼蛋白的基本特征Table 2 Basic characteristics of the proteins encoded by PeNLPs

    2.2 PeNLPs 基因結(jié)構(gòu)及其編碼蛋白保守基序分析

    基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),PeNLPs 均包含4 個內(nèi)含子,但不同基因內(nèi)含子的大小和位置存在一定的差異。依據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,PeNLPs 可分為3 個組,同一個組內(nèi)的基因成員具有相似的結(jié)構(gòu)以及內(nèi)含子長度和位置,如II 組中PeNLP2和PeNLP3的基因結(jié)構(gòu)高度相似,PeNLP2的最短內(nèi)含子和最長內(nèi)含子分別為134 bp 和740 bp,PeNLP3的最短內(nèi)含子和最長內(nèi)含子分別為133 bp 和730 bp,二者非常接近,組與組之間的基因結(jié)構(gòu)差異明顯(圖1A)。

    蛋白保守基序分析表明:PeNLPs 共有20 個保守基序(圖1B),其中,Motif 1~Motif 7、Motif 9、Motif 12、Motif 13為共有基序,Motif 19、Motif 14 和Motif 16 分別為Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ組成員所特有。另外,Ⅰ組成員缺少M(fèi)otif 11,Ⅱ組成員缺少M(fèi)otif 8 和Motif 17,Ⅲ組成員缺少M(fèi)otif 15、Motif 18 和Motif 20。

    圖1 PeNLPs 基因結(jié)構(gòu)(A)及其編碼蛋白保守基序(B)分析Fig.1 Gene structure (A) and the conserved motifs (B) of the proteins encoded by PeNLPs

    2.3 PeNLPs 的進(jìn)化分析

    為了解不同物種間NLP 的進(jìn)化關(guān)系,預(yù)測PeNLPs 的潛在功能,構(gòu)建了基于毛竹、水稻、擬南芥、玉米、毛果楊、二穗短柄草和苜蓿NLP 蛋白氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明:60 個NLPs 分成了3 個組(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),雙子葉植物NLPs 主要分布在Ⅰ組中,而單子葉植物NLPs 則在3 個組中均有分布(圖2),這與前人的研究一致[22]。PeNLPs 分布在Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ的成員個數(shù)分別為4、2、4 個,這和其它單子葉植物成員在3 個組的個數(shù)分布情況相似。在每個組中,多數(shù)PeNLPs與水稻NLPs 聚類在較近的分支,其次是二穗短柄草的NLPs,這說明毛竹與水稻、二穗短柄草在進(jìn)化上的親緣關(guān)系較近,而與擬南芥、毛果楊等雙子葉植物的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

    圖2 NLP 家族成員的系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2 Phylogenetic analysis of NLP family members

    共線性分析發(fā)現(xiàn),9 個PeNLPs 存在共線關(guān)系,并組成6 個共線性基因?qū)?,即PeNLP1和PeNLP8、PeNLP2和PeNLP3、PeNLP4和PeNLP7、PeNLP4和PeNLP10、PeNLP5和PeNLP6、PeNLP7和PeNLP10(圖3A),且共線性基因的Ka/Ks均小于1 (圖3B),說明這些基因在進(jìn)化中經(jīng)歷了純化選擇。此外,有9 個PeNLPs 與5 個OsNLPs 之間存在共線性,具有共線關(guān)系的PeNLPs 數(shù)量多于OsNLPs 數(shù)量,這可能與毛竹進(jìn)化過程中發(fā)生過基因組加倍事件有關(guān)[27]。

    圖3 毛竹與水稻的NLP 家族基因共線性分析Fig.3 Collinearity analysis of NLP family genes between Ph.edulis and O.sativa

    2.4 PeNLPs 的組織特異性表達(dá)

    利用毛竹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對PeNLPs 的組織表達(dá)特異性進(jìn)行分析。結(jié)果表明:PeNLPs 部分成員的表達(dá)具有組織特異性(圖4),如PeNLP2在葉片、葉鞘和籜片中特異表達(dá),PeNLP5和PeNLP9分別在葉鞘和0.1 cm 根中特異表達(dá),推測它們是在特定的部位發(fā)揮功能;還有部分成員呈組成型表達(dá),如PeNLP10在26 個組織中均檢測到表達(dá),且在各個組織中的表達(dá)量變化不大,推測它在毛竹各個部位及各個部位的不同生長階段均能發(fā)揮作用。然而,有些成員在26 個組織中檢測不到表達(dá),如PeNLP6和PeNLP7,推測它們可能為誘導(dǎo)表達(dá)型,或是存在功能冗余基因。

    圖4 毛竹不同組織中PeNLPs 的表達(dá)分析Fig.4 Expression analysis of PeNLPs in different tissues of moso bamboo

    此外,PeNLPs 在同一組織的不同生長階段的表達(dá)呈現(xiàn)一定的差異性。在根中,部分PeNLPs 的表達(dá)呈現(xiàn)出在生長早期表達(dá)高于生長后期的規(guī)律,如PeNLP1、PeNLP3、PeNLP8在0.1 cm 根中的表達(dá)量高于0.5 cm、成熟根等其它生長階段的根中的表達(dá)量,在0.2 m 筍中的表達(dá)量高于1.5、6.7 m 等其它高度的筍中的表達(dá)量,這可能是由于這3 個成員主要在根和筍的生長早期發(fā)揮作用;但PeNLP4卻呈相反的表達(dá)趨勢,其在3.0 m 和6.7 m 筍中的表達(dá)量高于在0.2 m 和1.5 m 筍中的表達(dá)量。由此表明,這些PeNLPs 可能在根或筍的不同生長階段具有不同的調(diào)控作用。

    2.5 氮饑餓及復(fù)氮過程中PeNLPs 的表達(dá)模式

    氮饑餓及復(fù)氮過程中PeNLPs 的表達(dá)模式分析表明:在氮饑餓處理過程中,PeNLPs 的表達(dá)呈現(xiàn)不同程度的波動變化,這說明不同時(shí)間PeNLPs 對氮饑餓的響應(yīng)程度不同,且各個成員之間存在一定的差異(圖5)。在施加氮饑餓1 h 內(nèi),PeNLP1的表達(dá)量迅速上升,且達(dá)到極顯著水平,PeNLP2、PeNLP3、PeNLP5、PeNLP8和PeNLP10則極顯著下降(p<0.01),表明PeNLPs 對氮饑餓的響應(yīng)均較迅速。隨著氮饑餓的施加,在1~24 h 過程中,PeNLP1的表達(dá)為先下降、后上升、再下降,至氮饑餓24 h 時(shí)的表達(dá)量與開始氮饑餓時(shí)(0 h)的表達(dá)量接近;PeNLP2、PeNLP5和PeNLP10的表達(dá)為先上升、后下降、再上升,至氮饑餓24 h 時(shí),PeNLP5 極顯著高于0 h,PeNLP2和PeNLP10則極顯著低于0 h (p<0.01);PeNLP3和PeNLP8呈先上升、后下降、再上升、再下降、再上升的波動表達(dá)模式,至氮饑餓24 h 時(shí),PeNLP3的表達(dá)極顯著低于0 h,PeNLP8的表達(dá)極顯著高于0 h (p<0.01)。由此推測,毛竹對氮饑餓過程的響應(yīng)可能存在不同的信號通路,PeNLPs 各成員通過不同的表達(dá)來參與毛竹對氮饑餓的響應(yīng)。

    圖5 氮饑餓過程中PeNLPs 的表達(dá)分析Fig.5 Expression analysis of PeNLPs during nitrogen starvation

    對氮饑餓72 h 后的毛竹進(jìn)行復(fù)氮處理,在復(fù)氮過程中PeNLPs 的表達(dá)量均顯著或極顯著上調(diào)(p<0.05 或p<0.01),說明復(fù)氮促進(jìn)了PeNLPs 的表達(dá),但呈現(xiàn)不同的波動變化(圖6)。如PeNLP1、PeNLP3、PeNLP8和PeNLP10呈現(xiàn)相似的變化趨勢,即先上升、后下降,再上升、再下降;PeNLP2和PeNLP5呈現(xiàn)相似的變化趨勢,即先上升、后下降,再上升、再下降,再上升、后下降。PeNLP1、PeNLP2、PeNLP3、PeNLP5和PeNLP10的表達(dá)量基本是在復(fù)氮處理后12 h 達(dá)到峰值,在處理后24 h 較12 h都顯著下降,而PeNLP8則是在處理后24 h 達(dá)到峰值,較處理后12 h 顯著上升,說明它們的表達(dá)可能存在晝夜節(jié)律,各個成員響應(yīng)硝酸鹽表達(dá)的波動差異,表明不同PeNLPs 對硝酸鹽的響應(yīng)可能具有不同的信號通路。

    圖6 復(fù)氮過程中PeNLPs 的表達(dá)分析Fig.6 Expression analysis of PeNLPs during nitrogen resupply

    3 討論

    本研究基于毛竹新基因組數(shù)據(jù),共鑒定到10 個毛竹NLP基因家族成員,比水稻(6 個)、玉米(9 個)、二穗短柄草(7 個)和苜蓿(5 個)等單子葉植物中成員數(shù)量多,而少于雙子葉植物毛果楊(14 個)中的成員,這可能與不同物種在進(jìn)化過程中經(jīng)歷的基因組加倍或基因丟失有關(guān)[28]。亞細(xì)胞定位預(yù)測10 個PeNLPs 有9 個定位在細(xì)胞核中,這符合轉(zhuǎn)錄因子的特性,而PeNLP9 定位在葉綠體中,這可能是NLP 家族的核穿梭現(xiàn)象[29],與擬南芥、水稻NLP 的核穿梭特征[20]類似。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,60 個NLPs 分為3 個組,各組成員功能相似但也出現(xiàn)了一定的功能分化,如Ⅰ組中擬南芥和水稻成員主要參與硝酸鹽信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和氮素營養(yǎng)調(diào)控植物生長發(fā)育[30],Ⅱ組成員中AtNLP8呈組成型表達(dá),當(dāng)硝酸鹽存在時(shí),AtNLP8 可以直接結(jié)合到編碼ABA 分解代謝酶基因CYP707A2的啟動子區(qū),降低種子中ABA 含量并促進(jìn)種子萌發(fā)[7];Ⅲ組中成員個數(shù)相對較多,AtNLP6/7 能夠結(jié)合硝酸鹽響應(yīng)基因ANR1、CIPK8的啟動子,調(diào)控氮吸收、同化和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程[31]。雖然可以根據(jù)已知功能的同源蛋白預(yù)測PeNLPs 的功能,但要對PeNLPs 在氮素利用率(NUE)中的作用給出明確的結(jié)論,尚有待于實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

    氮素利用效率受氮感知、吸收、轉(zhuǎn)運(yùn)、同化和再利用效率等因素的影響,其調(diào)控是一個復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),其中,NLP 轉(zhuǎn)錄因子是硝態(tài)氮吸收利用的核心轉(zhuǎn)錄因子[32]。擬南芥中AtNLP6/7 通過感知硝酸鹽信號后活性被誘導(dǎo),進(jìn)而結(jié)合到高親和力硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)基因蛋白(NRT2.1)、亞硝酸還原酶(NIR1)等基因的啟動子區(qū)和硝酸還原酶(NIA1)基因的3′側(cè)翼區(qū)的氮應(yīng)答DNA 元件(NRE)上[33]。AtNLP6/7還可以和TCP20 相互作用形成異源二聚體,正向調(diào)控氮同化及氮信號途徑中的基因NRT1.1、NIA1和NIA2的表達(dá),參與硝酸鹽的同化和信號傳遞[34],此外,NLPs 還能靶向LBD37-39 和NIGT1 兩類轉(zhuǎn)錄因子基因,通過觸發(fā)二級轉(zhuǎn)錄事件協(xié)同響應(yīng)硝酸鹽過程[35]。蒺藜苜蓿MtNLP1 在細(xì)胞核中與MtNIN互作,阻礙MtNIN 激活CRE1和NF-YA1,進(jìn)而抑制了根瘤菌感染以及節(jié)的形成[36]。另外,作為轉(zhuǎn)錄因子,NLP 也受到其它轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控,如擬南芥AtNLP3 受到bZIP1 的“非綁定”的調(diào)控方式來快速響應(yīng)硝酸鹽[37]。

    NLPs 除與上游的轉(zhuǎn)錄因子互作、下游基因結(jié)合來參與調(diào)控響應(yīng)硝酸鹽外,還通過自身表達(dá)的變化來響應(yīng)氮饑餓及復(fù)氮誘導(dǎo)過程。在毛竹根中PeNLPs 的表達(dá)對氮饑餓作出快速反應(yīng),如在氮饑餓1 h 時(shí),PeNLP1的表達(dá)量上升至對照的30 倍,而PeNLP3的表達(dá)量則降低至對照的0.2 倍,這與硝酸鹽處理玉米時(shí)ZmNLPs 的表達(dá)變化趨勢相類似[38]。而在氮饑餓后復(fù)氮處理過程中,所有PeNLPs的表達(dá)均顯著上調(diào),說明硝酸鹽誘導(dǎo)PeNLPs 的表達(dá),這與前人在水稻、擬南芥和玉米等物種中的研究結(jié)果一致[39]。此外,依據(jù)擬南芥中的NRE 元件以及水稻中鑒定的NRE-like 元件,對PeNLPs 的下游靶基因進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果表明:毛竹NPF 家族的PeNPF2.4、PeNPF2.5、PeNPF2.7、PeNPF4.1、PeNPF4.6、PeNPF6.2、PeNPF6.5、PeNPF6.8和PeNPF8.19的啟動子區(qū)有TGACCC…N…AAGAG序列[8,40],推測它們可能是PeNLPs 的靶基因,但還有待于進(jìn)一步驗(yàn)證。目前,對于NLPs 的認(rèn)知主要是基于擬南芥、水稻和豆類[41]等草本植物,而對于木本植物NLPs 的功能驗(yàn)證鮮有報(bào)道,木本植物的生長需要大量的氮[42],且多年生長處于復(fù)雜的環(huán)境中,它們可能比草本植物具有更加復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),在氮饑餓及復(fù)氮處理過程中,PeNLPs 表達(dá)的波動變化表明其參與調(diào)控的復(fù)雜性。因此,要揭示非草非木的竹子中NLPs 的功能,尚需更廣泛的深入研究。

    4 結(jié)論

    本研究從毛竹中鑒定出10 個NLP 家族成員(PeNLP1~ PeNLP10),依據(jù)蛋白序列差異它們可分成3 個組,分別具有4、2、4 個成員。PeNLPs 在毛竹各個組織的生長早期呈現(xiàn)高表達(dá),這可能與各組織早期快速生長需要大量的氮素有關(guān)。氮素誘導(dǎo)PeNLPs 的表達(dá),在氮饑餓和復(fù)氮過程中呈現(xiàn)波動變化模式,表明毛竹對氮饑餓過程的響應(yīng)可能存在不同的信號通路,PeNLPs 各成員通過不同的表達(dá)來參與毛竹對氮饑餓的響應(yīng)。研究結(jié)果為深入探索PeNLPs 的功能,解析其調(diào)控分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

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