宋彬彬 甄 然 彭 宇 丁思妍 楊 璇 于 佳
微管是真核細(xì)胞中重要的骨架結(jié)構(gòu)和胞內(nèi)運(yùn)輸軌道,其散布于胞質(zhì)中,對于維持細(xì)胞結(jié)構(gòu)、形態(tài)和功能具有重要作用[1]。微管正端示蹤蛋白可特異定位于微管正端,具有保守的特定序列和復(fù)雜的相互作用網(wǎng)絡(luò),參與調(diào)控微管的動態(tài)變化,影響細(xì)胞內(nèi)微管依賴的各種生物學(xué)過程。微管末端結(jié)合蛋白1(end-binding protein 1,EB1)可自發(fā)的定位于微管正端,呈彗星狀分布,能招募含特定序列的多種蛋白在微管正端的聚集,是形成微管正端示蹤蛋白網(wǎng)絡(luò)的中心分子[2,3]。近年來有報道顯示口腔鱗狀細(xì)胞癌患者中EB1過表達(dá)[4]。佩里綜合征患者致病基因DCTN1的突變位點(diǎn)位于其與EB1相互作用結(jié)構(gòu)域[5]。以上提示EB1含量和功能異常與多種疾病發(fā)生相關(guān)。本研究通過生化方法以1.5月齡野生型小鼠、成纖維細(xì)胞和HEK293細(xì)胞為材料,檢測EB1在小鼠神經(jīng)系統(tǒng)和細(xì)胞中表達(dá)和分布,以及EB1在細(xì)胞自噬通路中的作用。
1.主要儀器和試劑:siRNA轉(zhuǎn)染試劑購自德國QIAGEN公司;10% SDS溶液、蛋白酶抑制劑、蛋白定量試劑盒、蛋白電泳預(yù)制膠、超聲波細(xì)胞破碎儀、熒光標(biāo)記二抗以及封片液購自美國Thermo Fisher Scientific公司;Turbo轉(zhuǎn)印包、Trans-Blot Turbo轉(zhuǎn)印系統(tǒng)購自美國Bio-Rad公司;雞抗神經(jīng)絲重鏈(neurofilament heavy chian,NFH)單克隆抗體、山羊抗p150glued多克隆抗體購自英國Abcam公司;鼠抗EB1單克隆抗體購自美國BD公司;兔抗EB1多克隆抗體、鼠抗β-actin單克隆抗體、兔抗GAPDH多克隆抗體購自美國Sigma-Aldrich公司;豚鼠抗p62多克隆抗體購自日本MBL Life Science公司;兔抗LC3B多克隆抗體購自美國Novus Biologicals公司;熒光標(biāo)記二抗、Odyssey紅外激光成像系統(tǒng)購自美國LI-COR公司。
2.實驗動物:野生型C57BL/6J小鼠購自北京維通利華實驗動物技術(shù)有限公司,根據(jù)實驗動物相關(guān)規(guī)定進(jìn)行管理和操作。迅速取材小鼠眼(eye)、嗅球(olfactory bulb,OB)、皮質(zhì)(cortex,CX)、海馬(hippocampus,HC)、紋狀體(striatum,Str)、中腦(midbrain,Mid)、小腦(cerebellum,CB)、腦干(brainstem,BS)、脊髓(spinal cord,SC)、坐骨神經(jīng)(sciatic nerve,SN)和腓腸肌(gastrocnemius muscle),凍存于-80℃冰箱。
3.細(xì)胞培養(yǎng)與傳代:小鼠原代成纖維細(xì)胞培養(yǎng)于含有10%胎牛血清和100U/ml青霉素、100μg/ml鏈霉素的DMEM培養(yǎng)基中,培養(yǎng)于含5% CO2的37℃恒溫培養(yǎng)箱。HEK293細(xì)胞培養(yǎng)于含有10%胎牛血清和100U/ml青霉素、100μg/ml鏈霉素的DMEM培養(yǎng)基中,培養(yǎng)于含5% CO2的37℃恒溫培養(yǎng)箱中。顯微鏡下觀察細(xì)胞生長至80%~90%時用1×TrypLETMExpress Enzyme消化、傳代,待細(xì)胞增殖旺盛、狀態(tài)良好時進(jìn)行實驗。
4.siRNA轉(zhuǎn)染:細(xì)胞消化后,按照每孔5×105個細(xì)胞傳代到6孔板中,按照QIAGEN公司HiPerFect Transfection Reagent轉(zhuǎn)染試劑說明書進(jìn)行EB1 siRNA和scrambled siRNA轉(zhuǎn)染。
5.蛋白免疫印跡法檢測蛋白表達(dá)水平:1% SDS裂解液裂解HEK293細(xì)胞或小鼠組織樣品,超聲破碎(25% amplitude, 10s on,10s off,3個循環(huán)),室溫離心16800×g,10min,收集上清為總蛋白提取液。采用BCA試劑盒測定蛋白濃度,取各組等量蛋白提取液經(jīng)10% SDS-PAGE和NuPAGE預(yù)制凝膠電泳,再將預(yù)制凝膠中蛋白質(zhì)電轉(zhuǎn)至硝酸纖維素(nitrocellulose,NC)膜上。將NC膜放入封閉液中封閉30min,加入一抗兔抗EB1、豚鼠抗p62、兔抗LC3B、鼠抗β-actin、兔抗GAPDH、雞抗NFH,4℃孵育過夜。PBST漂洗5min×3次,將NC膜放入熒光素IRDye?標(biāo)記的山羊抗兔或山羊抗雞或山羊抗鼠或山羊抗豚鼠二抗中,孵育1h,PBST漂洗5min×3次,采用Odyssey凝膠成像儀檢測蛋白質(zhì)顯色,Image J軟件定量蛋白條帶的相對灰度。
6.免疫熒光和激光共聚焦顯微鏡技術(shù):小鼠原代成纖維細(xì)胞接種于鋪有玻片的24孔板中,貼壁后用-20℃預(yù)冷甲醇固定10min后,PBS緩沖液洗5min×3次。封閉液室溫封閉30min后,使用一抗鼠抗EB1、山羊抗p150glued室溫孵育2h,PBS緩沖液洗5min×3次,使用Alexa Fluor 488/546/647標(biāo)記的二抗進(jìn)行免疫染色,室溫孵育1h,PBS緩沖液洗5min×3次,封片晾干。使用Zeiss共聚焦激光掃描顯微鏡(LSM880)拍照,使用Image J軟件進(jìn)行圖像分析。
1.微管正端示蹤蛋白EB1在小鼠成纖維細(xì)胞中位于微管正端:免疫熒光和激光共聚焦顯微鏡技術(shù)檢測結(jié)果顯示,小鼠成纖維細(xì)胞中EB1(綠色熒光)主要聚集于p150glued蛋白標(biāo)記的微管(紫色熒光)的正端,且呈彗星狀分布(圖1)。
圖1 成纖維細(xì)胞中EB1蛋白表達(dá)與分布成纖維細(xì)胞中EB1(綠色熒光)、p150glued(紫色熒光)和DAPI(藍(lán)色熒光)三重免疫熒光染色
2.微管正端示蹤蛋白EB1在小鼠神經(jīng)系統(tǒng)中表達(dá)和分布:蛋白印跡法檢測結(jié)果顯示,微管正端示蹤蛋白EB1在小鼠眼、嗅球、皮質(zhì)、海馬、紋狀體、中腦、小腦、腦干、脊髓、坐骨神經(jīng)和肌肉中都有一定表達(dá),但其含量具有組織部位差異性(圖2中A、B)。β-actin為非肌肉型actin,在肌肉組織中不表達(dá)。與脊髓比較,小鼠坐骨神經(jīng)中EB1蛋白含量均顯著下降(圖2中C、D)。
圖2 小鼠組織中EB1蛋白表達(dá)和分布A.EB1在小鼠眼、腦、脊髓、坐骨神經(jīng)和腓腸肌中蛋白表達(dá)水平;B. EB1在小鼠眼、腦、脊髓、坐骨神經(jīng)和腓腸肌中蛋白表達(dá)水平的定量分析;C.EB1在小鼠脊髓和坐骨神經(jīng)中蛋白含量;D. EB1在小鼠脊髓和坐骨神經(jīng)中蛋白含量的定量分析
3.EB1 siRNA在HEK293細(xì)胞的自噬溶酶體通路中作用:蛋白印跡法檢測結(jié)果顯示,HEK293細(xì)胞中轉(zhuǎn)染EB1 siRNA可顯著下調(diào)EB1蛋白水平(P<0.01)。且HEK293細(xì)胞中敲減EB1可引起自噬通路中關(guān)鍵分子p62和LC3B-Ⅱ蛋白含量顯著上調(diào)(P<0.05),而LC3B-Ⅰ蛋白水平未發(fā)生明顯變化(P>0.05,圖3)。
圖3 HEK293細(xì)胞中敲減EB1對自噬通路關(guān)鍵蛋白含量影響A.HEK293細(xì)胞中EB1含量下降引起自噬通路關(guān)鍵蛋白含量變化;B. HEK293細(xì)胞中EB1含量下降引起自噬通路關(guān)鍵蛋白含量變化的定量分析。ctrl.hek293細(xì)胞中轉(zhuǎn)染scramble siRNA;siRNA.hek293細(xì)胞中轉(zhuǎn)染EB1 siRNA
微管是真核細(xì)胞中廣泛存在的纖維管狀結(jié)構(gòu),其兩端具有極性,負(fù)端位于近核區(qū),聚合速度慢,較穩(wěn)定;正端指向胞質(zhì),處于動態(tài)的聚合解聚的快速轉(zhuǎn)換狀態(tài),即動態(tài)不穩(wěn)定性(dynamic instability)[6]。微管正端示蹤蛋白EB1通過其N端的CH結(jié)構(gòu)域(calponin homology domain, CHD)直接與微管蛋白結(jié)合,特異性聚集于微管正端。C端具有卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域負(fù)責(zé)介導(dǎo)EB1二聚體的形成,且C端也可介導(dǎo)其與具有CAP-Gly和SxIP等特定修飾的微管正端示蹤蛋白相互作用[7,8]。本研究檢測了體外培養(yǎng)的野生型小鼠成纖維細(xì)胞中EB1的定位和分布,確認(rèn)了EB1隨微管分散于胞質(zhì),且在微管正端高度聚集,呈彗星狀分布。
EB1廣泛表達(dá)于機(jī)體各組織部位,參與調(diào)控微管動力學(xué)和穩(wěn)定性[9]。研究發(fā)現(xiàn),EB1定位于生長的微管末端,可促進(jìn)微管持續(xù)增長[10]。EB1功能缺失時彗星狀結(jié)構(gòu)縮短,生長的微管末端數(shù)量減少且生長速率下降,提示微管可能處于崩解狀態(tài)[11]。HeLa細(xì)胞中EBs功能缺失使Clip170和Clasp1在微管正端聚集減少,微管生長和縮短速率均顯著下降,崩解和重建頻率均顯著提高。微管負(fù)端在高爾基體聚集減少,而隨機(jī)分布于胞質(zhì)中[12]。破骨細(xì)胞中微管調(diào)控足體的形成,過表達(dá)EB1可促進(jìn)破骨細(xì)胞成熟,而EB1功能缺失可通過破壞微管動態(tài)不穩(wěn)定性而抑制足體形成帶狀結(jié)構(gòu)[13]。本研究結(jié)果進(jìn)一步證實,EB1在小鼠眼、嗅球、皮質(zhì)、海馬、紋狀體、中腦、小腦、腦干、脊髓、坐骨神經(jīng)以及肌肉中均有表達(dá),且表達(dá)水平具有組織部位差異性。與脊髓比較,坐骨神經(jīng)中EB1蛋白含量均顯著下降(P<0.05),這提示神經(jīng)元亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)軸突束(坐骨神經(jīng))中EB1水平較低于胞體(脊髓)。而EB1對于微管具有重要調(diào)節(jié)作用,因此軸突束中EB1蛋白含量或功能的細(xì)微變化即有可能對神經(jīng)元產(chǎn)生重要影響。
自噬是一種重要的胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)調(diào)控機(jī)制,是自噬小體包裹待降解貨物后通過溶酶體實現(xiàn)降解功能的細(xì)胞代謝過程。LC3B是廣泛用于檢測自噬小體形成、成熟和自噬活性的重要標(biāo)志蛋白[14]。p62可選擇性募集泛素化蛋白質(zhì),并與LC3結(jié)合,參與自噬小體的形成[15]。研究發(fā)現(xiàn),微管及微管相關(guān)蛋白可調(diào)控自噬小體的形成、運(yùn)輸及其與溶酶體的融合過程[16]。Huh-7細(xì)胞中藥物破壞微管可明顯促進(jìn)自噬小體的生成[17]。Wei等[18]研究發(fā)現(xiàn),EB1可與CAMSAP2蛋白相互作用,調(diào)節(jié)非中心體微管的動力學(xué)特性。破壞EB1與CAMSAP2的結(jié)合可影響EB1在微管末端分布,改變微管生長方向,使自噬小體逆向運(yùn)輸障礙,導(dǎo)致LC3-Ⅱ蛋白水平提高,自噬小體積累。本研究發(fā)現(xiàn),HEK293細(xì)胞中敲減EB1可引起p62和LC3A/B-Ⅱ蛋白含量顯著上調(diào)(P<0.05),這提示EB1缺失可能通過引起微管正端結(jié)構(gòu)和功能障礙而引起自噬小體積累,導(dǎo)致自噬異常。
綜上所述,微管正端示蹤蛋白EB1可招募蛋白質(zhì)在微管正端的定位,是連接微管正端示蹤蛋白網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵分子,對于調(diào)控微管穩(wěn)定性和動力學(xué)具有重要作用[19]。本研究檢測了EB1在小鼠經(jīng)系統(tǒng)中的表達(dá),發(fā)現(xiàn)其廣泛存在且具有組織部位特異性。與胞體比較,軸突束中EB1蛋白含量顯著下降。EB1特異性聚集于微管正端,在HEK293細(xì)胞中敲減EB1可能通過破壞微管正端結(jié)構(gòu)和功能,減少自噬小體的形成和運(yùn)輸,從而引起自噬異常。自噬異常與神經(jīng)元損傷和死亡密切相關(guān)[20]。本研究可為揭示微管正端示蹤蛋白EB1如何參與神經(jīng)系統(tǒng)疾病提供科學(xué)依據(jù)。