35日齡北京鴨回腸和盲腸微生物菌群的群落組成和空間分布研究

郝永勝 申仲健 吳永保 張 博 唐 靜 侯水生 謝 明

(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所，動物營養(yǎng)學(xué)國家重點實驗室，北京 100193)

我國是肉鴨生產(chǎn)和消費大國，肉鴨年出欄量遙居世界首位[1]。在養(yǎng)殖生產(chǎn)中，通過改善腸道黏膜結(jié)構(gòu)和微生物區(qū)系增強肉鴨消化功能和免疫機能已經(jīng)成為保障肉鴨健康的有效途徑[2]。肉鴨腸道中定植的菌群與腸道復(fù)雜的穩(wěn)態(tài)環(huán)境有著密切聯(lián)系。腸道菌群影響著宿主營養(yǎng)物質(zhì)的消化和吸收、腸道黏膜的發(fā)育、氨基酸和維生素的合成、腸道黏膜免疫系統(tǒng)的反應(yīng)和病原微生物的增殖[3-4]。同時短鏈脂肪酸(short chain fatty acids，SCFAs)作為腸道菌群的代謝產(chǎn)物能夠為宿主腸道上皮細胞提供能量，并抑制病原菌致病因子的表達[5]。因而腸道菌群組成和結(jié)構(gòu)對肉鴨的生長發(fā)育具有重要影響。目前，基于高通量測序技術(shù)的發(fā)展，不同樣本環(huán)境中的微生物群落圖譜得到進一步的補充完善，腸道菌群作為家禽腸道疾病預(yù)防和診斷的生物標記物逐漸得到關(guān)注[6-7]。肉鴨腸道微生物方面的研究主要集中在飼糧、日齡和添加劑等因素與腸道微生物組成和結(jié)構(gòu)變化關(guān)系的研究[1,8-9]，這些研究表明腸道微生物在肉鴨營養(yǎng)物質(zhì)消化及腸道健康中起到非常重要的作用。肉鴨盲腸作為微生物活動的主要場所，主要以微生物消化為主?；啬c作為肉鴨營養(yǎng)物質(zhì)化學(xué)消化的部位，其營養(yǎng)物質(zhì)的消化吸收也與微生物群落有著密不可分的關(guān)聯(lián)[10]。由此可見，肉鴨腸道功能的發(fā)揮與回腸和盲腸菌群的空間分布密切相關(guān)。目前，肉鴨腸道菌群的研究主要集中在盲腸，而回腸和盲腸菌群的群落組成和空間分布的研究鮮有報道。因此，本試驗旨在研究35日齡北京鴨回腸和盲腸菌群空間分布的變化，揭示回腸和盲腸菌群空間分布差異，為維持腸道正常功能和保障腸道健康提供基礎(chǔ)理論依據(jù)，為進一步開展腸道健康與微生物關(guān)系研究和新型飼用微生物制劑研發(fā)提供技術(shù)支撐。

1 材料與方法

1.1 試驗設(shè)計

試驗選用36只健康且體重基本一致的15日齡雄性北京鴨，隨機分為6個重復(fù)，每個重復(fù)6只鴨。試驗采用玉米-豆粕型基礎(chǔ)飼糧，飼糧營養(yǎng)水平滿足我國《肉鴨飼養(yǎng)標準》(NY/T 2122—2012)要求，基礎(chǔ)飼糧組成及營養(yǎng)水平見表1。試驗期為21 d。

表1 基礎(chǔ)飼糧組成及營養(yǎng)水平(風干基礎(chǔ))Table 1 Composition and nutrient levels of the basal diet (air-dry basis) %

續(xù)表1項目Items含量Content營養(yǎng)水平Nutrientlevels2)代謝能ME/(MJ/kg)12.22粗蛋白質(zhì)CP17.67粗纖維CF3.90鈣Ca0.80總磷TP0.61有效磷AP0.39賴氨酸Lys0.90蛋氨酸Met0.41蛋氨酸+半胱氨酸Met+Cys0.70色氨酸Trp0.22蘇氨酸Thr0.73

1.2 飼養(yǎng)管理

動物養(yǎng)殖試驗在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所昌平試驗基地進行。試驗鴨網(wǎng)上平養(yǎng)，自由采食與飲水，24 h光照。其他按試驗基地常規(guī)管理進行。

1.3 樣品采集

35日齡時，從每個重復(fù)中隨機選取2只北京鴨，然后進行屠宰，解剖并分離回腸和盲腸。將回腸和盲腸的內(nèi)容物快速地擠壓到1.5 mL滅菌離心管中，液氮速凍，-80 ℃保存。

1.4 回腸與盲腸微生物測定

1.5 16S rRNA數(shù)據(jù)處理

根據(jù)Barcode將測序得到的reads拆分出各樣本數(shù)據(jù)，通過Trimmomatic軟件去除Barcode和引物序列后利用Flash軟件將各個樣本的reads進行拼接，從而得到原始序列(raw reads)。利用Qiime 2軟件對raw reads進行質(zhì)量控制，得到質(zhì)量值小于20的干凈序列(clean reads)，然后使用UCHIME Algorithm去除clean reads中的嵌合體序列獲得有效序列(effective reads)。用Usearch(v7.0)按97%的相似性對樣本中的effective reads進行操作分類單元(operational taxonomic units，OTUs)聚類，選取97%相似水平的OTUs代表序列。通過Qiime 2將OTUs代表序列與Silva的SSU rRNA數(shù)據(jù)庫進行物種注釋分析，從而獲得樣本在各個分類學(xué)上的物種組成。使用Qiime 2對樣本進行alpha多樣性和beta多樣性分析，其中alpha多樣性指數(shù)為Ace、Chao1、Simpson和Shannon指數(shù)，beta多樣性中的主坐標分析(principal co-ordinates analysis，PCoA)基于Unweighted UniFrac距離算法。使用線性判別分析效應(yīng)大小(linear discriminant analysis effect size，LEfSe)軟件分析回腸與盲腸中相對豐度顯著差異的微生物，回腸與盲腸中的生物標記物篩選的線性判別分析(linear discriminant analysis，LDA)閾值大于4。

1.6 數(shù)據(jù)分析

采用SAS 9.4軟件對alpha多樣性指數(shù)及相關(guān)數(shù)據(jù)進行獨立樣本t檢驗，結(jié)果用平均值和標準誤(SE)表示，以P<0.05為差異顯著性水平，P<0.01為差異極顯著水平。

2 結(jié)果與分析

2.1 15～35日齡肉鴨生長性能

35日齡肉鴨的平均體重為(2 396.8±10.9)g，15～35日齡肉鴨料重比為2.21±0.02，表明肉鴨在養(yǎng)殖過程中生長發(fā)育正常。

2.2 35日齡肉鴨回腸和盲腸微生物菌群OTUs聚類和alpha多樣性比較分析

本試驗應(yīng)用Illumina MiSeq測序平臺進行雙末端(paired-end)測序，通過對reads進行拼接質(zhì)控后測得每樣本平均clean reads數(shù)目為53 309個，每樣本平均effective reads數(shù)目為43 944個，reads平均長度為418 bp?；?7%相似性對序列進行OTUs聚類，共獲得1 268個OTUs。由圖1可知，樣品稀釋曲線隨著測序深度的增加逐漸趨于平緩，表明測序數(shù)據(jù)量合理。

圖1 樣品稀釋曲線分析圖Fig.1 Rarefaction curve analysis figure of samples

由圖2可知，回腸和盲腸中共有的OTUs數(shù)目為509個，占到了總OTUs數(shù)目的40.14%，且盲腸中的OTUs數(shù)目多于回腸中的OTUs數(shù)目。與回腸相比，肉鴨盲腸中Simpson指數(shù)顯著降低(P<0.05)，Shannon指數(shù)極顯著增加(P<0.01)，表明肉鴨盲腸微生物的多樣性高于回腸；而肉鴨盲腸中Ace和Chao1指數(shù)差異不顯著(P>0.05)，表明肉鴨回腸和盲腸微生物的豐富度大致相同。

數(shù)據(jù)箱形標記*表示差異顯著(P<0.05)，標記**表示差異極顯著(P<0.01)。Value boxes with * mean significant difference (P<0.05)，and with ** mean extremely significant difference (P<0.01).圖2 肉鴨回腸和盲腸微生物菌群alpha多樣性分析Fig.2 Alpha diversity analysis of ileum and cecal microbiota of meat ducks

2.3 35日齡肉鴨回腸和盲腸微生物群落組成

本試驗共鑒定出23個門(phylum)，53個綱(class)，128個目(order)，211個科(family)，455個屬(genus)。由圖3可知，在回腸中厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidita)、放線菌門(Actinobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)為優(yōu)勢菌門(相對豐度>1%)，在盲腸中厚壁菌門、擬桿菌門、放線菌門、變形菌門和脫鐵桿菌門(Desulfobacterota)為優(yōu)勢菌門(相對豐度>1%)。厚壁菌門是回腸和盲腸微生物菌群中相對豐度(>60%)最高的菌門；擬桿菌門是盲腸中主要的優(yōu)勢菌門(相對豐度>20%)，而其在回腸中的相對豐度低于2%；變形菌門和放線菌門是回腸中主要的優(yōu)勢菌門(相對豐度>20%)，而在盲腸中二者的相對豐度低于8%；脫鐵桿菌門是盲腸中特有的優(yōu)勢菌門，相對豐度高于2%。

Firmicutes：厚壁菌門；Bacteroidita：擬桿菌門；Actinobacteriota：放線菌門；Proteobacteria：變形菌門；Desulfobacterota：脫鐵桿菌門；Streptococcus：鏈球菌屬；Bacteroides：擬桿菌屬；Lactobacillus：乳酸菌屬；Corynebacterium：棒桿菌屬；Megamonas：巨單細胞菌屬；Subdoligranulum：罕見小球菌屬；Candidatus_Arthromitus：分節(jié)絲狀菌屬；Faecalibacterium：糞桿菌屬；Romboutsia：羅姆布茨菌屬；unclassified_f_Lachnospiraceae：毛螺菌科未定義菌屬；Rothia：羅思氏菌屬；Enterococcus：腸球菌屬；Ruminococcus_torques_group：瘤胃球菌屬扭鏈群；Rikenellaceae_RC9_gut_group：理研菌科RC9腸道群；Collinsella：柯林斯氏菌屬；Shuttleworthia：沙特爾沃思菌屬；Phascolarctobacterium：考拉桿菌屬；Butyricicoccus：丁酸球菌屬；Desulfovibrio：脫硫弧菌屬；Negativibacillus：負芽孢桿菌屬；Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia：伯克霍爾德氏菌屬；norank_f_norank_o_Clostridia_UCG-014：梭菌目UCG-014；Erysipelatoclostridium：毛霉菌屬；norank_f_Ruminococcaceae：瘤胃菌科未定義屬；Peptococcus：肽球菌屬；Blautia：布勞特氏菌屬；others：其他。圖3 肉鴨回腸和盲腸微生物群落組成Fig.3 Ileum and cecal microbial community composition of meat ducks

在回腸和盲腸鑒定出的455個屬中，相對豐度高于1%的優(yōu)勢菌屬共有32個?；啬c和盲腸中主要的菌屬為擬桿菌屬(Bacteroides)、鏈球菌屬(Streptococcus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)和棒桿菌屬(Corynebacterium)。鏈球菌屬、乳桿菌屬和棒桿菌屬是回腸中的主要菌屬(相對豐度>50%)，而其在盲腸中的相對豐度低于5%；擬桿菌屬是盲腸中的優(yōu)勢菌屬，相對豐度達17%，而在回腸中的相對豐度僅為1%。

2.4 35日齡肉鴨回腸和盲腸微生物群落結(jié)構(gòu)

圖4表明了回腸和盲腸微生物群落結(jié)構(gòu)的相似性與差異性。PCoA分析展示了回腸和盲腸的微生物群落形成了2個獨立的簇，表明不同腸段影響著微生物群落結(jié)構(gòu)的形成。同時在科水平上展示了定植在回腸和盲腸微生物菌群相對豐度的差異性比較分析。棒桿菌科(Corynebacteriaceae)、乳桿菌科(Lactobacillaceae)和鏈球菌科(Streptococcaceae)是回腸微生物群落中主要的菌科，并形成了一個獨立的簇；毛螺菌科(Lachnospiraceae)、擬桿菌科(Bacteroidaceae)和瘤胃菌科(Ruminococcaceae)是盲腸微生物群落中主要的菌科，并聚類形成了一個獨立的簇，然而氣球菌科(Aerococcaceae)和微球菌科(Micrococcaceae)在盲腸中的相對豐度低于回腸。

Prevotellaceae：普雷沃氏菌科；Butyricicoccaceae：丁酸球菌科；Acidaminococcaceae：氨基酸球菌科；Desulfovibrionaceae：脫硫弧菌科；Peptostreptococcaceae：消化鏈球菌科；Coriobacte riaceae：腸桿菌科；Oscillospiraceae：顫桿菌科；Eubacterium_coprostanoligenes_group：產(chǎn)糞甾醇真桿菌科；Lachnospiraceae：毛螺菌科；Bacteroidaceae：擬桿菌科；Ruminococcaceae：瘤胃菌科；Selenomonadaceae：月形單細胞菌科；Rikenellaceae：理研菌科；Clostridiaceae：梭菌科；Micrococcaceae：微球菌科；Enterococcaceae：腸球菌科；Aerococcaceae：氣球菌科；Streptococcaceae：鏈球菌科；Lactobacillaceae：乳桿菌科；Corynebacteriaceae：棒桿菌科。圖4 肉鴨回腸和盲腸微生物群落結(jié)構(gòu)Fig.4 Ileum and cecal microbial community structure of meat ducks

2.5 35日齡肉鴨回腸和盲腸的差異微生物

LEfSe分析篩選出了回腸和盲腸的差異微生物。由圖5可知，盲腸中共獲得32個差異微生物，其中在科水平上具有顯著差異的微生物菌群為擬桿菌科、瘤胃菌科、毛螺菌科、理研菌科(Rikenellaceae)、顫桿菌科(Oscillospiraceae)、消化鏈球菌科(Peptostreptococcaceae)、腸桿菌科(Coriobacteriaceae)、氨基酸球菌科(Acidaminococcaceae)、丁酸球菌科(Butyricicoccaceae)和產(chǎn)糞甾醇真桿菌科(Eubacterium coprostanoligenes group)；回腸中共獲得22個差異微生物，其中在科水平上具有顯著差異的微生物菌群為鏈球菌科、乳桿菌科、棒桿菌科、微球菌科、氣球菌科、梭菌科(Clostridiaceae)、伯克氏菌科(Burkholderiaceae)和腸球菌科(Enterococcaceae)。

Clostridia：梭菌綱；Lachnospirales：毛螺菌目；Lachnospiraceae：毛螺菌科；Shuttleworthia：沙特爾沃思菌屬；unclassified_f_Lachnospiraceae：毛螺菌科未定義屬；Ruminococcus_torques_group：瘤胃球菌屬扭鏈群；Oscillospirales：顫桿菌目；Ruminococcaceae：瘤胃菌科；Subdoligranulum：罕見小球菌屬；Faecalibacterium：糞桿菌屬；Eubacterium_coprostanoligenes_group：產(chǎn)糞甾醇真桿菌科；norank_f__Eubacterium_coprostanoligenes_group：產(chǎn)糞甾醇真桿菌科未定義屬；Butyricicoccaceae：丁酸球菌科；Oscillospiraceae：顫桿菌科；Peptostreptococcaceae：消化鏈球菌科；Romboutsia：羅姆布茨菌屬；Clostridiales：梭菌目；Clostridiaceae：梭菌科；Candidatus_Arthromitus：念珠菌屬；Bacilli：桿菌綱；Lactobacillales：乳桿菌目；Aerococcaceae：氣球菌科；Enterococcaceae：腸球菌科；Enterococcus：腸球菌屬；Streptococcaceae：鏈球菌科；Streptococcus：鏈球菌屬；Lactobacillaceae：乳桿菌科；Lactobacillus：乳酸菌屬；Acidaminococcales：氨基酸球菌目；Acidaminococcaceae：氨基酸球菌科；Phascolarctobacterium：考拉桿菌屬；Actinobacteriota：放線菌門；Actinobacteria：放線菌綱；Micrococcales：微球菌目；Micrococcaceae：微球菌科；Rothia：羅思氏菌屬；Corynebacteriales：棒桿菌目；Corynebacteriaceae：棒桿菌科；Corynebacterium：棒桿菌屬；Coriobacteriia：腸桿菌綱；Coriobacteriales：腸桿菌目；Coriobacteriaceae：腸桿菌科；Collinsella：柯斯林氏菌屬；Burkholderiales：伯克氏菌目；Burkholderiaceae：伯克氏菌科；Bacteroidota：擬桿菌門；Bacteroidia：擬桿菌綱；Rikenellaceae：理研菌科；Alistipes：另枝菌屬；Rikenellaceae_RC9_gut_group：理研菌科RC9腸道群；Bacteroidaceae：擬桿菌科；Bacteroides：擬桿菌屬；Peptostreptococcales_Tissierellales：Peptostreptococcales_Tissierellales菌目。圖5 差異微生物LEfSe分析Fig.5 LEfSe analysis on differential microbiota

3 討 論

3.1 35日齡肉鴨回腸和盲腸菌群多樣性分析

家禽腸道中定植的微生物群落參與宿主的營養(yǎng)吸收和免疫防御過程，對家禽的生長和健康起到了重要的作用[12]?；啬c是肉鴨營養(yǎng)物質(zhì)吸收的主要部位，而盲腸是主要的發(fā)酵場所，進而使回腸和盲腸微生物菌群的多樣性與腸道功能有著密切的聯(lián)系[9]。盲腸中Simpson指數(shù)的降低和Shannon指數(shù)的增加表明了盲腸中微生物更加具有多樣性。Bjerrum等[13]報道，肉雞盲腸中定植的微生物菌群較回腸中的微生物菌群呈現(xiàn)出多樣化的特點。這一結(jié)果也得到了Mohdasrore等[14]研究結(jié)果的支持，在該研究中，通過對肉雞回腸和盲腸微生物菌群16S rRNA基因測序，表明盲腸微生物菌群的多樣性更加豐富。肉鴨盲腸中定植的微生物菌群多為專性厭氧菌，其在降解多糖、尿酸和纖維素中起關(guān)鍵作用[15]。肉鴨盲腸中的OTUs數(shù)目多于回腸中的OTUs數(shù)目，而二者之間的豐富度基本相同，表明回腸中菌群分布均勻性較低，部分OTUs中含有大量的effective reads。消化道中定植的微生物菌群之間在飼糧營養(yǎng)物質(zhì)的利用過程中存在競爭抑制效應(yīng)，導(dǎo)致腸道菌群均勻度降低。因此，肉鴨生長過程中不僅要控制腸道中潛在的病原菌，而且調(diào)節(jié)腸道菌群的平衡也至關(guān)重要。

3.2 35日齡肉鴨回腸和盲腸微生物群落組成

在門水平上，厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門和放線菌門是肉鴨回腸和盲腸中共有的優(yōu)勢菌門，其中厚壁菌門是回腸和盲腸中主要的菌門。擬桿菌門主要存在盲腸中，而在回腸中的相對豐度較低。研究發(fā)現(xiàn)，厚壁菌門和擬桿菌門參與腸道中SCFAs的代謝，其中厚壁菌門參與丙酸和丁酸的合成，擬桿菌門主要參與丙酸的代謝途經(jīng)[16]。擬桿菌門在肉鴨盲腸中相對豐度的增加表明盲腸中參與SCFAs代謝途徑的菌群更為發(fā)達，促進飼糧營養(yǎng)物質(zhì)的微生物發(fā)酵，尤其是飼糧纖維的利用，進而為宿主提供生長所需的能量和氨基酸等營養(yǎng)物質(zhì)[17]。此外，家禽腸道中厚壁菌門與擬桿菌門的比值與其生長性能和營養(yǎng)物質(zhì)的消化相關(guān)[18]。Singh等[18]研究發(fā)現(xiàn)，肉雞盲腸中厚壁菌門和擬桿菌門比值的增加，提高了肉雞對養(yǎng)分的利用效率，促進了肉雞的生長發(fā)育。與盲腸相比，肉鴨回腸中厚壁菌門與擬桿菌門比值的增加有利于提高回腸對營養(yǎng)物質(zhì)的消化能力，從而使回腸更好地執(zhí)行其消化功能。Wei等[4]研究報道，變形菌門和放線菌門是肉雞盲腸中主要的菌門，然而本試驗中發(fā)現(xiàn)變形菌門和放線菌門在回腸中的相對豐度高于盲腸，可能是由于宿主和飼養(yǎng)環(huán)境的差異而造成菌群多樣性的不同。

在屬水平上，肉鴨回腸和盲腸中主要的菌屬為鏈球菌屬、乳桿菌屬、棒桿菌屬和擬桿菌屬。鏈球菌屬、乳桿菌屬和棒桿菌屬在肉鴨回腸中的相對豐度高于盲腸。這與肉雞回腸中乳桿菌屬、棒桿菌屬相對豐度高于盲腸方面的研究結(jié)果[13,21-22]一致。研究表明，鏈球菌屬、乳桿菌屬和棒桿菌屬是淀粉分解菌，其能夠促進飼糧中的淀粉分解為可被宿主吸收的葡萄糖分子形式[19]。因而，肉鴨回腸中淀粉分解菌相對豐度的增加有利于飼糧中淀粉在回腸中消化吸收。家禽盲腸作為微生物發(fā)酵的主要場所，其腸腔內(nèi)氧分壓和氧化還原電位低于回腸，從而有利于專性厭氧菌在盲腸生態(tài)位中的增殖[4]。本試驗發(fā)現(xiàn)，在肉鴨盲腸生態(tài)位中專性厭氧菌擬桿菌屬和糞桿菌屬的相對豐度高于回腸。這一結(jié)果也得到了Mohdasrore等[14]研究結(jié)果的支持，在該研究發(fā)現(xiàn)肉雞盲腸中定植的擬桿菌屬和糞桿菌屬的相對豐度高于回腸。擬桿菌屬和糞桿菌屬是發(fā)酵產(chǎn)生SCFAs的主要菌群，其中擬桿菌屬在含氮物質(zhì)的利用以及膽汁酸和其他類固醇的生物轉(zhuǎn)化中也具有重要作用[20]。由此可見，肉鴨盲腸中產(chǎn)SCFAs菌群相對豐度的增加有利于執(zhí)行盲腸的發(fā)酵功能。

3.3 35日齡肉鴨回腸和盲腸菌群結(jié)構(gòu)和差異微生物分析

PCoA分析展示了肉鴨回腸和盲腸微生物菌群分別形成了2個獨立的簇，進而表明了回腸微生物菌群的組成與盲腸有著明顯的不同。Xiao等[22]應(yīng)用PCoA發(fā)現(xiàn)肉雞小腸的微生物菌群存在相似性，而與盲腸的微生物菌群組成存在明顯的差別。Lu等[23]研究表明，肉雞腸道微生物菌群的組成與其定植的腸道部位相關(guān)。通過在科水平上的分層聚類熱圖發(fā)現(xiàn)，瘤胃菌科、毛螺菌科和擬桿菌科是肉鴨盲腸中主要的菌科；而棒桿菌科、乳桿菌科和鏈球菌科是肉鴨回腸中主要的菌科，進一步表明了肉鴨腸道微生物在不同腸段中群落的組成和相對豐度各不相同。

LEfSe分析篩選出肉鴨盲腸中的差異微生物在科水平上主要為擬桿菌科、瘤胃菌科、毛螺菌科、理研菌科、顫桿菌科。瘤胃菌科、毛螺菌科和顫桿菌科是丁酸的主要生產(chǎn)者，其通過發(fā)酵飼糧中難以被肉鴨消化利用的多聚糖從而產(chǎn)生可被機體利用的SCFAs[24]。Polansky等[24]研究報道，SCFAs不僅為腸道上皮細胞提供能量，而且能夠抑制病原菌產(chǎn)生致病因子。Hu等[25]研究發(fā)現(xiàn)，毛螺菌科的相對豐度與肉雞生長性能之間存在顯著的正相關(guān)關(guān)系。此外，擬桿菌科能夠刺激腸道上皮細胞產(chǎn)生抗炎細胞因子[25]。肉鴨回腸中的差異微生物在科水平上主要為鏈球菌科、乳桿菌科、棒桿菌科。乳桿菌科中的乳酸菌屬是定植在家禽腸道中益生菌，其不僅能夠產(chǎn)生細胞素，而且生成大量的乳酸和乙酸，從而降低了腸道中的pH，有利于抑制病原菌的增殖[22]。因而，肉鴨回腸和盲腸中的差異微生物為其腸道生長發(fā)育提供了有利的微生態(tài)環(huán)境，為肉鴨的健康生長提供了保障。

4 結(jié) 論

① 肉鴨回腸和盲腸中共有的OTUs數(shù)目為509個，回腸和盲腸微生物的豐富度沒有顯著差異，盲腸微生物的多樣性高于回腸。

② 鏈球菌屬、乳桿菌屬和棒桿菌屬是肉鴨回腸中的主要菌屬，其為淀粉分解菌，可能影響回腸中淀粉的消化吸收。

③ 擬桿菌屬和巨單細胞菌屬是肉鴨盲腸中的主要菌屬，其為SCFAs的生產(chǎn)者，可能影響盲腸菌群繁殖和盲腸發(fā)育。