黃 瑤, 張秀玲, 王 艷, 孔桂美, 徐 勤
(1.揚(yáng)州市疾病預(yù)防控制中心檢驗(yàn)科,江蘇 揚(yáng)州 225002;2.揚(yáng)州大學(xué)醫(yī)學(xué)院,江蘇 揚(yáng)州 225009)
發(fā)熱呼吸道病毒感染是全球范圍內(nèi)引起人類發(fā)病和死亡的主要原因之一[1-4],了解病原體對(duì)疾病診治和預(yù)防具有十分重要的作用。鑒于呼吸道病毒疫情防控的復(fù)雜性[5-10],本研究在揚(yáng)州市住院肺炎患者中主動(dòng)開展了呼吸道病毒病原學(xué)監(jiān)測(cè),對(duì)住院肺炎患者進(jìn)行流感病毒、呼吸道合胞病毒、人腺病毒、人腸道病毒及人副流感病毒Ⅲ型這5種常見呼吸道病毒的檢測(cè),最大程度對(duì)呼吸道傳染疫情進(jìn)行預(yù)測(cè),以及時(shí)采取應(yīng)對(duì)措施,減少疫情對(duì)社會(huì)和經(jīng)濟(jì)發(fā)展的影響。
收集江蘇省蘇北人民醫(yī)院、揚(yáng)州大學(xué)附屬醫(yī)院、揚(yáng)州市第二人民醫(yī)院、高郵市人民醫(yī)院4家哨點(diǎn)醫(yī)院符合“采樣對(duì)象”定義的住院肺炎患者呼吸道咽拭子樣本,每家哨點(diǎn)醫(yī)院每周采集5人份樣本,每周采集1~2次。樣本采集后48 h內(nèi)送至揚(yáng)州市疾病預(yù)防控制中心病毒實(shí)驗(yàn)室,2~8 ℃保存;未能及時(shí)送達(dá)的樣本,-70 ℃或以下保存,并于1周內(nèi)送達(dá);樣本應(yīng)避免反復(fù)凍融。
納入符合以下3種情況之一的住院治療的肺炎患者作為“采樣對(duì)象”:(1)發(fā)熱(腋下體溫≥38 ℃),并具有肺炎的影像學(xué)特征,發(fā)病早期白細(xì)胞總數(shù)降低或正常(或淋巴細(xì)胞分類計(jì)數(shù)減少);(2)符合呼吸道病毒感染臨床表現(xiàn)(咽部不適、咽干或咽痛,鼻塞、流涕,鼻、咽、喉明顯充血或水腫,咳嗽,咳痰,氣短,聽診呼吸音異常,胸痛)中任意1項(xiàng);(3)經(jīng)規(guī)范抗菌藥物治療3 d,病情無明顯改善,或呈進(jìn)行性加重,或常見病原體感染不能解釋的肺炎病例。
Kingfisher96全自動(dòng)核酸提取儀、ZTLJB-Y64核酸提取試劑盒(西安天隆科技有限公司)、ABI ViiA7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(美國ABI公司);磁珠法病毒(NA)提取試劑盒(RD0164D,上海醫(yī)脈賽生物科技有限公司);甲型/乙型流感病毒、甲型H1N1流感病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒Victoria/Yamagata、副流感病毒Ⅲ型、腺病毒、呼吸道合胞病毒試劑盒和腸道病毒(通用型)核酸檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)(江蘇碩世生物公司)。
將樣本震蕩處理后,采用Kingfisher96全自動(dòng)核酸提取儀提取、純化核酸,采用ABI ViiA7實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行分型檢測(cè)。對(duì)流感病毒陽性樣本進(jìn)一步行亞型分型檢測(cè)。逆轉(zhuǎn)錄熒光聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)反應(yīng)條件:50 ℃ 30 min,95 ℃ 5 min,95 ℃ 10 s、55 ℃延伸1 min,45個(gè)循環(huán)。熒光PCR反應(yīng)條件:95 ℃ 5 min,95 ℃ 15 s、55 ℃延伸40 s,45個(gè)循環(huán)。結(jié)果判定:循環(huán)閾值(cycle threshold,Ct)≤35,且曲線呈S型為陽性;Ct>38或未檢出為陰性。
采用SPSS 20.0軟件及Excel 2019軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料以例或率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2017—2020年,共收到住院肺炎患者咽拭子樣本1 479例,患者男887例,女592例,年齡為<1個(gè)月~94歲。各哨點(diǎn)醫(yī)院各年樣本上送情況見表1。
1 479例咽拭子樣本中,檢出病毒陽性195例,陽性檢出率為13.18%,其中2種病毒混合感染7例(0.47%)。195例病毒陽性樣本中,流感病毒檢出率最高(5.54%),以下依次為呼吸道合胞病毒(2.63%)、人腸道病毒(1.89%)、人副流感病毒Ⅲ型(1.62%)、人腺病毒(1.01%)。7例混合感染病例中,人腺病毒合并人腸道病毒感染2例,人副流感病毒Ⅲ型合并人腸道病毒感染1例,呼吸道合胞病毒合并人腸道病毒感染2例,呼吸道合胞病毒合并人副流感病毒Ⅲ型感染2例。見表2。
2017—2020年,各家哨點(diǎn)醫(yī)院樣本上送數(shù)量穩(wěn)定。2017年陽性檢出率最高,達(dá)19.83%(68/343),以下依次為2018年(13.40%,43/321)、2019年(17.44%,60/344)、2020年(5.10%,24/471),不同年份病毒檢出率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=45.60,P<0.01)。
2017年呼吸道病毒檢出高峰時(shí)間集中在3~5月和11~12月,2018年集中在7月和9月,2019年集中在1~3月和12月,2020年僅有9月1個(gè)小高峰。2017年3~5月檢出病毒以B型Victoria流感病毒為主,11~12月則以新甲型H1N1流感病毒及人腸道病毒為主;2018年7月的高峰以呼吸道合胞病毒(12.50%)、人副流感病毒Ⅲ型(12.5%)、人腸道病毒(4.17%)和人腸道病毒與人副流感病毒Ⅲ型混合感染(4.17%)為主,陽性檢出率達(dá)到33.34%,9月的高峰則以人腸道病毒為主(37.5%),人腺病毒、人副流感病毒Ⅲ型、人腺病毒+人腸道病毒混合感染及呼吸道合胞病毒+人腸道病毒混合感染檢出率僅為4.17%,病毒陽性檢出率高達(dá)54.18%;2019年1~3月主要為新甲型H1N1流感病毒感染,12月的高峰由H1N1流感病毒,B型Victoria流感病毒及呼吸道合胞病毒構(gòu)成;2020年9月小高峰主要由呼吸道合胞病毒和人副流感病毒Ⅲ型構(gòu)成。
887例男性患者中,101例病原檢測(cè)陽性,陽性檢出率為11.39%;592例女性患者中,94例病原檢出陽性,陽性檢出率為15.88%。男性、女性陽性檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.4.26,P<0.05)。
根據(jù)患者年齡進(jìn)行分組,不同年齡患者呼吸道病毒陽性檢出率分別為:0~6歲組16.57%(90/543),7~18歲組18.00%(18/100),19~59歲組12.72%(44/346),≥60歲組8.78%(43/490)。不同年齡組陽性檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=15.87,P<0.01)。
2017、2018、2019 、2020年住院肺炎患者病毒病原譜有所不同(χ2=72.63,P<0.01)。2017年以流感病毒、人腸道病毒、人呼吸道合胞病毒為主,分別占所有檢出病原體的54.41%、16.18%、16.18%;其中流感病毒共檢出4個(gè)亞型,以B型Victoria為優(yōu)勢(shì)毒株,H1N1亞型同期共存,H7N9與H3N2亞型交替檢出。2018年病毒病原譜則以人腸道病毒、呼吸道合胞病毒、人副流感病毒Ⅲ型為主,分別占所有檢出病原體的32.56%、25.58%、13.95%,流感病毒檢出率則大大降低,僅為13.95%,甲型流感病毒僅有新甲型H1N1檢出,乙型流感病毒僅有B型Yamagata檢出,分別占4.65%與9.30%。2019年病原譜以流感病毒為主(67.60%),除H7N9亞型之外,其余4種亞型均有檢出,以新甲型H1N1與B型Victoria為主。2020年以呼吸道合胞病毒和人副流感Ⅲ型病毒為主(各占37.5%),流感病毒僅占8.34%。見表3。
住院肺炎患者中,男性、女性病毒病原譜差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=7.68,P>0.05),主要病原均為流感病毒和呼吸道合胞病毒。
4個(gè)年齡組中,所占比例最大的均為流感病毒和呼吸道合胞病毒,其次為人腸道病毒和副流感病毒Ⅲ型。4個(gè)年齡組病毒病原譜構(gòu)成差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=27.33,P<0.05)。見表4。
表4 不同年齡患者病毒病原譜 例(%)
本研究通過對(duì)揚(yáng)州市住院肺炎患者開展常見呼吸道病毒主動(dòng)監(jiān)測(cè),初步了解了揚(yáng)州地區(qū)住院肺炎患者病毒病原構(gòu)成及流行情況。2017—2020年,揚(yáng)州地區(qū)住院肺炎患者呼吸道病毒總檢出率為13.18%,低于相關(guān)文獻(xiàn)中發(fā)熱呼吸道人群監(jiān)測(cè)中的病毒總陽性率[11-12],可能是住院肺炎患者病程已經(jīng)進(jìn)展了一段時(shí)間,多數(shù)經(jīng)過了抗病毒藥物治療,導(dǎo)致病毒檢出率有所下降;除此之外,本研究病原學(xué)監(jiān)測(cè)只針對(duì)常見的5種呼吸道病毒,病毒檢測(cè)范圍小于相關(guān)文獻(xiàn)的8~9種,可能會(huì)使病毒檢出率有所下降。本研究病毒檢出時(shí)間分布結(jié)果顯示,2017年住院肺炎患者中呼吸道病毒陽性檢出高峰主要集中在3~5月和11~12月,2018年集中在7月和9月,2019年集中在1~3月和12月,2020年僅有9月1個(gè)小高峰,這和相應(yīng)病毒的流行高發(fā)季節(jié)基本能夠一一對(duì)應(yīng)。流感病毒的流行季節(jié)以冬春季為主,人腸道病毒的流行季節(jié)為夏秋季,人副流感病毒Ⅲ型則是全年都有流行。本研究中,呼吸道合胞病毒為秋冬季流行,與相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的流行季節(jié)為冬春季[11-12]略有不同,可能與地域、樣本來源、樣本基數(shù)不同有關(guān)。本研究由于病毒總體陽性檢出率不高,各病毒流行趨勢(shì)無法根據(jù)數(shù)據(jù)描述發(fā)病與年齡、季節(jié)等相關(guān)的流行病學(xué)特征,有待于日后進(jìn)一步監(jiān)測(cè),擴(kuò)充數(shù)據(jù)后進(jìn)行描述。本研究結(jié)果顯示,揚(yáng)州地區(qū)2020年呼吸道病毒陽性檢出率顯著下降,流感病毒在1~3月零星出現(xiàn)過后一直未有檢出,可能與2020年新型冠狀病毒肺炎疫情發(fā)生后采取的嚴(yán)格隔離防范措施密切相關(guān)。
本研究不同性別住院肺炎患者呼吸道病毒檢出結(jié)果顯示,男性患者病毒陽性檢出率低于女性,與相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的男性更易感呼吸道病毒[13-15]的結(jié)論不一致,這可能是因?yàn)闃颖緛碓床煌瑢?dǎo)致的。但也有研究結(jié)果表明,女性感染呼吸道病毒,其臨床癥狀可能更為嚴(yán)重,住院肺炎患者一般處于呼吸道感染癥狀較為嚴(yán)重的階段,本研究結(jié)果是否可提示女性感染呼吸道病毒更易發(fā)展為肺炎,需要進(jìn)一步的監(jiān)測(cè)結(jié)果加以驗(yàn)證。
本研究不同年齡患者病毒檢出率差異極顯著,0~6歲兒童的陽性檢出率最高,表明學(xué)齡前兒童免疫力較低,在幼托機(jī)構(gòu)等場(chǎng)所容易交叉感染呼吸道病毒,與文獻(xiàn)報(bào)道[16-19]一致,且易進(jìn)展為肺炎,而≥60歲老年患者病例數(shù)僅次于0~6歲兒童,但陽性檢出率最低,表明≥60歲老年人由于抵抗力下降,呼吸道感染容易進(jìn)展為肺炎,但病毒性感染不是主要原因。
綜上所述,2017—2020年揚(yáng)州地區(qū)住院肺炎患者呼吸道病毒流行季節(jié)及病原譜每年均有所不同,但主要病原為流感病毒和呼吸道合胞病毒,應(yīng)加強(qiáng)呼吸道病毒監(jiān)測(cè),將流感病毒及呼吸道合胞病毒作為呼吸道感染防控重點(diǎn)。