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    HLA-DQB1*02:106鑒定和相關(guān)單體型分析及蛋白三級結(jié)構(gòu)分析①

    2021-11-25 09:22:28王天菊李恒新王滿妮王小芳西安市中心血站HLA高分辨分型確認(rèn)實(shí)驗室西安710061
    中國免疫學(xué)雜志 2021年19期
    關(guān)鍵詞:外顯子等位基因單體

    王天菊 齊 珺 李恒新 王滿妮 王小芳 (西安市中心血站HLA高分辨分型確認(rèn)實(shí)驗室,西安710061)

    人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)位于染色體6p21.3 區(qū)域,與機(jī)體自我識別和免疫應(yīng)答密切相關(guān),在人類遺傳學(xué)、移植免疫學(xué)、輸血醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域中發(fā)揮重要作用[1-5]。精準(zhǔn)的HLA 分型技術(shù)促使越來越多的HLA 等位基因被發(fā)現(xiàn)和鑒定,為造血干細(xì)胞移植、疾病相關(guān)性研究、群體遺傳學(xué)等提供數(shù)據(jù)支持。截至2020 年4 月,IMGT/HLA數(shù)據(jù)庫 3.40 版(http://www. ebi. ac. uk/ipd/imgt/hla/stats)報道已發(fā)現(xiàn)的HLA 等位基因有27 258 個,其中HLA-DQB1等位基因有1 826個。HLA-DQB1位點(diǎn)屬于HLA-Ⅱ類分子基因位點(diǎn),與HLA-A/B/C/DRB1 位點(diǎn)相比,多態(tài)性較少,隨著對HLA-DQB1 位點(diǎn)研究的逐漸深入,發(fā)現(xiàn)其與自身免疫性疾病、感染性疾病、腫瘤等有相關(guān)性。另外,HLA-DQB1抗原是移植免疫中最重要的抗原之一,2006 年HORN等[6]提出應(yīng)將HLA-DQB1 分型列入造血干細(xì)胞移植前的組織配型實(shí)驗中,其在造血干細(xì)胞移植中的作用也逐漸被認(rèn)知和總結(jié)。

    作者所在實(shí)驗室應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-直接測序法(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)和序列特異性寡核苷酸探針(polymerase chain reaction-sequence-specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)對臨床異基因造血干細(xì)胞移植前HLA 高分辨確認(rèn)分型時,發(fā)現(xiàn)HLA-DQB1 位點(diǎn)分型結(jié)果存在模棱兩可,進(jìn)一步采用基于Ion Torrent S5測序系統(tǒng)的下一代測序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)進(jìn)行鑒別,鑒定出一個罕見HLADQB1 等位基因 HLA-DQB1*02:106,通過對變異氨基酸在其三級結(jié)構(gòu)中的位置比對和模擬分析,進(jìn)一步分析變異氨基酸是否影響分子的高級結(jié)構(gòu)。將罕見等位基因與經(jīng)家系調(diào)查總結(jié)出其相應(yīng)的HLAA/B/C/DRB1/DQB1 單體型,查詢其在不同人種中的分布,現(xiàn)報告如下。

    1 資料與方法

    1.1 資料

    1.1.1 樣本來源 先證者為西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院血液內(nèi)科就診的一名急性髓細(xì)胞白血病患者,陜西籍,漢族,女性,在本實(shí)驗室HLA 高分辨分型中因HLA-DQB1 位點(diǎn)分型結(jié)果存在模棱兩可而進(jìn)一步確認(rèn)。先證者及其親屬,包括父親、母親、弟弟均為陜西籍,經(jīng)患者及家屬知情同意后采集靜脈血2管(EDTA抗凝管,5 ml/管)。

    1.1.2 主要試劑與設(shè)備 血液基因組DNA 提取試劑盒(北京TIANGEN,批號S7709);Magcore DNA 提取試劑盒(中國臺灣芮寶公司);HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 SecoreTMSBT 分型試劑(美國Thermo Fisher Life Technologies 公司);HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 SSO 高分辨分型試劑(美國 One Lambda 公司);NX TypeTMNGS 測序試劑(美國Thermo Fisher Scientific公司)。核酸蛋白定量檢測儀(美國,GeneQuant pro);全自動核酸提取儀(中國臺灣芮寶公司);PCR擴(kuò)增儀(德國SENSO 公司,Sensoquest Labcycler);全自動DNA 測序分析儀(美國ABI公司,ABI-3730xl);FLEXMAP-3DTM熒光磁珠流式分析儀(美國Lunimex公司);Ion Torrent S5TM測序儀(美國Thermo Fisher Scientific公司)。

    1.2 方法

    1.2.1 兩種方法提取基因組DNA 制備 分別采用血液基因組DNA 提取試劑盒(提取DNA 標(biāo)識此樣本①號)和Magcore自動提取儀(提取DNA 標(biāo)識此樣本②號)嚴(yán)格按照試劑操作說明提取血液基因組DNA,進(jìn)行濃度和純度的檢測并標(biāo)識,提取DNA的濃度范圍為20~80 ng/μl,純度A260n/mA280nm為1.6~1.9。

    1.2.2 PCR-SBT 分型 采用 SeCore?HLA-SBT 分型試劑盒對該樣本進(jìn)行常規(guī)高分辨的HLA 基因分型(批號 HLA-A:007,HLA-B:010,HLA-C:006,HLA-DRB1:008,HLA-DQB1:008)。對 1.2.1 提取的 DNA 進(jìn)行 HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 位點(diǎn) PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物用ExoⅠ/SAP 酶純化后,對HLA-A/B進(jìn)行第1~5外顯子正反向測序反應(yīng),C 位點(diǎn)進(jìn)行1~7外顯子正反向測序反應(yīng),HLA-DRB1 進(jìn)行第2 外顯子正反向及Condon86 正向測序反應(yīng),DQB1 位點(diǎn)進(jìn)行2、3 外顯子正反向測序反應(yīng)。測序產(chǎn)物再經(jīng)乙醇/醋酸鈉沉淀,95℃熱變性迅速冷卻后的產(chǎn)物用ABI 測序儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳,將電泳序列導(dǎo)入uTYPE 7.2 分析軟件進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn)HLA-DQB1 位點(diǎn)存在模棱兩可組合,無法區(qū)分。

    1.2.3 PCR-SSO 分型 采用 LABType SSO 試劑對1.2.1 提取的①號DNA 進(jìn)行HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 5 個位點(diǎn)的特異性擴(kuò)增。在雜交板加入1.5 μl變性液,吸取3.0 μl擴(kuò)增產(chǎn)物與變性液混合,室溫反應(yīng)10 min。每孔加入中和液,將按比例稀釋的磁珠加入各孔,60℃孵育15 min 后加入洗滌液,4 000/rmin 離心 5 min,棄上清液,重復(fù) 3 次洗滌步驟。加入熒光標(biāo)記,60℃孵育5 min,洗滌1 次后加入緩沖液,轉(zhuǎn)移到上機(jī)板后放入Luminex 3D 熒光磁珠流式分析儀讀取數(shù)據(jù),分析軟件為One Lambda HLA Fusion 4.2。

    1.2.4 NGS 主要分為文庫制備、模板制備、測序反應(yīng)和數(shù)據(jù)分析三大步驟。

    1.2.4.1 文庫制備 測定DNA 濃度后均一化,采用NXTypeTMNGS 試劑擴(kuò)增HLA-A/B/C 位點(diǎn)全長,HLA-DRB1/DQB1 位點(diǎn)第2~6 外顯子。擴(kuò)增產(chǎn)物純化和定量后,濃度均一化。將處理好的產(chǎn)物片段化,接頭連接,末端修復(fù),加標(biāo)簽,磁珠純化選擇300~1 000 bp 長度的目標(biāo)片段。二次擴(kuò)增,純化和定量后,將HLAⅠ類和Ⅱ類產(chǎn)物進(jìn)行等摩爾混合。

    1.2.4.2 模板制備 將50 μl 制備好的文庫加入Ion S5 ExT Chef Reagents 試劑盒指定管中進(jìn)行單克隆擴(kuò)增。

    1.2.4.3 測序反應(yīng)和數(shù)據(jù)分析 將擴(kuò)增產(chǎn)物加載至Ion 530TMChip 芯片,在Ion S5 測序平臺上加入4 種脫氧核苷酸,開始測序反應(yīng),采用Type Stream Visual 軟件指定 HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 等位點(diǎn)基因型。

    1.2.5 家系單體型分析及地區(qū)分布分析 通過家系分析,推導(dǎo)含有HLA-DQB1*02:106 的HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 5 位點(diǎn)單體型。在HaploStats 網(wǎng)站(http://www. HaploStats. org)查詢該單體型在不同人種的分布情況。

    1.2.6 HLA-DQB1*02:01:01:01 與 HLA-DQB1*02:106 編碼蛋白三維空間結(jié)構(gòu)預(yù)測分析 IMGT/HLA 查詢 HLA-DQB1*02:106 氨基酸序列,提交SWISS MODEL(https://swissmodel. expasy. org/)進(jìn)行同源建模,選定 PDB 數(shù)據(jù)庫 ID 號為 5KSU[7]作為模板進(jìn)行兩分子間結(jié)構(gòu)和差異氨基酸的比較,找出差異氨基酸的位置并標(biāo)明氨基酸結(jié)構(gòu)差異。將HLA-DQB1*02:01:01:01 分子外顯子 2 的氨基酸、外顯子 2 和 3 的氨基酸,HLA-DQB1*02:106 分子外顯子2的氨基酸、外顯子2和3的氨基酸序列分別提交Phyre2蛋白折疊識別建模在線軟件(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/htm/lpage.cgi?id=index),下載得到的pdb 格式文件。將相應(yīng)文件導(dǎo)入FATCAT(http://fatcat.godziklab.org/)[8]在線比對分析兩者結(jié)構(gòu),以兩分子間的均方根偏差(RMSD,單位nm)作為表示兩分子結(jié)構(gòu)大小的參數(shù)。

    2 結(jié)果

    2.1 PCR-SBT 分型結(jié)果 先證者HLA-A/B/C/DRB1 位點(diǎn) PCR-SBT 分型結(jié)果分別為 A*02:06,31:01;B*13:01,35:08;C*03:04,04:01;DRB1*03:01,15:01。DQB1 位點(diǎn)的分型結(jié)果為模棱兩可組合02:01,06:109 與02:106,06:02,無法確定唯一高分指定結(jié)果,與常見等位基因組合02:01,06:02 組合相比,在619位核苷酸有差異。常見等位基因組合02:01,06:02 在619 位為G,模棱兩可組合為R(A+G),見圖1。

    圖1 該樣本HLA-DQB1位點(diǎn)測序結(jié)果Fig.1 Sequencing results of HLA-DQB1 locus of the sample

    2.2 PCR-SSO 分型 先證者 HLA-A/B/C/DRB1 位點(diǎn)PCR-SSO 分型結(jié)果分別為A*02:06:01G,31:01:02G;B*13:01:01G,35:08:01G;C*03:04:01G,04:01:01G;DRB1*03:01:01G,15:01:01G。DQB1 位點(diǎn)分型結(jié)果為 DQB1*02:01:01G(G 組包含 02:106),06:02:01G(G 組包含06:109)。擴(kuò)增值良好,未發(fā)現(xiàn)有異常反應(yīng)的磁珠,但結(jié)果為模棱兩可組合,無法區(qū)分(圖2)。

    圖2 HLA-DQB1位點(diǎn)Luminex SSO 分型結(jié)果Fig.2 HLA-DQB1 locus Lumines SSO results

    2.3 NGS 結(jié)果 經(jīng)NGS 方法驗證,該樣本HLA-A/B/C/DRB1 位點(diǎn)分型結(jié)果與PCR-SBT 和PCR-SSO兩種方法檢測結(jié)果相同,HLA-DQB1 結(jié)果確定為02:106,06:02。

    2.4 DQB1*02:106 與 DQB1*02:01:01:01 核苷酸和氨基酸序列比對 與DQB1*02:01:01:01 相比,DQB1*02:106 在第 3 外顯子 619 位置有一個氨基酸的差異,DQB1*02:01:01:01 為 G,DQB1*02:106 為A,造成第175位氨基酸由非極性疏水性氨基酸纈氨酸Val(GTG)變成極性中性氨基酸蛋氨酸Met(ATG),見圖3。

    圖3 DQB1*02:106 與 DQB1*02:01:01:01 差異核苷酸和氨基酸比較Fig.3 Comparison of nucleotide and amino acid differ?ence between DQB1*02:106 and DQB1*02:01:01:01

    2.5 HLA-DQB1*02:01:01:01 與 HLA-DQB1*02:106 三維同源建模與分子間RMSD HLA-DQB1*02:106 分子與氨基酸序列最接近HLA-DQB1*02:01:01:01分子相比,差異氨基酸位于β2鏈β折疊的部分,接近β2 鏈的尾端。經(jīng)FATCAT 在線軟件對三維結(jié)果的比對分析,含有183 個氨基酸的HLADQB1*02:106 與 HLA-DQB1*02:01:01:01 分 子RMSD值為1.65,見圖4。

    圖4 HLA-DQB1*02:106 與 HLA-DQB1*02:01:01:01 差異氨基酸和三維結(jié)構(gòu)比較Fig.4 Comparisons of difference amino acid and threedimensional structure of HLA-DQB1*02:106 and HLA-DQB1*02:01:01:01 molecule models

    2.6 通過家系單體型分析及地區(qū)分布分析 根據(jù)家系分析先證者的HLA 兩條單體型為A*31:01-B*15:18-C*04:01-DRB1*03:01-DQB1*02:106 和 A*02:06-B*13:01-C*03:04-DRB1*15:01-DQB1*06:02。經(jīng)家系分析該等位基因遺傳于父親,見圖5。

    圖5 先證者HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 5 位點(diǎn)單體型家系分析Fig.5 Pedigree analysis of HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 haplotype

    2.7 查詢單體型地區(qū)分布 在HaploStats(http://www.HaploStats.org)在線數(shù)據(jù)庫查詢單體型A*31:01-B*15:18-C*04:01-DRB1*03:01-DQB1*02:106在世界所有人群中的分布,未查詢到該單體型的分布。以HLA-DQB1*02:106 查詢無相關(guān)單體型。以單體型 A*31:01-B*15:18-DRB1*03:01-DQB1*02:01 查詢到的單體型有3 種,相關(guān)聯(lián)的C 位點(diǎn)等位基因不同,單體型和頻率如表1。A*31:01-C*03:03-B*15:18-DRB1*03:01-DQB1*02:01 在西班牙人種中頻率最高(5.712E-8),在高加索人種的頻率為2.391E-8,在非裔美國人頻率為7.542E-10,亞洲和太平洋島民和印第安人未發(fā)現(xiàn)該單體型。A*31:01-C*07:01-B*15:18-DRB1*03:01-DQB1*02:01 僅在非裔美國人種發(fā)現(xiàn)。A*31:01-C*07:04-B*15:18-DRB1*03:01-DQB1*02:01在非裔美國人種,高加索人種,西班牙人種都有發(fā)現(xiàn)。

    表1 A*31:01-B*15:18-DRB1*03:01相關(guān)單體型在不同人種的分布Tab.1 Distribution of A*31:01-B*15:18-DRB1*03:01 related haplotypes in different races

    3 討論

    目前,應(yīng)用于臨床HLA 的檢測方法主要有序列特異性寡核苷酸探針、序列特異性引物、PCR-SBT、NGS 等[9-11]。PCR-SBT 被譽(yù)為 HLA 基因分型的金標(biāo)準(zhǔn),由于測序結(jié)果存在多種等位基因組合在檢測區(qū)域內(nèi)具有相同的雜合序列,模棱兩可組合出現(xiàn)越來越多[12-13]。NGS技術(shù)應(yīng)用于HLA 等位基因測序主要有兩個優(yōu)勢,第一,針對HLA 單鏈測序,分別得到特定單一等位基因序列,很大程度上減少了模棱兩可的結(jié)果;第二,NGS 技術(shù)針對HLA 位點(diǎn)整個基因組序列進(jìn)行測定,得到的HLA 分型結(jié)果更精準(zhǔn)。本次臨床HLA 檢測工作中,HLA-DQB1 測序分析的結(jié)果為常見等位基因+罕見等位基因模棱兩可組合(DQB1*02:01:01+06:109 和DQB1*02:106+06:02:01:01),PCR-SSO 及檢測結(jié)果為 DQB1*02:01G(包含DQB1*02:106)+06:02G(包含DQB1*06:109),這兩種方法均無法確定唯一高分辨結(jié)果。經(jīng)NGS 技術(shù)鑒定,該樣本HLA-DQB1 位點(diǎn)最終結(jié)果為DQB1*02:106,06:02:01:01。至此,最終確定該樣本HLADQB1 位點(diǎn)的結(jié)果為罕見等位基因DQB1*02:106 與常見等位基因DQB1*06:02:01:01組合。

    根據(jù) IMGT/HLA 數(shù)據(jù)庫(版本 3.40.0,2020 年4 月發(fā)布),共有1 826 種HLA-DQB1 等位基因,根據(jù)中國常見及確認(rèn)HLA 等位基因CWD 表2.4 版,HLA-DQB1 位點(diǎn)常見及確認(rèn)等位基因有60 種,罕見等位基因占95.36%。HLA-DQB1*02組共有228種等位基因,常見等位基因有4 種:HLA-DQB1*02:01,HLA-DQB1*02:02,HLA-DQB1*02:03,HLADQB1*02:12,提示雖然HLA 等位基因眾多,但罕見等位基因占了大多數(shù),約40%的HLA 等位基因只被報道過 1 次。DQB1*02:106 在 2018 年首次被瑞士報道后,未查詢到在其他實(shí)驗室和人種的關(guān)于此等位基因和單體型的相關(guān)報道,直到本次被再次檢測到并且有相關(guān)單體型,因此需要在臨床檢測工作中不斷地對罕見等位基因和單倍型進(jìn)行分析和總結(jié),對于研究人群特異性免疫遺傳學(xué)基礎(chǔ)和臨床移植免疫有重要意義。

    HLA 抗原具有高度遺傳多態(tài)性,主要表現(xiàn)在同一基因座位等位基因的高度多態(tài)性,在機(jī)體的免疫應(yīng)答啟動和免疫調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用,HLA-DQB1*02:01 與疾病間的相關(guān)性研究已有諸多報道。HJELMSTR?M 等[14]報道 HLA-DQB1*02:01 與重癥肌無力發(fā)病呈陽性關(guān)聯(lián),Ala57β于早期發(fā)病患者中頻率升高。HLA-DQB1*02:01 在伊朗人群中與1 型糖尿病顯著相關(guān),與韓國兒童1 型糖尿病抗胰島素抗體相關(guān)[15-16]。在印度南部人群中HLA-DQB1*02:01是自身免疫性甲狀腺疾病的保護(hù)性等位基因,Ala86β、Tyr87β、Gly26β、Ser74β、Phe9β和 Ser57β是 自 身免 疫性甲狀腺疾病的保護(hù)性氨基酸殘基[17]。HLADQB1*02 與慢性丙型肝炎感染和干燥綜合癥相關(guān)[18]。關(guān)于HLA-DQB1 位點(diǎn)的等位基因和氨基酸殘基與疾病相關(guān)的研究都是針對HLA-DQB1 等位基因 Exon2 編碼的 β1 鏈的 90 個氨基酸,因為 β1 鏈?zhǔn)亲罹叨鄳B(tài)性的部位,同時也是與抗原肽結(jié)合的部位。Exon3 編碼的β2 鏈?zhǔn)敲庖咔虻鞍讟訁^(qū),作用主要為與T 細(xì)胞的CD4 分子結(jié)合和穩(wěn)定HLA Ⅱ類分子的結(jié)構(gòu)。DQB1*02:106 核苷酸序列與DQB1*02:01:01:01 相比,只在 619 位有一個核苷酸的差異(G>A),導(dǎo)致 β2 鏈 175 位氨基酸由纈氨酸(GTG,Val)變?yōu)榈鞍彼幔ˋTG,Met),該位置的氨基酸變化是否會影響HLA 分子與抗原肽結(jié)合,還需在后續(xù)的研究中探討。在對HLA 等位基因與疾病相關(guān)性研究中,為了確保檢驗效能,一般不統(tǒng)計分析頻率小于2%的等位基因,罕見等位基因如HLA-DQB1*02:106 通常不被計算。自 2010 年 4 月起,HLA 命名委員會基于抗原結(jié)合槽核苷酸序列相同(HLAⅠ類等位基因外顯子2、3 核苷酸序列相同和HLA Ⅱ類抗原外顯子2 序列相同)將HLA 等位基因分為不同的G 組,HLA-DQB1*02:106 屬于 HLA-DQB1*02:01:01G,在病例對照研究中,是否應(yīng)該基于G 組進(jìn)行頻率的差異統(tǒng)計,分析與疾病相關(guān)性的等位基因組,有待于進(jìn)一步研究。

    在異基因造血干細(xì)胞移植中,HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 是影響移植存活率的主要因素之一。與HLA-A/B/C 分子相比,HLA-DQB1 分子在細(xì)胞表面的表達(dá)量少,多態(tài)性少,與HLA-DRB1 位點(diǎn)的等位基因呈強(qiáng)連鎖不平衡,直到2006年才被確認(rèn)為異基因造血干細(xì)胞移植前必須檢測的HLA 等位基因之一。隨著異基因造血干細(xì)胞移植技術(shù)的廣泛開展,HLA 不完全相合移植在逐漸增多。HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 等位基因錯配對異基因造血干細(xì)胞移植后效果的評估由只是單純統(tǒng)計不相合等位基因的個數(shù)逐漸向基因功能和表達(dá)量分析轉(zhuǎn)變[19-20]。目前對DQB1 位點(diǎn)異基因移植錯配后是否會引起移植物抗宿主?。╣raft versus host disease,GVHD)還沒有統(tǒng)一的結(jié)論。在一項德國人群移植后回顧性分析發(fā)現(xiàn),DQB1 等位基因不相合與其他HLA 等位基因不相合有相同的危險比[21],但在一項HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 9/10 匹配臨床回顧性研究發(fā)現(xiàn),與HLA-A,-B,-C 位點(diǎn)的不相合相比,DRB1/DQB1 有些錯配是允許的[22]。目前在可允許錯配方面還沒有建立統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),一些采用交叉反應(yīng)組,還有一些采用氨基酸殘基匹配方案。這兩種方案都是建立在抗原結(jié)合槽的基礎(chǔ)上,分析HLA-Ⅰ類抗原α1和 α2 區(qū)域和 HLA-Ⅱ類抗原的 β1 區(qū)域。HLA 分子關(guān)鍵位置的氨基酸替換會引起嚴(yán)重的急性GVHD[20,23]。與HLA-DQB1*02:01氨基酸序列相比,HLA-DQB1*02:106 盡管只在 175 位有一個氨基酸的差異,由非極性疏水性氨基酸纈氨酸(GTG,Val)變?yōu)闃O性中性氨基酸蛋氨酸(ATG,Met),但氨基酸側(cè)鏈大小不同可能會導(dǎo)致HLA 分子空間結(jié)構(gòu)不同,僅1個氨基酸的差別也可引起HLA分子三維結(jié)構(gòu)明顯變化;而HLA-DQB1*02:106 與HLA-DQB1*02:01的RMSD 值為1.65,分子間結(jié)構(gòu)差異較大。既往研究表明,供受體之間HLA-Ⅱ類分子間RMSD 值大于0.02 nm,極有可能發(fā)生嚴(yán)重的 GVHD[24]。DQB1*02:106 與 DQB1*02:01 分子錯配移植是否會發(fā)生GVHD,需要建立在HLA 三維結(jié)構(gòu)和功能基礎(chǔ)上的對異基因造血干細(xì)胞移植后GVHD、總生存率、移植后是否產(chǎn)生HLA 分子的抗體產(chǎn)生等方面回顧性研究來最終確定。

    HLA 高度的多態(tài)性使得異基因造血干細(xì)胞移植供受者之間HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 位點(diǎn)10/10 完全匹配的可能性降低,尤其是攜帶罕見等位基因的患者,找到全相合無關(guān)異基因捐獻(xiàn)者的可能性更低。某些罕見基因可能與某些單體型關(guān)聯(lián)或僅存在于保守的單體型中,本次臨床檢測樣本HLADQB1 位點(diǎn)的結(jié)果為 HLA-DQB1*02:106,家系分析其 相 關(guān) 單 體 型 為 A*31:01-B*15:18-C*04:01-DRB1*03:01-DQB1*02:106,來源于先證者父親,并且穩(wěn)定遺傳至先證者和弟弟,可以進(jìn)行親緣的半相合造血干細(xì)胞移植?;诩蚁捣治龅任换蚝蛦误w型,在相同的遺傳背景下更容易找到相合的供者。

    本研究基于在臨床HLA 高分辨確認(rèn)分型實(shí)驗中檢出HLA-DQB1 模棱兩可組合,經(jīng)NGS 確認(rèn)為HLA-DQB1*02:106,進(jìn)一步分析該等位基因核苷酸和氨基酸序列及對三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測和比對分析,同時對先證者進(jìn)行家系分析確定HLA-DQB1*02:106 相關(guān)的單體型并查詢該單體型在不同人群的分布,對罕見等位基因和單體型的總結(jié)研究為臨床指導(dǎo)非親緣造血干細(xì)胞移植供者的選擇提供理論依據(jù),保證攜帶確認(rèn)和罕見等位基因的患者最大可能地找到匹配的供者。

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