孔桂萍,劉志峰,金 玉,鄭必霞,閆坤龍*
1南京醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院消化科,2兒科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 210008
Rubinstein?Taybi 綜合征(Rubinstein?Taybi syn?drome,RSTS)是一種非常罕見(jiàn)的常染色體顯性遺傳病,1963 年由Jack Rubinstein 和Hooting Taybi 首次報(bào)道[1],發(fā)病率約為1∶125 000[2]。該病主要表現(xiàn)為智力低下、生長(zhǎng)發(fā)育落后,寬而扁的拇指及第一腳趾以及特殊面容,包括高眉弓、長(zhǎng)睫毛、眼裂下斜、鉤狀鼻、小下顎等[3]。本文對(duì)臨床上高度懷疑該綜合征的1例患兒采用二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行相關(guān)基因檢測(cè),發(fā)現(xiàn)CREBBP基因突變后,用Sanger測(cè)序法驗(yàn)證患兒父母是否有該類型突變,并對(duì)臨床表現(xiàn)和基因型進(jìn)行分析,現(xiàn)報(bào)告如下。
患兒,男,4月齡,2014年11月因“發(fā)熱4 d,咳嗽3 d”于我院就診?;純簽镚1P1,41周順產(chǎn)娩出,生時(shí)羊水清亮,新生兒Apgar評(píng)分9分,出生體重3.3 kg,身長(zhǎng)47 cm。出生即發(fā)現(xiàn)頭發(fā)、眉毛、睫毛黑而濃密,寬而扁的拇指。生后體重增長(zhǎng)慢,目前不能注視追人和與人眼神交流,不能抬頭,雙手不會(huì)主動(dòng)拿物。父母體健,非近親婚配。否認(rèn)家族中有類似疾病患者。既往因先天性隔疝、反復(fù)肺部感染多次住院治療,每次感染后血象均增高明顯[白細(xì)胞(19~35)×10-9/L]。
入院查體:體溫37.2 ℃,脈搏132 次/min,呼吸42次/min,體重7 kg,身高58 cm(低于正常同齡男童參考值第3百分位點(diǎn)),上部量36 cm,下部量22 cm,指間距49 cm,頭圍36.5 cm(低于正常同齡男童參考值第3百分位點(diǎn)),前囟平軟1.5 cm×1.5 cm。頭發(fā)濃密,發(fā)絲粗黑,質(zhì)硬,前后發(fā)際低,眉毛粗長(zhǎng),色黑,高拱形眉弓;雙內(nèi)眥贅皮,雙眼裂下斜,鼻外形正常;口唇紅潤(rùn),腭弓高,牙齒未萌出。耳位低。心肺檢查未見(jiàn)異常,腹部稍膨隆,肝臟肋下2 cm,質(zhì)軟,脾臟肋下未觸及。雙手無(wú)通貫掌,雙拇指及拇趾寬;陰莖發(fā)育正常,雙側(cè)睪丸觸及。肌力及肌張力偏低,胸骨、肋骨和脊柱正常,病理征未引出(圖1)。入院診斷為:支氣管肺炎、先天性隔疝、精神運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲滯。頭顱CT、MRI、體液免疫、細(xì)胞免疫、血氨基酸及尿有機(jī)酸代謝篩查均無(wú)明顯異常。
圖1 患兒臨床表現(xiàn)
5 月齡時(shí)(2014 年12 月)因先天性隔疝于我院胸外科行隔疝修補(bǔ)術(shù)。7月齡時(shí)行智能發(fā)育量表評(píng)分,智力發(fā)育指數(shù)(MDI)、運(yùn)動(dòng)發(fā)育指數(shù)(PDI)均<50,評(píng)價(jià)相當(dāng)于4.4月齡。
征得父母知情同意后,取患兒及其父母外周靜脈抗凝血2 mL,基因全外顯子測(cè)序由北京智因東方轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心協(xié)助完成。使用BloodGen Midi Kit(北京康為世紀(jì)生物科技有限公司)提取患者全基因組DNA,構(gòu)建文庫(kù),應(yīng)用Illumina Hiseq XTen 平臺(tái)對(duì)全基因組進(jìn)行高通量測(cè)序,利用Illumina 官方basecall 分析軟件BclToFastq 得到原始數(shù)據(jù)(raw data)。測(cè)序數(shù)據(jù)運(yùn)用BWA 軟件與UCSC 數(shù)據(jù)庫(kù)提供的人類基因組hg19 參考序列進(jìn)行比對(duì)。根據(jù)測(cè)序深度,突變質(zhì)量,對(duì)檢測(cè)得到的單核苷酸多態(tài)性(SNP),插入或缺失(InDel)進(jìn)行過(guò)濾篩選,得到高質(zhì)量可靠的突變。使用SIFT利用基于同源比對(duì),蛋白結(jié)構(gòu)的保守性等的算法,預(yù)測(cè)篩選出的變異對(duì)蛋白質(zhì)的影響。對(duì)明確或可能與受檢者臨床表型相關(guān)的基因突變,采用一代測(cè)序(Sanger法)驗(yàn)證。
經(jīng)過(guò)測(cè)序,患兒存在CREBBP基因27號(hào)外顯子上的復(fù)雜移碼突變:c.4499至c.4493缺失TGCAGTC插入AAGCA(圖2)。該突變?cè)谇藬?shù)據(jù)庫(kù)、dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù)及hapmap 數(shù)據(jù)庫(kù)中沒(méi)有查到相關(guān)記載,缺失/插入突變的致病性明確,根據(jù)氨基酸的保守性、公共數(shù)據(jù)庫(kù)資料和患兒典型臨床表現(xiàn),定義為致病突變,最終診斷為RSTS。其父母標(biāo)本檢測(cè)未發(fā)現(xiàn)有該基因位點(diǎn)的突變,患兒為de novo變異。
圖2 基因測(cè)序圖
作為多系統(tǒng)疾病,RSTS 的主要特征為3 類:顱面畸形、骨骼畸形以及生長(zhǎng)和精神運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲滯。此外,還可伴發(fā)其他表現(xiàn),如眼瞼下垂、白內(nèi)障、青光眼,先天性心臟疾病,泌尿系統(tǒng)畸形、多毛、前額紅斑、瘢痕皮膚、惡性腫瘤等[3-4]。嬰兒期開(kāi)始出現(xiàn)明顯生長(zhǎng)發(fā)育落后,通常低于同齡兒童參考值第15百分位水平。智商平均在35~50 分,但也有智商在正常低限的報(bào)道[5]。后期易出現(xiàn)注意力集中時(shí)間短、運(yùn)動(dòng)刻板印象、協(xié)調(diào)性差等行為異常[6],青春期會(huì)有焦慮,情緒不穩(wěn)和攻擊性行為等[3]。超過(guò)90%的病例可以存活到成年[7]。本文所述病例存在生長(zhǎng)和精神運(yùn)動(dòng)發(fā)育落后、寬而扁的拇指和第一腳趾、特殊面容、多毛等表現(xiàn),與RSTS 高度相符。該患兒同時(shí)還存在先天性隔疝,為該病的首次發(fā)現(xiàn)。
目前認(rèn)為,55%~70%的RSTS 病例來(lái)源于CREBBP基因突變[8],5%~8%源于EP300 基因突變[5],其余病例原因尚未明確[9]。CREBBP 基因位于染色體16p13.3,其同源物EP300位于染色體22q13.2,兩者均由相等數(shù)量的外顯子(31)組成。RSTS 發(fā)病機(jī)制尚不明確,已知CREBBP廣泛表達(dá),具有固有的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)活性,可作為支架通過(guò)染色質(zhì)重塑來(lái)穩(wěn)定與轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的其他蛋白質(zhì)相互作用,從而調(diào)節(jié)許多影響細(xì)胞途徑的基因表達(dá)[10]。CREBBP 變異可能導(dǎo)致CREB 結(jié)合蛋白被截短或被氨基酸取代,HAT 結(jié)構(gòu)域中的致病變異會(huì)干擾組蛋白的乙?;?,這是轉(zhuǎn)錄激活的重要步驟。EP300 編碼p300 轉(zhuǎn)錄激活蛋白,該蛋白與CREBBP 在氨基酸水平上具有63%的同源性,起HAT 的作用,通過(guò)染色質(zhì)重塑調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄,并在細(xì)胞增殖和分化中發(fā)揮重要作用。致病性變體導(dǎo)致P300 蛋白被截?cái)嗷虻任换虮磉_(dá)消失,這可能導(dǎo)致HAT 活性喪失[3-5]。本文所述病例發(fā)現(xiàn)CRBBP基因中一處新的移碼突變,為首次報(bào)道,推測(cè)患兒存在先天性膈疝可能與該新變異位點(diǎn)有關(guān),但兩者關(guān)系仍有待進(jìn)一步深入研究探討。
CREBBP 的突變譜由點(diǎn)變異(30%~50%)和缺失(~10%)組成[9],EP300 突變患者表型被認(rèn)為比CREBBP 突變的先證者要輕[5]。本例患兒為CREBBP基因復(fù)雜移碼突變,臨床表現(xiàn)典型,與文獻(xiàn)報(bào)道一致。由于具有高度變異性,迄今為止,有關(guān)RSTS基因型與臨床表現(xiàn)的關(guān)系尚無(wú)定論。
大多數(shù)RSTS病例報(bào)道為新發(fā)突變引起,僅有少數(shù)影響同胞的相關(guān)報(bào)道,垂直傳輸亦極為罕見(jiàn)[3]。如果先證者的父母受到影響和/或已知在先證者中鑒定出CREBBP 或EP300 致病變異,則同胞的風(fēng)險(xiǎn)為50%[7]。一旦確定了引起RSTS 的致病變體,就可以進(jìn)行產(chǎn)前檢測(cè),雖然該病再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)通常較低,但適當(dāng)?shù)倪z傳咨詢對(duì)于產(chǎn)前診斷還是必要的。
本例基因變異位點(diǎn)在國(guó)內(nèi)外屬首次發(fā)現(xiàn),臨床表現(xiàn)伴有先天性隔疝亦屬首次報(bào)道。RSTS 作為一種極為罕見(jiàn)、復(fù)雜的疾病,雖然已經(jīng)明確了一些臨床特征,但目前仍然存在許多未解決的問(wèn)題,仍需要進(jìn)行多中心研究,包括新生兒至成年階段,以擴(kuò)大對(duì)臨床表型的認(rèn)識(shí),確定不同基因型與表型的相關(guān)性,從而有助于早期識(shí)別診斷,及時(shí)干預(yù)。