石云雷
此前最受關(guān)注的是新冠病毒刺突蛋白上的D614G突變,去年6月,該變體成為全球范圍內(nèi)最主要的新冠病毒,能促進(jìn)病毒進(jìn)入人類細(xì)胞。但它并不位于受體結(jié)合域,因此不會(huì)影響疫苗的效果。但近期,一些新出現(xiàn)的新冠病毒突變毒株帶來(lái)了更大的威脅。
例如,在英國(guó)出現(xiàn)的有7個(gè)突變位于刺突蛋白上,其中關(guān)鍵的突變N501Y就存在于受體結(jié)合域,且在與病毒結(jié)合的序列中。它能增加新冠病毒與人細(xì)胞ACE2受體的親和力,加快病毒在人群中的傳播。除此之外,其刺突蛋白上的兩個(gè)氨基酸丟失,或可以幫助其逃避免疫反應(yīng);而P681H 突變可能還會(huì)增強(qiáng)它與細(xì)胞的融合能力。
但相比之下,在南非發(fā)現(xiàn)的501.V2突變株情況更加嚴(yán)重。它的刺突蛋白上存在9個(gè)突變,其中3個(gè)位于刺突蛋白的受體結(jié)合域,分別是N501Y、K417N和E484K。尤其值得注意的是,E484K也位于受體結(jié)合域的結(jié)合序列中。
3D打印的新冠病毒的刺突蛋白
前期檢測(cè)顯示,這一突變與病毒逃脫綜合性抗體的能力相關(guān),可能會(huì)影響一些靶向刺突蛋白疫苗的效果。此外,501.V2突變株的刺突蛋白上還存在3個(gè)氨基酸的丟失,這可能會(huì)影響新冠病毒的抗原性,進(jìn)而導(dǎo)致病毒出現(xiàn)“逃逸突變”,逃避單克隆抗體(單一的特異性抗體,能與刺突蛋白上特定的序列結(jié)合)的免疫反應(yīng)。
根據(jù)WHO官網(wǎng)的數(shù)據(jù),截至1月12日,B.1.1.7突變株已傳播到了50多個(gè)國(guó)家,它的傳播速度比此前傳播的其他新冠病毒株更快。另外截至目前,501.V2突變株已蔓延到29個(gè)國(guó)家。南非科學(xué)家和官員表示,501.V2突變株在年輕人中的流行度更高,相比于其他突變株,更容易造成嚴(yán)重的疾病,還可能造成“重大的再感染風(fēng)險(xiǎn)”。南非衛(wèi)生部也表示,這種突變株可能正在推動(dòng)南非的第二波新冠大流行,因?yàn)樗绕渌缙谕蛔冎甑膫鞑ニ俣雀臁?/p>
近期,發(fā)表于預(yù)印本平臺(tái)bioRxiv的多項(xiàng)研究,測(cè)試了目前使用的新冠疫苗、單克隆抗體和治療性血清對(duì)B.1.1.7突變株和501.V2突變株的作用效果。研究顯示,當(dāng)前的疫苗或許還對(duì)B.1.1.7突變株有效,但它們對(duì)501.V2突變株以及一些新的突變株的情況,或不容樂觀。
1月19日,輝瑞公司和BioNTech在預(yù)印本平臺(tái)bioRxiv上公布了BNT162b2疫苗對(duì)在英國(guó)發(fā)現(xiàn)的B.1.1.7突變株刺突蛋白的中和效果。他們利用水皰性口炎病毒(VSV)構(gòu)建了假病毒模型,即在病毒表面表達(dá)B.1.1.7突變株完整的刺突蛋白,并以此驗(yàn)證了BNT162b2接種個(gè)體的血清對(duì)它的中和效力。結(jié)果顯示,血清的中和活性沒有明顯降低,因此這一突變株或許不會(huì)影響B(tài)NT162b2疫苗產(chǎn)生的免疫保護(hù)。目前,這項(xiàng)研究還有待同行評(píng)議。
緊隨其后的是兩項(xiàng)評(píng)估501.V2突變株的研究(目前同樣在bioRxiv平臺(tái)上等待同行評(píng)議),來(lái)自美國(guó)和南非的研究人員分別測(cè)試了治療性血清、單克隆抗體對(duì)該突變株的抑制能力。
mRNA疫苗介導(dǎo)產(chǎn)生的多種抗體在新冠病毒受體結(jié)合域上的作用位點(diǎn)
其中,美國(guó)加州理工學(xué)院、洛克菲勒大學(xué)和NIH的科學(xué)家分析了mRNA-1273疫苗和BNT162b2疫苗介導(dǎo)的免疫反應(yīng)對(duì)501.V2突變株的中和效果。他們分別給14位和6位志愿者接種了mRNA-1273和BNT162b2疫苗,并收集和分析了他們的血清。在第2劑疫苗注射的8周后,志愿者血清中出現(xiàn)了很高的抵抗新冠病毒刺突蛋白、受體結(jié)合區(qū)域的特異性IgM和 IgG抗體。
他們通過(guò)在HIV-1型病毒構(gòu)建了假病毒模型,并評(píng)估了志愿者血清對(duì)10種突變的刺突蛋白的中和活性,其中包括N501Y(B1.1.7突變株)、K417N、E484K以及3個(gè)基因突變的組合(501Y.V2突變株)。結(jié)果顯示,與沒有突變的情況相比,血清對(duì)E484K、N501Y以及K417N:E484K:N501Y組合突變的刺突蛋白的中和活性出現(xiàn)了顯著降低,分別是3:1、2.5:1.3和3:1.1。
除此之外,他們還評(píng)估了記憶B細(xì)胞分泌的中和性抗體(共84種)對(duì)存在突變的病毒受體結(jié)合域突變的中和活性。有22種抗體(占比26%)對(duì)至少有一個(gè)突變的受體結(jié)合域的中和活性降低了5倍以上。
接種兩種疫苗后的血清,對(duì)3種突變的刺突蛋白的中和活性降低
而另一項(xiàng)由南非國(guó)家傳染病研究所(NICD)的科學(xué)家發(fā)表的研究,也得到了類似的結(jié)論。他們選擇了44份康復(fù)者的血清(其中22份血清的抗體濃度更高)進(jìn)行了研究,分析了這些血清對(duì)病毒的受體結(jié)合域和501.V2突變株的中和活性。研究顯示,27%的血清對(duì)比具有單一突變的受體結(jié)合域的假病毒,喪失了中和活性。而對(duì)501.V2突變株的評(píng)估顯示,近一半的血清沒有中和活性,有一些血清的中和活性降低達(dá)86倍。
在單克隆抗體中和效應(yīng)的實(shí)驗(yàn)中,南非的研究人員評(píng)估了12種抗體(第1類)對(duì)假病毒上刺突蛋白K417N突變,以及8種抗體(第2類)、5種納米抗體對(duì)E484K突變的中和活性。與沒有突變相比,第1類抗體的濃度提高2.5倍時(shí),仍無(wú)法中和假病毒上K417N突變的刺突蛋白。第2類抗體對(duì)E484K突變的受體結(jié)合域的中和活性也明顯降低。
這一結(jié)果顯示,501.V2突變株能逃避主要抗體的中和反應(yīng)。此外,他們還評(píng)估了501.V2突變株的刺突蛋白(抗原結(jié)構(gòu))上3個(gè)氨基酸丟失造成的影響。實(shí)驗(yàn)顯示,針對(duì)整個(gè)抗原結(jié)構(gòu)的抗體的中和反應(yīng)也會(huì)減弱。
美國(guó)的研究人員評(píng)估了17種最具治療潛力的單克隆抗體對(duì)假病毒上12種刺突蛋白突變(分別是A475V、E484K、Q493R、R346S、N439K、N440K、K417N、Y453F、S477R、N501Y、D614G、R683G突變)的中和活性。測(cè)試結(jié)果顯示,這些單克隆抗體對(duì)K417N、E484K、N501Y 突變的中和活性均降低了。其中,有9種和4種單克隆抗體分別對(duì)存在E484K突變和N501Y突變的受體結(jié)合域(RBD)的中和活性下降超10倍,還有5種對(duì)K417N突變新冠假病毒中和活性減弱。而這些正是南非501Y.V2突變株的刺突蛋白上關(guān)鍵的3個(gè)突變點(diǎn)。
針對(duì)上述的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,兩個(gè)研究團(tuán)隊(duì)均表示,需要測(cè)試臨床使用的單克隆抗體對(duì)其他新冠突變株的中和活性,而其中有很多或已失去了對(duì)501.V2突變株的中和活性。此外,我們還需要定期去更新靶向新冠病毒刺突蛋白的mRNA疫苗,以避免其潛在的臨床療效喪失。
除此之外,大多數(shù)曾感染新冠病毒的康復(fù)患者對(duì)501Y.V2突變株的中和活性很小,或者無(wú)法檢測(cè)到對(duì)其的中和活性,因此很有可能出現(xiàn)新冠病毒感染復(fù)陽(yáng)。南非的研究人員還提到,在巴西發(fā)現(xiàn)的一種新冠病毒突變株存在一些關(guān)鍵的突變,可能增加其對(duì)中和性抗體的抗性,而我們應(yīng)該更多地關(guān)注著它和501Y.V2突變株。