秦家碧 盛小奇 王婷婷 黃鵬 李依寰 羅柳 劉亦萍 刁靜怡 朱平
(1.廣東省人民醫(yī)院/廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院,廣東廣州 510100;2.中南大學(xué)湘雅公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)系,湖南長沙 410078;3.湖南省婦幼保健院國家衛(wèi)健委出生缺陷研究與預(yù)防重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南長沙 410008;4.湖南省兒童醫(yī)院心胸外科,湖南長沙 410007)
先天性心臟?。╟ongenital heart disease,CHD)是指胚胎發(fā)育時(shí)期由于心臟及大血管的形成障礙而引起的局部解剖結(jié)構(gòu)異常,或出生后應(yīng)閉合的通道未閉合而引起的心臟、血管功能異常,是我國最常見的出生缺陷和嬰幼兒非感染性死亡的主要原因。全球發(fā)病率為8.22‰[1],我國為8.98‰[2],發(fā)病呈逐年上升趨勢[3]。此外,即使經(jīng)過有效干預(yù),CHD患者仍存在較高的心血管疾病及死亡風(fēng)險(xiǎn),并可能在行為、認(rèn)知、注意力和運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)等方面存在功能缺陷[4-5]。同其他復(fù)雜疾病一樣,CHD病因涉及遺傳和環(huán)境因素。流行病學(xué)證據(jù)顯示圍孕期增補(bǔ)葉酸或含葉酸的多種維生素能有效降低CHD的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[6],但這種危險(xiǎn)降低的機(jī)制并不清楚。調(diào)查與葉酸代謝、吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)酶基因的遺傳變異有助于解釋葉酸相關(guān)出生缺陷的發(fā)生機(jī)制。許多學(xué)者已經(jīng)將焦點(diǎn)集中于影響葉酸代謝的酶基因上,包括5,10亞甲基四氫葉酸還原酶基因、蛋氨酸合酶還原酶基因、胱硫醚β合酶基因等[7-8]。然而,在機(jī)體利用葉酸過程中,除上述與葉酸代謝有關(guān)的酶外,尚有葉酸轉(zhuǎn)運(yùn)過程中涉及到的受體及載體,如葉酸受體和還原葉酸載體(reduced folate carrier,RFC)也在葉酸吸收轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入細(xì)胞過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用[9]。因此,RFC基因的突變或表達(dá)異??赡艹蔀樵心溉~酸正常代謝過程的重要影響因素。值得注意的是,雖然有研究顯示RFC基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與CHD發(fā)生存在關(guān)聯(lián)[10],但這些研究只關(guān)注了該基因的一個(gè)位點(diǎn)(rs1051266)。RFC基因上除了已經(jīng)關(guān)注的位點(diǎn)外,尚有其他SNP位點(diǎn)。本研究首次關(guān)注母親RFC基因多個(gè)位點(diǎn)(rs10483080、rs2236484、rs3788190、rs3788189、rs12483377、rs2330183) 與子代CHD的關(guān)聯(lián),能為CHD遺傳易感因素研究提供流行病學(xué)依據(jù),也為揭示葉酸預(yù)防出生缺陷的潛在作用機(jī)制提供線索。
采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例對照研究,招募2017年11月至2020年3月在湖南省兒童醫(yī)院心胸外科就診的683例CHD嬰兒的母親為病例組。診斷的CHD亞型包括:房間隔缺損、室間隔缺損、房室隔缺損、動(dòng)脈導(dǎo)管未閉、主肺動(dòng)脈隔缺損、法洛四聯(lián)癥、完全大動(dòng)脈轉(zhuǎn)位。招募同期因感冒、腹瀉、外傷等就診于同一家醫(yī)院并排除任何畸形的740例嬰兒的母親為對照組。
所有CHD患兒均為單純性CHD,排除其他系統(tǒng)畸形,均符合臨床診斷標(biāo)準(zhǔn),并且經(jīng)心臟彩超或術(shù)中探查證實(shí)。對照組患兒經(jīng)體檢初篩及心臟彩超證實(shí)心臟結(jié)構(gòu)、功能均正常,且無染色體異常及系統(tǒng)性畸形等疾病。研究對象需滿足以下標(biāo)準(zhǔn):(1)了解本項(xiàng)目并簽署知情同意,愿意配合本課題調(diào)查研究;(2)彼此無親緣關(guān)系;(3)完成調(diào)查問卷并愿意提供血標(biāo)本用于本課題基因SNP檢測;(4)漢族;(5)單胎受孕。本研究排除輔助生殖技術(shù)受孕、多胎受孕或患有精神障礙性疾病不能配合完成調(diào)查的產(chǎn)婦。為了降低對孕前或孕期環(huán)境暴露的回憶偏倚,本研究也排除產(chǎn)后超過1年的產(chǎn)婦。
本研究使用統(tǒng)一的問卷調(diào)查表,所有調(diào)查員經(jīng)過統(tǒng)一培訓(xùn),以訪談的形式對研究對象進(jìn)行流行病學(xué)問卷調(diào)查。調(diào)查內(nèi)容包括:產(chǎn)婦基本社會人口學(xué)特征(孕齡、文化程度、家庭年收入、民族、戶籍等)、出生缺陷家族史、個(gè)人先天畸形史、家族近親婚配史、既往不良妊娠史(自然流產(chǎn)、死胎或死產(chǎn)、早產(chǎn)、低出生體重、妊娠糖尿病、妊娠高血壓等)、圍孕期感冒和發(fā)熱史、圍孕期生活行為史(主動(dòng)吸煙、二手煙暴露、飲酒史等)、圍孕期葉酸補(bǔ)充情況、圍孕期環(huán)境污染物接觸史等。圍孕期定義為懷孕前3個(gè)月至懷孕后12周。為防止回憶偏倚,本研究結(jié)合孕母婦幼保健手冊,以進(jìn)一步確認(rèn)圍孕期相關(guān)暴露信息。
完成問卷后,采集產(chǎn)婦5 mL靜脈血用于基因SNP檢測。本研究選擇RFC基因作為備檢基因,并參考已發(fā)表的文獻(xiàn)[11]所介紹的方法來選擇相關(guān)候選位點(diǎn)。檢索NCBI和HapMap數(shù)據(jù)庫,查詢并核實(shí)RFC基因主要的SNP位點(diǎn),要求選擇tanSNP時(shí)r2所設(shè)的閾值不小于0.8,且最小等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)不低于10%。最終,6個(gè) 位 點(diǎn) (rs10483080、rs2236484、rs3788190、rs3788189、rs12483377、rs2330183)被確定為本研究的待檢位點(diǎn)。采用QIAamp DNA Mini Kit(Qiagen,Valencia,CA,USA)提取血細(xì)胞中的DNA,用紫外分光光度計(jì)測定DNA溶液的濃度和純度。應(yīng)用MassARRAY飛行時(shí)間質(zhì)譜對6個(gè)位點(diǎn)的SNP進(jìn)行檢測,具體檢測工作由博淼生物科技(北京)有限公司完成。
采用EpiData 3.1軟件建立數(shù)據(jù)庫,應(yīng)用SPSS 22.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)數(shù)資料采用率或構(gòu)成比(%)描述,組間比較采用卡方檢驗(yàn)或Fisher確切概率法;等級資料比較采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)。對對照組人群基因型分布頻率進(jìn)行哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)檢驗(yàn)(如果P>0.01,說明對照樣本符合HWE)。采用logistic回歸模型計(jì)算優(yōu)勢比(odds ratio,OR)和95%置信區(qū)間(confidence interval,CI),以評估RFC基因SNP與CHD的關(guān)聯(lián)性。采用基因模型選擇(genetic model selection,GMS)的方法判定各位點(diǎn)與疾病關(guān)聯(lián)的遺傳模型[當(dāng)哈迪-溫伯格不平衡趨勢檢驗(yàn) (Hardy-Weinberg disequilibrium trend test,HWDTT)ZHWDTT<-1.645時(shí),判定為顯性模型;ZHWDTT>1.645時(shí),判定為隱性模型;ZHWDTT>-1.645或ZHWDTT<1.645時(shí),判定為加性模型]。利用Haploview 4.2軟件計(jì)算各位點(diǎn)之間的r2值,r2>0.8表明兩個(gè)位點(diǎn)之間存在連鎖不平衡;同時(shí),利用四配子檢驗(yàn)的方法構(gòu)建單倍型,并評估各單倍型與CHD發(fā)生的關(guān)聯(lián)。采用廣義多因子降維法探討各位點(diǎn)間交互作用與CHD發(fā)生的關(guān)聯(lián)。涉及多重比較時(shí),采用錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,F(xiàn)DR)校正的方法調(diào)整P值以控制假陽性率,得到校正P值(QFDR),并以QFDR≤0.05作為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的判定標(biāo)準(zhǔn)。
病例組和對照組產(chǎn)婦戶籍、文化程度、家庭年收入、家族出生缺陷史和近親婚配史、既往不良妊娠史(死胎或死產(chǎn)、妊娠糖尿病、妊娠高血壓)及圍孕期感冒或發(fā)熱史、葉酸補(bǔ)充、不良生活習(xí)慣(主動(dòng)或被動(dòng)吸煙、飲酒)和環(huán)境污染物接觸史方面比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),這些因素將作為后續(xù)多因素分析的混雜因素進(jìn)行控制,見表1。
表1 病例組和對照組的基線資料比較 [例(%)]
HWE檢驗(yàn)顯示,對照組人群RFC基因有1個(gè)位點(diǎn)(rs10483080)的基因型分布不符合HWE(P<0.001),因此后續(xù)分析中不納入該位點(diǎn)(表2)。多因素logistic回歸分析顯示,在調(diào)整表1基線資料比較中差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的混雜因素后,母親RFC基因的兩個(gè)位點(diǎn)rs2236484和rs2330183的多態(tài)性與CHD風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)(表3)。在位點(diǎn)rs2236484上,攜帶AG(OR=1.91,95%CI:1.45~2.51;QFDR<0.001)或GG(OR=1.96,95%CI:1.40~2.75;QFDR<0.001)基因型的母親與攜帶AA基因型相比,子代CHD的風(fēng)險(xiǎn)顯著增加;該位點(diǎn)的顯性模型(OR=1.93,95%CI:1.48~2.50;QFDR<0.001)和加性模型(OR=1.43,95%CI:1.21~1.69;QFDR<0.001)與CHD風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)。在位點(diǎn)rs2330183上,攜帶CT(OR=1.39,95%CI:1.06~1.83;QFDR=0.045) 基因型的母親與攜帶CC基因型比較顯著增加了子代CHD的風(fēng)險(xiǎn);該位點(diǎn)顯性模型(OR=1.39,95%CI:1.07~1.79;QFDR=0.030)與CHD風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)。
表2 母親RFC基因型分布頻數(shù)及HWE檢驗(yàn) (例)
表3 母親RFC基因多態(tài)性與CHD關(guān)聯(lián)的logistic回歸分析
表3 (續(xù))
基于HWDTT,利用病例組和對照組在各位點(diǎn)不同基因型頻率,計(jì)算各位點(diǎn)對應(yīng)的統(tǒng)計(jì)量ZHWDTT,并通過與C=1.645相比,判定各位點(diǎn)的遺傳模型,結(jié)果見表4??梢姡赣HRFC基因與子代CHD風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)的兩個(gè)位點(diǎn)rs2236484和rs2330183的遺傳模型均為顯性模型。
表4 各位點(diǎn)遺傳模型分析
連鎖不平衡分析顯示,母親RFC基因的兩個(gè)位點(diǎn)rs3788189和rs3788190之間存在連鎖不平衡(r2=0.916),提示兩個(gè)位點(diǎn)間強(qiáng)關(guān)聯(lián)(表5)。單倍型分析顯示,RFC基因的5個(gè)位點(diǎn)共形成2個(gè)單倍型塊(Block)。Block1涉及兩個(gè)位點(diǎn)rs12483377和rs2236484,構(gòu)成3種單倍型:G-A、G-G和A-G。Block2涉及兩個(gè)位點(diǎn)rs3788189和rs3788190,構(gòu)成3種單倍型:G-A、T-G和G-G(圖1)。在Block1中,母親攜帶單倍型G-G(OR=1.21,95%CI:1.03~1.41)顯著增加子代CHD的風(fēng)險(xiǎn);在Block2中,母親攜帶單倍型T-G(OR=1.25,95%CI:1.07~1.46)顯著增加子代CHD的風(fēng)險(xiǎn)(表6)。
采用廣義多因子降維法分析RFC基因各位點(diǎn)間的交互作用。結(jié)果顯示,2個(gè)位點(diǎn)(rs2236484和rs2330183)的一階交互作用、3個(gè)位點(diǎn)(rs2236484、rs3788189和rs2330183)的二階交互作 用 、4個(gè) 位 點(diǎn) (rs2236484、rs3788189、rs12483377和rs2330183)的三階交互作用可能與CHD的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)(P=0.001),見表7。
表5 基因位點(diǎn)連鎖不平衡檢驗(yàn)
圖1 RFC基因各位點(diǎn)連鎖不平衡圖 圖中紅色方框代表位點(diǎn)連鎖不平衡的程度,顏色越深表示位點(diǎn)之間連鎖不平衡強(qiáng)度越強(qiáng)??蛑袛?shù)值為連鎖不平衡指標(biāo)的具體值,接近于100,提示兩位點(diǎn)之間連鎖不平衡強(qiáng)度越強(qiáng);接近于0,則提示兩位點(diǎn)連鎖不平衡強(qiáng)度越弱,即趨向于遺傳平衡。數(shù)字1~5分別對應(yīng)數(shù)字上方的位點(diǎn)rs號。
表6 單倍型分析及其在病例組和對照組中的分布情況
表7 RFC基因各位點(diǎn)間交互作用分析
母親妊娠前后增補(bǔ)葉酸或含葉酸的維生素可以有效降低神經(jīng)管畸形、唇腭裂及CHD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)[6,12-13]。因此,圍孕期增補(bǔ)葉酸已成為預(yù)防神經(jīng)管畸形等先天缺陷的一級預(yù)防措施。然而,妊娠期增補(bǔ)葉酸可以降低出生缺陷發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的機(jī)制仍不清楚。研究影響葉酸的細(xì)胞吸收、轉(zhuǎn)運(yùn)及代謝的遺傳變異能幫助解釋一部分葉酸相關(guān)出生缺陷的發(fā)病機(jī)制。目前,國內(nèi)外的研究大多只關(guān)注葉酸代謝相關(guān)基因的遺傳變異對CHD的影響。本研究分析了母親RFC基因的6個(gè)SNP與子代CHD的關(guān)聯(lián)。結(jié)果表明,RFC基因rs2236484和rs2330183位點(diǎn)的多態(tài)性與子代CHD的發(fā)生顯著相關(guān)。RFC基因位于21號染色體(21q22.2-22.3),編碼分子量在80~120 kDa間的膜蛋白,對還原葉酸具有高親和力[14]。RFC主要的生理功能是與葉酸受體共同作用完成葉酸從組織到細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)運(yùn),介導(dǎo)葉酸在腸道的吸收,以維持細(xì)胞內(nèi)的葉酸濃度[15]。作為葉酸轉(zhuǎn)運(yùn)的主要載體,還原葉酸載體促進(jìn)葉酸向胎盤的轉(zhuǎn)移,有利于DNA合成和細(xì)胞增生,對胚胎的生長和分化具有重要意義[16]。已有研究表明RFC基因多態(tài)性與血漿中葉酸水平降低和同型半胱氨酸水平升高顯著相關(guān)[14]。因此,RFC基因突變或異常表達(dá)可能導(dǎo)致RFC酶活性降低,RFC轉(zhuǎn)運(yùn)葉酸能力下降,葉酸的正常代謝受到影響進(jìn)而導(dǎo)致組織發(fā)育異常,從而增加CHD的風(fēng)險(xiǎn)[17]。
既往關(guān)于RFC基因多態(tài)性與疾病的研究多集中在神經(jīng)管畸形和顱面畸形[9,18-19],僅有3項(xiàng)研究評估了其與CHD的關(guān)聯(lián)[10,20-21]。但是這些研究都只關(guān)注了RFC基因上的一個(gè)位點(diǎn)rs1051266(A80G),結(jié)果表明rs1051266位點(diǎn)突變與子代CHD、神經(jīng)管畸形及顱面畸形等出生缺陷的高患病風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)[10,20-21]。本研究首次關(guān)注了RFC基因上多個(gè)位點(diǎn) (rs10483080、rs2236484、rs3788190、rs3788189、rs12483377、rs2330183)與子代CHD的關(guān)系,為揭示RFC基因的遺傳變異與CHD發(fā)病機(jī)制的關(guān)系提供潛在的線索。此外,本研究還對各位點(diǎn)的遺傳模型進(jìn)行了篩選并在分析單個(gè)位點(diǎn)基因多態(tài)性的基礎(chǔ)上進(jìn)行了單倍型分析。由于在復(fù)雜疾病的研究中很難事先明確基因的遺傳模式,且錯(cuò)誤的遺傳模型會降低分析的檢驗(yàn)效能,因此對單個(gè)位點(diǎn)的遺傳模型進(jìn)行篩選能更清晰地明確基因在疾病發(fā)生中的作用[22-23]。RFC基因各位點(diǎn)的遺傳模型分析結(jié)果顯示,與子代CHD發(fā)生相關(guān)的rs2236484和rs2330183位點(diǎn)均為顯性模型。單倍型是等位基因的線性排列,具有整體遺傳的趨勢[24]。在基因與疾病的關(guān)聯(lián)分析中結(jié)合單倍型有助于更精準(zhǔn)地定位致病基因。RFC基因的5個(gè)位點(diǎn)共形成2個(gè)單倍型塊,Block1中的單倍型G-G與Block2中的單倍型T-G均顯著增加子代CHD的風(fēng)險(xiǎn)。
本研究的局限性:第一,作為一項(xiàng)以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例對照研究,本研究在資料的收集上不可避免地存在回憶偏倚。為了減少這種偏倚,選擇1歲以內(nèi)兒童的母親作為研究對象并結(jié)合孕母婦幼保健手冊確認(rèn)圍孕期相關(guān)暴露信息。第二,本研究只納入活產(chǎn)住院的CHD患者,那些因?yàn)镃HD流產(chǎn)的病例并未納入,這可能導(dǎo)致選擇性偏倚。第三,由于樣本量的限制,本研究未對RFC基因多態(tài)性與不同CHD亞型的關(guān)聯(lián)進(jìn)行評估。
綜上所述,母親RFC基因兩個(gè)位點(diǎn)(rs2236484和rs2330183)的遺傳變異與子代CHD的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)升高顯著相關(guān),并且該基因各位點(diǎn)之間在CHD的發(fā)生中存在交互作用,這為CHD遺傳易感因素的研究提供了新的流行病學(xué)證據(jù),也為揭示葉酸預(yù)防出生缺陷的潛在作用機(jī)制提供線索。然而,RFC基因的遺傳變異如何影響CHD發(fā)生的潛在機(jī)制仍不明確,未來需要開展更多研究。
志謝:本研究得到了湖南省兒童醫(yī)院心胸外科的全力支持。該科室工作人員在繁忙的工作中承擔(dān)了收集病例資料及收集標(biāo)本的任務(wù),同時(shí)為我們進(jìn)行現(xiàn)場調(diào)查提供支持。在此,我們對該科室工作人員表示誠摯的感謝!
利益沖突聲明:所有作者均聲明不存在利益沖突。