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    多模態(tài)融合的膝關(guān)節(jié)損傷預(yù)測(cè)

    2021-05-14 06:29:28陸莉霞鄒俊忠郭玉成
    關(guān)鍵詞:半月板卷積模態(tài)

    陸莉霞,鄒俊忠,郭玉成,張 見,王 蓓

    1.華東理工大學(xué) 控制科學(xué)與工程學(xué)院,上海200237

    2.清影醫(yī)療科技(深圳)有限公司,廣東 深圳518083

    膝關(guān)節(jié)主要包括韌帶、關(guān)節(jié)面、肌肉、肌腱等多個(gè)組織結(jié)構(gòu),是人體結(jié)構(gòu)中最復(fù)雜、最易發(fā)生損傷的關(guān)節(jié)之一。作為臨床上一種常見的骨損傷類型,膝關(guān)節(jié)損傷多發(fā)生在半月板、膝關(guān)節(jié)韌帶等位置,患者多表現(xiàn)為不同程度腫脹、疼痛等,且隨著現(xiàn)代交通業(yè)、建筑業(yè)的不斷發(fā)展,該疾病發(fā)生率呈現(xiàn)出逐年增高的趨勢(shì),不僅給患者生活帶來(lái)了極大的不便,還影響到患者的生活質(zhì)量[1]。

    隨著X 線、CT、MRI 等影像學(xué)檢查的普及,膝關(guān)節(jié)損傷診斷的準(zhǔn)確率顯著上升,為臨床早期治療提供客觀依據(jù)。MRI檢查具有較高的軟組織分辨率,能夠采集到更為豐富的圖像信息。通過(guò)矢狀位、橫軸位等方位的MRI 影像能夠?qū)οリP(guān)節(jié)軟組織及周圍結(jié)構(gòu)予以全面的探查,獲得詳細(xì)的、準(zhǔn)確的圖像,因而MRI檢查對(duì)前十字韌帶撕裂、半月板撕裂的臨床診斷表現(xiàn)出較高的準(zhǔn)確性[2-3]。近年來(lái),膝關(guān)節(jié)磁共振成像(MRI)已成為診斷膝關(guān)節(jié)損傷的首選方法,一個(gè)用于分析膝關(guān)節(jié)MRI影像的自動(dòng)化系統(tǒng),可以篩選出高?;颊?,并幫助臨床醫(yī)生做出更準(zhǔn)確的診斷。

    傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)影像分析主要采用邊緣檢測(cè)、紋理特征、形態(tài)學(xué)濾波以及構(gòu)建形狀模型和模板匹配等方法。Haralick等人[4]使用灰度共生矩陣來(lái)提取乳腺組織的紋理特征;Swain 等人[5]使用顏色直方圖來(lái)提取眼底圖像的顏色特征。

    MRI影像的多維度、多平面的特性限制了傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)影像分析方法對(duì)膝關(guān)節(jié)MRI的應(yīng)用[6],而深度學(xué)習(xí)方法能夠自動(dòng)學(xué)習(xí)多層特征,非常適合于輔助診斷醫(yī)學(xué)影像[7]。近年來(lái),深度學(xué)習(xí)方法已經(jīng)超越了傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)影像分析方法,并在膝關(guān)節(jié)MRI 影像領(lǐng)域取得了重大進(jìn)展。Prasoon等人[8]提出了一種新的體素分割系統(tǒng),該系統(tǒng)集成了三個(gè)二維CNN 網(wǎng)絡(luò),分別用于MRI 三維影像的xy、yz和zx三個(gè)平面的膝關(guān)節(jié)脛骨軟骨的分割。Liu 等人[9]開發(fā)了一套基于深度學(xué)習(xí)的全自動(dòng)膝關(guān)節(jié)MRI軟骨損傷檢測(cè)系統(tǒng),該系統(tǒng)有兩個(gè)CNN網(wǎng)絡(luò)組成,第一個(gè)CNN 網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行軟骨和骨骼的快速分割;第二個(gè)CNN網(wǎng)絡(luò)評(píng)估了分葉軟骨組織的結(jié)構(gòu)異常。吳恩達(dá)團(tuán)隊(duì)[10]首次提出了用于預(yù)測(cè)膝關(guān)節(jié)損傷的深度學(xué)習(xí)模型——MRNet,該模型通過(guò)MRI 影像對(duì)膝關(guān)節(jié)常見的損傷進(jìn)行預(yù)測(cè),提高M(jìn)RI診斷的質(zhì)量。

    本文通過(guò)將膝關(guān)節(jié)矢狀面、冠狀面和軸向面的MRI影像的多種特征融合,對(duì)前交叉韌帶撕裂、半月板撕裂和一般異常三種常見的膝關(guān)節(jié)損傷進(jìn)行分類預(yù)測(cè)。通過(guò)各個(gè)對(duì)比實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證本文方法的有效性和可行性。

    1 方法介紹

    對(duì)于膝關(guān)節(jié)MRI影像的特征提取方法,主要分為傳統(tǒng)特征提取方法和深度學(xué)習(xí)特征提取方法。一般來(lái)說(shuō),傳統(tǒng)方法提取的特征底層語(yǔ)義特征,例如邊緣特征和紋理特征。而深度學(xué)習(xí)如卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Convolution Neural Network,CNN)等,提取的圖像特征包含更多的細(xì)節(jié)信息,能表達(dá)高層語(yǔ)義信息。底層特征語(yǔ)義信息與高層語(yǔ)義信息對(duì)于膝關(guān)節(jié)損傷的診斷均有重要意義,因此本文提出用于膝關(guān)節(jié)診斷的一種多模態(tài)特征融合網(wǎng)絡(luò),如圖1所示。

    圖1 多模態(tài)特征融合網(wǎng)絡(luò)流程圖

    首先,提取邊緣特征HOG 特征和紋理特征LBP 特征,經(jīng)contact 融合后利用PCA 選取特征貢獻(xiàn)度超過(guò)95%的特征作為傳統(tǒng)特征;其次,在VGG16網(wǎng)絡(luò)模型的基礎(chǔ)上加入金字塔融合的思想,將多個(gè)feature map 的信息融合作為深度特征;最后,通過(guò)一個(gè)多層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)將傳統(tǒng)特征和深度特征經(jīng)進(jìn)行深度融合,并得到預(yù)測(cè)概率。

    1.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理

    膝關(guān)節(jié)MRI 影像的一個(gè)樣本的數(shù)據(jù)大小為n×256×256,其中n為一組MRI影像序列所包含的靜態(tài)圖片數(shù)目。

    由于膝關(guān)節(jié)主要位于MRI的中央位置,因此先將所有靜態(tài)圖片進(jìn)行裁剪操作,并截取圖像中心224×224區(qū)域。接著進(jìn)行歸一化操作,像素值被歸一化到[0,255]之間,歸一化是為了消除其他變換函數(shù)對(duì)圖像變換的影響。在訓(xùn)練階段,數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng),包括水平翻轉(zhuǎn)和旋轉(zhuǎn)角度為25°,水平和垂直方向移動(dòng)0.1的仿射變換。

    1.2 傳統(tǒng)特征提取

    1.2.1 HOG特征

    HOG特征提取算法是Dalal等[11]提出的一種特征提取算法,核心思想是通過(guò)計(jì)算圖像局部區(qū)域梯度,并將每個(gè)局部區(qū)域中各像素點(diǎn)梯度的方向直方圖級(jí)聯(lián)。圖2為HOG特征提取算法的基本流程圖。

    圖2 HOG特征提取算法的基本程圖

    HOG特征提取的具體步驟如下:

    (1)為消除光照和噪聲的影像,首先對(duì)圖像進(jìn)行圖像灰度化和伽馬標(biāo)準(zhǔn)化處理。

    (2)用一維中心對(duì)稱算子k=[-1 01]及其轉(zhuǎn)置計(jì)算圖像橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)方向的梯度,表達(dá)式為:

    其中,H(x,y)表示像素在(x,y)處的灰度值。得到像素點(diǎn)的梯度幅值和梯度方向?yàn)椋?/p>

    (3)將圖像分割為若干個(gè)小塊(block),每個(gè)小塊由4 個(gè)單元(cell)組成,每個(gè)單元由8×8 像素組成,塊的滑動(dòng)步長(zhǎng)為1個(gè)單元。將θ(x,y)在[0,π]區(qū)間上分為9個(gè)區(qū)間,即每20°為一個(gè)方向(bin)。單元(cell)中的每一個(gè)像素點(diǎn)都為直方圖通道進(jìn)行加權(quán)投票,權(quán)重為g(x,y),這樣就得到每個(gè)單元內(nèi)的9個(gè)方向的梯度直方圖。

    最后按順序級(jí)聯(lián)所有block 的直方圖向量,得到圖像的HOG特征μHOG,維度為7 056維。

    1.2.2 LBP特征

    原始的LBP模式算子為3×3的局部鄰域,以鄰域中心點(diǎn)像素的灰度值I(c)為基準(zhǔn),對(duì)周圍其他8 個(gè)像素點(diǎn)做二值化處理,比I(c)大的鄰域像素值置為1,否則為0。將這8個(gè)二進(jìn)制數(shù)按順序排列得到一個(gè)二進(jìn)制序列即為中心點(diǎn)像素的LBP值。

    為對(duì)原始的LBP模式進(jìn)行降維,并在數(shù)據(jù)量減少的情況下能最好地表示圖像的信息,本文采用均勻局部二值模式(Uniform Local Binary Pattern,ULBP)[12]。當(dāng)某個(gè)LBP 所對(duì)應(yīng)的循環(huán)二進(jìn)制數(shù)從0 到1 或從1 到0 最多有兩次跳變時(shí),該LBP所對(duì)應(yīng)的二進(jìn)制就稱為一個(gè)等價(jià)模式,其余情況為非均勻模式。通過(guò)這樣的改進(jìn),模式數(shù)量由原來(lái)的2p種減少為p(p-1)+2,二進(jìn)制模式的種類大大減少,而不會(huì)丟失任何信息。

    本文用局部二進(jìn)制編碼直方圖表示LBP 圖像的特征,將LBP 圖像分為8×8 塊區(qū)域,獲取每個(gè)區(qū)域的LBP編碼直方圖,繼而得到整幅圖像的LBP 編碼直方圖,一張LBP圖像共有3 776維特征,記為μLBP。

    1.2.3 HOG特征與LBP特征融合

    經(jīng)上述方法提取到的HOG特征和LBP特征均存在特征維度過(guò)高,維度之間存在耦合的問(wèn)題,本文通過(guò)主成分分析(PCA)[13]來(lái)達(dá)到降維的效果。PCA 不僅減少了特征集的維數(shù),同時(shí)避免了重要信息的丟失,保持特征集中對(duì)方差貢獻(xiàn)最大的特征。

    設(shè)向量X=(x1,x2,…,xn)T,PCA的具體步驟如下:

    將HOG 特征和LBP 特征歸一化后,經(jīng)contact 融合后的特征為[μHOG,μLBP]。經(jīng)PCA 降維后,將特征向量按對(duì)應(yīng)特征值大小從上到下按行排列,前1 325 項(xiàng)的累計(jì)貢獻(xiàn)率超過(guò)95%,為95.43%。因此將原特征集降維到1 325維得到傳統(tǒng)特征集μ=(μ1,μ2,…,μ1325)。

    1.3 深度特征提取

    近年來(lái),卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在醫(yī)療圖像診斷領(lǐng)域的應(yīng)用得到了廣泛而迅速地發(fā)展,并已取得不錯(cuò)的成果。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)通過(guò)對(duì)圖像的卷積操作,可自動(dòng)完成特征的提取,且這些特征擁有更高級(jí)的語(yǔ)義信息,魯棒性更強(qiáng)[14]。

    VGG16網(wǎng)絡(luò)[15]是2014年由牛津大學(xué)的視覺幾何組(Visual Geometry Group)提出,該網(wǎng)絡(luò)共有五個(gè)卷積塊,每個(gè)卷積塊后都是最大池化層,最后三層為全連接層,VGG16的結(jié)構(gòu)配置見表1。

    表1 VGG16結(jié)構(gòu)配置

    VGG16 網(wǎng)絡(luò)利用最后一層特征來(lái)進(jìn)行分類,這種方法的優(yōu)點(diǎn)是速度快、需要內(nèi)存少。缺點(diǎn)是僅僅關(guān)注深層網(wǎng)絡(luò)中最后一層的特征,卻忽略了其他層的特征,但多種信息的融合可以在一定程度上提升診斷的準(zhǔn)確率。由于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中淺層可以學(xué)習(xí)到比較通用的低級(jí)特征,如基本的灰度和邊緣信息等,深層可以學(xué)到特征的更多細(xì)節(jié)。因此本文在VGG16 網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上加入Top-down 結(jié)構(gòu),將提取的特征層逐步搭建為特征金字塔,并進(jìn)行像素疊加,網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖3所示。

    通常深度學(xué)習(xí)被認(rèn)為在大量有標(biāo)注的圖像上進(jìn)行訓(xùn)練才可以達(dá)到良好的效果,在醫(yī)學(xué)圖像中很難有大量帶有標(biāo)注的病理圖像用于分割訓(xùn)練,因此本文采用遷移學(xué)習(xí)的方法,直接使用預(yù)訓(xùn)練好的VGG16 的第二至第五個(gè)卷積塊卷積塊(Block)。將每個(gè)卷積塊的最后一個(gè)卷積層得到的特征映射提取出來(lái),分別為F(n),其中n=2,3,4,5。F(n)經(jīng)上采樣(upsampling)與F(n-1)經(jīng)1×1 卷積處理后的結(jié)果進(jìn)行像素點(diǎn)融合,再采用3×3 的卷積核對(duì)融合結(jié)果進(jìn)行修正,消除了上采樣的混疊效應(yīng),得到新的特征映射F′(n-1)。金字塔融合的公式為:

    獲得最后一層融合層的F′(2),依次通過(guò)BN 層、ReLU層、自適應(yīng)最大池化層和全連接層。BN 層不僅能夠加快模型的收斂速度,還能提升分類效果[16]經(jīng)過(guò)BN(Batch Normalization)層。設(shè)x(k)為F′(2)第k維特征,BN層為x(k)引入了兩個(gè)可學(xué)習(xí)的參數(shù)γ(k)和β(k),并利用無(wú)差估計(jì)輸出第k維特征:

    ReLU 層加入非線性因素的,增加模型的表達(dá)能力不夠。ReLU激活函數(shù)的表達(dá)式為:

    自適應(yīng)最大池化層與標(biāo)準(zhǔn)的Max Pooling 區(qū)別在于,自適應(yīng)最大池化層Adaptive Max Pooling 會(huì)根據(jù)input_size(In)來(lái)控制輸出output_size(Out)。stride和κernelsize分別為:

    全連接層可以看做h×w的全尺寸卷積,h和w為前一層輸出的大小,最終得到1 024 維通過(guò)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提取的深度特征g=(g1,g2,…,g1024)。

    1.4 多模態(tài)特征自適應(yīng)融合

    由于提取到的傳統(tǒng)特征和深度特征維度均較高,若直接級(jí)聯(lián)兩個(gè)特征向量作為最后的特征會(huì)大大增加時(shí)間成本和計(jì)算成本,因而在多模態(tài)特征融合時(shí)要減少融合后特征的維度。同時(shí)考慮到不同模態(tài)的特征在融合結(jié)果中所起到的作用,以及保留多模態(tài)的相關(guān)性,本節(jié)構(gòu)建了一個(gè)多模態(tài)特征融合模塊,該模塊包含一個(gè)神經(jīng)元個(gè)數(shù)小于特征維數(shù)的隱藏層和一個(gè)Sigmoid 層,通過(guò)最大化特征層的能量比重來(lái)訓(xùn)練整個(gè)網(wǎng)絡(luò),如圖4 所示。隱藏層對(duì)融合后特征進(jìn)行非線性降維,Sigmoid 層將融合后特征映射到(0,1)區(qū)間,即預(yù)測(cè)概率。令特征向量x=(μ,g),前向傳播公式為:

    圖3 加入金字塔融合的VGG16網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖

    圖4 多模態(tài)特征融合網(wǎng)絡(luò)圖

    其中,T為樣本數(shù)量。當(dāng)函數(shù)ψ(θ)取得最大值時(shí),特征層的能量比重大,隱層的能量小。當(dāng)在網(wǎng)絡(luò)內(nèi)傳輸數(shù)據(jù)時(shí),數(shù)據(jù)流的方向也是能量衰減的方向,多次迭代之后,網(wǎng)絡(luò)能量呈衰減趨勢(shì),網(wǎng)絡(luò)趨于有序或者概率分布趨于集中。

    本文將偏差βi、αj初始值設(shè)為服從平均值為0,標(biāo)準(zhǔn)差為0.1的正態(tài)分布的隨機(jī)數(shù),權(quán)重γij初始值設(shè)為服從平均值為0,標(biāo)準(zhǔn)差為0.01的正態(tài)分布很小的隨機(jī)數(shù),隱藏層神經(jīng)元設(shè)為1 000個(gè)。

    2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

    實(shí)驗(yàn)時(shí),所使用的CPU 型號(hào)為3.4 GHz、16 核AMD1950x,內(nèi)存容量為64 GB,GPU 為12 GHz 顯存NVIDIA TITAN-V。軟件方面,使用Python作為設(shè)計(jì)語(yǔ)言,配合opencv等視覺庫(kù)進(jìn)行代碼編寫。深度學(xué)習(xí)模型框架使用Pytorch以完成對(duì)模型的構(gòu)建,訓(xùn)練與預(yù)測(cè)。

    本文網(wǎng)絡(luò)模型使用Adam優(yōu)化器,增加模型收斂穩(wěn)定性和收斂速度,同時(shí)也能得到優(yōu)良的分類結(jié)果。學(xué)習(xí)率經(jīng)過(guò)調(diào)試設(shè)置為1E-5,權(quán)重衰減為0.01,模型運(yùn)行50輪。

    2.1 評(píng)價(jià)指標(biāo)

    實(shí)驗(yàn)過(guò)程中使用了公開的膝關(guān)節(jié)MRI 競(jìng)賽數(shù)據(jù)集[10]對(duì)本研究中的網(wǎng)絡(luò)模型進(jìn)行訓(xùn)練和驗(yàn)證。本研究的核心任務(wù)為檢陽(yáng),因而本文采用了以下評(píng)價(jià)指標(biāo):準(zhǔn)確率Accuracy、Recall 和AUC(Area Under Curve)值定量的評(píng)估不同模型的性能。

    準(zhǔn)確率為模型預(yù)測(cè)正確的樣本占所有參與預(yù)測(cè)的樣本的比例。定義為:

    其中,TP為真陽(yáng)性樣本數(shù)量,TN為真陰性樣本數(shù)量,F(xiàn)P為假陽(yáng)性樣本數(shù)量,F(xiàn)N為假陰性樣本數(shù)量。

    AUC 值被定義為ROC 曲線下與坐標(biāo)軸圍成的面積。由于ROC曲線一般都處于y=x這條直線的上方,所以AUC 的取值范圍在0.5 和1 之間。AUC 越接近1.0,檢測(cè)方法真實(shí)性越高。

    2.2 數(shù)據(jù)集

    本次研究中的膝關(guān)節(jié)MRI 影像數(shù)據(jù)集來(lái)自于斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)中心整理的從2001 年1 月1 日至2012 年12 月31 日期間內(nèi)的1 370 個(gè)膝關(guān)節(jié)核磁共振檢查數(shù)據(jù)集——MRNet數(shù)據(jù)集[18]。該數(shù)據(jù)集包含1 104例(80.6%)異常(Abnormal)檢查,其中前交叉韌帶撕裂(ACL tear)319例(23.3%),半月板撕裂(Meniscus tear)508例(37.1%)。194例(38.2%)患者同時(shí)發(fā)生前交叉韌帶撕裂和半月板撕裂。每個(gè)樣本包括矢狀面加權(quán)序列(sagittal plane)、冠狀面加權(quán)序列(coronal plane)和軸向面加權(quán)序列(axial plane)。這些序列的圖像數(shù)量從17 幅到61 幅不等(平均31.48幅,SD7.97幅)。

    數(shù)據(jù)集被分為訓(xùn)練集(1 130個(gè)樣本,1 088名患者)和驗(yàn)證集(120個(gè)樣本,111名患者),訓(xùn)練集與測(cè)試集的數(shù)據(jù)分布見表2。

    表2 訓(xùn)練集與測(cè)試集的數(shù)據(jù)分布

    若將矢狀面加權(quán)序列、冠狀面加權(quán)序列和軸向面加權(quán)序列同時(shí)放入上述多模態(tài)特征融合網(wǎng)絡(luò)中,不僅對(duì)硬件要求較高,運(yùn)行時(shí)間較長(zhǎng),而且不同序列的特征表達(dá)差異較大,預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度不高。

    因而本研究針對(duì)每個(gè)任務(wù)(異常、前交叉韌帶撕裂、半月板撕裂)和序列類型(矢狀面、冠狀面、軸向面)訓(xùn)練了不同的9個(gè)模型。

    在驗(yàn)證階段,采用回歸模型得到異常、前交叉韌帶撕裂、半月板撕裂的預(yù)測(cè)概率,回歸模型結(jié)構(gòu)圖如圖5所示。

    圖5 回歸模型結(jié)構(gòu)圖

    將同一個(gè)樣本的矢狀面、冠狀面和軸向面加權(quán)序列同時(shí)放入上述多模態(tài)特征融合網(wǎng)絡(luò)中,分別得到在該序列下,樣本為異常樣本的概率P(A)、P(B)和P(C)。然后,將P(A)、P(B)和P(C)分別乘以一個(gè)回歸系數(shù),相加后通過(guò)Sigmoid 函數(shù)得到在三種序列下,此樣本為異常樣本的預(yù)測(cè)概率,計(jì)算公式為:

    為了尋找最佳參數(shù)wA、wB和wC,本文采用梯度上升的方法,將梯度算子移動(dòng)的步長(zhǎng)記為α,則梯度算法的迭代公式為:

    同樣地,可以獲得此樣本為前交叉韌帶撕裂樣本和半月板撕裂樣本的預(yù)測(cè)概率。

    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

    特征提取不僅僅是分類和預(yù)測(cè)的前提,也是分類準(zhǔn)確率的保證,而高效準(zhǔn)確的特征可以提高后續(xù)分類和預(yù)測(cè)的精確度。本文數(shù)據(jù)經(jīng)相同的預(yù)處理后,每種膝關(guān)節(jié)MRI序列提取的傳統(tǒng)特征(Model a)、CNN特征(Model b)和多模態(tài)融合特征在每個(gè)任務(wù)下的實(shí)驗(yàn)結(jié)果見表3。

    由表3 中Model a 的結(jié)果可知,僅僅依靠MRI 影像的紋理和邊緣特征,在膝關(guān)節(jié)損傷預(yù)測(cè)任務(wù)中存在一定的局限性,尤其在半月板撕裂的預(yù)測(cè)上,最高的準(zhǔn)確率僅有69.17%,無(wú)法很好地輔助臨床醫(yī)生進(jìn)行預(yù)測(cè)。而與傳統(tǒng)方法相比,深度學(xué)習(xí)方法在膝關(guān)節(jié)MRI影像診斷領(lǐng)域具有明顯優(yōu)勢(shì)。由表3中Model a和Model b的結(jié)果可知,深度學(xué)習(xí)方法的準(zhǔn)確率、召回率和AUC值均有大幅提升,其中在異常預(yù)測(cè)任務(wù)中召回率最高已達(dá)到97.89%,同時(shí)在傳統(tǒng)方法有所欠缺的半月板撕裂預(yù)測(cè)任務(wù)中,深度學(xué)習(xí)方法的準(zhǔn)確率均高于76%,充分顯示了深度學(xué)習(xí)方法能夠更好地診斷出陽(yáng)性的樣本,同時(shí)AUC值也更高,因而在偏態(tài)的樣本中更穩(wěn)健。

    表3 各模型效果對(duì)比

    本文模型在卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中融入低級(jí)語(yǔ)義信息,豐富了模型的特征表達(dá)。由表3中Ours的結(jié)果可知,在融合了傳統(tǒng)特征與深度學(xué)習(xí)特征后,各性能指標(biāo)均得到一定程度的提升,尤其是準(zhǔn)確率和AUC值。在異常、前交叉韌帶撕裂、半月板撕裂這三項(xiàng)任務(wù)中,最高準(zhǔn)確率為92.50%、92.50%和81.83%,最高AUC 值為0.961 3、0.974 2 和0.857 4。同時(shí),本文模型對(duì)一般異常的陽(yáng)性樣本的檢出率均高于94%,對(duì)前交叉韌帶撕裂和半月板撕裂陽(yáng)性樣本的檢出率也較高。這對(duì)于優(yōu)先發(fā)現(xiàn)高?;颊卟f(xié)助臨床醫(yī)生進(jìn)行診斷有著重要意義。

    由表3 中Ours 的結(jié)果可知,在一般異常預(yù)測(cè)任務(wù)中,軸向面序列表現(xiàn)最佳,準(zhǔn)確率、召回率和AUC 值分別為92.50%、97.95%和0.961 3;在前交叉韌帶撕裂預(yù)測(cè)任務(wù)中,矢狀面序列更有優(yōu)勢(shì),準(zhǔn)確率、召回率和AUC值分別為92.50%、94.44%和0.972 8;在半月板撕裂預(yù)測(cè)任務(wù)中,軸向面序列表現(xiàn)較好,準(zhǔn)確率、召回率和AUC值分別為81.83%、82.92%和0.846 5。此結(jié)果與半月板位于兩側(cè)脛骨與股骨外側(cè)髁間[19]而前交叉韌帶位于膝關(guān)節(jié)滑膜外側(cè)[20]的膝關(guān)節(jié)結(jié)構(gòu)相符合,因此,本文實(shí)驗(yàn)結(jié)果具有一定的科學(xué)性。

    鑒于每個(gè)任務(wù)均只有陽(yáng)性和陰性兩種可能,為了更好地展示回歸模型的效果,將回歸模型預(yù)測(cè)概率大于或等于0.5 的認(rèn)為是陽(yáng)性樣本,小于0.5 的認(rèn)為是陰性樣本,則在一般異常、前交叉韌帶撕裂和半月板撕裂下的實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表4。

    表4 回歸模型各性能指標(biāo)

    由表4 可知,本文模型在一般異常、前交叉韌帶撕裂和半月板撕裂預(yù)測(cè)任務(wù)中均有較好的性能指標(biāo)。尤其是一般異常和前交叉韌帶撕裂預(yù)測(cè)任務(wù),準(zhǔn)確率和召回率均超過(guò)90%,AUC 值均高于0.94,說(shuō)明本次研究所應(yīng)用的方法能夠在這兩項(xiàng)膝關(guān)節(jié)損傷預(yù)測(cè)中為臨床醫(yī)生提供可靠的基礎(chǔ)診斷。由于半月板主要由纖維軟骨構(gòu)成,而MRI影像對(duì)軟骨組成成分具有局限性[21]。在這種情況下,本文模型在半月板撕裂預(yù)測(cè)任務(wù)中的AUC值仍達(dá)到了0.847 9。綜合來(lái)看,本文方法在膝關(guān)節(jié)損傷診斷方面具有一定的價(jià)值。

    表5 不同膝關(guān)節(jié)損傷檢測(cè)模型性能比較

    表5 對(duì)比了本文算法與MRNet 競(jìng)賽[18]前三名結(jié)果和現(xiàn)有文獻(xiàn)中最好結(jié)果的平均AUC值。

    可以發(fā)現(xiàn),在對(duì)膝關(guān)節(jié)損傷進(jìn)行預(yù)測(cè)時(shí),表5中6種深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)AUC 值均高于90%,都能夠取得較好的預(yù)測(cè)結(jié)果,驗(yàn)證了深度學(xué)習(xí)強(qiáng)大的特征學(xué)習(xí)能力。Bien等[10]在論文中提出的MRnet 以及mrnet-baseline 都是以alexnet 模型為基礎(chǔ)的,AUC 值雖已達(dá)到0.917,但受alexnet模型本身深度和廣度的限制[22],卷積層能學(xué)習(xí)到的特征的數(shù)量和種類有限。本文模型以更深層的vgg16模型為基礎(chǔ),并在該卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上加入了多模態(tài)的融合特征,包括多層卷積層的融合特征以及MRI影像的紋理和邊緣特征,讓模型有了更強(qiáng)大的表達(dá)能力,以此來(lái)獲得更好的預(yù)測(cè)效果。因此本文模型的平均AUC值略高與其他深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),為0.920。

    3 結(jié)束語(yǔ)

    本文提出了用于膝關(guān)節(jié)診斷的一種多模態(tài)特征融合網(wǎng)絡(luò)。首先,通過(guò)對(duì)膝關(guān)節(jié)MRI影像的預(yù)處理,從傳統(tǒng)與深度學(xué)習(xí)兩方面提取膝關(guān)節(jié)損傷的多模態(tài)特征;然后,通過(guò)多層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)特征進(jìn)行快速的相關(guān)性融合;最后,用logistic 回歸整合各個(gè)模型的概率。通過(guò)不同的實(shí)驗(yàn),對(duì)上述所提到的三種模型進(jìn)行了比較,同時(shí)對(duì)回歸模型進(jìn)行了分析,結(jié)果顯示本文方法在膝關(guān)節(jié)損傷預(yù)測(cè)方面具有較大的優(yōu)勢(shì)和較高的實(shí)用價(jià)值。在未來(lái)的研究工作中,將嘗試更多模態(tài)的特征融合,例如MRI影像在時(shí)間維度上的特征。同時(shí)將此應(yīng)用在膝關(guān)節(jié)MRI 的算法應(yīng)用在其他醫(yī)學(xué)圖像類型和不同人體器官的診斷上。

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