壽昕洋 張弈舒 陳 冰 陳思邈 陳偉燕 裘 濤 張宇燕
(浙江中醫(yī)藥大學(xué),浙江 杭州 310053)
缺血性腦卒中具有發(fā)病率高、致殘率高、死亡率高和復(fù)發(fā)率高的特點(diǎn)[1-2]。低血壓性腦梗死在缺血性腦卒中危險(xiǎn)因素中占有重要地位[3]。升陷湯由黃芪、柴胡、升麻、知母和桔梗組成,始載于張錫純的《醫(yī)學(xué)衷中參西錄》,治“大氣下陷”所致諸癥。目前升陷湯臨床用于心腦血管疾病的治療,對(duì)低血壓[4]、慢性心力衰竭[5]、分水嶺腦梗死[6]、腦卒中后眩暈[7]均有較好的臨床療效。升陷湯對(duì)低血壓性腦梗死的研究,大多數(shù)集中于臨床應(yīng)用及對(duì)組方中藥及成分的研究。本文利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從多成分、多靶點(diǎn)與多通路的角度闡釋藥物、靶點(diǎn)、疾病間相互作用的整體性,為多成分的中藥作用機(jī)制研究提供方法[8]的優(yōu)勢(shì),開展中藥復(fù)方升陷湯組分、成分、作用靶點(diǎn)與低血壓性腦梗死的病理機(jī)制的相互關(guān)系分析,探討升陷湯治療低血壓性腦梗死及改善預(yù)后的作用機(jī)制。
1.1 升陷湯組分藥物的活性成分、藥物靶點(diǎn)篩選 運(yùn)用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)(http://tcmspw.com/tcmsp.php)篩選升陷湯活性成分、藥物靶點(diǎn)。
1.2 低血壓性腦梗死相關(guān)基因篩選 在OMIM、GEN-ECARD、DRUGBANK等數(shù)據(jù)庫(kù)中,以“Hypotensive cerebral infarction”為關(guān)鍵詞,檢索與低血壓性腦梗死相關(guān)的基因。
1.3 活性成分-交集基因篩選 將1.1和1.2中篩選到的靶點(diǎn)分別上傳至韋恩圖,得到藥物靶點(diǎn)與低血壓性腦梗死相關(guān)基因的交集,稱交集基因。
1.4 交集基因名稱規(guī)范化 借助UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)查詢“1.3”所得交集基因的基因名與ID,限定物種為人。
1.5 PPI網(wǎng)絡(luò)和藥物-有效成分-交集基因網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 將“1.4”中得到的交集基因輸入STRING,將蛋白種類設(shè)置為“Homo sapiens”,最低相互作用閾值設(shè)為最高,并進(jìn)行模塊化分析。將得到的TSV文件和藥物活性成分,導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件,以≥10的度值為篩選條件獲得PPI網(wǎng)絡(luò),以≥5的度值、≥1倍接近中心性的中位數(shù)及≥1倍介數(shù)中心度中位數(shù)獲得藥物-有效成分-交集基因網(wǎng)絡(luò)圖。
1.6 交集基因的模塊化通路分析 將1.4得到的模塊基因分別導(dǎo)入DAVID進(jìn)行GO富集分析和KEGG通路分析,限定EASY為0.05,各取P值排名前十的條目。
2.1 升陷湯有效成分篩選 以“黃芪”“柴胡”“升麻”“知母”“桔梗”為關(guān)鍵詞,以O(shè)B≥30%、DL≥0.18為條件,刪除無(wú)靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)的化合物,合并共有化合物,篩選出活性化合物69個(gè)。
2.2 交集基因篩選和藥物分類 并通過(guò)OMIM、GENECARD、DRUGBANK數(shù)據(jù)庫(kù)和制作韋恩圖,篩選得到低血壓性腦梗死相關(guān)基因1 328個(gè),藥物靶點(diǎn)197個(gè),交集基因131個(gè)。
2.3 交集基因PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 通過(guò)STRING中的聚類分析(K-means算法),交集基因被分為3大模塊,結(jié)果顯示模塊一內(nèi)86個(gè),模塊二內(nèi)25個(gè),模塊三內(nèi)20個(gè)。將生成的TSV文件導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件分析,包含118個(gè)節(jié)點(diǎn),538條邊,平均節(jié)點(diǎn)度值為9.11(見(jiàn)圖1),根據(jù)Degree值大小篩選出前10位的靶點(diǎn)(見(jiàn)表1)。
圖1 交集基因PPI網(wǎng)絡(luò)圖
表1 度值排名前10的交集基因及其部分拓?fù)鋮?shù)
2.4 藥物-有效成分-交集基因網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 將升陷湯有效成分和交集基因?qū)隒ytoscape3.7.2軟件,建立藥物-有效成分-交集基因網(wǎng)絡(luò)圖。該網(wǎng)絡(luò)共包括176個(gè)節(jié)點(diǎn)(40個(gè)化合物節(jié)點(diǎn)、131個(gè)靶點(diǎn)節(jié)點(diǎn)、5個(gè)藥物節(jié)點(diǎn))。該網(wǎng)絡(luò)中每個(gè)化合物平均與10.50個(gè)靶點(diǎn)相互作用,每個(gè)靶點(diǎn)平均與3.20個(gè)化合物相互作用;從化合物的角度,有22.5%的化合物的作用靶點(diǎn)≥15個(gè),其中靶點(diǎn)≥30個(gè)的化合物3個(gè),經(jīng)分析度值排名前5位的化合物分別是槲皮素、木樨草素、山柰酚、7-O-甲基異丙炔醇和脫水淫羊藿素,分別能與93、42、33、23、19個(gè)靶點(diǎn)蛋白發(fā)生相互作用;從靶基因的角度,度值排名前5位的是PTGS2、PTGS1、AR、ADRB2、RXRA,分別能與31、23、14、13、12個(gè)化合物發(fā)生相互作用(見(jiàn)圖2)。
圖2 藥物-有效成分-交集基因網(wǎng)絡(luò)圖(度值≥5)
2.5 GO富集分析 PPI聚類分析后,交集基因分為3大模塊,結(jié)果顯示模塊一內(nèi)86個(gè),模塊二內(nèi)25個(gè),模塊三內(nèi)20個(gè)。將3個(gè)不同模塊內(nèi)的靶點(diǎn)分別進(jìn)行GO分析,各取P值排名前10的條目(見(jiàn)圖3)。GO分析結(jié)果表明,升陷湯治療低血壓性腦梗死是多種生物學(xué)過(guò)程共同參與的,體現(xiàn)了升陷湯多靶點(diǎn)、多層次的作用特點(diǎn)。
圖3 各模塊靶點(diǎn)GO分析結(jié)果前10名
2.6 KEGG通路分析 KEGG通路富集得出靶點(diǎn)主要富集在癌癥相關(guān)(癌癥途徑、前列腺癌、膀胱癌、小細(xì)胞肺癌、結(jié)腸直腸癌、慢性骨髓性白血病、腫瘤壞死因子信號(hào)通路、癌癥蛋白多糖)、信號(hào)通路相關(guān)(cGMP-PKG信號(hào)通路、鈣信號(hào)通路、cAMP信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、toll樣受體信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路、甲狀腺激素信號(hào)通路、類節(jié)點(diǎn)受體信號(hào)通路)、傳染病相關(guān)(利什曼病、瘧疾、乙型肝炎、非洲錐蟲病、百日咳、南美錐蟲病、軍團(tuán)菌?。⑸窠?jīng)活性配體受體相互作用、肌動(dòng)蛋白骨架的調(diào)節(jié)(見(jiàn)圖4)。KEGG結(jié)果顯示,升陷湯通過(guò)多種疾病通路、信號(hào)通路改善低血壓性腦梗死預(yù)后。
圖4 各模塊靶點(diǎn)KEGG分析結(jié)果前10名
病理性低血壓可以導(dǎo)致腦灌注不足發(fā)生缺血性腦卒中,此類腦卒中為低血壓性腦梗死。中醫(yī)學(xué)無(wú)低血壓病名,一般辨病屬于虛勞,辨證屬于大氣虛損證,治以扶正補(bǔ)虛、益氣升陷法[3]。缺血性腦卒中的中醫(yī)病名往往被認(rèn)為是“中風(fēng)”“厥證”“類中風(fēng)”等,辨證通常分為中經(jīng)絡(luò)和中臟腑,病邪以風(fēng)、痰、瘀為主,多治以息風(fēng)、豁痰、化瘀法[9]。升陷湯治大氣下陷所致諸癥,“大氣”早在《黃帝內(nèi)經(jīng)》[10]中就被提及,后世醫(yī)家認(rèn)為大氣即宗氣多出于此。張錫純?cè)凇夺t(yī)學(xué)衷中參西錄》中對(duì)大氣的作用論述頗詳,張氏認(rèn)為“至胸中大氣,獨(dú)名為大氣者,誠(chéng)以其能撐持全身,為諸氣之綱領(lǐng),包舉肺外,司呼吸之樞機(jī),故鄭而重之曰大氣”[11]。升陷湯方中重用黃芪,其味甘,性微溫,兼具補(bǔ)氣、益氣之功;知母其性涼潤(rùn),不僅制黃芪之溫?zé)幔铱汕鍤庀葜魺?,再輔以柴胡、升麻與桔梗,以助其升提之效。柴胡、升麻為引經(jīng)藥,分別入少陽(yáng)、陽(yáng)明經(jīng),以引下陷之大氣自左、右而升;桔梗味辛且微溫,可引藥入肺經(jīng),導(dǎo)藥力直達(dá)胸中。氣虛甚者,加人參以培補(bǔ)元?dú)?,顧護(hù)大氣之根,或加凈山茱萸肉以收斂大氣,防其耗散太過(guò);下陷甚者,倍用升麻,以增全方升提之力[12]。同時(shí)張氏又在升陷湯一方后,附有回陽(yáng)升陷湯、解郁升陷湯以及醒脾升陷湯三個(gè)變方,來(lái)治療大氣下陷兼加心肺陽(yáng)虛、氣分郁結(jié)或脾虛諸證。臨床研究也表明升陷湯對(duì)低血壓性腦梗死治療及預(yù)后有較好的作用。
現(xiàn)代藥理研究表明,升陷湯中黃芪具有雙向調(diào)節(jié)血壓的作用,其升壓作用與增加心排血量和收縮血管有關(guān)[13],黃芪總黃酮對(duì)腦缺血再灌注損傷大鼠具有明顯的保護(hù)作用,其可能與抑制氧化應(yīng)激水平、減少炎癥反應(yīng)、抗凋亡作用有關(guān)[14];知母中皂苷類成分能增加腦血流量,減輕能量代謝障礙,抗氧化損傷[15];柴胡皂苷A對(duì)腦損傷大鼠認(rèn)知功能有明顯改善作用[16];升麻苷H-1不僅能透過(guò)血腦屏障,同時(shí)可調(diào)節(jié)腦缺血興奮性氨基酸神經(jīng)遞質(zhì)的功能紊亂,對(duì)缺血腦組織神經(jīng)元有一定的保護(hù)作用[17]。
對(duì)單味藥、藥對(duì)、拆方的化學(xué)成分及其藥理作用的研究表明,升陷湯整方及組分、成分具有較好的治療腦梗死的作用,本研究在此基礎(chǔ)上,利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的技術(shù)方法,通過(guò)“升陷湯活性成分-交集基因-通路”關(guān)系網(wǎng)絡(luò)的搭建、拓?fù)鋮?shù)的分析及生物通路的信息挖掘,對(duì)升陷湯的活性成分、關(guān)鍵靶點(diǎn)及其分子機(jī)制進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)升陷湯活性化合物69個(gè),交集基因131個(gè),其中相關(guān)度最高的是槲皮素和木樨草素。而槲皮素和木樨草素均能通過(guò)調(diào)節(jié)ROS的生成,抑制IL-1β、TNF-α、IL-6、IFN-γ的表達(dá),發(fā)揮其抗氧化及清除自由基、抗炎、抗病毒、抗腫瘤、降糖及免疫調(diào)節(jié)作用,減輕腦缺血再灌注后神經(jīng)功能損傷[18]。
PPI網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析結(jié)果顯示,升陷湯主要通過(guò)JUN、MAPK1、TP53、TNF、Akt1、RELA、MAPK14、IL6、APP、CXCL8等靶蛋白改善低血壓性腦梗死預(yù)后、減輕腦缺血再灌注后神經(jīng)功能損傷。JUN編碼的蛋白是cjun,c-jun既可通過(guò)促進(jìn)雙皮質(zhì)素(DCX)的表達(dá)來(lái)保護(hù)神經(jīng)元,同時(shí)也可激活Caspase蛋白家族以啟動(dòng)細(xì)胞凋亡程序[19]。Akt1通過(guò)刺激血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子、PI3K-Akt途徑誘導(dǎo)血管內(nèi)皮細(xì)胞遷移[20],從而介導(dǎo)血管生成,改善腦缺血。升陷湯中活性化合物多為黃酮類化合物,可通過(guò)抑制炎癥轉(zhuǎn)錄因子NF-κB實(shí)現(xiàn)鎮(zhèn)痛、抗氧化、抗炎的作用,減少TNF-α、IL-6、IL-8等炎癥因子的產(chǎn)生,增強(qiáng)抗凋亡信號(hào)傳導(dǎo),促進(jìn)髓鞘再生,使神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)部鈣超載減弱[21]。APP是結(jié)合銅的淀粉樣蛋白前體蛋白,與維持銅穩(wěn)態(tài)關(guān)系密切,可以被銅離子和生長(zhǎng)因子樣結(jié)構(gòu)域(GFLD)刺激,加速突觸生成,改善神經(jīng)功能[22]。
PPI聚類分析后,交集基因分為3大模塊。各模塊GO富集分析結(jié)果表明,模塊一靶點(diǎn)主要參與對(duì)藥物反應(yīng)、細(xì)胞對(duì)脂多糖的反應(yīng)、對(duì)脂多糖的反應(yīng)、衰老、RNA聚合酶II啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、炎癥反應(yīng)等生物學(xué)過(guò)程。模塊二靶點(diǎn)主要參與對(duì)凋亡過(guò)程負(fù)調(diào)控、細(xì)胞對(duì)缺氧的反應(yīng)、缺乏配體時(shí)的體外凋亡信號(hào)通路、RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控等生物學(xué)過(guò)程。模塊三靶點(diǎn)主要參與G蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路、磷脂酶C激活G蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路、腺苷酸環(huán)化酶激活腎上腺素能受體信號(hào)通路、MAPK級(jí)聯(lián)的正調(diào)控、細(xì)胞增殖的正調(diào)控、血小板脫粒等生物學(xué)過(guò)程改善低血壓性腦梗死預(yù)后。
KEGG通路富集結(jié)果顯示,升陷湯通過(guò)cGMPPKG信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、cAMP信號(hào)通路、甲狀腺激素信號(hào)通路、鈣信號(hào)通路改善低血壓性腦梗死預(yù)后。cGMP-PKG信號(hào)通路活化,可調(diào)節(jié)神經(jīng)發(fā)生[23],促進(jìn)神經(jīng)干細(xì)胞的增殖和分化[24],有效促進(jìn)腦缺血后海馬神經(jīng)發(fā)生,改善認(rèn)知功能[25]。PI3K-Akt信號(hào)通路可以通過(guò)活化Akt來(lái)刺激NF-κB信號(hào)通路、p53信號(hào)通路、甲狀腺激素信號(hào)通路,同時(shí)抑制正常細(xì)胞凋亡程序和調(diào)節(jié)血管生成[26-28]。Toll樣受體信號(hào)通路和NF-κB信號(hào)通路在局部腦缺血再灌注模型大鼠腦組織中高表達(dá)[29],黃芪甲苷可通過(guò)TLR4/NF-κB信號(hào)通路改善血管內(nèi)皮功能障礙[30],柴胡多糖通過(guò)影響并抑制TLR4信號(hào)通路而發(fā)揮其抗炎免疫作用[31]。柴胡皂苷A通過(guò)cAMP/CREB信號(hào)通路對(duì)腦損傷大鼠認(rèn)知功能有較好的改善作用[32]。鈣超載已被公認(rèn)為是腦缺血缺氧性損傷及神經(jīng)細(xì)胞死亡的共同通路,有研究顯示鈣信號(hào)作用與腦缺血再灌注損傷密切相關(guān),調(diào)節(jié)透血腦屏障能力不佳的活性組分具有進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾提高臨床療效的價(jià)值[33]。
本研究結(jié)果表明,具有益氣升提作用的升陷湯,其主要活性成分槲皮素、木樨草素等可能通過(guò)作用Akt1、TNF、RELA、IL-6、JUN、VEGFA、MYC、MAPK8、CXCL2、ESR1等關(guān)鍵靶點(diǎn)調(diào)節(jié)多條信號(hào)通路,發(fā)揮對(duì)低血壓性腦梗死的治療作用。升陷湯治療低血壓性腦梗死及改善預(yù)后的機(jī)制主要集中調(diào)節(jié)PI3K-Akt信號(hào)通路抗凋亡、cGMP-PKG通路促進(jìn)神經(jīng)干細(xì)胞增殖和分化等過(guò)程中。研究結(jié)果為進(jìn)一步探索低血壓性腦梗死動(dòng)物模型、確定治療時(shí)間窗提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù),也有助于指導(dǎo)臨床用藥,尋找有效組分和成分、開發(fā)新劑型,為開發(fā)治療缺血性腦卒中的中藥新藥奠定基礎(chǔ)。