王佳雪 王 冠 李召霞 方春秋 張 濤
(1.長春中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院, 長春 130117; 2.吉林省長白山中藥資源工程研究中心, 長春 130117)
赤芍是著名的野生道地中藥材,用量大、用途廣,應(yīng)用歷史久遠(yuǎn)。吉林省的野生資源在逐年遞減,優(yōu)質(zhì)的赤芍資源也在遞減,藥材市場供應(yīng)難以得到保障,赤芍的市場年需求量大約為4 500 t,貨源緊缺。白芍是常用家種大宗藥材[1],年需求量在2 000 t左右。擴大白芍、赤芍資源的人工栽培代替野生挖掘可緩解目前市場上白芍、赤芍短缺的現(xiàn)狀,保護中藥材資源和生態(tài)資源[2],同時對促進(jìn)經(jīng)濟發(fā)展具有重大意義。
近年來,吉林省白芍和赤芍藥材栽培發(fā)展迅速,有伊通、蛟河、松原、通化、舒蘭、柳河等多處藥材種植基地,而在吉林省藥材市場,赤芍種子品種復(fù)雜,白芍和赤芍種子藥農(nóng)難以分辨,流通過程中造成用藥混亂。根據(jù)吉林省藥材市場情況,現(xiàn)急需鑒別白芍和赤芍種子完整而準(zhǔn)確的方法。本研究利用形態(tài)特點和分子鑒定等方法研究白芍、赤芍種子鑒別方法,即是利用ITS 2序列對白芍、赤芍種子進(jìn)行DNA條形碼鑒別研究,以ITS 2序列為核心條形碼,作為藥用植物鑒定的分子依據(jù)[3-5],為吉林省白芍和赤芍藥材種植提供科學(xué)鑒定依據(jù)。白芍來源于毛茛科植物芍藥(PaeonialactifloraPall.)的干燥根,赤芍來源于毛茛科植物芍藥(P.lactifloraPalI)或川赤芍(P.veitchiiLynch)的干燥根[6]。白芍長于養(yǎng)血調(diào)經(jīng)、斂陰止汗、平抑肝陽[7];赤芍則長于清熱涼血、活血散瘀、清瀉肝火[8-9],二者具有較大的差異。探索研究白芍、赤芍藥材的共性與差異,是確保白芍、赤芍質(zhì)量的關(guān)鍵,為中藥材質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的建立和實施提供參考。
白芍和赤芍種子采集于吉林省中藥材種植基地,白芍種子樣本9份,赤芍種子樣本9份,從GenBank數(shù)據(jù)庫中下載ITS 2序列:芍藥10份,川赤芍、草芍藥各4份,新疆芍藥2份,窄葉芍藥1份(表1)。
1.2.1鑒 別
根據(jù)《中國植物志》和《中國藥典》對所采集植物及其藥用部位進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定和藥材性狀鑒別。
1.2.2藥材前處理
剪掉白芍、赤芍植株,分別將含種子的白芍殼、赤芍殼置于自封袋中,放置適量硅膠干燥,直至殼內(nèi)的白芍、赤芍種子全部裂開,將所有的白芍、赤芍種子放入袋中,放置于通風(fēng)、干燥處。
表1 白芍、赤芍及芍藥屬樣本來源及ITS 2序列GenBank登錄號
1.2.3DNA提取
白芍、赤芍基因組 DNA 提取采用改良的 CTAB法[10]提取DNA,NanoDrop估測濃度,瓊脂糖凝膠電泳質(zhì)量鑒定。
1.2.4PCR擴增及測序
實驗樣品擴增正向引物5’-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3’,反向引物為5’-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3’。 PCR反應(yīng)體系為20 μL,體系內(nèi)含PremixTaq10 μL、ddH2O 8 μL、FP(10 μM)0.5 μL、RP(10 μM)0.5 μL、DNA模板(100 ng·L-1)1 μL。ITS 2引物:每個模板做2個PCR管,離心混勻后,加入10 μL石蠟油密封,繼續(xù)離心,混勻體系后,進(jìn)行PCR擴增反應(yīng)。PCR擴增反應(yīng)步驟為95 ℃ 5 min;95 ℃ 15 s,55 ℃ 15 s,72 ℃ 1 min,40 cycles;72 ℃ 5 min;40 ℃保存。PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)純化后,進(jìn)行雙向測序,測序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
1.2.5數(shù)據(jù)處理
測序所得到的序列峰圖,運用SeqMan軟件去除引物、序列拼接,標(biāo)準(zhǔn)為堿基量不能低于20。對于所獲得ITS 2序列,可以使用隱馬爾可夫模型(HMMer)的注釋方法切除ITS 2兩端的5.85和28 S區(qū)域.獲得標(biāo)準(zhǔn)的ITS 2間隔區(qū)序列[11]。采用MEGA 7.0軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行多序列比對,計算物種(K 2 P)遺傳距離并構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,進(jìn)行研究分析。使用Bootstrap(1 000次重復(fù))檢驗各分支的支持率,僅顯示支持率≥50%的數(shù)值,來鑒定各樣本。
通過形態(tài)觀察顯示,白芍、赤芍種子樣本二者的形態(tài)相似,大小有微小差異,肉眼難以辨別,并且有一定難度,易出現(xiàn)偏差(圖1)。
總計18個白芍、赤芍種子樣本,ITS 2序列PCR擴增瓊脂糖凝膠電泳總DNA提取成功率為100%;ITS 2序列擴增成功率為100%;測序成功率100%。由測序所得峰圖分析可知,各個序列的堿基質(zhì)量均>20,通過BLAST鑒定9份白芍樣本和9份赤芍樣本堿基序列均確定為芍藥(P.lactifloraPall)。
白芍、赤芍種子及芍藥屬的39個樣本的ITS 2序列長度為230 bp。以赤芍樣本為基準(zhǔn),運用MEGA 7.0軟件進(jìn)行序列比對,39份樣本中共有54個堿基變異位點,經(jīng)MEGA 7.0分析顯示,吉林省中藥材種植基地種植的白芍、赤芍種子樣本之間沒有種內(nèi)變異位點,區(qū)分不出差異(表2),白芍種子和赤芍種子的遺傳距離為0,說明白芍種子與赤芍種子樣本無差異(表3),與從GenBank上下載的芍藥有3個變異位點,從GenBank上下載的新疆芍藥有7個變異位點,遺傳距離為0.04和0.03,從GenBank上下載的窄葉芍藥有6個變異位點,遺傳距離為0.04、0.03和0.02,從GenBank上下載的草芍藥有6個變異位點,遺傳距離為0.04、0.03、0.02和0.01,種間變異明顯,易于區(qū)分。
圖1 白芍、赤芍種子的形態(tài)特征
表2 基于ITS 2序列白芍、赤芍種子及芍藥屬的堿基變異
根據(jù)ITS 2序列,對39個樣本構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖2,除去9個白芍種子樣本、9個赤芍種子樣本以及GenBanK下載的芍藥聚在一支,其他芍藥屬各為一支,其中從GenBank上下載的川赤芍聚為一支,從GenBank上下載的新疆芍藥聚為一支,從GenBank上下載的草芍藥聚為一支,同時從GenBank上下載的川赤芍、從GenBank上下載的窄葉芍藥與新疆芍藥聚為一支。由此可以明顯的區(qū)分出芍藥屬不同種雖然在一定程度上有親緣關(guān)系,但仍然存在差別;同時結(jié)合變異位點以及(K 2 P)遺傳距離可以清晰地發(fā)現(xiàn)本實驗采集樣本白芍、赤芍種子應(yīng)用ITS 2堿基序列難以區(qū)分,種內(nèi)之間無差異,由此可得出白芍、赤芍種子2個研究樣本之間的親緣關(guān)系無差異,結(jié)合基于ITS 2堿基序列變異位點、K 2 P遺傳距離比較、NJ聚類樹顯示可得出,說明吉林省中藥材種植基地種植的白芍種子和赤芍種子是同種。
表3 基于ITS 2序列白芍、赤芍種子及芍藥屬樣本的K 2 P遺傳距離
圖2 基于ITS 2序列構(gòu)建的白芍、赤芍及芍藥屬的鄰接(NJ)樹
采用DNA條形碼鑒定技術(shù),通過ITS 2條形碼片段的比對表明白芍和赤芍種子樣本基因序列相同,說明吉林省中藥材種植基地的白芍種子和赤芍種子是同種。運用DNA條形碼鑒定技術(shù)來鑒別種子的真?zhèn)?,從而實現(xiàn)中藥鑒定標(biāo)準(zhǔn)化、自動化。分子生物學(xué)方法,即通過基因組進(jìn)行研究,比較DNA序列上的差異[12],不受樣本形態(tài)的限制,減少了人為因素的影響,使得鑒定結(jié)果具有準(zhǔn)確性。理想的DNA條形碼要有足夠的種間變異和較小的種內(nèi)差異。
這一技術(shù)的應(yīng)用對于中藥材產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重要意義,將其作為一種監(jiān)察手段,可為中藥材種質(zhì)優(yōu)選、良種培育、規(guī)?;N植等各階段提供保障;為中藥材的種植、加工、流通、臨床使用等各個環(huán)節(jié)提供保障;可維護藥農(nóng)切身利益,減少因假種劣種流通造成的損失;可為中藥材質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的建立提供一定的參考依據(jù),推進(jìn)中藥材種子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)制定實施。