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    印加孔雀草對(duì)土壤細(xì)菌群落多樣性的影響

    2020-08-20 09:07:02鄆玲玲張瑞海宋振付衛(wèi)東王然王忠輝張國良
    關(guān)鍵詞:印加萬壽菊菌門

    鄆玲玲,張瑞海,宋振,付衛(wèi)東,王然,王忠輝,張國良

    中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展研究所,北京 100081

    外來入侵雜草對(duì)生物多樣性、生態(tài)環(huán)境以及人類生產(chǎn)生活造成了嚴(yán)重的影響(Montserrat et al.,2011;萬方浩等,2002;閆小玲等,2014)。在入侵植物與土著植物的種間競爭中,土壤微生物可能起到了重要的“橋梁”的作用,外來植物可能通過改變?nèi)肭值赝寥牢⑸锶郝浣Y(jié)構(gòu)與功能促進(jìn)自身生長或阻礙共生植物的生長和更新(Yu et al.,2005;Li et al.,2006)。大量研究表明,入侵植物可以通過改變土壤微生物功能類群來改變養(yǎng)分循環(huán)及其他環(huán)境條件,進(jìn)而形成有利其競爭的微生態(tài)環(huán)境,以利于快速形成自身群落,最終實(shí)現(xiàn)入侵(Katharine et al.,2006;彭鑫怡等,2019;Niu et al.,2007;宋振等,2016)。入侵植物紫莖澤蘭(Eupatorium adenophorum)根系可從根際土壤中選擇性富集梭狀芽胞桿菌(Clostridium)和腸桿菌(Enterobacter),這些根際微生物的變化使土壤營養(yǎng)成分更有利于紫莖澤蘭生長(Chen et al.,2019);菊科植物黃頂菊(Flaveria bidentis)入侵導(dǎo)致土壤中鏈霉菌(Streptomyces)、中華桿菌(Saprospiraceae)等細(xì)菌的豐度增加,而芽孢桿菌(Bacillus)、Solibacterales等細(xì)菌的豐度減少,這些微生態(tài)環(huán)境的改變可能會(huì)影響本地植物的生長發(fā)育,從而有利于黃頂菊的入侵、競爭與擴(kuò)張(Song et al.,2017);飛機(jī)草(Chromolaena odorata)可以富集入侵地土壤中的土傳致病真菌半裸鐮刀菌(Fusarium semitectum),使其能夠抑制當(dāng)?shù)刂参锏纳L,促進(jìn)自身的入侵過程(Vaisakh et al.,2012)。另外,植物之間的競爭作用也會(huì)改變土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)(Garbeva et al.,2004),如閆素麗等(2011)研究發(fā)現(xiàn),黃頂菊與高丹草(Sorghum bicolor×S.sudanense)、向日葵(Helianthus annuus)、紫花苜蓿(Medicago sativa)和黑麥草(Lolium perenne)4種替代植物混合種植可以改變黃頂菊入侵地的微生物群落結(jié)構(gòu),使其接近于替代植物的土壤微生物類群,這可能是替代植物對(duì)黃頂菊具有較強(qiáng)競爭優(yōu)勢的原因所在;李光義等(2013)研究發(fā)現(xiàn)不同搭配方式的白三葉(Trifolium repens)、雜交甜高粱(Sorghum dochna)、雜交狼尾草(Pennisetum alopecuroides)與入侵雜草勝紅薊(Ageratum conyzoides)混種對(duì)土壤細(xì)菌多樣性產(chǎn)生了不同程度的影響。

    印加孔雀草(TagetesminutaL.)又名臭羅杰,屬菊科(Asteraceae),萬壽菊屬(Tagetes),一年生草本植物,原產(chǎn)自南美洲南部,后引種到歐洲、亞洲、非洲、馬達(dá)加斯加島、印度、澳大利亞以及夏威夷等地區(qū)。在我國境內(nèi),2006年首次臺(tái)灣地區(qū)發(fā)現(xiàn)印加孔雀草(Wang et al.,2006),2011年在北京郊區(qū)發(fā)現(xiàn)了印加孔雀草野生群落(張勁林等,2014),并呈現(xiàn)種群入侵?jǐn)U張趨勢,近幾年陸續(xù)在河北、山東、山西、西藏等多地發(fā)生大面積危害(張瑞海等,2019)。印加孔雀草對(duì)生境的適應(yīng)能力強(qiáng),耐干旱、耐鹽堿、耐瘠?。℉ulina,2008);具有強(qiáng)大的繁殖能力,種子小、產(chǎn)量高、且易傳播(張勁林等,2014);并分泌化感物質(zhì)抑制其伴生植物的生長(Meissner et al.,2013)。目前國內(nèi)對(duì)其研究較少,研究內(nèi)容主要集中在形態(tài)學(xué)、發(fā)生危害等方面,張瑞海等(2019)分析證明了印加孔雀草為具有危害性和侵入性的物種,土艷麗等(2019)研究表明了惡性入侵植物印加孔雀草能顯著增加農(nóng)作物藏青稞的死亡率;而國外對(duì)印加孔雀草的研究主要集中在其精油的化學(xué)成分及利用等方面(Martín et al.,2005)。

    目前國內(nèi)外對(duì)于印加孔雀草入侵對(duì)根際土壤微生物群落的影響研究尚未見報(bào)道。印加孔雀草入侵怎樣影響土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)?而與其共生植物存在競爭時(shí)又是否會(huì)造成土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的變化?基于以上問題,本研究采用第二代高通量測序技術(shù),以印加孔雀草為研究對(duì)象,探討其入侵及與本地植物競爭條件下土壤微生物群落的響應(yīng),比較分析印加孔雀草對(duì)土壤細(xì)菌群落多樣性的影響及其與環(huán)境因子間的關(guān)系,以期從微生態(tài)學(xué)的角度探究印加孔雀草的入侵機(jī)制,為其綜合防控及生態(tài)系統(tǒng)的修復(fù)提供理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料采集

    試驗(yàn)所需印加孔雀草種子、入侵發(fā)生地原位土壤皆采集于北京市昌平區(qū)興壽鎮(zhèn)桃林村(40°13′47.98″N、116°25′26.63″E),該地位于北京市西北部,屬暖溫帶,為半濕潤大陸性季風(fēng)氣候,具有明顯的干季和雨季,四季分明,是印加孔雀草入侵較為嚴(yán)重的地區(qū)之一。所采集的原位土壤為適合印加孔雀草生存但未入侵過的褐土,萬壽菊種子購買于市面種子公司。

    1.2 試驗(yàn)設(shè)置及取樣

    試驗(yàn)區(qū)位于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展研究所順義農(nóng)業(yè)環(huán)境綜合試驗(yàn)基地(北京市順義區(qū) 40°14′55.42″N,116°39′23.10″),設(shè)置 4 個(gè)處理(花盆大小為:23 cm×18.4 cm):未種植任何植物的裸土(不種植任何植物,記為CK)、本地植物萬壽菊單優(yōu)群落(只種植萬壽菊,記為 Te)、入侵植物印加孔雀草與本地植物萬壽菊混種群落(印加孔雀草與萬壽菊1:1種植,記為TmTe)、入侵植物印加孔雀草單優(yōu)群落(只種植印加孔雀草,記為Tm),每個(gè)處理3次重復(fù)。整個(gè)試驗(yàn)持續(xù)50 d,覆蓋植物發(fā)芽、營養(yǎng)生長等過程,使其形成相對(duì)穩(wěn)定的根際微環(huán)境,期間保證適當(dāng)?shù)乃止?yīng)。試驗(yàn)結(jié)束后,將每個(gè)花盆輕輕去除上層土(3 cm左右),然后采用抖土法取得植物根際土壤(Hofman et al.,1989)。采集到的每個(gè)處理的土壤樣品充分混勻后,分別采用四分法取得一部分土壤樣品,裝進(jìn)自封袋,立即帶回實(shí)驗(yàn)室放入?80 ℃冰箱中,用于高通量測序;其他部分也分別裝進(jìn)自封袋,帶回實(shí)驗(yàn)室,置于陰涼處自然晾干,用于測土壤 pH值、全氮(TN)、全磷(TP)、全鉀(TK)和有機(jī)質(zhì)(OM)等指標(biāo)。而后隨機(jī)選取各處理中(CK除外)長勢一致具有代表性的5株植株(混種處理中每種植物各選取5株),將植株洗凈,用于植物生物量的測定。

    1.3 植物生物量及土壤理化性質(zhì)的測定

    將植株洗凈,用濾紙吸去多余水分,120 ℃殺青、80 ℃烘干至恒質(zhì)量,測定植物干質(zhì)量。檢測前處理后的土壤樣品理化性質(zhì),包括土壤pH值(電極法),有機(jī)質(zhì)(重鉻酸鉀容量法)、全氮(半微量開氏法)、全磷(碳酸氫鈉鉬藍(lán)法)以及全鉀(火焰光度法)含量,測定方法參照鮑士旦(2005)方法。

    1.4 土壤DNA的提取及細(xì)菌16S rDNA的PCR擴(kuò)增

    采用土壤基因組 DNA提取試劑盒(北京,Solarbio公司)提取土壤樣品總基因組DNA,利用1%瓊脂糖凝膠電泳及超微量紫外分光光度法檢測DNA純度。以純化后的DNA為模板,以細(xì)菌16S rDNA V3-V4區(qū)通用引物(V3F:5'-TACGGRAGGCA GCAG-3′,V4R:5′-AGGGTATCTAATCCT-3′)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增(Peiffer et al.,2013;Bortolini et al.,2016)。采用TransGen AP221-02 PCR反應(yīng)體系:TransStart Fastpfu DNA Polymerase,20 μL,DNA 模板 10 ng,上、下游引物(5 μmol·L?1)各 0.4 μL,dNTP(2.5 mmol·L?1) 2 μL , FastPfu Polymerase 0.4 μL ,5×FastPfu buffer 4μL,補(bǔ)充 ddH2O 至 20 μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性2 min;95 ℃變性30 s、55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,30個(gè)循環(huán);最后于72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。每個(gè)樣品3個(gè)重復(fù),將同一樣品的PCR產(chǎn)物混合后用質(zhì)量體積比為2%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測。

    1.5 Miseq文庫構(gòu)建及測序

    樣品質(zhì)檢合格之后,構(gòu)建測序文庫,其步驟分為:(1)連接“Y”字形接頭;(2)使用磁珠篩選去除接頭自連片段;(3)利用PCR擴(kuò)增進(jìn)行文庫模板的富集;(4)氫氧化鈉變性,產(chǎn)生單鏈DNA片段。利用Illumina公司的Miseq PE300平臺(tái)進(jìn)行測序(由北京奧維森基因科技有限公司提供),步驟如下:(1)DNA片段的一端與引物堿基互補(bǔ),固定在芯片上;(2)另一端隨機(jī)與附近的另外一個(gè)引物互補(bǔ),也被固定住,形成“橋(bridge)”;(3)PCR擴(kuò)增,產(chǎn)生DNA簇;(4)DNA擴(kuò)增子線性化成為單鏈;(5)加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標(biāo)記的dNTP,每次循環(huán)只合成 1個(gè)堿基;(6)用激光掃描反應(yīng)板表面,讀取每條模板序列第一輪反應(yīng)所聚合上去的核苷酸種類;(7)將“熒光基團(tuán)”和“終止基團(tuán)”化學(xué)切割,恢復(fù)3′端粘性,繼續(xù)聚合第2個(gè)核苷酸;(8)統(tǒng)計(jì)每輪收集到的熒光信號(hào)結(jié)果,獲知模板DNA片段的序列。

    1.6 數(shù)據(jù)分析

    Miseq測序得到的PE reads首先根據(jù)overlap關(guān)系進(jìn)行拼接,同時(shí)對(duì)序列質(zhì)量進(jìn)行質(zhì)控和過濾。由于不同樣本間的 reads數(shù)不同,因此在分析多樣性和群落組成前,先依據(jù)最低 reads數(shù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。區(qū)分樣品后進(jìn)行OTU(operational taxonomic unit)聚類分析和物種分類學(xué)分析,基于 OTU進(jìn)行物種多樣性指數(shù)分析。基于分類學(xué)信息,在各個(gè)分類水平上進(jìn)行群落結(jié)構(gòu)的統(tǒng)計(jì)分析。在上述分析的基礎(chǔ)上,進(jìn)行一系列群落結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育等的統(tǒng)計(jì)學(xué)和可視化分析。使用FLASH軟件(FLASH v 1.2.7)對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接,得到OTUs數(shù)據(jù)(Raw Tags),利用Trimmomatic(v 0.33)對(duì)Raw Tags質(zhì)控過濾,得到Clean Tags,所得Clean Tags數(shù)據(jù)上傳至在美吉云平臺(tái) I-Sanger(https://www.i-sanger.com/),進(jìn)行數(shù)據(jù)分析?;?97%相似度下,利用 Usearch(vsesion 7.0)軟件在Silva數(shù)據(jù)庫進(jìn)行OTU物種分類學(xué)分析和聚類分析。4組樣本利用Adonis置換多因素方差分析和 ANOSIM 相似性分析,判斷分組的可信度和可行性。

    Ace、Chao指數(shù)為土壤細(xì)菌群落豐富度指標(biāo),皆用以估計(jì)群落中OTU數(shù)目,Chao指數(shù)采用chao1算法(Chao,1984),Ace指數(shù)算法與其不同(Chao et al.,1993);Shannon、Simpson 指數(shù)為用來估算樣品中細(xì)菌群落多樣性指標(biāo),Shannon值越大群落多樣性越高(Shannon,1948a,1948b),Simpson指數(shù)則是由 Edward Hugh Simpson(1949)提出,Simpson值越大群落多樣性越低。利用 mothur(version v.1.30.1)對(duì) Ace、Chao、Shannon 和 Simpson指數(shù)進(jìn)行分析Alpha多樣性,用T檢驗(yàn)分析Alpha多樣性指數(shù)差異,然后用R作圖;利用柱形圖表示細(xì)菌群落組成;各樣本差異物種組成通過One-way ANOVA單因素方差分析,LEfSe軟件首先使用nonparametric factorial Kruskal-Wallis (KW) sum-rank test(非參數(shù)因子克魯斯卡爾—沃利斯秩和驗(yàn)檢)檢測具有顯著豐度差異特征,并找到與豐度有顯著性差異的類群,然后采用線性判別分析(LDA)來估算每個(gè)組分(物種)豐度對(duì)差異效果影響的大小;環(huán)境因子與菌群的關(guān)聯(lián)分析,檢測pH、OM、TN、TP、TK等5個(gè)指標(biāo),利用單因素方差分析及posthoc檢驗(yàn)篩選不同樣點(diǎn)根際土壤菌群差異物種,通過計(jì)算環(huán)境因子與根際土壤菌群之間的相關(guān)性系數(shù)(Spearman等級(jí)相關(guān)系數(shù)、Pearson相關(guān)系數(shù)等),然后利用Pheatmap Package軟件,將獲得的數(shù)值矩陣通過Heatmap圖展示出平均相對(duì)豐度前10的屬與環(huán)境因子的相關(guān)性。

    2 結(jié)果

    2.1 植物生物量及土壤理化性質(zhì)

    各處理印加孔雀草與萬壽菊的生物量及土壤理化性質(zhì)指標(biāo)分析結(jié)果如表1所示。結(jié)果顯示,無論單種(Tm、Te)處理還是混種(TmTe)處理,入侵植物印加孔雀草的生物量都顯著高于萬壽菊。土壤理化性質(zhì)結(jié)果顯示,相比于CK,3個(gè)處理(Tm、Te、TmTe)的土壤理化性質(zhì)都發(fā)生了不同程度的變化。土壤pH均呈堿性,且有印加孔雀草入侵過的土壤pH顯著增加,各處理之間差異顯著(P<0.05);種植植物的3個(gè)處理中,TmTe的土壤全氮(TN)質(zhì)量分?jǐn)?shù)高于Tm(P=0.033)與Te(P=0.722),均值為0.116%;Tm的土壤全鉀(TK)質(zhì)量分?jǐn)?shù)顯著高于 TmTe(P=0.047)與 Te(P=0.028),為 1.473%;土壤全磷(TP)、有機(jī)質(zhì)質(zhì)量分?jǐn)?shù)在各處理之間差異不顯著。

    表1 植物生物量及土壤理化性質(zhì)比較Table 1 Comparison of plant biomass, soil physical and chemical properties

    2.2 土壤細(xì)菌的OTU豐度和α多樣性

    對(duì) 12個(gè)樣品進(jìn)行高通量測序,共產(chǎn)生 223.72 Mb干凈數(shù)據(jù),經(jīng)過拼接和過濾處理后,獲得 16S rDNA標(biāo)簽序列,并根據(jù)97%的序列相似性劃為不同的OTU。OTUs豐度稀釋曲線(圖1)顯示,隨著測序數(shù)量的增加,稀釋曲線斜率逐漸降低,趨向平坦但未達(dá)平臺(tái)期,說明大多數(shù)樣本的測序數(shù)據(jù)量足夠,能夠反映樣品中的物種組成特征。

    圖1 樣品在遺傳距離0.03下的稀釋曲線圖Fig. 1 The rarefaction of different samples obtained at the genetic distances of 0.03

    圖2 樣品在遺傳距離0.03下的細(xì)菌α多樣性指數(shù)Fig. 2 Alpha diversity for different samples obtained at genetic distance of 0.03

    土壤細(xì)菌豐富度指數(shù)和多樣性指數(shù)如圖 2所示,CK、Tm、Te與TmTe的Simpson指數(shù)均值分別為0.0035、0.0030、0.0035、0.0033,Shannon指數(shù)均值分別為6.75、6.89、6.82、6.80,Tm與CK表現(xiàn)出了明顯差異,Simpson指數(shù)顯著低于 CK(P=0.033)、Shannon指數(shù)顯著高于CK(P=0.024),說明印加孔雀草單優(yōu)群落的細(xì)菌群落多樣性最高,其它處理未表現(xiàn)出與CK的顯著性差異;CK、Tm、Te以及 TmTe的 Ace指數(shù)均值分別為 4035.9、3964.7、3918、3718.2,Chao指數(shù)的均值分別為4000.4、3928.6、3907.2、3691.7,TmTe的Ace指數(shù)顯著低于CK(P=0.039)與Tm(P=0.035)、Chao指數(shù)顯著低于CK(P=0.049),說明印加孔雀草與萬壽菊混種處理群落豐富度最低,印加孔雀草單優(yōu)群落的豐富度高于混種處理,萬壽菊單優(yōu)群落與其他處理未表現(xiàn)出顯著性差異。

    2.3 高通量序列生物信息學(xué)分析

    通過測序共產(chǎn)生4615個(gè)細(xì)菌OTU(圖3),其中 4個(gè)處理共有的 OTUs為 3169個(gè),占總數(shù)的68.67%。CK的細(xì)菌群落數(shù)最高,平均含4189個(gè)細(xì)菌OTU;Tm次之,為4110個(gè)OTU;TmTe的細(xì)菌群落數(shù)最低,為3814個(gè)OTU。且TmTe和Te相比,TmTe特有的細(xì)菌OTU數(shù)目為321個(gè),占8.42%。結(jié)果說明,不同處理帶來了不同程度的土壤細(xì)菌OTU差異,混種處理土壤細(xì)菌OTU數(shù)目最低,印加孔雀草單優(yōu)群落處理有使OTU數(shù)目升高的趨勢,這與α多樣性中的群落豐富度的研究結(jié)果一致。

    圖3 細(xì)菌OTUs分布韋恩圖Fig. 3 Venn graph of bacteria OTUs distribution

    2.4 細(xì)菌群落組成

    選取各樣品中細(xì)菌在門分類水平上最大豐度排名前 10的物種,生成物種相對(duì)豐度堆積圖(圖4)。由圖4可知,4個(gè)處理的土壤樣品都具有豐富的物種,其中豐度最高的 5個(gè)門為變形菌門(Proteobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)及芽單胞菌門(Gemmatimonadetes),共計(jì)占各處理的80%以上。12個(gè)樣品中所檢測到的細(xì)菌門的數(shù)量相似,但不同處理不同門所占的比例不同。相比于裸土(CK),其他3個(gè)處理中不同門所占比例都有不同程度的變化。進(jìn)一步分析3個(gè)處理(Te、TmTe、Tm)的群落組成平均值,發(fā)現(xiàn)隨著印加孔雀草密度的增加(Te、TmTe、Tm),放線菌門、綠彎菌門以及芽單胞菌門所占的比例呈現(xiàn)出先升高再降低的趨勢,變形菌門呈現(xiàn)先降低后升高的趨勢,而酸桿菌門呈現(xiàn)不斷上升的趨勢,但差異不顯著。這表明不同門下的細(xì)菌在印加孔雀草入侵過程中發(fā)揮著不同的功能,而酸桿菌門有可能在其入侵過程中起到比較重要的作用。

    圖4 門水平上的細(xì)菌相對(duì)豐度柱形圖Fig. 4 The relative abundance of bacteria in Phylum level

    2.5 Lefse多級(jí)物種差異判別分析

    抽取出在門至屬水平上各處理序列數(shù)總和大于等于100個(gè)OTU的細(xì)菌,利用LEfSe軟件,可以得到Tm、Te、TmTe分別與CK相比顯著富集且具有顯著差異的菌,這些細(xì)菌與各自處理的植物群落的生長與維持關(guān)系密切,分別記為Tm vs CK、Te vs CK和 TmTe vs CK,對(duì)其進(jìn)行韋恩圖分析(圖5)。得到對(duì)印加孔雀草入侵有利的細(xì)菌,為共同存在于Tm vs CK和TmTe vs CK中但不屬于Te vs CK的10個(gè)OTU類群。對(duì)其進(jìn)行進(jìn)一步分析(表2)顯示,這10個(gè)OTU類群隸屬于變形菌門、放線菌門、藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)及酸桿菌門4個(gè)門,其數(shù)量分別為3、3、3、1個(gè)。其中,變形菌門下的有多囊粘細(xì)菌科(Polyangiaceae)、侏囊菌科(Nannocystaceae)等3個(gè)科下的3個(gè)菌屬;放線菌門下的有假諾卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)、Ilumatobacteraceae科等2個(gè)科下的3個(gè)菌屬;藍(lán)細(xì)菌門下的有念珠藻科(Nostocaceae)、席藻科(Phormidiaceae)等2個(gè)科下的 3個(gè)菌屬以及酸桿菌門下Blastocatellaceae科下的 1個(gè)菌屬。另外,TmTe顯著性差異于其他處理的菌為圖中 29個(gè)OTU類群,Tm顯著性差異于其它處理的菌為圖中33個(gè)OTU類群。

    圖5 3個(gè)處理分別顯著富集且具有顯著差異于CK的細(xì)菌韋恩圖Fig. 5 Venn graph of bacteria with significant enrichment and difference between the three treatments and CK

    2.6 環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析

    選取各樣品中細(xì)菌在門分類水平上最大豐度排名前 10的物種,通過計(jì)算環(huán)境因子與菌群之間的 Spearman等級(jí)相關(guān)系數(shù),生成環(huán)境因子相關(guān)性Heatmap圖(圖6)。由圖6可知,不同菌群與各種環(huán)境因子體現(xiàn)出不同程度的相關(guān)性關(guān)系。其中,硝化螺旋菌門(Nitrospirae)、酸桿菌門、棒狀桿菌門(Rokubacteria)、浮霉菌門(Planctomycetes)、放線菌門、變形菌門、擬桿菌門(Bacteroidetes)、綠彎菌門以及芽單胞菌門與土壤全磷、全鉀含量呈不同程度的正相關(guān),與土壤pH呈現(xiàn)出了不同程度的負(fù)相關(guān),與土壤全氮和土壤有機(jī)質(zhì)含量無明顯相關(guān)性,個(gè)別呈現(xiàn)出了微弱的負(fù)相關(guān)關(guān)系。其中,放線菌門與土壤全鉀含量呈極顯著正相關(guān)(R=0.71735,P=0.00863),硝化螺旋菌門、變形菌門、擬桿菌門、綠彎菌門以及芽單胞菌門與土壤全鉀含量呈顯著正相關(guān)。但是,藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)與環(huán)境因子之間的關(guān)系不同于其他菌門,具體表現(xiàn)與土壤全氮、全磷、全鉀含量呈微弱的負(fù)相關(guān),與pH、有機(jī)質(zhì)含量呈微弱的正相關(guān)。

    3 結(jié)論與討論

    3.1 討論

    高通量序列生物信息學(xué)及α多樣性分析結(jié)果表明,印加孔雀草單優(yōu)群落的土壤細(xì)菌群落多樣性最高且顯著高于CK,其它處理未表現(xiàn)出與CK的顯著性差異,這說明印加孔雀草的入侵可以提高土壤細(xì)菌群落多樣性,且入侵植物印加孔雀草對(duì)于土壤細(xì)菌多樣性的作用效果要大于與其共生的萬壽菊。宋振等(2016)在研究同為菊科的入侵植物黃頂菊的根際微生物群落結(jié)構(gòu)時(shí)發(fā)現(xiàn),黃頂菊單優(yōu)群落的土壤細(xì)菌群落多樣性顯著高于本地植物,這與本研究的結(jié)果是一致的;入侵植物空心蓮子草(Altemanthera philoxeroides)可以通過改變土壤微生物菌群的結(jié)構(gòu)和豐富度從而影響土壤有機(jī)碳的形成,其入侵提高了土壤微生物群落的多樣性(李珂,2019),印加孔雀草提高土壤細(xì)菌群落多樣性從而形成有利于自身生長的微生態(tài)環(huán)境,進(jìn)而提高生物量以促進(jìn)自身生長及發(fā)育,這很有可能是其入侵成功的重要原因之一。有研究表明,紫莖澤蘭與本地植物存在競爭時(shí),其土壤細(xì)菌的群落豐富度與未入侵土壤及紫莖澤蘭單優(yōu)群落土壤之間未表現(xiàn)出明顯差異(朱珣之等,2015);互花米草(Spartina alterniflora)入侵改變了土壤微生物群落和提高了根際微生物豐富度,而高豐富度的根際微生物影響了土壤養(yǎng)分循環(huán)和植物間的競爭關(guān)系,從而促進(jìn)互花米草快速生長,并成功入侵(章振亞等,2012)。在本研究中,印加孔雀草與萬壽菊混種處理的群落豐富度最低且顯著低于 CK,印加孔雀草、萬壽菊單種處理都未表現(xiàn)出與CK的顯著性差異,說明印加孔雀草與萬壽菊種間競爭使得土壤細(xì)菌群落豐富度降低,這可能是萬壽菊與印加孔雀草相互作用的結(jié)果。

    表2 在印加孔雀草入侵過程中起重要作用的10種菌在各水平上的分類及數(shù)目Table 2 Classification and the number in 10 bacteria that play an important role in invasion process of T. minuta L.

    圖6 門分類水平上最大豐度排名前10的細(xì)菌與環(huán)境因子的相關(guān)性Heatmap圖Fig. 6 Heatmap map of the correlation between bacteria and environmental factors in the top 10 most abundant species on Phylu m level

    本研究各處理中豐度最高的5個(gè)門依次為變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、綠彎菌門和芽單胞菌門。通過 Lefse多級(jí)物種差異判別以及進(jìn)一步的Venn分析,得到共同存在于Tm vs CK和TmTe vs CK中但不屬于Te vs CK的類群,為4個(gè)門(變形菌門、藍(lán)細(xì)菌門等)下的8個(gè)科(多囊粘細(xì)菌科、侏囊菌科、念珠藻科等)的共10個(gè)OTU類群,這些類群可能在印加孔雀草在入侵過程中起著重要作用。例如,多囊粘細(xì)菌科與侏囊菌科屬于粘細(xì)菌,隸屬于變形菌綱的粘球菌目。粘細(xì)菌是一類捕食菌,也是繼放線菌和真菌之后又一重要的活性次級(jí)代謝產(chǎn)物產(chǎn)生菌(王春玲等,2019),廣泛分布于全球各地的土壤中,能夠形成對(duì)溫度、干旱、輻射、鹽脅迫均具有抗性的粘孢子,而具有較高的環(huán)境適應(yīng)力(Shimkets,1991),其群落和代謝產(chǎn)物對(duì)土壤微生態(tài)環(huán)境的改變很可能有利于印加孔雀草的入侵。而與TmTe顯著差異的存在于Tm、Te的29個(gè)OTU類群可能有利于維持印加孔雀草入侵的土壤微生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu),Tm顯著性差異于 Te、TmTe的33個(gè)OTU類群則可能有利于印加孔雀草單優(yōu)群落狀態(tài)的維持,但是否是這些 OTU類群及其功能還需要進(jìn)一步深入研究。

    不同門類的細(xì)菌同時(shí)受到土壤理化性質(zhì)和植被特性等環(huán)境因子的影響而產(chǎn)生差異(Zhou et al.,2017),本研究中環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明,菌群與環(huán)境因子存在不同程度的顯著相關(guān)性,印加孔雀草入侵后,其根際土壤可能會(huì)快速形成穩(wěn)定的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)以及多樣性,有利于提高印加孔雀草其自身對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力以及單優(yōu)群落的形成。環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析也表明,不同門下的菌群與各種環(huán)境因子體現(xiàn)出不同的相關(guān)性特征,放線菌門與土壤全鉀含量呈極顯著正相關(guān),硝化螺旋菌門、變形菌門、擬桿菌門、綠彎菌門以及芽單胞菌門與土壤全鉀含量呈顯著正相關(guān),而藍(lán)細(xì)菌門與環(huán)境因子的關(guān)系則表現(xiàn)出了和其他菌門較為不同的特點(diǎn)。藍(lán)細(xì)菌是發(fā)現(xiàn)的最早能夠利用光合作用釋放氧氣的原核生物(Bryant,1995),在自然界中不僅分布在淡水、海水等水體中,也廣泛分布在各類土壤以及極端環(huán)境中(Nicholas et al.,1992)。本研究中藍(lán)細(xì)菌表現(xiàn)出與環(huán)境因子特殊的相關(guān)性可能是由于印加孔雀草在快速繁殖擴(kuò)散過程中對(duì)土壤有機(jī)物合成和氧氣釋放有著較為特殊的需求。

    植物根系分泌的很多次生代謝物質(zhì)可作為植物與土壤微生物互作的信號(hào)分子物質(zhì)而影響植物根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)(Ueda et al.,2010;Ahuja et al.,2012),如豚草的次生代謝產(chǎn)物對(duì)土壤微生物具有一定的選擇抑制作用(趙昕,2003),黃頂菊次生代謝產(chǎn)物紫云英苷可以改變土壤微生物群落結(jié)構(gòu)(張瑞海,2017)等。目前已有研究發(fā)現(xiàn),印加孔雀草植株能夠分泌萜烯類化感物質(zhì)從而抑制伴生植物的生長(Liza et al.,2008;Scrivanti et al.,2003),是否這些物質(zhì)也導(dǎo)致了印加孔雀草土壤微生物的改變從而有利于自身群落的穩(wěn)定,或者有其他特殊的次生代謝產(chǎn)物影響了土壤微生物群落,需要進(jìn)一步深入研究。另外,本研究采用了入侵地未生長過印加孔雀草的單一褐土類型土壤,然而不同土壤類型的起始土壤細(xì)菌群落的組成存在差異,這種差異很可能會(huì)影響入侵種對(duì)土壤的響應(yīng),印加孔雀草對(duì)不同土壤類型的響應(yīng)是否與本試驗(yàn)結(jié)果存在不同,這還需要大量重復(fù)試驗(yàn)進(jìn)行研究。

    3.2 結(jié)論

    印加孔雀草入侵能夠改變?nèi)肭值赝寥兰?xì)菌多樣性。印加孔雀草顯著提高了土壤細(xì)菌群落多樣性,其與萬壽菊混種使得土壤細(xì)菌群落豐富度顯著降低,且印加孔雀草競爭效果大于非入侵植物萬壽菊;土壤中細(xì)菌相對(duì)豐度最高的前5個(gè)門分別是變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、綠彎菌門和芽單胞菌門;不同菌群與環(huán)境因子表現(xiàn)出了不同程度的正負(fù)相關(guān)關(guān)系,其中放線菌門、硝化螺旋菌門、變形菌門、擬桿菌門、綠彎菌門以及芽單胞菌門與土壤全鉀含量呈顯著正相關(guān),藍(lán)細(xì)菌門和環(huán)境因子的相關(guān)關(guān)系不同于其他菌門;多囊粘細(xì)菌科、侏囊菌科、念珠藻科等8個(gè)科的10個(gè)OTU類群有可能在印加孔雀草入侵過程中起著重要作用。本研究結(jié)果為揭示印加孔雀草入侵的土壤微生態(tài)機(jī)制提供了理論依據(jù)。

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