舒迎霜,賀濛初,桂雪兒,夏曉冬,馮士彬,李玉,王希春,吳金節(jié)
(安徽農(nóng)業(yè)大學動物科技學院,安徽 合肥 230061)
黃芪在我國已有兩千多年的使用歷史,味甘微溫,具有益氣固表、斂汗固脫、利水消腫之功效[1].其中黃芪多糖是黃芪中最主要的活性成分,是一種可溶于水的中雜性多糖,在體內(nèi)體外均具有顯著的免疫調(diào)節(jié)作用,可參與機體的一系列免疫反應(yīng)、抗腫瘤和抗氧化等過程[2-3].經(jīng)研究證實,腸道內(nèi)微生物、多糖的代謝與機體免疫水平三者相互作用、密不可分[4].多糖可顯著促進腸道內(nèi)益生菌的增殖,提高腸道微生物多樣性,腸道微生物亦可參與多糖代謝,將多糖降解為短鏈脂肪酸,短鏈脂肪酸含量與腸道免疫與健康密切相關(guān)[5-7].犬腸道中微生物較為豐富的部位為后腸段,其中盲腸內(nèi)微生物多樣性最高,試驗表明通過調(diào)控犬腸道內(nèi)微生物的多樣性可改善犬腸道免疫功能,影響機體健康[8].Tanl等[9]研究認為,黃芪多糖可顯著提高畜禽生產(chǎn)性能并且能夠改善畜禽腸道發(fā)育.何旭云等[10]發(fā)現(xiàn)黃芪多糖可恢復高脂飲食誘導肥胖小鼠的腸道菌群紊亂現(xiàn)象.廖寧波等[11]發(fā)現(xiàn)河蜆多糖 CSPF-N可改變腸道微生物結(jié)構(gòu),微生物結(jié)構(gòu)主要由厚壁菌門、變形菌門、放線菌門和擬桿菌門組成.
前期研究表明,黃芪多糖可增強犬血清及腸粘膜免疫,加強其機體免疫力[12].本研究擬以18只健康比格犬為試驗動物,在日糧中添加黃芪多糖,通過高通量測序技術(shù)對犬盲腸菌群細菌數(shù)量、菌群多樣性以及群落結(jié)構(gòu)組成和豐度進行分析,探討黃芪多糖對犬盲腸菌群的影響,進一步探討其作用機理,為黃芪多糖在生產(chǎn)實踐中的應(yīng)用提供依據(jù).
試驗選取18只1歲齡健康比格犬,由安徽農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)院提供,動物合格證號為ZXD-C2017917,體質(zhì)量約10 kg,試驗前正常飼養(yǎng)觀察7 d,試驗前常規(guī)驅(qū)蟲與免疫,每天定時飼喂2次基礎(chǔ)日糧,上下午各1次(每次15 g/kg),自由飲水.
黃芪(制備好的中藥飲片),購自合肥立方大藥房;PBS緩沖液,購自北京索萊寶科技有限公司;三氯乙酸、NaOH,購自國藥集團化學試劑有限公司;食用酒精,購自無錫展望化工試劑有限公司.
TD-100小型提取濃縮機,購自浙江森力機械科技有限公司;LGJ-12N冷凍干燥機,購自北京亞星儀科科技發(fā)展有限公司;DHG-9243B5-Ⅲ電熱恒溫干燥箱,購自上海新苗醫(yī)療器械有限公司;HHS型數(shù)顯式電熱恒溫水浴鍋,購自上海博訊實業(yè)有限公司;臺式低速離心機,購自湖南赫西儀器裝備有限公司.
1.2.1 中藥制備 根據(jù)文獻[13]報道,稱取5 kg黃芪,去除雜質(zhì),清洗3次,瀝干水分,按照料液比1∶10的比例加入50 L濃度為80%的酒精提取3次,每次1 h,去除油脂.取出未粉碎的藥渣用電恒溫干燥箱60 ℃烘干,再稱質(zhì)量,按照料液比1∶20的比例加入純水,超聲波震蕩提取80 min.將藥液轉(zhuǎn)移至濃縮罐中濃縮至4 L,再加入3倍量的95%的酒精,4 ℃靜置12 h,使黃芪多糖沉淀,3 000 r/min離心5 min,取沉淀,加蒸餾水溶解至4 L.加入等體積5%的三氯乙酸,同時加入適量活性炭(樣品量的15%~20%)脫色,濾去活性炭,4 ℃靜置24 h,使蛋白沉淀除去蛋白.3 000 r/min離心5 min,棄去沉淀,取上清液加2 mol/L的NaOH調(diào)節(jié)pH為7.0,濃縮至4 L.加入3倍量95%酒精,使醇濃度達到80%,低溫靜置,得疏松沉淀物,洗滌干燥得脫蛋白黃芪多糖粉,4 ℃保存?zhèn)溆?考馬斯亮藍法測得蛋白質(zhì)去除率為80.25%,苯酚硫酸法測得多糖含量為12.91%.
1.2.2 試驗動物分組 將18只犬隨機分為3組,即對照組(只飼喂基礎(chǔ)日糧),低劑量組(基礎(chǔ)日糧+以生藥計1%的黃芪多糖),高劑量組(基礎(chǔ)日糧+以生藥計2%的黃芪多糖),每組6只,試驗期14 d,試驗期間各組犬的管理條件完全一致.
1.2.3 樣品采集 第14天,將全部試驗犬麻醉放血后再解剖.點酒精燈在超凈工作臺內(nèi)采取盲腸內(nèi)容物于2 mL無菌管中,保存于-80 ℃冰箱,用于高通量測序.
1.2.4 總DNA提取和16S rDNA測序 使用QIAamp DNA Microbiome Kit試劑盒提取犬盲腸內(nèi)容物中細菌總DNA,具體步驟參照試劑盒說明書進行.通過分光光度計檢測在260 nm處的OD值測得DNA的濃度,置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆?
根據(jù)16S rDNA 基因的V4區(qū)保守序列設(shè)計通用引物對:515F(5′-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3′)和806R(5′-GGACTACHVGGGTWTC TAAT-3′)進行PCR擴增.PCR反應(yīng)體系:Q5 Reaction Buffer 0.5 μL,滅菌超純水8.75 μL,Q5 GC high Enhancer 5.0 μL,dNTP 2.0 μL,上下游引物各1.0 μL,Q5 Polymerase 0.25 μL,模板DNA(40 ng)2.0 μL.擴增條件為94 ℃預(yù)變性300 s,隨后94 ℃ 60 s,64 ℃復性60 s,72 ℃延伸600 s,共25個循環(huán).每個樣本3個重復,PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測.文庫測序使用Agilent 2100生物分析儀(Agilent DNA 1000 Reagents)確定平均分子長度,并通過實時定量PCR(q-PCR)(TaqMan Probe)對文庫進行定量.總DNA 提取、PCR 擴增和基于Illumina MiSeq平臺的測序由深圳華大基因協(xié)助完成.
樣品數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)過濾,濾除低質(zhì)量的reads,剩余高質(zhì)量的Clean data方可用于后期分析;通過reads之間的Overlap關(guān)系將reads拼接成Tags;在給定的相似度下將Tags聚成OTU,然后通過OTU與數(shù)據(jù)庫比對,對OTU進行物種注釋;基于OTU和物種注釋結(jié)果進行樣品物種復雜程度分析以及組間物種差異分析.
2.1.1 測序結(jié)果 從對照組、黃芪多糖低劑量組和黃芪多糖高劑量組3組犬盲腸9個樣品中共獲得885 399條Tags,通過在97%的相似度下將已拼接優(yōu)化的Tags聚類為OTU,OTU主要用于將不同物種進行分類,可以通過OTU所代表的不同種屬找出不同環(huán)境下的核心生物.每個樣品OTU統(tǒng)計結(jié)果如表1所示.
表1 測序結(jié)果
Venn圖展示了所有樣品的OTU數(shù),并且可以直觀的看出樣品之間獨有和重疊的OTU數(shù)目.OTU的豐度表示樣品的豐度.由圖1可知,本試驗的9個樣品總共得到OTU數(shù)為1 710個,對照組559個,黃芪多糖低劑量組573個,黃芪多糖高劑量組578個.結(jié)果顯示,黃芪多糖組與對照組之間菌群豐富程度存在差異,黃芪多糖組菌群豐富度較對照組有升高趨勢,而黃芪多糖低劑量組與高劑量組之間菌群豐度無明顯差異.
2.1.2 Alpha多樣性分析 Alpha多樣性分析是針對某個樣品內(nèi)物種的多樣性進行分析,主要包括Observed species指數(shù)、Chao指數(shù)、Ace指數(shù),Shannon指數(shù)以及Simpson指數(shù)等.前4個指數(shù)越大,最后1個指數(shù)越小,說明樣品中的物種豐富度越大,群落多樣性越高.由表2可知,對照組前4個指數(shù)均小于黃芪多糖組,Simpson指數(shù)大于黃芪多糖組,說明黃芪多糖組盲腸內(nèi)容物的豐富度和多樣性高于對照組,且各個樣品的覆蓋率均大于0.999,測序的深度幾乎覆蓋了樣本中的所有物種,表明本試驗數(shù)據(jù)具有有效性.
D:對照組;E:黃芪多糖低劑量組;F:黃芪多糖高劑量組.
PCA分析即主成分分析,不同樣品的OTU組成不同,通過分析樣品的OTU組成,可以反映樣品微生物組成的差異.如果在二維平面上2個樣品距離越相近,則組成就越相似.本試驗的主成分分析圖如圖2所示,圖中橫坐標為第一主成分分析(PC1),檢測到的總微生物的代表性貢獻率為48.44%,縱坐標為第二主成分分析(PC2),貢獻率為22.13%.對照組點與黃芪多糖組點明顯分開,離散性較高,表明對照組與黃芪多糖組樣品中微生物組成差異較大;黃芪多糖低劑量組和高劑量組點基本聚集在同一范圍內(nèi),離散性低,重疊部分較大,雖也分開但距離相近,說明飼喂黃芪多糖組犬盲腸內(nèi)微生物組成更為相似.
橫坐標表示第一主成分,括號中的百分比則表示第一主成分對樣品差異的貢獻值;縱坐標表示第二主成分,括號中的百分比表示第二主成分對樣品差異的貢獻值;圖中點分別表示各個樣品;不同顏色代表樣品屬于不同的分組.
表 2 Alpha多樣性分析
2.3.1 門水平上腸道微生物豐度 由表3和圖3可知,在門水平上犬腸道微生物主要由5個優(yōu)勢菌門組成,分別為放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、變形菌門(Proteobacteria).
與對照組相比,黃芪多糖組放線菌門和厚壁菌門顯著升高(P<0.05);變形菌門顯著降低(P<0.05).黃芪多糖組擬桿菌門和梭桿菌門差異均不顯著(P>0.05),但梭桿菌門有降低趨勢.
圖3 樣本門分類水平中物種分布柱狀圖
表3 腸道微生物在門水平的物種豐度顯著性分析
不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05).
The lowercase letters indicate significant difference(P<0.05).
2.3.2 綱水平上腸道微生物豐度 由表4可知,在綱水平上犬腸道微生物主要由8個優(yōu)勢菌群組成,分別由放線菌綱(Actinobacteria)、芽孢桿菌綱(Bacilli)、擬桿菌綱(Bacteroidia)、β-變形菌綱(Betaproteobacteria)、梭菌綱(Clostridia)、丹毒絲菌綱(Erysipelotrichia)和梭桿菌綱(Fusobacteriia)組成.
與對照組相比,黃芪多糖組放線菌綱和芽孢桿菌綱顯著升高(P<0.05),β-變形菌綱極顯著降低(P<0.01),丹毒絲菌綱和梭桿菌綱顯著降低(P<0.05).黃芪多糖組擬桿菌綱和梭菌綱與對照組相比差異不顯著(P>0.05).
表4 腸道微生物在綱水平的物種豐度顯著性分析
不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05);不同大寫字母表示差異極顯著(P<0.01).
The lowercase letters indicate significant difference(P<0.05);The uppercase letters indicate extremely significant difference(P<0.01).
2.3.3 科水平上腸道微生物豐度 由表5可知,在科水平上犬腸道微生物組成有13種,其中主要為產(chǎn)堿桿菌科(Alcaligenaceae)、擬桿菌科(Bacteroidaceae)、雙歧桿菌科(Bifidobacteriaceae)、梭桿菌科(Fusobacteriaceae)、乳桿菌科(Lactobacillaceae)、丹毒絲菌科(Erysipelotrichaceae)、消化鏈球菌科(Peptostreptococcaceae)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、瘤胃菌科(Ruminococcaceae).
與對照組相比,黃芪多糖組梭桿菌科極顯著降低(P<0.01);雙歧桿菌科和乳桿菌科顯著升高(P<0.05);黃芪多糖低劑量組普雷沃氏菌科顯著升高(P<0.01),高劑量組極顯著升高(P<0.01).
表5 腸道微生物在科水平的物種豐度顯著性分析
不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05);不同大寫字母表示差異極顯著(P<0.01).
The lowercase letters indicate significant difference(P<0.05);The uppercase letters indicate extremely significant difference(P<0.01).
2.3.4 屬水平上腸道微生物豐度 由表6可知,在屬水平上犬腸道微生物組成有26種,其中比重較多的有10種,分別為別樣棒菌屬(Allobaculum)、擬桿菌屬(Bacteroides)、勞特氏菌屬(Blautia)、梭菌屬(Clostridium)、糞桿菌屬(Faecalibacterium)、梭桿菌屬(Fusobacterium)、乳酸桿菌屬(Lactobacillus)、考拉桿菌屬(Phascolarctobacterium)、普氏菌屬(Prevotella)、薩特氏菌屬(Sutterella).
與對照組相比,黃芪多糖組別樣棒菌屬極顯著增加(P<0.01),勞特氏菌屬、乳酸菌屬和普氏菌屬顯著增加(P<0.05);黃芪多糖低劑量組梭桿菌屬顯著降低(P<0.05),高劑量組極顯著降低(P<0.01);黃芪多糖組擬桿菌屬、糞桿菌屬和薩特氏菌屬與對照組相比均無顯著差異(P>0.05).
表6 腸道微生物在屬水平的物種豐度顯著性分析
不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05);不同大寫字母表示差異極顯著(P<0.01).
The lowercase letters indicate significant difference(P<0.05);The uppercase letters indicate extremely significant difference(P<0.01).
黃芪多糖作為黃芪中含量較高的免疫活性物質(zhì)之一,能夠顯著促進機體免疫器官和免疫細胞的發(fā)育,提高動物的免疫力和生產(chǎn)性能,在畜禽養(yǎng)殖上可作為1種免疫佐劑被廣泛應(yīng)用.并且多糖作為益生元,可刺激機體腸道中部分益生菌的增值以及代謝水平,調(diào)節(jié)人體腸道菌群多樣性改善機體健康[4].動物腸道中棲息著數(shù)量龐大且復雜的菌群,能夠維持機體胃腸道系統(tǒng)的生態(tài)平衡,進一步促進機體對營養(yǎng)物質(zhì)的消化和吸收[14-15].并且正常動物體內(nèi)的微生物群落是重要的腸道保護屏障,對于某些病原微生物的入侵有顯著的拮抗作用.本試驗采用高通量測序技術(shù)對9只犬的新鮮糞便進行測序分析,3組犬盲腸9個樣品中共獲得885 399條高質(zhì)量的細菌16S rDNA 序列.Alpha多樣性分析和PCA分析顯示,各組覆蓋率均大于0.999,說明本次試驗測序結(jié)果已基本覆蓋所有樣本,證實了試驗數(shù)據(jù)的有效性,另外飼喂黃芪多糖組Chao指數(shù)、ACE指數(shù)、Shannon指數(shù)均高于對照組,而Simpon指數(shù)小于對照組,這說明隨著飼糧中黃芪多糖含量的增加,犬盲腸內(nèi)微生物數(shù)量和群落多樣性也在升高,且黃芪多糖組犬腸道菌群組成更為相似.甄玉國等[16]研究發(fā)現(xiàn)黃芪多糖可提高斷奶仔豬盲腸菌群細菌數(shù)量,與本試驗結(jié)果相一致.
通過高通量測序技術(shù)發(fā)現(xiàn),飼喂黃芪多糖后犬盲腸內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,在門水平上的優(yōu)勢菌門主要為放線菌門、擬桿菌門、厚壁菌門、梭桿菌門、變形菌門.Norouzi等[17]研究發(fā)現(xiàn)放線菌可抵抗多種抗耐藥性病原微生物,屬于潛在益生菌.厚壁菌門的部分細菌能促進多糖在腸道中充分發(fā)酵,維持動物腸道健康,提高免疫[18].梭桿菌門內(nèi)細菌大部分為條件致病菌,一定情況下會導致某些疾病的發(fā)生.變形菌門包括大腸桿菌、沙門氏菌、霍亂弧菌、幽門螺桿菌等,多數(shù)為病原菌,易引起疾病損害機體健康.與對照組相比,飼喂黃芪多糖組犬腸道內(nèi)放線菌門、厚壁菌門細菌所占比例顯著增加,變形菌門顯著降低;梭桿菌門有降低趨勢,這與賀琴等[19]研究結(jié)果相似.在綱水平上,放線菌綱和芽孢桿菌綱顯著升高,β-變形菌綱、丹毒絲菌綱和梭桿菌綱顯著降低.
在科水平上,梭桿菌科顯著降低,雙歧桿菌科、乳桿菌科和普雷沃氏菌科顯著升高;在屬水平上,別樣棒菌屬、勞特氏菌屬、乳酸菌屬和普氏菌屬顯著增加;梭桿菌屬顯著降低,與李樹鵬等[20]試驗結(jié)果相一致.王學智等[21]發(fā)現(xiàn)一定劑量和濃度的黃芪粗多糖在體外有利于雞腸道部分細菌增值,主要為乳桿菌和雙歧桿菌.有研究發(fā)現(xiàn)梭桿菌屬主要與結(jié)直腸癌有關(guān)[22],結(jié)直腸癌患者腸道中梭桿菌屬細菌數(shù)量較正常人顯著上升,本研究結(jié)果顯示梭桿菌屬細菌數(shù)量有所降低,可能與黃芪多糖有顯著的抗癌、抗腫瘤作用有關(guān).普雷沃氏菌科主要功能是分解淀粉、粘蛋白以及半纖維素等代謝產(chǎn)物,同時可產(chǎn)生短鏈脂肪酸[23].腸道中有益菌大多可產(chǎn)生短鏈脂肪酸,短鏈脂肪酸作用有抗炎、保護腸黏膜功能、調(diào)節(jié)代謝水平和免疫功能等作用,能產(chǎn)生短鏈脂肪酸的細菌主要有勞特氏菌屬、別樣棒菌屬、普氏菌屬、乳酸菌屬等.腸道中有害菌大多會產(chǎn)生內(nèi)毒素,腸道中內(nèi)毒素含量上升會引起腸道炎癥反應(yīng)、腸黏膜功能紊亂、代謝失衡和免疫失調(diào)等一系列疾病,能產(chǎn)生內(nèi)毒素的細菌主要包括變形菌門以及梭桿菌門的細菌[24-25].同時,多糖也可被腸道內(nèi)微生物分解為短鏈脂肪酸,主要為乙酸、丙酸和丁酸,腸上皮細胞可將多糖降解的丁酸重新利用,調(diào)控腸上皮細胞和腸上皮間淋巴細胞的增值和凋亡,且代謝產(chǎn)生的酸性物質(zhì)可以維持腸道內(nèi)酸性環(huán)境[26-27].低pH環(huán)境對部分病原微生物的生長非常不利,有害微生物的生存條件更加困難,病原微生物入侵腸道導致腸道疾病的風險顯著降低,從側(cè)面保護了腸黏膜免疫屏障的完整性.
在犬日糧中添加黃芪多糖在一定時間內(nèi)可使犬腸道內(nèi)菌群數(shù)量增多,多樣性上升,且黃芪多糖可使腸道菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,益生菌所占比例增加,條件致病菌比例下降,從而加強腸道的保護屏障,調(diào)節(jié)機體的免疫力.而黃芪多糖低劑量組與高劑量組盲腸菌群數(shù)量、多樣性和群落組成結(jié)構(gòu)無明顯差異.