董貴彬, 潘穎越, 司雅楠, 王新月, 白仲虎, 劉秀霞, 楊艷坤
(糧食發(fā)酵工藝與技術(shù)國家工程實驗室 工業(yè)生物技術(shù)教育部重點實驗室 江南大學 生物工程學院, 無錫 214122)
人胃內(nèi)因子(Gastric intrinsic factor,gif,GIF)是一種由胃黏膜壁細胞產(chǎn)生的糖蛋白(NCBI Reference Sequence: NP_005133.2;GeneID:2694),具有結(jié)合并保證維生素B12有效吸收的功能。有人通過該作用機制提出了一種口服給藥方式,可以保證藥物不被降解且被人體有效吸收[1]。在人體內(nèi),GIF的缺乏將直接導致機體無法正常吸收維生素B12,進而引起機體患惡性貧血[2]。Mottram等人通過小鼠模型研究發(fā)現(xiàn)GIF缺失會導致機體免疫力下降,易感染腸道沙門氏菌等病菌[3]。GIF由胃黏膜壁細胞產(chǎn)生,存在于人的胃腸道內(nèi),與食物中的VB12結(jié)合后通過小腸吸收,在維持機體健康中扮演著重要角色,但是目前尚未有關(guān)于表達生產(chǎn)人胃內(nèi)因子的研究報道。
此前,C.glutamicum主要應用于各種氨基酸和醇等小分子的生產(chǎn)[4-5]。研究發(fā)現(xiàn),其在蛋白表達上同樣具有優(yōu)勢。它不產(chǎn)內(nèi)毒素,胞外水解酶活性低,能夠產(chǎn)生正確折疊的外源蛋白[6]。目前已有用C.glutamicum表達scFv、EGFP、VHH和淀粉酶等外源蛋白報道[7-9]。C.glutamicum可以作為一種優(yōu)良的宿主用于各種蛋白的發(fā)酵生產(chǎn)[10-11],尤其是一些對內(nèi)毒素等嚴格限制的藥用蛋白。本研究擬利用谷氨酸棒桿菌CGMCC1.15647(C.glutamicumCGMCC1.15647)進行藥用蛋白人胃內(nèi)因子的表達生產(chǎn)。
1.1.1 菌株與質(zhì)粒
E.coliDH5α和C.glutamicumCGMCC1.15647由本實驗室保藏。pXMJ19保藏于本實驗室;pUC57-kan由蘇州金唯智有限責任公司提供。
1.1.2 主要試劑與儀器
PrimeSTAR? Max DNA Polymerase,DNA Ligation Kit購自TAKARA公司;Hind III、BamH I購自Thermo公司;DNA凝膠回收、PCR純化和質(zhì)粒小量提取試劑盒均購自Axygen公司;人胃內(nèi)因子(GIF)ELISA檢測試劑盒購自ImmunoClone公司。
PCR儀購自LongGene公司;超聲破碎儀購自sonics公司;AKTA蛋白純化儀購自通用電氣公司。
1.1.3 培養(yǎng)基
LB和LBB[LB添加1%(W/V)腦心浸出液]若用到固體,均補加1.8%(W/V)瓊脂粉,若用到氯霉素或卡那霉素抗生素,針對E.coli和C.glutamicum的工作濃度分別為30和10 μg/mL。
1.2.1 基因合成
從NCBI獲取天然人胃內(nèi)因子的氨基酸序列,對其編碼序列進行密碼子優(yōu)化,由蘇州金唯智有限公司進行序列合成,獲取重組基因克隆載體pUC57-kan-rgif。
1.2.2 表達載體pXMJ19-rgif的構(gòu)建
以pUC57-kan-rgif為模板,以rgif-F和rgif-R為引物,PCR克隆rgif。引物序列如下:
rgif-F:5′-TTCGAAGCTTAAAGGAGGACAACCATGGCCTGGTTTGCCCTG-3′(直線為Hind III位點,曲線為RBS);
rgif-R:5′-CCGGGGATCCTTAATGATGATGATGAT GATGATACTGGGTGAAATTGGCG-3′(直線為BamH I位點,曲線為His標簽)。
采用分子克隆技術(shù)將pXMJ19和rgif構(gòu)建表達載體pXMJ19-rgif(圖1),經(jīng)氯化銣法轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,篩選得到陽性克隆菌。
1.2.3C.glutamicum/pXMJ19-rgif的構(gòu)建
采用文獻所述轉(zhuǎn)化方法[12]將構(gòu)建好的質(zhì)粒pXMJ19-rgif電擊轉(zhuǎn)化C.glutamicum獲得表達菌株C.glutamicum/pXMJ19-rgif,并通過菌落PCR進行陽性克隆菌的驗證。為了能夠更好地反映GIF的表達情況,同時構(gòu)建空質(zhì)??寺.glutamicum/pXMJ19做對照。
圖1 rgif的基因合成和pXMJ19-rgif的構(gòu)建
1.2.4C.glutamicum/pXMJ19-rgif和C.glutamicum/pXMJ19的誘導表達
C.glutamicum/pXMJ19-rgif和C.glutamicum/pXMJ19分別接種于5 mL氯霉素抗性的LBB,于30 ℃ 220 r/min培養(yǎng)過夜,之后轉(zhuǎn)接到100 mL新鮮的氯霉素抗性LBB,培養(yǎng)10 h時分別添加100 μL濃度為100 mmol/L的IPTG,繼續(xù)發(fā)酵18 h后收獲菌體進行蛋白分析。
1.2.5C.glutamicum/pXMJ19-rgif的發(fā)酵條件優(yōu)化
根據(jù)預實驗以及查閱文獻[13],研究誘導劑濃度,誘導時機,發(fā)酵時長和發(fā)酵溫度對C.glutamicum/pXMJ19-rgif發(fā)酵產(chǎn)GIF的影響。本優(yōu)化采用正交試驗設計,各因素的水平如表1所示,試驗安排如表2所示。
1.2.6 WB結(jié)果灰度分析
使用Image J對GIF的WB結(jié)果進行灰度分析,間接對GIF進行定量。
1.2.7 GIF蛋白純化及定量
表1 GIF發(fā)酵條件正交試驗因素與因素水平
取20 mL發(fā)酵液,收集菌體沉淀,用10 mL鎳柱純化溶液A重懸菌體,并進行超聲破碎,于12 000 r/min離心10 min收集上清,選用HisTrap FF進行目標蛋白純化,用溶液B洗脫目標蛋白。按照文獻[14]所述方法,進行蛋白定量。
1.2.8 GIF活性分析
取發(fā)酵表達GIF的菌體破碎液上清,用人胃內(nèi)因子(GIF)ELISA檢測試劑盒,嚴格按照說明書操作,進行GIF活性檢測。
rgif基因片段PCR克隆、pXMJ19空質(zhì)粒酶切以及pXMJ19-rgif表達載體構(gòu)建酶切驗證結(jié)果如圖2所示,rgif基因序列長度為1254 bp,與圖示大小相符。得到的表達載體pXMJ19-rgif經(jīng)酶切和測序驗證無誤。
1:PCR克隆rgif;2:pXMJ19空載體酶切;3:pXMJ19-rgif雙酶切驗證
1:rgifcloning by PCR; 2: enzyme digestion of empty pXMJ19 vector; 3: double enzyme digestion verification of pXMJ19-rgif
圖2 表達載體pXMJ19-rgif的構(gòu)建與驗證
Figure 2 Construction and verification of the expression vector pXMJ19-rgif
電轉(zhuǎn)獲取的表達菌株C.glutamicum/pXMJ19-rgif和C.glutamicum/pXMJ19經(jīng)PCR驗證均無誤。
C.glutamicum/pXMJ19-rgif和C.glutamicum/pXMJ19在相同的條件下進行了發(fā)酵試驗。GIF在C.glutamicum中的表達情況如圖3所示。結(jié)果顯示GIF可以在谷氨酸棒桿菌中大量表達,但是只有部分可溶。
使用ImageJ對正交試驗收獲菌體的WB結(jié)果進行灰度分析,比較各試驗組WB條帶的灰度值間接對比GIF的表達量差異,結(jié)果如表2所示。通過比較不同實驗組條帶的灰度值可知,在試驗組9 A3B3C2D1的試驗條件下,GIF的表達量最高。通過分析各因素的K值可知,GIF的產(chǎn)量在本次試驗中,隨著誘導劑濃度從50 μmol/L增加到100 μmol/L而增加,之后降低;隨著誘導時間從0推遲到10 h持續(xù)增加;隨著發(fā)酵時長從18 h增加到22 h而增加,之后降低,隨著發(fā)酵溫度從23 ℃增加到37 ℃持續(xù)降低。
A:WB 分析;B:SDS-PAGE分析;1:C.glutamicum/pXMJ19菌體可溶總蛋白;2:C.glutamicum/pXMJ19-rgif菌體可溶總蛋白;3:C.glutamicum/pXMJ19菌體破碎沉淀總蛋白;4:C.glutamicum/pXMJ19-rgif菌體破碎沉淀總蛋白
A: WB assay;B: SDS-PAGE assay;1: Soluble protein ofC.glutamicumBZH001/pXMJ19; 2:Soluble protein ofC.glutamicumBZH001/pXMJ19-rgif;3: Insoluble protein ofC.glutamicumBZH001/pXMJ19; 4: Insoluble protein of C.glutamicumBZH001/pXMJ19-rgif
圖3 GIF在C.glutamicum中的表達
Figure 3 Expression of GIF inC.glutamicumBZH001
以正交試驗推測的最佳發(fā)酵條件,在轉(zhuǎn)接后10 h添加終濃度100 μmol/L的誘導劑,在23 ℃條件下發(fā)酵22 h后收獲菌體進行蛋白提取純化,純化結(jié)果如圖4所示,成功獲取GIF純品。經(jīng)計算,GIF的產(chǎn)量約為47.15 mg/L。
表2 GIF發(fā)酵條件正交試驗優(yōu)化實驗組合表
1:總蛋白;2:流穿蛋白;3:洗脫蛋白
1: Total protein; 2: Loss protein; 3: Target protein
圖4 GIF表達純化
Figure 4 GIF purification
根據(jù)人胃內(nèi)因子(GIF)ELISA檢測試劑盒建立的方法繪制GIF標準品與VB12競爭抑制的標準曲線。隨著GIF標準品濃度的增大,吸光度隨之減弱。采用Logistic曲線擬合獲得擬合方程為:y=1.04/[1+(x/320.67)^1.43]+0.02。發(fā)酵表達GIF菌體破碎液樣品經(jīng)測量產(chǎn)量為42.3 mg/L。
人胃內(nèi)因子對于人體健康非常重要,它的缺失會導致惡型貧血的發(fā)生,同時可以降低人體免疫力。谷氨酸棒桿菌在蛋白的表達上具有巨大的潛力,尤其是其具有不產(chǎn)內(nèi)毒素的特點,使該菌特別適合于藥用蛋白的生產(chǎn)。
用原核生物表達人源蛋白目前還存在很大的限制。例如,大腸桿菌在發(fā)酵過程中會產(chǎn)生內(nèi)毒素,原核生物普遍缺少蛋白修飾能力等,這對蛋白的表達和利用是很不利的。但是,谷氨酸棒桿菌作為一種食品級的微生物具有不產(chǎn)內(nèi)毒素的優(yōu)點。與真核細胞相比,原核生物還具有發(fā)酵周期短,培養(yǎng)成本低,便于基因操作,效益高等優(yōu)點,有利于外源蛋白的發(fā)酵放大。
在可查閱的文獻范圍內(nèi),本研究是第一篇在C.glutamicum中表達GIF的研究,雖然存在部分不可溶蛋白,但通過正交試驗對GIF發(fā)酵條件進行優(yōu)化后得到極大的改善。除了發(fā)酵溫度,同時優(yōu)化誘導劑濃度、誘導時機和發(fā)酵時長。分析正交試驗各因素R值可知,發(fā)酵溫度、誘導時機、發(fā)酵時間和誘導劑濃度對GIF表達的影響依次減弱。交互作用分析正交試驗誘導劑濃度和誘導時機時發(fā)現(xiàn),誘導劑濃度發(fā)生變化時,GIF表達量隨著誘導時機的變化也發(fā)生變化,兩者存在交互作用。另外誘導劑濃度和發(fā)酵時長、誘導時機同發(fā)酵時長也同樣表現(xiàn)出交互作用。目前得到最優(yōu)發(fā)酵組合是:誘導劑濃度100 μmol/L,誘導時機10 h,發(fā)酵時長22 h,發(fā)酵溫度23 ℃。該發(fā)酵條件下,GIF的產(chǎn)量經(jīng)人胃內(nèi)因子(GIF)ELISA檢測試劑盒定量達到42.3 mg/L,與純化定量存在差異,推測與谷氨酸棒桿菌缺乏糖基化修飾有關(guān)[15]。本研究是目前第一個在C.glutamicum中表達GIF的研究,為GIF的原核表達提供了一種可能的選擇,并初步研究了GIF表達的主要限制因素。本研究發(fā)現(xiàn)優(yōu)化發(fā)酵溫度和誘導劑加入時機可以進一步有效提高GIF的可溶性表達,這可能是因為適當?shù)牡蜏睾驼T導時機的控制促進了GIF的正確折疊。為了更好地開發(fā)谷氨酸棒桿菌用于外源蛋白的表達,人為引入必要的蛋白修飾通路將是一個很有前景的研究方向。另外,對于修飾有嚴格要求的蛋白,在不考慮發(fā)酵成本的情況下也可以選擇酵母、哺乳動物細胞等具有修飾能力的生物進行糖蛋白的表達。