何美玲,楊喆,戴研平,雷珊,高曉勤
(1.貴州醫(yī)科大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,貴州 貴陽 550004;2.遵義醫(yī)藥高等??茖W(xué)校,貴州 遵義 563006)
胰腺癌(pancreatic cancer,PC)是人類消化道的惡性腫瘤之一,其病情進展迅速易發(fā)生早期轉(zhuǎn)移和產(chǎn)生化學(xué)抗性,通常患者確診時已為晚期[1-2]。對PC治療有手術(shù)切除、化學(xué)療法和放射療法等多種手段,但患者5年生存率仍低于5%[2-3]。因此,詳細了解PC發(fā)病的分子機制,對尋找新的PC生物標志物和治療策略的發(fā)展具有重要的意義。長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, LncRNA)是一類長度超過200個核苷酸的不編碼蛋白質(zhì)的 RNA,在多種細胞病理生理過程中起著至關(guān)重要的作用,如增殖、凋亡、去分化、周期阻滯、侵襲和遷移等[4-5]。LncRNA異常表達的現(xiàn)象在各種腫瘤中均有發(fā)現(xiàn),提示lncRNA可能是潛在的致癌或抑癌的RNA[6-9]。Linc00152是一種定位于2號染色體(2p11.2)的LncRNA[10],研究表明其在多種類型的癌癥中參與腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移[11-14],本課題組前期研究發(fā)現(xiàn)Linc00152在胰腺癌組織和細胞系中均高表達,影響胰腺癌患者的生存預(yù)后,但Linc00152在胰腺癌中的相關(guān)功能及影響尚不清楚。本研究通過干擾胰腺癌細胞株MIA PaCa-2和SW1990中Linc00152的表達,研究Linc00152對胰腺癌細胞增殖能力的影響,為尋找胰腺癌潛在的治療靶點提供依據(jù)。
胰腺癌細胞株MIA PaCa-2和SW1990購自美國ATCC細胞庫,胎牛血清(FBS)、轉(zhuǎn)染用OPTI-MEM培養(yǎng)基購自美國Gibco公司,RT試劑盒、PCR相關(guān)SYBRP、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自鼎國生物有限公司,CCK-8試劑盒購自日本同仁化學(xué)研究所,細胞周期試劑盒購自美國Thermo公司,兔抗人單克隆抗體細胞周期蛋白D1(cyclinD1)、細胞周期蛋白依賴性激酶4(CDK4)以及鼠抗人GAPDH單克隆抗體均購自武漢賽威爾生物技術(shù)有限公司,Lipofectamine 2000和相關(guān)轉(zhuǎn)染試劑盒購自Invitrogen公司,Linc00152的下調(diào)siRNA序列TAGGCGATACGATGCTTTA-3′、陰性對照(NC)序列TAATCGCTACGATGCACTA-3′及RT-qPCR相關(guān)的Linc00152和GAPDH上游、下游引物均由上海生工生物技術(shù)有限公司設(shè)計合成,Linc00152上游引物5′-AAAATCACGACTCAGCCCCC-3′、下游引物5′-AATGGGAAACCGACCAGACC-3′,GAPDH上游引物5′-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3′、下游引物 5′-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3′。
1.2.1細胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染 人胰腺癌細胞MIA PaCa-2和SW1990分別培養(yǎng)在含10% FBS的DMEM培養(yǎng)基中,均放置于在5% CO2、37 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng);根據(jù)Lipofectamine 2000操作說明轉(zhuǎn)染NC及Si-Linc00152序列,實驗分為陰性對照組(NC組)和Linc00152干擾組(Si-Linc00152組),細胞轉(zhuǎn)染48 h后, 進行后續(xù)實驗。
1.2.2實時熒時聚合酶鏈式反應(yīng)(RT-qPCR)驗證Linc00152的干擾效率 收集各組轉(zhuǎn)染48 h后的細胞,在TRIzol 試劑,離心、萃取,加異丙醇沉淀,75%乙醇洗滌,DEPC水溶解,測RNA純度和濃度。取總RNA 1 000 ng配制RT反應(yīng)液,Takara逆轉(zhuǎn)錄試劑盒進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。按說明書配好PCR反應(yīng)液后,瞬時離心,上實時熒光定量PCR儀擴增Linc00152以及內(nèi)參基因GAPDH,通過2-(ΔΔCT)法計算Linc00152的相對表達量。
1.2.3CCK-8實驗檢測細胞增殖 轉(zhuǎn)染48 h后,胰酶消化各組細胞株,終止消化并重懸細胞,以每孔1×103個細胞,接種到96孔培養(yǎng)板中;于6、24、48、72和96 h時,將 CCK-8的溶液加入每個孔中,在37 ℃下孵育2 h;取出96孔培養(yǎng)板上酶標儀,在450 nm處檢測CCK-8的吸光度,根據(jù)吸光度描繪曲線。
1.2.4平板克隆細胞集落形成實驗 轉(zhuǎn)染48 h后,胰酶消化各組對數(shù)生長期的細胞株,用含10%胎牛血清的完全培養(yǎng)基重懸,分別接種到6 cm培養(yǎng)皿中,調(diào)整密度為每皿1 200個。然后在5% CO2培養(yǎng)箱中于37 ℃溫育8 d,棄去培養(yǎng)基,PBS洗滌2次后,用4%多聚甲醛固定30 min后,倒掉甲醛,加入結(jié)晶紫染液染色30 min,倒掉結(jié)晶紫液,純水清洗、拍照,并計數(shù)染色的集落形成數(shù)目。
1.2.5流式細胞儀檢測細胞周期 分別將轉(zhuǎn)染48 h后的各組細胞株接種于6孔板培養(yǎng)72 h,胰酶消化,調(diào)整細胞密度1×107個/L,70%乙醇-20 ℃固定過夜后,離心棄上清,加PBS洗凈重懸,加入RNA酶、碘化丙啶在37 ℃下避光放置30 min,最后上流式細胞儀檢測細胞周期。用CellQuest 軟件、ModFit 軟件分析實驗結(jié)果,統(tǒng)計學(xué)方法分析各組細胞周期的分布。
1.2.6Western blot檢測細胞周期相關(guān)蛋白cyclinD1及CDK4表達 取出轉(zhuǎn)染48 h后的各組PC細胞株,加RIPA蛋白裂解液,低溫離心,提取總蛋白,加入BCA顯色劑,制作標準曲線。蛋白變性10 min,按配方配制SDS-PAGE膠,電泳,轉(zhuǎn)PVDF膜,室溫封閉2 h,加一抗4 ℃孵育過夜;次日加二抗于搖床上室溫孵育2 h。上曝光機,加ECL化學(xué)發(fā)光混合液,曝光顯影,Image J軟件用于分析蛋白質(zhì)條帶的灰度值,統(tǒng)計圖分析蛋白表達量。
利用siRNA構(gòu)建干擾模型 48 h,與NC組比較, Si-Linc00152組的Linc00152表達水平明顯降低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),見圖1。
注:(1)與NC組比較,P<0.01。圖1 轉(zhuǎn)染后胰腺癌細胞Linc00152相對表達量Fig.1 The relative expression of Linc00152 after transfection
通過轉(zhuǎn)染Si-Linc00152干擾Linc00152的表達,結(jié)果顯示,在72和96 h兩個時間節(jié)點,Si-Linc00152組較NC組的增殖能力顯著降低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),見圖2。
注:A為MIA PaCa-2,B為SW1990;(1)與NC組比較,P<0.01。圖2 干擾Linc00152表達對胰腺癌細胞增殖能力的影響 (CCK8法)Fig.2 Effect of knockdown Linc00152 on the cell proliferation of pancreatic cancer cells by CCK8 assay
收集經(jīng)轉(zhuǎn)染48 h后的各組胰腺癌細胞,細胞在培養(yǎng)皿中培養(yǎng)8 d后,NC組MIA PaCa-2集落形成的數(shù)量為(548.3±11.6)個、Si-Linc00152組為(245.0±9.8)個,NC組SW1990集落形成的數(shù)量為(562.3±14.1)個、Si-Linc00152組為(306.0±8.4)個,Si-Linc00152組均較NC組的細胞集落形成數(shù)目明顯減少,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),見圖3。
與NC組比較,Si-Linc00152組在細胞周期中的G1期細胞所占百分比上升,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),見圖4。提示干擾Linc00152可誘導(dǎo)胰腺癌細胞在G0/G1期細胞周期阻滯。
注:A為平板克隆實驗,B為細胞集落形成數(shù);(1)與NC組比較,P<0.01。圖3 干擾Linc00152表達對胰腺癌細胞增殖的影響(克隆形成實驗)Fig.3 Effect of knockdown Linc00152 on the cell proliferation of pancreatic cancer cells by colony formation assay
注:A~D為流式細胞圖,E、F為直條圖,A、B、E為MIA PaCa-2,C、D、F為SW1990,A、C為NC組,B、D為Si-Linc00152組;(1)與NC組比較,P<0.01。圖4 干擾Linc00152表達后對細胞周期的影響 (流式細胞術(shù)) Fig.4 Effect of knockdown Linc00152 on cell cycle of pancreatic cancer cells by FCM
Western blot檢測轉(zhuǎn)染48 h時MIA PaCa-2和SW1990細胞蛋白表達水平變化,實驗顯示,與NC組比較,Si-Linc00152組的細胞周期相關(guān)蛋白cyclinD1及CDK4的表達均減少,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),見圖5。提示干擾Linc00152抑制了胰腺癌細胞株的增殖能力,誘導(dǎo)細胞在細胞周期G0/G1期停滯,可能與細胞周期相關(guān)蛋白cyclinD1及CDK4的表達減少有關(guān)。
注:A為Western blot結(jié)果,B、C分別為MIA PaCa-2、SW1990條圖;(1)與NC組比較,P<0.01。圖5 干擾Linc00152表達后對胰腺癌細胞中CyclinD1及CDK4蛋白表達的影響Fig.5 The expression of CyclinD1and CDK4 proteins after knocking down Linc00152
LncRNA已成為基因表達的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,并在各種癌癥的發(fā)生和進展中發(fā)揮關(guān)鍵作用[15]。Linc00152(長基因間非編碼RNA 152),是一類與癌癥相關(guān)的828 bp的lncRNA,定位于2號染色體短臂(2p11.2)[16]。有研究表明,Linc00152的高表達與腫瘤進展、淋巴結(jié)侵襲和TNM分期進展呈正相關(guān)[17],并且在體外和體內(nèi)促進腫瘤進展[18]。盡管Linc00152逐步被證實為多種人類惡性腫瘤形成的重要的基因表達調(diào)控器,但是其與胰腺癌的關(guān)系卻尚不清楚。在本實驗室前期研究中,發(fā)現(xiàn)在Linc00152胰腺癌細胞株和組織中均高表達,且與生存預(yù)后密切相關(guān)。本研究中,CCK8實驗結(jié)果顯示干擾Linc00152表達后胰腺癌細胞的增殖能力明顯降低;平板克隆實驗結(jié)果表明,沉默Linc00152后胰腺癌細胞克隆數(shù)目顯著降低;結(jié)果表明干擾Linc00152的表達可抑制MIA PaCa-2和S1990細胞的增殖能力。細胞周期主要由細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK)驅(qū)動,CDK通過在不同細胞周期階段與細胞周期蛋白(cyclin)結(jié)合形成特異性復(fù)合物而被激活,并促進細胞通過G1/S期調(diào)控點進入S期進行DNA復(fù)制,因此促進細胞增殖,異常調(diào)節(jié)的CDK會誘導(dǎo)細胞不定期增殖[19]。流式細胞術(shù)實驗表明,沉默Linc00152的表達后G1期MIA PaCa-2和S1990細胞增多,發(fā)生細胞周期阻滯;沉默Linc00152后cyclinD1和CDK4的表達下調(diào),而cyclinD1和CDK4是細胞周期G1 向S期轉(zhuǎn)換的調(diào)節(jié)劑,因此干擾Linc00152能延長G1期的持續(xù)時間,阻礙G0/G1到S期的轉(zhuǎn)變,導(dǎo)致細胞在細胞周期G0/G1期停滯,抑制了細胞的增殖。
綜上所述,本研究證實干擾Linc00152在體外能抑制胰腺癌細胞株的增殖,顯示了Linc00152在胰腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的調(diào)控作用,為胰腺癌的分子靶向治療提供了思路和依據(jù)。目前對Linc00152的機制研究仍然不完整,其具體的作用途徑及分子生物學(xué)機制尚未明確,還需要進一步的探索及研究。