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蜜蜂所研究揭示蜜蜂殘翅病毒來源

近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蜜蜂研究所蜜蜂病蟲害生物學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，聯(lián)合德國烏爾姆大學(xué)和英國?？巳卮髮W(xué)相關(guān)人員，采用大尺度取樣對(duì)我國22個(gè)省近200個(gè)蜂場(chǎng)的意大利蜜蜂和中華蜜蜂，進(jìn)行了蜜蜂殘翅病毒的流行、群體遺傳和進(jìn)化重構(gòu)分析，厘清了我國蜜蜂殘翅病毒的主要流行基因型和季節(jié)性變化特點(diǎn)。該研究有助于揭示蜜蜂殘翅病毒的來源與進(jìn)化歷史，更有助于理解病毒動(dòng)力學(xué)變化及對(duì)生態(tài)中其他授粉昆蟲潛在的感染風(fēng)險(xiǎn)。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《科學(xué)報(bào)告（Scientific Reports）》上。

國際上主要流行的觀點(diǎn)認(rèn)為，蜜蜂殘翅病毒的流行與蜜蜂寄生性病害——狄斯瓦螨最相關(guān)，而狄斯瓦螨被認(rèn)為最原始寄主為我國中華蜜蜂，而后傳入意大利蜜蜂，從而因蜜蜂殘翅病毒較強(qiáng)的傳播能力成為意大利蜜蜂健康發(fā)展的最重要威脅之一。然而該病毒在我國的流行情況及是否與國際最主要流行毒株基因型一致仍不清楚。研究結(jié)果表明，我國意大利蜜蜂流行的主要蜜蜂殘翅病毒基因型與歐洲主要流行型相一致；而我國中華蜜蜂對(duì)該病毒的整體感染率并不高，更不是歐洲主要流行基因型；另外，相比較意大利蜜蜂，中華蜜蜂的蜜蜂殘翅病毒具有更高的遺傳多樣性，表明我國意大利蜜蜂流行的蜜蜂殘翅病毒可能來源于歐洲，而中華蜜蜂具有更強(qiáng)的進(jìn)化手段抵抗該病毒。

我國科學(xué)家發(fā)布地方豬 “超清” 基因組圖譜

近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所豬基因組設(shè)計(jì)育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，發(fā)布了中國優(yōu)良地方豬——陸川豬的高質(zhì)量基因組序列。該基因組序列的發(fā)表，不僅填補(bǔ)了亞洲家豬缺少高質(zhì)量參考基因組的空白，更為基因組組裝提供了新的方向。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《BioRxiv》上。

我國是世界上最大的生豬養(yǎng)殖和豬肉消費(fèi)國，擁有全球最豐富的豬種資源。我國地方豬群具有豐富的遺傳多樣性，是深入挖掘豬種肉質(zhì)品質(zhì)和抗病力等重要性狀優(yōu)質(zhì)基因的遺傳寶庫。然而，隨著西方商業(yè)豬種的普及，本地豬種受到了較大的沖擊，有些著名地方品種的數(shù)量比大熊貓還要稀少，部分品種甚至已經(jīng)滅絕。地方豬種質(zhì)資源的保護(hù)刻不容緩具有重要的戰(zhàn)略意義。

該項(xiàng)研究公布的豬基因組序列采用了目前最新的Pacbio，Bionano DLS和ProximoHi-C等多項(xiàng)測(cè)序技術(shù)，以及Falcon Phase組裝算法，首次獲得了染色體級(jí)別的定相（Phased ）基因組。這標(biāo)志著來自親本的等位基因可以完整區(qū)分，具有重要的理論和應(yīng)用價(jià)值。經(jīng)過不懈的努力與技術(shù)攻關(guān)，研究團(tuán)隊(duì)最終獲得了染色體級(jí)別的豬基因組序列，contigN50超過了18兆，ScaffoldN50超過了140兆。并且利用最新的組裝算法和Hi-C技術(shù)，獲得了完整的兩套基因組序列。這是基因組研究領(lǐng)域的重大突破，為研究等位基因的功能互作提供了寶貴的數(shù)據(jù)和技術(shù)基礎(chǔ)。