李雅絢
摘? ?要:圍繞轉(zhuǎn)錄組的4類高通量測序技術(shù),對轉(zhuǎn)錄組在植物與授粉有關(guān)的花部特殊結(jié)構(gòu)、花粉萌發(fā)與花粉管伸長、植物自交不親和與生殖隔離,以及在授粉后植物花部結(jié)構(gòu)的變化中的研究進(jìn)行了綜述,旨在促進(jìn)植物育種,提高植物種子和果實產(chǎn)量的應(yīng)用研究。
關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)錄組;植物響應(yīng);授粉機(jī)制;研究
授粉是指花粉借助一定載體到達(dá)柱頭,繼而萌發(fā)花粉管的過程。目前,轉(zhuǎn)錄組學(xué)在植物生物與非生物逆境脅迫、生長發(fā)育調(diào)控及種質(zhì)資源等方面的研究應(yīng)用廣泛?;ǖ倪M(jìn)化經(jīng)常與植物授粉的現(xiàn)狀相聯(lián)系,因此,研究植物與授粉有關(guān)的花部特殊結(jié)構(gòu)是植物響應(yīng)授粉分子機(jī)制的一部分。
1? ?植物響應(yīng)授粉轉(zhuǎn)錄組鑒定的高通量測序技術(shù)
轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究技術(shù)主要可分為4類:SAGE基因表達(dá)系列分析技術(shù)和MPSS技術(shù)、cDNA-AFLP擴(kuò)增片段長度多態(tài)性技術(shù)、cDNA芯片技術(shù)及RNA測序技術(shù)。
2? ?轉(zhuǎn)錄組在植物響應(yīng)授粉中的研究進(jìn)展
2.1? ?轉(zhuǎn)錄組在植物適應(yīng)傳粉花部結(jié)構(gòu)中的研究進(jìn)展
植物花的特征能吸引傳粉者授粉,以提高自身授粉率。Timothy Butler等用RNA-seq技術(shù)比較裸莖條果芥中紫色與白色花芽表達(dá)的差異,發(fā)現(xiàn)在白花瓣中兩個響應(yīng)干燥的基因比紫花瓣有更高的表達(dá)。白色花瓣中特異表達(dá)的基因,表明白色花瓣可能與微環(huán)境有顯著的相關(guān)性[1]。
Brian W Kram等利用基因芯片技術(shù)系統(tǒng),研究擬南芥在開花前后的花蜜分泌組織、蜜腺分泌組織和非蜜腺分泌組織的轉(zhuǎn)錄組,以鑒定涉及花蜜分泌的潛在基因和路徑,其中270個差異表達(dá)基因被鑒定與花蜜分泌相關(guān)聯(lián)?;鄯置诘倪^程涉及基因調(diào)節(jié)、碳代謝及脂質(zhì)的代謝路徑。
2.2 ?轉(zhuǎn)錄組在植物的自交不親和與生殖隔離中的研究進(jìn)展
Wei Zhang等將燈盞細(xì)辛在未授粉、自交和異交授粉后的頭狀花序進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組的比較分析,鑒定出大約有230個基因可能與自交不親和相聯(lián)系。SRLK(SRK-like)與它的下游信號因子MLPK及大量在細(xì)胞間進(jìn)行交流、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)并在授粉過程中有重要作用的基因LPK、ARC1、CaM、Exo70A1、MAP、SF21、Nod等,被推斷是編碼燈盞細(xì)辛中的自交不親和回應(yīng)的重要調(diào)控者[2]。
JB Pease等將兩種番茄屬植物中雄蕊和雌蕊組織的多個發(fā)展階段進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,研究單向生殖隔離中基因表達(dá)的改變,鑒定出5個配子合成前種間生殖隔離的候選基因,包括之前研究所證實與自交不親和有關(guān)的2個基因及3個新發(fā)現(xiàn)的候選基因。
Leydon AR等在擬南芥生殖中使用單核苷酸多態(tài)性轉(zhuǎn)錄組測序,清晰地定義了雌雄配子體基因的表達(dá)模式,研究定義了一組由MYB轉(zhuǎn)錄因子控制的花粉管分泌蛋白,由于它被花粉管將精子釋放到雌配子體中所需要,因此它對種間雜交是一個重要的障礙。而且,這些基因序列編碼的水平及在擬南芥中的表達(dá)具有高度可塑性[3]。
2.3? ?轉(zhuǎn)錄組在授粉后花器官變化中的研究進(jìn)展
果實的生長,是由授粉后子房中胚珠的成功授精所誘導(dǎo)的。S Guo等用Roche/454 GS-FLX進(jìn)行4個西瓜發(fā)展階段的轉(zhuǎn)錄組測序,鑒定出3 023個在西瓜果實發(fā)展和成熟階段的差異表達(dá)基因,為西瓜水果生物學(xué)提供了進(jìn)行功能分析的候選基因,并研究出了色素和甜度等西瓜重要質(zhì)量指標(biāo)的代謝譜。
倪偉用蘋果屬品種1379、嘎啦的花粉對富士授粉,將花后15 d、30 d、45 d、60 d的果實進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。結(jié)果表明,在授粉后,果實的發(fā)育抗壞血酸合成相關(guān)基因GME、GGP、APX下調(diào)表達(dá),AO基因上調(diào)表達(dá),類黃酮合成相關(guān)基因CHI、DFR、LAR、ANR下調(diào)表達(dá)。
唐其對羅漢果果實的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)有20種基因涉及羅漢果甜苷V的生物合成。通過對80條細(xì)胞色素P450基因和90條葡糖基轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)量的變化規(guī)律推測,P450基因中4條候選基因和UDPG基因中6條候選基因可能參與羅漢果甜苷V的生物合成[4]。
Jian Chen等使用轉(zhuǎn)錄組測序,以從受精到胚胎成熟的全部種子組織的53個樣本為基礎(chǔ),做出了一個B73玉米種子發(fā)育時間與空間的轉(zhuǎn)錄組地圖集,鑒定出了91個轉(zhuǎn)錄因子及1 167個基因與種子發(fā)育的關(guān)鍵機(jī)制有關(guān)。另外,基因表達(dá)與DNA甲基化模式的相關(guān)性,揭示了基因主體范圍的低甲基化是種子特殊基因。
今后,應(yīng)當(dāng)加強(qiáng)篩選能應(yīng)用于育種實踐的基因,進(jìn)行表達(dá)分析和功能研究,篩選出在實際生產(chǎn)中帶來經(jīng)濟(jì)效益的分子標(biāo)記,實現(xiàn)植物經(jīng)濟(jì)產(chǎn)物及育種效率的整體提升。
參考文獻(xiàn):
[ 1 ] 蔣晶晶.白菜花粉發(fā)育和授粉受精相關(guān)基因的表達(dá)分析與功能驗證[D].杭州:浙江大學(xué),2012.
[ 2 ] 劉紅亮,鄭麗明,劉青青,等.非模式生物轉(zhuǎn)錄組研究[J].遺傳,2013,35(08):955-970.
[ 3 ] 蒲敏,廉小平,羅紹蘭,等.結(jié)球甘藍(lán)自花和異花授粉誘導(dǎo)的柱頭轉(zhuǎn)錄組分析[J].園藝學(xué)報,2018,45(01):71-84.
[ 4 ] 張代玉,無芒隱子草閉花授粉的形態(tài)特征及其轉(zhuǎn)錄組表達(dá)研究[D].蘭州:蘭州大學(xué),2017.