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    地震前兆OracleLOB數(shù)據(jù)壓縮與交換及其訪問效率研究

    2019-08-19 01:49:29王建軍趙銀剛劉高川
    地震研究 2019年3期

    王建軍 趙銀剛 劉高川

    摘要:針對目前地震前兆Oracle數(shù)據(jù)庫存在的存儲空間大、交換速度慢、讀寫速度慢等問題,分別用Bzip2,Gzip,GzipIO這3種壓縮算法對Clob和Blob的壓縮和未壓縮數(shù)據(jù)進行讀寫和交換速度測試,使用直接讀取、分段讀取、分段+線程池讀取3種方法進行了讀庫速度測試。結(jié)果表明:①無論在存儲、交換還是讀寫速度方面Blob均優(yōu)于Clob;②Blob+Gzip為地震前兆分秒數(shù)據(jù)的“最佳”存儲結(jié)構(gòu),讀寫和交換速度有大幅度提升,數(shù)據(jù)庫整體容量降至目前的7%(或更少),秒數(shù)據(jù)的交換速率至少是目前的789倍;③最簡單且被軟件開發(fā)者廣泛使用的直接讀取方法讀庫效率較差,分段+線程池技術(shù)無論在Clob還是Blob、壓縮還是未壓縮時都表現(xiàn)出較高的讀庫效率,給LOB數(shù)據(jù)讀取速度帶來飛躍式的提升。

    關(guān)鍵詞:Oracle;LOB;數(shù)據(jù)壓縮;交換效率;訪問效率

    中圖分類號:P31573?? 文獻標(biāo)識碼:A?? 文章編號:1000-0666(2019)03-0447-07

    0 引言

    隨著信息化社會的發(fā)展,存儲、傳輸和處理急劇增長的海量信息的壓力越來越大。為了節(jié)省信息的存儲空間和提高信息的傳輸效率,數(shù)據(jù)壓縮作為解決海量信息存儲和傳輸?shù)闹С旨夹g(shù)受到極大重視(鄭翠芳,2011)。數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)一般分為有損壓縮和無損壓縮。無損壓縮是指重構(gòu)壓縮數(shù)據(jù)(還原、解壓縮)與原數(shù)據(jù)必須完全相同,適用于要求重構(gòu)信號與原始信號完全一致的場合(李雷定等,2009;鄭翠芳,2011)。壓縮算法必須能夠提供較高的數(shù)據(jù)壓縮率以支持實時數(shù)據(jù)庫海量存儲的特點,壓縮和解壓縮兩個過程都必須具有較好的速度性能(劉紅霞,牛富麗,2010)。

    Bzip2是基于Burrows-Wheeler變換(BWT)的無損壓縮算法,是一種不依賴于數(shù)據(jù)內(nèi)部重復(fù)性的變換方法,它能將數(shù)據(jù)中相同的字符有效地聚集到一起,為進一步壓縮創(chuàng)造條件(李冰等,2015;Seward,2002,2007)。它能夠把普通的數(shù)據(jù)壓縮至10%~15%,壓縮和解壓效率都非常高,按照開源軟件協(xié)議在其網(wǎng)站上可下載完整的C,Java,C#源代碼及相應(yīng)的dll接口文件。它因為較高的壓縮比和速度性能在國外被廣泛應(yīng)用(Gilchrist,2008;Pankratius et al,2009;Mccool et al,2012;Salazar,Sánchez,2017),但在國內(nèi)的應(yīng)用仍然偏少(李冰等,2015)。數(shù)據(jù)壓縮算法有Bzip2和Gzip兩種,Net的SystemIOCompression提供另一種Gzip壓縮算法,本文簡稱為GzipIO。

    2007年底地震前兆臺網(wǎng)“十五”系統(tǒng)正式建成并投入運行,該軟件系統(tǒng)是一個分層的4級互聯(lián)互通分布式系統(tǒng),由臺站、省局、國家中心和學(xué)科中心4級構(gòu)成。為便于各級數(shù)據(jù)交換,全國采用統(tǒng)一的數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)(Oracle10g)和統(tǒng)一的數(shù)據(jù)庫表結(jié)構(gòu)(周克昌等,2009,2010;劉高川,2008)。軟件系統(tǒng)主要有2個:管理系統(tǒng)(B/S架構(gòu),服務(wù)器運行)和處理系統(tǒng)(C/S架構(gòu),客戶端PC機運行),前者每天定時將臺站數(shù)據(jù)逐級交換至省局、國家中心和學(xué)科中心(劉高川,2008),后者負責(zé)每天的數(shù)據(jù)預(yù)處理和產(chǎn)品數(shù)據(jù)計算。

    中國地震臺網(wǎng)中心前兆臺網(wǎng)部是全國地震前兆數(shù)據(jù)的匯集中心,同時也是容量最大的前兆數(shù)據(jù)庫。截至2018年8月,該數(shù)據(jù)庫中存儲了3 328套觀測儀器(秒采樣儀器364套,分采樣儀器2 126套,時、日采樣儀器838套)的產(chǎn)出數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)庫總量約8 000 GB,目前仍在以每年約800 GB的速度遞增,其中時間分辨率為分和秒的數(shù)據(jù)(以下簡稱為分秒數(shù)據(jù))總量占到數(shù)據(jù)庫總是的95%以上。因為所有分秒數(shù)據(jù)全部采用Clob+ASCII未壓縮的存儲格式,數(shù)據(jù)庫出現(xiàn)了存儲空間大、交換速度慢、讀寫速度慢、運維困難等問題。如“處理系統(tǒng)”遠程讀取FHDZ-M15地磁儀器1天6個要素的秒采樣數(shù)據(jù)需要約4 min;中國地震臺網(wǎng)中心前兆臺網(wǎng)部(8 000 GB)冷備份到另一臺服務(wù)器需要連續(xù)拷貝10天左右,這10天必須關(guān)閉數(shù)據(jù)庫并停止所有服務(wù),這種冷備份方式顯然不實用;而熱備份系統(tǒng)(由地震系統(tǒng)自主研發(fā))因為軟件原因只能對應(yīng)一臺服務(wù)器,如果主庫和備庫同時出現(xiàn)問題導(dǎo)致數(shù)據(jù)丟失,結(jié)果將是災(zāi)難性的。

    Oracle數(shù)據(jù)庫中,Clob和Blob(簡稱LOB)是2個典型的大對象數(shù)據(jù)存儲結(jié)構(gòu),在各級數(shù)據(jù)庫中都有廣泛使用。Clob只能存儲單字節(jié)字符數(shù)據(jù),多用于存儲長文本數(shù)據(jù);Blob用于存儲無結(jié)構(gòu)的二進制數(shù)據(jù),主要存儲圖像、視頻、音頻及Word文檔等帶格式數(shù)據(jù)(張靜,王永敏,2011)。為提高地震前兆數(shù)據(jù)庫的存取效率,國內(nèi)地震行業(yè)學(xué)者分別進行了如下研究:姚運生等(2006)提出把一串觀測數(shù)據(jù)以二進制存儲為一個記錄的新的數(shù)據(jù)庫表結(jié)構(gòu);李井岡等(2008)對比了Clob和Blob的存取速度,發(fā)現(xiàn)Blob具有更高的效率,主要原因如下:一是二進制數(shù)據(jù)比字符串型數(shù)據(jù)存取快;二是Blob類型占用更少的空間,網(wǎng)絡(luò)傳輸快;劉堅等(2009)把LZMA壓縮算法封裝成API動態(tài)鏈接庫,調(diào)用接口函數(shù)壓縮大數(shù)據(jù)后保存至Blob字段,調(diào)用數(shù)據(jù)時將數(shù)據(jù)解壓縮還原,不僅節(jié)省了數(shù)據(jù)庫的磁盤空間,同時也提高了數(shù)據(jù)存取效率。

    本文基于NET開發(fā)平臺,分別使用Bzip2,Gzip,GzipIO這3種壓縮算法對Clob和Blob的壓縮和未壓縮數(shù)據(jù)進行了讀寫速度、交換速度測試和比較,使用直接讀取、分段讀取、分段+線程池讀取3種技術(shù)進行了讀庫速度測試,對每種壓縮算法和讀庫方法的優(yōu)缺點進行了歸納和總結(jié),以此檢驗適用于地震前兆數(shù)據(jù)庫的“最佳”壓縮算法和讀庫方法。

    1 測試數(shù)據(jù)和研究方法

    11 測試數(shù)據(jù)選取

    本文選用的測試數(shù)據(jù)全部為2009年1月1日至蘭州FHDZ-M15地磁儀器記錄的共31天的6個要素分秒數(shù)據(jù)。該儀器為秒采樣,每個要素每天包括86 400個秒采樣數(shù)據(jù),分數(shù)據(jù)由秒采樣數(shù)據(jù)通過高斯濾波計算得到,每個要素每天包括1 440個分數(shù)據(jù)。

    本文測試選用的本地服務(wù)器位于甘肅省地震局信息機房,遠程服務(wù)器位于中國地震局地球物理研究所信息機房,本地和遠程的測試數(shù)據(jù)和表結(jié)構(gòu)完全相同。測試軟件為Net開發(fā)平臺編寫的客戶端軟件(運行在辦公室的PC機上)。

    地震前兆數(shù)據(jù)庫中分秒數(shù)據(jù)的表結(jié)構(gòu)見表1,觀測數(shù)據(jù)用Clob+ASCII未壓縮的存儲格式,每套儀器每個要素每天一條記錄。

    12 LOB數(shù)據(jù)壓縮和解壓縮方法

    Net中引用Bzip2提供的接口文件ICSharp CodeSharpZipLibdll后,通過命名空間ICSharpCodeSharpZipLib,調(diào)用BZip2OutputStream和BZip2InputStream分別完成Bzip2壓縮和解壓過程,調(diào)用GzipOutputStream和GzipInputStream分別完成Gzip壓縮和解壓過程,通過調(diào)用SystemIO CompressionGzipStream分別完成GzipIO壓縮和解壓過程。

    13 數(shù)據(jù)庫連接和LOB讀寫方法

    Net使用ADONET完成數(shù)據(jù)庫訪問,OracleConnection進行數(shù)據(jù)庫連接,OracleDataAdapter和DataTable完成LOB數(shù)據(jù)讀取和暫存,OracleCommand完成LOB數(shù)據(jù)寫入。

    14 3種LOB讀庫方法

    (1)直接讀?。簩浖_發(fā)者而言,LOB數(shù)據(jù)最簡單最常用的讀庫方法就是直接使用Select LobName讀取。

    (2)分段讀?。簾o論Clob還是Blob都可以使用Oracle自帶的DBMS_LOB包中的substr函數(shù)來分段讀取數(shù)據(jù),即DBMS_LOBsubstr(lobName,n,pos),lobName為Lob字段名,n為讀取的字節(jié)數(shù),pos為讀取的起始位置。分段讀取時Clob每次可讀取的最大長度為4 000字節(jié),Blob為2 000字節(jié),因此必須循環(huán)多次執(zhí)行,每次循環(huán)都要重新設(shè)置讀取的起始位置(pos),循環(huán)結(jié)束后需要把同一條記錄的LOB數(shù)據(jù)按先后順序拼接起來。

    (3)分段+線程池讀?。篘ET的ThreadPool類提供線程池管理,將分段讀取的SQL語句依次放入線程池中,可以實現(xiàn)分段讀取并行執(zhí)行(多個線程同時讀?。?。圖1為該方法讀庫流程圖,使用時還需要編寫一個單獨的子線程類,該類中需要創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)庫連接,執(zhí)行分段讀取的SQL語句;任務(wù)全部添加進線程池后,還需要一個while循環(huán),判斷所有線程全部執(zhí)行結(jié)束后才能退出循環(huán)執(zhí)行后續(xù)操作。

    2 LOB數(shù)據(jù)壓縮和交換速度測試

    21 LOB數(shù)據(jù)壓縮測試

    分別使用Bzip2,Gzip,GzipIO這3種壓縮算法,對蘭州FHDZ-M15地磁儀器產(chǎn)出的2009年1月分秒數(shù)據(jù)進行壓縮測試。表2顯示平均每條記錄的壓縮比,無論分或秒數(shù)據(jù),Bzip2的壓縮比最高,Gzip次之,GzipIO最低;Bzip2壓縮后每條記錄的容量最小,意味著占用更小的存儲空間;但其壓縮和解壓時間最長,遠高于其他2種算法,意味著讀庫(解壓)和寫庫(壓縮)消耗的時間更長。Gzip的壓縮時間大概是GzipIO的25倍,二者的解壓時間相差很小,但分秒數(shù)據(jù)的二進制壓縮比分別提高了5%和3%。

    22 LOB數(shù)據(jù)交換速度測試

    目前地震前兆管理系統(tǒng)軟件在數(shù)據(jù)交換時采用的是“dbLink+Insert”技術(shù),數(shù)據(jù)交換的核心命令為insert into XX from XX@dbLinkName,dbLinkName為遠程數(shù)據(jù)庫的dbLink。根據(jù)目前的地震前兆數(shù)據(jù)交換機制,交換過程中無需解析LOB數(shù)據(jù),因此壓縮和解壓效率對交換速度沒有影響,能影響到交換速度的只是每條記錄的容量大小。登錄遠程(北京)數(shù)據(jù)庫后直接運行該交換命令,其執(zhí)行時間作為實際交換時間,即平均每條記錄由本地(蘭州)傳輸?shù)竭h程(北京)的時間。蘭州FHDZ-M15地磁儀器2009年1月所有分秒數(shù)據(jù)平均每條記錄的數(shù)據(jù)交換速度測試結(jié)果見表3,預(yù)估交換倍率=“Clob未壓縮”容量/其他容量,實際交換倍率=“Clob未壓縮”交換時間/其他交換時間。

    由表3可見,無論Clob還是Blob,3種壓縮結(jié)構(gòu)的實際交倍率都沒有預(yù)估交換倍率高,秒數(shù)據(jù)Blob壓縮的實際交換倍率有7~9倍的提升,而分數(shù)據(jù)的實際交換倍率提升幅度很小;秒數(shù)據(jù)Blob和Clob這2種未壓縮結(jié)構(gòu)相比,在存儲容量完全相同的情況下實際交換倍率卻有184倍的提升。

    3 LOB數(shù)據(jù)讀寫速度測試

    31 3種壓縮算法的讀寫速度測試

    使用直接讀取方法對Blob和Clob的4種存儲結(jié)構(gòu)(3種壓縮+未壓縮)進行讀寫速度測試,由表4可見:①就寫庫速度而言,無論Clob還是Blob速度最快是GzipIO,Gzip次之,兩者相差極小,Bzip2因為壓縮時間長導(dǎo)致本地寫庫速度遠慢于其它;②就讀取速度而言,Clob中Bzip2最快,Blob中Gzip最快,即便偶有慢于其他方法的現(xiàn)象,讀取速度仍與最快速度相差最小;③對同一種壓縮或未壓縮結(jié)構(gòu),2種LOB類型的寫庫速度基本相當(dāng),但Blob的讀庫速度遠優(yōu)于Clob。

    32 3種LOB讀庫方法的讀取速度測試

    分別使用3種LOB讀庫方法對壓縮和未壓縮結(jié)構(gòu)進行讀庫速度測試,測試結(jié)果見表5:①直接讀取方法在Clob未壓縮中讀取效率最差,遠慢于其他2種方法;在Blob中除了秒數(shù)據(jù)1天本地讀取速度較快外,其他讀取效率最差,并且隨著讀取天數(shù)的增加,與分段+線程池方法的讀取速度差距增大。②分段讀取方法在Clob未壓縮中相對直接讀取速度有大幅度提升,但在Blob秒數(shù)據(jù)讀取時表現(xiàn)不穩(wěn)定,頻繁出現(xiàn)讀取時間遠高于其它方法現(xiàn)象。③分段+線程池方法在Clob未壓縮中讀取速度最快,遠優(yōu)于其他2種方法,在Blob中雖偶有略慢于其它方法,仍與讀取最快速度相差極小。④無論哪種讀庫方法,Gzip的讀取速度都優(yōu)于GzipIO。

    相對而言,與其他2種方法相比,無論在Clob還是Blob,壓縮還是未壓縮,分段+線程池方法都能表現(xiàn)出最高的讀庫效率,尤其在Clob未壓縮的讀取速度有飛躍式的提升。Blob+Gzip的存儲結(jié)構(gòu)結(jié)合分段+線程池讀庫方法,可使地震前兆數(shù)據(jù)庫的讀庫性能達到“最佳”。

    4 討論

    實驗表明Blob在存儲性能上優(yōu)于Clob,但Clob字段在提高長文本數(shù)據(jù)的檢索速度方面存在優(yōu)勢(張靜,王永敏,2011)。上述測試結(jié)果再次驗證了Blob無論在存儲、交換還是讀寫速度方面均優(yōu)于Clob,但Clob+ASCII未壓縮格式可以使用DBMS_ LOBsubstr函數(shù)讀取部分數(shù)據(jù)(由分隔符反推每個數(shù)據(jù)的起始位置),此時的讀取速度遠優(yōu)于整體讀取,而Blob因為采取二進制存儲而無法做到。對地震前兆數(shù)據(jù)庫而言,讀取部分數(shù)據(jù)的情況極少,大量的實際應(yīng)用是整體讀?。〝?shù)據(jù)處理、繪圖、下載等)。

    最佳的壓縮算法為壓縮比最高、壓縮和解壓速度最快的算法,但實際中很難同時滿足這樣的要求。Bzip2的壓縮比最高,但壓縮和解壓時間偏長,Gzip和GzipIO的壓縮和解壓時間短但壓縮比略低。壓縮和解壓2個過程都必須具有較好的速度性能,這2個問題的解是相互矛盾的,我們就是要找到兩者的平衡點,使其達到最優(yōu)性能(劉紅霞,牛富麗,2010)。

    從表2,4和5的測試結(jié)果來看,3種壓縮算法的壓縮比差異導(dǎo)致平均每條記錄的容量不一樣,進而導(dǎo)致讀寫速度與壓縮算法相關(guān),表4和5的讀寫時間包括了壓縮和解壓時間,以此來反映壓縮和解壓速度。如果單從分秒數(shù)據(jù)的讀寫速度來考慮,Gzip和GzipIO優(yōu)于Bzip2;Gzip和GzipIO相比,前者讀庫速度占優(yōu),后者寫庫速度占優(yōu),但Gzip的分秒數(shù)據(jù)壓縮比高出GzipIO的5%和3%,將為磁盤節(jié)省更多的存儲空間,數(shù)據(jù)交換速度將更快。

    對地震前兆數(shù)據(jù)庫而言,如果采用Blob+Gzip存儲結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)庫整體容量降至目前的7%(或更少),分秒數(shù)據(jù)讀寫速度有大幅度提升,秒數(shù)據(jù)交換速度至少是目前的789倍,臺站數(shù)據(jù)可在最短時間內(nèi)交換到5個前兆學(xué)科中心,從而讓地震前兆數(shù)據(jù)發(fā)揮更為重要的時效性。

    直接讀取方法是最簡單且被軟件開發(fā)者使用最廣泛的一種讀庫方法,但其讀庫效率較差。分段讀取方法在Clob秒數(shù)據(jù)讀取時平均循環(huán)150次(58851 Kb/4 000 b)才能讀取一條記錄,但讀取速度卻遠優(yōu)于直接讀取,這應(yīng)該是它所使用的Substr函數(shù)將大對象轉(zhuǎn)換為Varchar2類型所致;Clob每次可讀取的最大長度為4 000字節(jié),Blob為2 000字節(jié),在記錄容量相同的情況下,Blob的循環(huán)次數(shù)是Clob的2倍,部分程度會導(dǎo)致Blob讀取效率下降,這應(yīng)該是它在Blob秒數(shù)據(jù)讀取時表現(xiàn)不穩(wěn)定,頻繁出現(xiàn)讀取時間遠高于其他2種方法的根本原因。分段+線程池方法采用的是多線程并行讀取技術(shù),恰好彌補了這個不足,無論在Clob還是Blob、壓縮還是未壓縮時都表現(xiàn)出了較高的讀庫效率。

    分段+線程池方法的缺點是讀取過程中要消耗大量的數(shù)據(jù)庫連接,數(shù)據(jù)庫中必須設(shè)置有足夠的連接數(shù)量(Open_Cursors)。NET中線程池管理具有每個可用處理器最多25個線程的默認限制,筆者在大量的讀庫測試中監(jiān)測到的最大并發(fā)線程數(shù)只有19個,雖然在LOB讀取時同時開啟的線程總數(shù)可能高達200~300個,但實際上并發(fā)讀取的最多只能有25個,其他線程全部處于等待狀態(tài)。全國地震前兆數(shù)據(jù)庫目前的Open_Cursors總數(shù)全部設(shè)置為30 000,按此推算可同時支持1 200人使用該方法并發(fā)讀庫,而且數(shù)據(jù)庫訪問必須在地震行業(yè)專網(wǎng)下,該配置足以支持“分段+線程池”方法在地震系統(tǒng)內(nèi)部使用。

    2015年10月,筆者利用Bzip2算法完成地磁學(xué)科中心數(shù)據(jù)庫Ceabak表空間壓縮,并提供給全國分析預(yù)報人員訪問,所有分秒數(shù)據(jù)全部改用Blob+Bzip2壓縮結(jié)構(gòu),壓縮前地磁數(shù)據(jù)庫總量約為3 500 GB,壓縮后為126 GB,整體壓縮比約為36%,該壓縮數(shù)據(jù)庫運行至今未出現(xiàn)任何問題。2015年10月,筆者在全國地磁臺網(wǎng)數(shù)據(jù)處理軟件V20156版本中將Clob讀取改用分段讀取方法(之前版本采用直接讀取方法),2017年11月在V20172版本中將Clob和Blob全部改用分段+線程池讀庫技術(shù),這2次升級后該軟件讀庫速度均有大幅度提升,目前每天的用戶總數(shù)約200人次,臺站人員利用該軟件協(xié)助地磁學(xué)科進行分秒數(shù)據(jù)遠程監(jiān)控也得已實現(xiàn)。

    5 結(jié)論

    本文選取2009年1月1日至31日蘭州FHDZ-M15地磁儀器的6個要素分秒數(shù)據(jù),分別用Bzip2,Gzip,GzipIO壓縮算法進行壓縮測試,用Clob和Blob進行了讀寫和交換速度測試,并使用3種讀庫方法進行了讀庫速度測試,主要結(jié)論如下:Blob無論在存儲、交換還是讀寫速度方面均優(yōu)于Clob,但Clob在長文本數(shù)據(jù)檢索方面存在優(yōu)勢;Blob+Gzip為地震前兆數(shù)據(jù)庫分秒數(shù)據(jù)的“最佳”存儲結(jié)構(gòu),讀寫速度均有大幅度提升,數(shù)據(jù)庫整體容量至少可降至目前的7%(或更少),秒數(shù)據(jù)交換速率至少是目前的789倍,臺站數(shù)據(jù)可在最短時間內(nèi)交換到5個前兆學(xué)科中心,從而讓地震前兆數(shù)據(jù)發(fā)揮更為重要的時效性;最簡單且被軟件開發(fā)者使用最廣泛的直接讀取方法讀庫效率較差,分段讀取方法在Clob中遠優(yōu)于直接讀取,但在Blob中表現(xiàn)不穩(wěn)定,分段+線程池技術(shù)無論在Clob還是Blob、壓縮還是未壓縮時都表現(xiàn)出較高的讀庫效率,給LOB數(shù)據(jù)的讀取速度帶來飛躍式的提升。

    本文所有測試數(shù)據(jù)全部來自國家地磁臺網(wǎng)中心,在此表示誠摯的感謝!

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