排孜麗耶·尤山塔依,嚴(yán)傳波,木拉提·哈米提,姚娟,阿布都艾尼·庫(kù)吐魯克,吳淼
(1.新疆醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,烏魯木齊830011;2.新疆醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)工程技術(shù)學(xué)院,烏魯木齊830011;3.新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院影像中心,烏魯木齊830011)
肝包蟲病,是囊狀幼蟲寄生在肝臟所致的寄生蟲病,潛伏期較長(zhǎng),初期癥狀不明顯,畜牧地區(qū)較常見,多流行于我國(guó)西北、內(nèi)蒙和四川西部地區(qū)[1]。近年來隨著旅游業(yè)的發(fā)展、人口的流動(dòng)和家犬的增多,肝包蟲病已成為全世界流行性疾病,嚴(yán)重危害著各國(guó)人民的健康和經(jīng)濟(jì)發(fā)展[2]。
國(guó)家雖已對(duì)肝包蟲病的防治做了大量工作,但是由于牧區(qū)醫(yī)療條件相對(duì)落后,人才缺失等諸多因素,目前包蟲病防治仍然面臨諸多困難[3]。內(nèi)陸和沿海地區(qū)因肝包蟲病甚為少見,導(dǎo)致當(dāng)?shù)蒯t(yī)生缺乏對(duì)該病認(rèn)識(shí),容易誤診[4]。肝包蟲病起病隱匿,臨床癥狀和體征與其他肝占位性病變無特異性,因此,及時(shí)準(zhǔn)確地發(fā)現(xiàn)和診斷肝包蟲病,對(duì)降低其誤診率和死亡率有重要意義。計(jì)算機(jī)輔助診斷(computer aided diagnosis,CAD)技術(shù)通過分析患者圖像,向醫(yī)生提供病灶信息及初步診斷意見以供參考,提高診斷準(zhǔn)確性和工作效率,減少或避免誤診和漏診的發(fā)生[5]。本研究在項(xiàng)目組已有的研究基礎(chǔ)上,把圖像融合方法應(yīng)用到肝包蟲病的分類識(shí)別中,與傳統(tǒng)預(yù)處理方法進(jìn)行比較,研究適合于肝包蟲病的計(jì)算機(jī)輔助診斷方法,為后期研發(fā)肝包蟲病計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)奠定基礎(chǔ)。
本研究實(shí)驗(yàn)對(duì)象由新疆醫(yī)科大學(xué)各附屬醫(yī)院影像中心提供,隨機(jī)選取正常肝臟、單囊型肝包蟲病、肝囊腫CT圖像各120幅,共360幅。經(jīng)影像科醫(yī)師指導(dǎo)分類,并從原始圖像中人工干預(yù)下分割出病灶信息區(qū),即感興趣區(qū)域(region of interest,ROI),見圖1。
圖1 ROI選擇Fig 1 ROI selection
圖2 預(yù)處理結(jié)果Fig 2 Results of preprocessing
2.2.2 圖像融合 圖像融合,即盡量地對(duì)多源信道圖像每一信道中的有用信息進(jìn)行提取并綜合成一幅圖像,使各種信息能夠在同一幅圖像中得到表達(dá),提高圖像的有用信息包含量,有利于更準(zhǔn)確、可靠、全面地獲取目標(biāo)信息[7]。本研究根據(jù)CT圖像的特點(diǎn),對(duì)ROI圖像分別提取蘊(yùn)涵著圖像多方面信息的特征子圖像,再對(duì)其進(jìn)行融合。
在空域中,采用了對(duì)掃描噪聲非常有效的中值濾波器[8]和使傳輸過程中由于受干擾而退化的圖像細(xì)節(jié)變得清晰的銳化濾波器[8-9];在頻率域中,選取了高斯低通濾波器[8]、高斯高通濾波器[8]和同態(tài)濾波器[9];為了消除圖像邊緣的毛刺,填補(bǔ)圖像中由于干擾等原因出現(xiàn)的斷裂和缺口,運(yùn)用了形態(tài)學(xué)方法對(duì)圖像進(jìn)行腐蝕、膨脹、開啟與閉合操作[8-9]。最后,采用列灰度均值替換原灰度值的方法對(duì)圖像進(jìn)行點(diǎn)處理,這樣新得到的增強(qiáng)圖像可以反映原有圖像本身的對(duì)比度與明暗度。以上處理較全面地反映圖像的特點(diǎn),體現(xiàn)圖像的邊緣和細(xì)節(jié)特征,反映圖像的自然屬性。
高斯低通濾波器:
式中,σ是高斯曲線的標(biāo)準(zhǔn)差。
高斯高通濾波器:
膨脹運(yùn)算:
其中,?為空集,B為結(jié)構(gòu)元素。
腐蝕運(yùn)算:
式中,Qr為計(jì)算區(qū)多年平均地下水補(bǔ)給量(m3/a),ρ為開采系數(shù)。經(jīng)計(jì)算,地下水可開采量(Qap)為 13275 萬 m3/a。
均值與方差是數(shù)理統(tǒng)計(jì)中常用的特征統(tǒng)計(jì)量,在圖像分析中,均值反應(yīng)圖像的亮度,方差反應(yīng)圖像高頻部分的大小,CT圖像具有豐富的高頻細(xì)節(jié)信息,因此,采用提取每幅特征子圖像的列均值與列方差組成特征矩陣來進(jìn)行特征圖像的融合,減少計(jì)算量的同時(shí)又盡可能地保留特征圖像的特征信息。假設(shè)特征圖像Xi=(X1,…,XN) ,i=1,…,N,則:
其中,j是圖像行維數(shù)。
特征圖像提取和融合結(jié)果見圖3,第一個(gè)箭頭左邊是原始圖像ROI,右邊從左到右依次是中值濾波,銳化濾波,高斯低通濾波,高斯高通濾波,同態(tài)濾波,腐蝕,膨脹,開啟,閉合與列均值替換后的特征圖像,第二個(gè)箭頭右邊是融合后圖像。
圖3 特征圖像提取并融合結(jié)果Fig 3 Results of feature image extraction and fusion
2.2.3 圖像特征提取 紋理作為物體表面的一種基本屬性,能很好地表征圖像,被廣泛應(yīng)用于圖像分析中。本研究采用基于Tamura和灰度-梯度共生矩陣算法的紋理特征提取方法[10]?;叶?梯度共生矩陣能很好地描繪圖像的紋理信息。
(1)粗糙度 圖像中像素的平均強(qiáng)度值為:
其中,活動(dòng)窗口大小2k×2k,g(i,j)是坐標(biāo) (i,j)的像素灰度值,k=0,1,…,5。每個(gè)像素在不相重疊窗口之間的平均強(qiáng)度差:水平方向
垂直方向
使E值達(dá)到最大的k值來設(shè)置最佳尺寸:
計(jì)算整幅圖像中Sbest的平均值可得到粗糙度,表達(dá)式為:
式中,m,n分別為水平和垂直方向的像素總數(shù)。
式中,np為直方圖中峰值的數(shù)目,p為直方圖HD中的峰值,wp為峰值p包含的量化值范圍,?p為波峰中心位置,?為量化后的方向角,r為直方圖歸一化因子。
其中,PDd表示在距離內(nèi)的n×n大小的局部方向共生矩陣。
r是歸一化因子,σxxx是Fxxx的標(biāo)準(zhǔn)差。
提取到單囊型肝包蟲病、肝囊腫、正常肝臟CT圖像預(yù)處理后的和融合后的ROI圖像Tamura 6個(gè)特征和GGCM 15個(gè)特征值:小梯度優(yōu)勢(shì)、大梯度優(yōu)勢(shì)、灰度分布不均勻性、梯度分布不均勻性、能量、灰度均值、梯度均值、灰度標(biāo)準(zhǔn)差、梯度標(biāo)準(zhǔn)差、相關(guān)性、灰度熵、梯度熵、混合熵、差分距、逆差分距,把它們輸入到支持向量機(jī)[11]和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[12]算法中,進(jìn)行分類處理,分類結(jié)果見表1、表2.(注:最佳分類準(zhǔn)確率是模型最優(yōu)參數(shù)下的分類準(zhǔn)確率,混合特征是由Tamura和GGCM特征組成的特征,即共21維特征)
實(shí)驗(yàn)過程中,采用十折交叉驗(yàn)證法,支持向量機(jī)使用序列最小最優(yōu)化SMO算法,核函數(shù)選擇多項(xiàng)式核函數(shù),調(diào)整參數(shù)C(默認(rèn)值1,一般10-4≤C≤104)和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的隱含層神經(jīng)元個(gè)數(shù)(計(jì)算公式是屬性數(shù)量,o是類別數(shù)量,n是1~10之間的常數(shù))進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。其中,C是懲罰系數(shù),即對(duì)誤差的寬容度。C越高,說明越不能容忍出現(xiàn)誤差,容易過擬合。C越小,容易欠擬合。C過大或過小,模型泛化能力變差。本實(shí)驗(yàn)調(diào)節(jié)C范圍1~30。平均分類準(zhǔn)確率跟參數(shù)調(diào)整曲線和最佳平均分類準(zhǔn)確率下的模型參數(shù)評(píng)估見圖4(注:標(biāo)簽1、2分別代表預(yù)處理后和融合后圖像)
表1 不同特征下3種肝臟預(yù)處理后圖像最佳分類準(zhǔn)確率Table 1 The best classification accuracy of preprocessing images with different features
表2 不同特征下3種肝臟融合后圖像最佳分類準(zhǔn)確率Table 2 The best classification accuracy of three kinds of liver fusion images with different features
由表1、2可知,傳統(tǒng)預(yù)處理方法對(duì)肝囊腫CT圖像Tamura和混合特征的分類效果明顯優(yōu)于圖像融合方法,其中Tamura特征的分類效果優(yōu)于混合特征,最佳分類準(zhǔn)確率為98.333%;圖像融合方法對(duì)單囊型肝包蟲和正常肝臟CT圖像不同特征下的分類準(zhǔn)確率均高于傳統(tǒng)預(yù)處理方法,其中單囊型肝包蟲病圖像GGCM特征的分類效果比Tamura和混合特征好,最佳分類準(zhǔn)確率為99.167%,正常肝臟CT圖像不同特征下的分類準(zhǔn)確率均相等,為100%。由圖4可以看出,圖像融合方法不同特征、不同分類器下的平均分類準(zhǔn)確率均高于傳統(tǒng)預(yù)處理方法。
評(píng)價(jià)一個(gè)分類模型的分類精度,除了分類準(zhǔn)確率之外,還需要計(jì)算一些統(tǒng)計(jì)量,如查準(zhǔn)率(Precision),查全率(Recall),F(xiàn)度量(F-Measure)和 ROC曲線下面積(AUC)等,這些指標(biāo)均是[0,1]范圍內(nèi)的小數(shù),越接近1,說明分類模型越好。由圖4可以看出,圖像融合方法不同特征下兩種分類器的參數(shù)值均高于預(yù)處理方法,說明圖像融合方法下的分類模型的平均分類精度比預(yù)處理方法的好。
圖4 不同方法下平均分類準(zhǔn)確率跟參數(shù)調(diào)整變化曲線和模型參數(shù)評(píng)估Fig 4 Average classification accuracy,parameter adjustment variation curve and model parameter evaluation under different methods
本研究把圖像融合方法應(yīng)用于肝包蟲病CT圖像的分型中,從原圖像ROI中提取多幅特征子圖像,并對(duì)其進(jìn)行融合為一幅蘊(yùn)涵著原圖像多方面特征信息的融合圖像,同時(shí)使用傳統(tǒng)的預(yù)處理方法與之比較,通過對(duì)融合后和預(yù)處理后的圖像進(jìn)行紋理特征提取和分類,結(jié)果表明圖像融合方法對(duì)正常肝臟和單囊型肝包蟲的分類能力比傳統(tǒng)的預(yù)處理方法好,而傳統(tǒng)的預(yù)處理方法適合于肝囊腫CT圖像的分類。