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    非洲豬瘟病毒結(jié)構(gòu)蛋白在病毒感染過程中的作用

    2019-07-26 09:10:38歐云文劉俐君代軍飛馬炳張永光張杰
    生物技術(shù)通報 2019年6期
    關(guān)鍵詞:衣殼內(nèi)囊水解

    歐云文 劉俐君 代軍飛 馬炳 張永光 張杰

    (1. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所 家畜疫病病原生物學(xué)國家重點實驗室,蘭州 730046;2. 開江縣動物疫病預(yù)防控制中心,達(dá)州 636250;3. 達(dá)州市動物疫病預(yù)防控制中心,達(dá)州 635099)

    非洲豬瘟(African swine fever,ASF)是由非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一種急性、烈性、出血性豬傳染病,急性感染死亡率為100%[1]。急性和亞急性ASF常在多種器官上表現(xiàn)出嚴(yán)重的血管性病變,如腎臟出血、淋巴結(jié)彌漫性出血、肺水腫、彌散性血管內(nèi)凝血和血小板減少等。其主要臨床癥狀是高熱、皮膚發(fā)紺、有出血點、嘔吐和便血等[2]。因此,ASF被世界動物衛(wèi)生組織(OIE)列為必須報告的法定動物疫病之一,我國將其列為一類動物疫?。?]。1921年,在非洲(肯尼亞)首次發(fā)現(xiàn)ASF。1957年,歐洲(葡萄牙)首次暴發(fā)ASF疫情,隨后蔓延到全球多個國家和地區(qū),如俄羅斯、烏克蘭、愛沙尼亞、拉脫維亞、波蘭等東歐國家和高加索地區(qū)[3-8]。2018年以來,全球有波蘭、俄羅斯、拉脫維亞、捷克、羅馬尼亞、摩爾多瓦、烏克蘭、匈牙利、保加利亞、比利時、科特迪瓦、南非、贊比亞和中國等14個國家發(fā)生ASF疫情,國際疫情形勢十分嚴(yán)峻[9]。2018年8月,遼寧省出現(xiàn)我國首例ASF疫情[10]。截至目前,在全國23個?。ㄊ?、自治區(qū))先后發(fā)生100起疫情,給我國養(yǎng)豬業(yè)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。

    ASFV是一種有囊膜的雙鏈DNA病毒,屬于非洲豬瘟病毒科、非洲豬瘟病毒屬的唯一成員,也是唯一蟲媒DNA病毒[11]。家豬、野豬和軟蜱均為ASFV的宿主,豬單核細(xì)胞-巨噬細(xì)胞為ASFV主要的靶細(xì)胞[12-13]。病毒基因組全長約為170-193 kb,基因組中間是一段長度約為125 kb的保守區(qū)[14-15]?;蚪M擁有150-167個開放閱讀框(ORFs),編碼150-200種蛋白質(zhì),其中約50種為結(jié)構(gòu)蛋白[16],主要結(jié)構(gòu)蛋白有pp220、pp62、p72、p54、p22和CD2v蛋白等。ASFV粒子由病毒類核、內(nèi)核芯殼、內(nèi)囊膜、衣殼和外囊膜中由內(nèi)向外組裝而成[16]。結(jié)構(gòu)蛋白作為病毒粒子的主要成分,在ASFV吸附、侵入和復(fù)制等感染過程中起作用[16-17]。因此,本文綜述了ASFV結(jié)構(gòu)蛋白在病毒感染中的作用,以期為ASFV結(jié)構(gòu)蛋白的進(jìn)一步研究提供參考。

    1 內(nèi)核芯殼蛋白

    1.1 pp220和pp62蛋白

    ASFV粒子直徑為170-190 nm,是由病毒類核、內(nèi)核芯殼、內(nèi)囊膜、衣殼和外囊膜組成復(fù)雜的多層結(jié)構(gòu),核心結(jié)構(gòu)直徑為70-100 nm,包括病毒基因組、編碼酶和被組裝成病毒顆粒的蛋白質(zhì)[16]。pp220和pp62蛋白為ASFV多聚蛋白前體,分別由CP2475L和CP530R基因編碼,屬于病毒感染過程中的晚期蛋白質(zhì)。pp220蛋白含有多個蛋白酶水解靶基序,在Gly-Gly-X(任意)氨基酸序列水解位點,病毒編碼的SUMO樣S273R蛋白酶將pp220水解為成熟的病毒粒子蛋白p150、p37、p14和p34。因此,成熟的病毒粒子中不含pp220蛋白。按照相似的機(jī)理,pp62被水解為p35和p15蛋白[17],S273R蛋白酶作為ASFV編碼蛋白,也是病毒粒子內(nèi)核芯殼蛋白之一[18-19]。多聚蛋白水解產(chǎn)物主要位于病毒粒子內(nèi)核芯殼,約占病毒蛋白總量的30%,是內(nèi)核芯殼的主要成分,pp220、pp62的水解與病毒粒子的組裝是同時進(jìn)行,該類蛋白的水解產(chǎn)物在病毒衣殼的組裝過程中起關(guān)鍵作用[20-21]。有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),病毒顆粒主要聚集在靠近細(xì)胞核的離散細(xì)胞質(zhì)區(qū)域,該區(qū)域又被稱為“病毒加工廠”,pp220蛋白則位于“病毒加工廠”之中[22]。有學(xué)者進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),多聚蛋白pp220和pp62的加工需要病毒衣殼蛋白p72的表達(dá),當(dāng)p72表達(dá)受阻時,未加工的多聚蛋白pp220和pp62組裝成異常的拉鏈樣結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)由細(xì)長的膜結(jié)合蛋白組成。此外,pp220和pp62在COS細(xì)胞中共表達(dá)時,該兩種蛋白相互作用形成拉鏈樣結(jié)構(gòu),pp220的表達(dá)則為pp62的加工奠定了基礎(chǔ)[19]。因此,pp220和pp62水解為p150、p37、p14、p34、p35和p15蛋白成為病毒顆粒成熟的重要標(biāo)志[23-24],當(dāng)pp220和pp62蛋白的水解受阻,組裝的病毒顆粒則缺少內(nèi)核芯殼,或者組裝的病毒粒子不具有感染性[21-22]。

    1.2 pp220和pp62蛋白水解產(chǎn)物

    p37蛋白作為病毒內(nèi)核芯殼的組分之一,是ASFV編碼的第一個細(xì)胞核-細(xì)胞質(zhì)骨架穿梭蛋白,具有輸出和輸入活性[25]。p37是pp220的水解產(chǎn)物,并與SUMO-1家族的蛋白酶具有較高的氨基酸序列相似性。通過對ASFV感染的細(xì)胞中p37進(jìn)行定位,發(fā)現(xiàn)在病毒感染的早期,p37存在于細(xì)胞核的多個不同區(qū)域;而在感染后期,其僅存在于細(xì)胞質(zhì)[26]。有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),p37蛋白N-末端和C-末端區(qū)域主動從細(xì)胞核轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì),CRM1依賴性和CRM1非依賴性核轉(zhuǎn)運(yùn)途徑介導(dǎo)p37核酸轉(zhuǎn)運(yùn)途徑,p37蛋白中疏水性氨基酸對上述3種核轉(zhuǎn)運(yùn)信號功能至關(guān)重要[27]。這些研究表明,p37核酸轉(zhuǎn)運(yùn)途徑對整個ASFV復(fù)制周期起著重要作用[26]。

    p34蛋白作為重要的結(jié)構(gòu)蛋白,有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),p34蛋白受胰蛋白酶的保護(hù)。同時,可從胞質(zhì)溶膠和膜組分中回收被錯誤加工的p34蛋白[21]。p34和p150蛋白膜相關(guān)組分可組裝成病毒基質(zhì)結(jié)構(gòu),大多數(shù)被錯誤加工的p150亦可從胞質(zhì)溶膠之中回收,而p150的正確加工產(chǎn)物則被選擇性地聚集到內(nèi)囊膜[23]。p35和p15蛋白主要存在于內(nèi)核芯殼,其基質(zhì)樣結(jié)構(gòu)域位于含有DNA的類核和內(nèi)囊膜之間,p35、p15蛋白和pp220水解產(chǎn)物在病毒粒子中以等分子量形式存在[18]。p14蛋白作為pp220的又一水解產(chǎn)物,參與抑制病毒DNA的復(fù)制,屬于早期病毒蛋白。采用免疫熒光技術(shù)發(fā)現(xiàn),該蛋白存在于被ASFV感染細(xì)胞的胞質(zhì)膜,p14特異性抗體介導(dǎo)ASFV感染細(xì)胞的補(bǔ)體依賴性細(xì)胞溶解和抗體依賴性細(xì)胞毒性[28]。

    有學(xué)者采用蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)對pp220和pp62蛋白成熟產(chǎn)物進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)兩種從未檢測到的小蛋白p8和p5[16]。p8蛋白是含有67個氨基酸序列的成熟蛋白,該蛋白由病毒pS273R蛋白酶在pp62蛋白Gly-Gly-X(任意)序列處切割水解而成。在第158-159氨基酸位點(GGG位點),pp62蛋白被水解切割為p15蛋白和中間前體(pp46蛋白);在第463-464氨基酸位點(GGR位點),進(jìn)一步水解切割為成熟的p35和p8蛋白。p35和p15蛋白易被其特異性抗體檢測,但是通過免疫印跡技術(shù)發(fā)現(xiàn),pp46中間前體蛋白誘導(dǎo)產(chǎn)生的p8抗體不能檢測p8蛋白,其原理尚不清楚[16,29-30]。p5蛋白為含有43個氨基酸序列的成熟蛋白,在pp220蛋白第44-45氨基酸位點(GGG位點)水解切割而成。p5蛋白與p8蛋白相比,其蛋白小,免疫原性低,可快速降解,不易被檢測[16,29-30]。有學(xué)者采用質(zhì)譜(MS)分析技術(shù)進(jìn)一步證實了p5和p8蛋白是病毒顆粒的結(jié)構(gòu)組分[16]??傊琾p220、pp62及其水解加工產(chǎn)物在病毒的組裝和感染過程中具有重要的功能。

    2 內(nèi)囊膜蛋白

    2.1 p54蛋白

    ASFV通過受體介導(dǎo)的胞吞機(jī)制進(jìn)入靶細(xì)胞,利用囊膜和內(nèi)吞泡膜的融合機(jī)制將病毒釋放到細(xì)胞漿。p54蛋白由E183L基因編碼,含有跨膜結(jié)構(gòu)域和Gly-Gly-X氨基酸基序,以及多種ASFV結(jié)構(gòu)蛋白的加工識別序列,位于病毒顆粒的內(nèi)囊膜,是ASFV非常重要的抗原蛋白[31]。有學(xué)者制備了一種具有感染性的重組ASFV,確定感染細(xì)胞內(nèi)病毒的運(yùn)動軌跡和速度,從而將“病毒加工廠”的形成動態(tài)實現(xiàn)可視化[31]。采用轉(zhuǎn)染細(xì)胞瞬時表達(dá)p54蛋白,發(fā)現(xiàn)該蛋白主要存在于轉(zhuǎn)染細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜。當(dāng)p54蛋白合成受阻,則病毒粒子的形成受抑制。這表明,在病毒蛋白經(jīng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜轉(zhuǎn)化成病毒包膜時,p54蛋白扮演重要角色[32]。在ASFV感染的早期階段,p54可以激活caspase 3,進(jìn)而誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,這是首次報道ASFV蛋白可以誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[33]。

    在病毒感染期間,p54直接結(jié)合到動力蛋白C-末端的輕鏈8(LC8),進(jìn)而與微管動力蛋白相互作用[34]。采用核磁共振(NMR)技術(shù)發(fā)現(xiàn),p54和突觸后支架蛋白是動力蛋白輕鏈(DYNLL1)的兩個靶標(biāo),這兩種蛋白與DYNLL1直接相互作用,同時谷氨酰胺對其結(jié)合起著重要作用,并且這些蛋白序列都含有GIQVD和KXTQT基序[35-36]。采用減毒毒株免疫接種動物,發(fā)現(xiàn)p54在誘導(dǎo)特異性抗體中起重要作用,p54抗體可以抑制ASFV的吸附[31,44]。因此,在桿狀病毒和大腸桿菌系統(tǒng)中表達(dá)的p54常被用于ASFV的血清學(xué)診斷[37-38]。曹琛福等[39]采用單克隆抗體對p54蛋白抗原表位進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)第23-29位、第36-45位、第72-94位、第114-120位和第137-150位氨基酸為p54蛋白抗原位點。p54和p30蛋白作為與ASFV侵入宿主細(xì)胞密切相關(guān)的結(jié)構(gòu)蛋白,其在病毒感染過程中具有相似的作用。與此同時,p54和p30作為抗原蛋白,可聯(lián)合用于ASFV酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)方法的研發(fā),提高檢測方法的靈敏度[38-40]。

    2.2 pE248R蛋白及其他內(nèi)囊膜蛋白

    pE248R蛋白是由E248R基因編碼的ASFV晚期結(jié)構(gòu)蛋白,是重要的內(nèi)囊膜蛋白,參與蛋白分子中二硫鍵的形成。在病毒感染過程中,該蛋白被?;幚?,并與病毒粒子內(nèi)囊膜相連[41]。有學(xué)者發(fā)現(xiàn),pE248R蛋白的缺失不影響病毒的吸附和內(nèi)化,但抑制病毒粒子在宿主細(xì)胞中復(fù)制,以及病毒基因的早期和晚期表達(dá)。因此,pE248R蛋白缺陷的誘導(dǎo)型重組ASFV內(nèi)囊膜與內(nèi)體膜不發(fā)生融合作用,抑制其向細(xì)胞質(zhì)核心區(qū)域轉(zhuǎn)運(yùn)[42]。pE248R和pE199L蛋白與痘病毒侵入/融合復(fù)合體具有很高的序列相似性,這表明該蛋白與ASFV融合機(jī)制有著密切聯(lián)系[42-43]。采用免疫電子顯微鏡發(fā)現(xiàn),pE248R、p17、p12和pH108R蛋白位于病毒內(nèi)囊膜前體和“病毒加工廠”內(nèi)二十面體顆粒,而非細(xì)胞表面。p17和pE183L蛋白是病毒粒子組裝必需蛋白,而pE248R、p12和pE199L蛋白則與病毒侵入密切相關(guān)[20,41,44-45]。總之,在 ASFV 侵入宿主細(xì)胞后,pE248R蛋白對病毒基因的表達(dá)起重要作用。

    p17蛋白作為ASFV重要的內(nèi)囊膜蛋白,是病毒內(nèi)囊膜上的跨膜蛋白,該蛋白可促進(jìn)病毒膜前體進(jìn)一步組裝為二十面體中間體,以及增強(qiáng)病毒活力。當(dāng)p17表達(dá)受阻,將抑制pp220和pp62蛋白的水解[45]。p12蛋白作為又一內(nèi)囊膜蛋白,由O61R基因編碼,參與病毒吸附,但是其吸附作用機(jī)制仍需進(jìn)一步研究[46]。p22蛋白由KP177L基因編碼,位于病毒顆粒外部,可被非離子去污劑從病毒顆粒表面上溶解處理。有學(xué)者采用冷凍切片免疫金標(biāo)記技術(shù),確定p22蛋白的亞病毒定位[47]。J5R蛋白,又名pH108R蛋白,由H108R基因編碼,111個氨基酸組成,屬于ASFV感染晚期表達(dá)蛋白[44]。該蛋白N-末端含有跨膜結(jié)構(gòu)域,參與免疫應(yīng)答反應(yīng),在病毒復(fù)制和形態(tài)發(fā)生等方面起重要作用[48]。

    表1 ASFV結(jié)構(gòu)蛋白的作用

    3 衣殼蛋白

    3.1 p72蛋白

    p72蛋白由B646L(VP72)基因編碼,是ASFV主要衣殼蛋白,是病毒二十面體衣殼的主要成分,具有高度抗原性和免疫原性。在病毒感染的晚期階段,p72與其他相關(guān)蛋白的表達(dá),以及形成病毒衣殼都緊密相關(guān)[16]。在病毒顆粒形成初期,p72在細(xì)胞質(zhì)中富集,并與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜結(jié)合,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜凸出的表面上形成病毒顆粒衣殼,在凹進(jìn)的表面上形成內(nèi)核芯殼[16,49]。p72參與ASFV的吸附和侵入過程,該蛋白的表達(dá)常作為病毒復(fù)制的標(biāo)志[49-51]。p72抗體可阻斷病毒與巨噬細(xì)胞的結(jié)合,但是其在抗體介導(dǎo)的免疫保護(hù)中不起決定性作用,這或許是目前尚無有效ASF疫苗的重要原因之一[40]。有學(xué)者采用針對p72和A151R基因的小干擾RNA(siRNA)技術(shù)來控制ASFV的體外復(fù)制,研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),靶向基因p72的siRNA可以降低病毒的復(fù)制,以及信使RNA(mRNA)水平[52]。將來自不同地區(qū)的ASFV毒株p72編碼基因序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),p72基因在不同分離株中具有高度的保守性[53]。這表明,p72蛋白有較穩(wěn)定的抗原性,為ASFV抗原研究提供了良好的靶蛋白[54-57]。有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn)p72蛋白N端第11-18位、第26-48位、第73-82位、第136-150位、第159-174位、第181-189位、第191-210位、第247-276位、第279-295位、第313-323位和第382-392位氨基酸為p72蛋白的抗原位點[58]。

    3.2 其他衣殼蛋白

    p14.5蛋白,又稱pE120R蛋白,是病毒衣殼蛋白之一,是DNA結(jié)合蛋白,參與抑制病毒DNA復(fù)制,是病毒粒子從“病毒加工廠”轉(zhuǎn)移到胞質(zhì)膜過程中的必需蛋白質(zhì)。該蛋白由E120R基因編碼,參與病毒粒子的胞內(nèi)運(yùn)輸,其在病毒內(nèi)核芯殼和衣殼的形成過程中起著重要作用[59]。有學(xué)者采用二維凝膠電泳(2DE)和MS技術(shù)發(fā)現(xiàn),在病毒感染期間,p14.5蛋白N-末端丙氨酸(Ala)殘基被乙?;幚?。與正常表達(dá)條件下比較,當(dāng)pE120R蛋白表達(dá)受阻時,胞內(nèi)病毒滴度未受影響,但胞外病毒滴度比對照組低100倍[59-60]。p49蛋白由B438L基因編碼,屬于ASFV感染晚期表達(dá)的病毒衣殼蛋白,是形成具有感染性病毒粒子的必需結(jié)構(gòu)蛋白,由438個氨基酸組成,存在于“病毒加工廠”[61]。該蛋白缺乏時,組裝的病毒粒子不呈二十面體對稱結(jié)構(gòu),而呈異常的管狀結(jié)構(gòu)。在病毒感染期間,pB438L蛋白與膜結(jié)合,表現(xiàn)為完整的膜蛋白[61-62]。

    4 外囊膜蛋白

    CD2v蛋白,又稱pEP402R蛋白,是一種糖蛋白,類似于T淋巴細(xì)胞表面的黏附受體CD2,由信號肽、跨膜域以及147個氨基酸的胞質(zhì)尾組成。在ASFV感染期間,調(diào)節(jié)性反式高爾基體網(wǎng)絡(luò)(TGN)蛋白復(fù)合物AP-1作為CD2v蛋白的靶標(biāo)。CD2v蛋白主要在T細(xì)胞和NK細(xì)胞上表達(dá),采用共聚焦顯微技術(shù)發(fā)現(xiàn),大部分表達(dá)的CD2v蛋白主要位于細(xì)胞質(zhì)“病毒加工廠”周圍區(qū)域,而非細(xì)胞表面[63]。在缺乏細(xì)胞外配體時,絕大多數(shù)的CD2v蛋白主要位于細(xì)胞核周膜腔區(qū)域[64]。在感染后期,紅細(xì)胞吸附現(xiàn)象表明感染細(xì)胞中CD2v蛋白得到表達(dá)。在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或高爾基體中,CD2v蛋白可被切割成N-末端糖基化和C-末端非糖基化兩種形式。與此同時,在感染細(xì)胞中,這兩種切割形式可與CD2v完整蛋白同時存在[63]。CD2v蛋白參與細(xì)胞間黏附、毒力增強(qiáng)和免疫應(yīng)答調(diào)節(jié)過程,對ASFV的組織趨向性、免疫逃避等一系列致病機(jī)理起著重要作用[65]。CD2v蛋白可破壞淋巴細(xì)胞功能,并且該蛋白的表達(dá)與ASFV在家豬之間的傳播有著密切聯(lián)系。有學(xué)者采用酵母雙雜交系統(tǒng)發(fā)現(xiàn),CD2v蛋白的細(xì)胞質(zhì)尾部可與細(xì)胞質(zhì)接頭蛋白SH3P7相互作用,而SH3P7蛋白質(zhì)參與多種細(xì)胞功能調(diào)節(jié),如囊泡轉(zhuǎn)運(yùn)和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)[64]。有學(xué)者提出,將CD2v蛋白的細(xì)胞質(zhì)區(qū)域作為新的遺傳標(biāo)記,這一特性可用于分析來自不同區(qū)域的ASFV毒株,并追蹤病毒的傳播軌跡,最終建立基于蛋白質(zhì)細(xì)胞外部分的全球毒株血清學(xué)分類體系[66-67],研究ASFV毒株在自然界中的多樣性,并為疫苗研發(fā)奠定堅實的基礎(chǔ)[66-68]。p12蛋白C-末端區(qū)域富含半胱氨酸的結(jié)構(gòu)域,參與病毒的吸附,在病毒感染的晚期,由O61R基因表達(dá),有學(xué)者通過免疫電子顯微鏡發(fā)現(xiàn),該蛋白位于病毒粒子層,細(xì)胞表面的膜蛋白是ASFV的受體。在機(jī)體外,p12蛋白可阻斷ASFV侵入宿主細(xì)胞,但p12蛋白抗體被動接種機(jī)體內(nèi),其不能中和ASFV,進(jìn)而達(dá)到被動保護(hù)機(jī)體的作用[69]。

    5 總結(jié)與展望

    ASF作為一種急性、烈性、出血性的豬傳染性疫病,給疫情發(fā)生國家(地區(qū))的養(yǎng)豬業(yè)帶來嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。我國作為對外貿(mào)易強(qiáng)國和養(yǎng)豬業(yè)大國,一旦ASF在我國完全定殖,將會給我國的養(yǎng)豬業(yè)帶來嚴(yán)重?fù)p失,ASF防控形勢不容樂觀[70-71]。ASFV基因型較多,種類龐大,免疫逃逸機(jī)制復(fù)雜多樣。ASFV編碼蛋白的數(shù)量眾多,其中結(jié)構(gòu)蛋白作為病毒顆粒的主要組分,參與病毒的吸附、進(jìn)入和復(fù)制等感染階段。雖然相關(guān)蛋白的研究不斷得到深入,但仍有大量編碼蛋白的功能,以及與宿主細(xì)胞的作用機(jī)制尚不清楚,這系列問題必將成為ASFV研究的熱點。國內(nèi)學(xué)者先后對ASFV的致病機(jī)理、分子流行病學(xué)、診斷方法、疫苗研究等方面進(jìn)行了綜述[72-75],對ASFV的致病機(jī)制有了一定的認(rèn)識,但仍有不足之處。因此,本文通過對參與ASFV感染的結(jié)構(gòu)蛋白,以及這些蛋白和宿主細(xì)胞之間相互作用的機(jī)制進(jìn)行綜述,進(jìn)一步闡釋ASFV結(jié)構(gòu)蛋白在感染過程中的作用,為我國的ASF防控提供理論參考。

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