2018 年 1 月 18 日,《科學(xué)》雜志發(fā)布了Johns Hopkins Kimmel 癌癥研究中心 Nickolas Papadopoulos 研究小組的一項研究成果——基于循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)和蛋白質(zhì)生物標(biāo)記物組合分析的血液檢測方法CancerSEEK。這種檢測方法能夠正確檢測出 8 種最常見的癌癥,其中卵巢癌的檢出率高達(dá) 98%。
團(tuán)隊通過收益遞減原理確定CancerSEEK 檢測中使用的DNA堿基最佳數(shù)量,同時將從血漿中回收的總DNA分成多個等份進(jìn)行獨(dú)立測序,減少每個測序孔中的DNA分子數(shù)量,但每個測序孔中突變分子的檢出比例得以增加,使樣本中的 16 種基因突變更容易被發(fā)現(xiàn)。
因為大多數(shù)早期腫瘤不釋放ctDNA,團(tuán)隊進(jìn)而研究了血漿樣本中的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物,他們發(fā)現(xiàn)癌癥相關(guān)的8種蛋白質(zhì)可在單一免疫分析平臺上區(qū)分癌癥患者與健康對照者。
最終,研究人員檢測了來自1005位癌癥患者的血液樣本。結(jié)果發(fā)現(xiàn),卵巢癌的檢出率最高,達(dá)98%,70%的胰腺癌檢出率也讓研究人員非常興奮(胰腺癌目前很難檢測)。特異度的測試結(jié)果也非常理想,812名健康人群僅7人結(jié)果為陽性。
研究人員還訓(xùn)練了一種機(jī)器學(xué)習(xí)算法來找出血液樣本的信息與癌癥所處部位之間的關(guān)聯(lián)性,以判斷出癌癥所處身體部位,測試正確識別率達(dá)到 83%。
這種新型檢測方法意義非常重大,因為早期癌癥沒有擴(kuò)散之前一般都能被治愈?!拔艺J(rèn)為,我們最終將能找到一種能在發(fā)現(xiàn)腫瘤瘤體、或者察覺身體異常之前就能檢測出癌癥的方法,”美國癌癥協(xié)會的副首席醫(yī)療官Len Lichtenfeld評論道。不過他也提醒道,研究人員還要提高檢測方法的特異度,以防給原本健康的人帶來心理陰影。