楊英楠,干 丹,王振宜
(上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬岳陽(yáng)中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院,上海 200437)
肛瘺是肛腸科的常見(jiàn)病、多發(fā)病,其發(fā)病率高達(dá)8.6/100 000~10/100 000[1]。根據(jù)內(nèi)口和外口的數(shù)量,可將其分為單純性肛瘺和復(fù)雜性肛瘺。復(fù)雜性肛瘺是指肛管直腸瘺,主要為肛管和直腸受到炎癥侵犯,導(dǎo)致周?chē)M織破潰形成瘺,內(nèi)口或外口數(shù)量2個(gè)以上(含2個(gè)),手術(shù)是其主要治療手段。糖尿病是臨床常見(jiàn)的代謝紊亂性疾病,具有發(fā)病率高、難愈、終生性等特點(diǎn)[2]。而肛瘺并發(fā)糖尿病則增加了創(chuàng)面感染的風(fēng)險(xiǎn),并有可能延緩創(chuàng)面愈合。2015年8月—2016年4月,筆者通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)評(píng)估了補(bǔ)氣升提法對(duì)糖尿病復(fù)雜性肛瘺患者術(shù)后創(chuàng)面局部微環(huán)境的影響,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
1.1一般資料 選擇上述時(shí)期在本院治療的復(fù)雜性肛瘺患者24例,均符合《中醫(yī)病證診斷療效標(biāo)準(zhǔn)》[3]中復(fù)雜性肛瘺診斷標(biāo)準(zhǔn),均為男性,年齡18~65歲,血常規(guī)、凝血功能、肝腎功能檢查均正常,自愿參與葡萄糖(空腹)檢測(cè),自愿加入本試驗(yàn)并簽署知情同意書(shū)。排除妊娠期婦女,對(duì)觀察藥物過(guò)敏者,合并血液、心腦血管、肝臟、腎臟等嚴(yán)重原發(fā)性疾病和炎性腸病、結(jié)核性肛瘺、惡性腫瘤、精神異常者,最近3個(gè)月內(nèi)參與過(guò)其他臨床實(shí)驗(yàn)者。血糖檢測(cè)并參照文獻(xiàn)[4]標(biāo)準(zhǔn)證實(shí)存在糖尿病者16例,將此16例患者隨機(jī)分為2組:治療組8例,年齡(46.87±13.87)歲;陽(yáng)性對(duì)照組8例,年齡(49.63±16.32)歲。不伴糖尿病的8例作為陰性對(duì)照組,年齡(37.85±11.27)歲。3組患者年齡比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
1.2治療方法 3組患者均由肛腸科手術(shù)經(jīng)驗(yàn)豐富的高年資醫(yī)師行復(fù)雜性肛瘺切除術(shù),伴糖尿病者在術(shù)前邀請(qǐng)內(nèi)科醫(yī)生會(huì)診, 并予以口服降糖藥物或者胰島素注射控制血糖水平,控制空腹血糖(FPG)4.4~6.1 mmol/L ,餐后2 h血糖(2hPG)4.4~8.0 mmol/L,糖化血紅蛋白(HbAlc)<6.5%。3組患者術(shù)后均給予左氧氟沙星注射液0.4 g加入生理鹽水250 mL中靜脈滴注,每日1次,連續(xù)2 d。每日8:00和15:00各換藥1次:常規(guī)清潔創(chuàng)面,外用馬應(yīng)龍麝香痔瘡膏,用消毒紗布及無(wú)菌棉塊包扎固定。換藥后予局部紅外線照射2~3 min。治療組在上述治療基礎(chǔ)上給予芪參固托湯口服,組方:太子參30 g、黃芪30 g、黨參30 g、山藥30 g、白芍30 g、白術(shù)30 g、升麻30 g、柴胡20 g、當(dāng)歸20 g、陳皮15 g、炙甘草15 g,由本院制劑室制備,具體方法:將上述中藥進(jìn)行沖洗過(guò)濾后,放入全自動(dòng)中藥煎藥機(jī)(型號(hào)JYJ-25),280 g 中藥加水820 mL(煎藥機(jī)加水量=吸收常量1.5 mL/g×飲片質(zhì)量+預(yù)計(jì)取得藥液量+耗損量200 mL),溫度105 ℃,壓力0.15 MPa,煎煮30 min,共煎煮2次,過(guò)濾濃縮后每10 mL加入70%乙醇靜置24 h,重復(fù)上述步驟,回收乙醇,適量蒸餾水稀釋,最后每劑中藥留取約200 mL藥液,真空包裝,統(tǒng)一由中藥房配送至病房護(hù)理部。護(hù)理部經(jīng)隔水密封加熱至35~40 ℃,護(hù)理部統(tǒng)一于每日早、晚飯后30 min發(fā)放至患者處并觀察其服用完畢。
1.3觀察項(xiàng)目及檢測(cè)方法 在術(shù)后第1天及第14天8:00未行創(chuàng)面清潔、消毒、換藥、紅外線照射等基礎(chǔ)治療前,用標(biāo)準(zhǔn)規(guī)格無(wú)菌長(zhǎng)棉簽蘸取術(shù)后創(chuàng)面局部分泌物,采用高通量測(cè)序方法分析創(chuàng)面分泌物菌群的組成情況。
1.3.1DNA提取 將所取術(shù)后創(chuàng)面局部分泌物立即放入-80 ℃冰箱速凍,送至實(shí)驗(yàn)室提取DNA,余備管樣本存于-80 ℃冰箱保存。糞便DNA按照QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit 標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行抽提。
1.3.216S rRNA-V1-V3區(qū)的PCR擴(kuò)增及測(cè)序采用二次PCR建庫(kù)測(cè)序流程:①DNA質(zhì)檢及Qubit定量;②第一輪PCR;③PCR產(chǎn)物純化;④Qubit定量及混庫(kù);⑤第二輪PCR;⑥Beads二次純化;⑦Qubit定量及Q-PCR質(zhì)檢;⑧Miseq測(cè)序;⑨數(shù)據(jù)分析。
1.3.3生物信息學(xué)分析 ①數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化;②Illumina Miseq測(cè)序得到的原始圖像數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)Base Calling轉(zhuǎn)化為序列數(shù)據(jù),結(jié)果以FASTQ文件格式來(lái)存儲(chǔ);③原始數(shù)據(jù)質(zhì)量分析;④通過(guò)生物信息統(tǒng)計(jì)學(xué)的方法,對(duì)所有測(cè)序reads的每個(gè)circle進(jìn)行堿基分布和質(zhì)量波動(dòng)的統(tǒng)計(jì),直觀反映出測(cè)序樣本的測(cè)序質(zhì)量和文庫(kù)構(gòu)建質(zhì)量;⑤原始數(shù)據(jù)質(zhì)量控制;⑥使用cutadapt v1.3檢測(cè)接頭和修剪末端,使用QIIME v1.8.0篩選序列和嵌合體,嵌合體去除使用QIIME v1.8.0的Usearch算法,參數(shù)默認(rèn);⑦使用QIIME分析流程進(jìn)行分析;⑧OTU聚類(lèi):使用pick_open_reference方式進(jìn)行OTU聚類(lèi),聚類(lèi)算法使用Uclust,數(shù)據(jù)庫(kù)使用Greengenes 2013-08 release (http://greengenes.lbl.gov/Download/)版本,相似度閾值為97%,對(duì)所有序列進(jìn)行OTU劃分并進(jìn)行生物信息統(tǒng)計(jì)分析,其余參數(shù)為QIIME默認(rèn)參數(shù);⑨alpha_diversity分析:使用軟件QIIME v1.8.0 alpha_diversity分析模塊評(píng)價(jià)各個(gè)樣本或者分組的5個(gè)alpha多樣性指數(shù)(shannon,chao1,observed_species,goods_coverage,simpson);⑩稀釋性曲線:使用QIIME v1.8.0 alpha_rarefaction.py做5個(gè)alpha多樣性指數(shù)的稀釋性曲線;Beta多樣性分析:分別計(jì)算 Unweighted/Weighted Unifrac來(lái)表征Beta diversity;upgma_tree 目錄:使用UPGMA bootstrap tree 分析。
1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 統(tǒng)計(jì)軟件采用SPSS 22.0.0.0(64位版本)。對(duì)樣本數(shù)量及數(shù)據(jù)分布進(jìn)行初步判斷后,采用非參數(shù)檢驗(yàn)中的秩和檢驗(yàn)。生物學(xué)信息統(tǒng)計(jì)采用 QIIME v1.8.0軟件,選用rdp_classifier v2.2算法。
2.1實(shí)驗(yàn)完成情況 治療組退出1例,陽(yáng)性對(duì)照組脫落1例,陰性對(duì)照組剔除1例,共21例患者完成實(shí)驗(yàn)。
2.2樣本測(cè)序純化處理前后的序列 術(shù)后第1天及第14天共獲得未加工序列590287,經(jīng)純化處理后得到純凈序列478587,質(zhì)控后優(yōu)化序列為81.08%,樣本質(zhì)量良好,可順利進(jìn)行后續(xù)測(cè)序,結(jié)果可信。見(jiàn)表1。
2.3各樣本物種豐度及多樣性分析 術(shù)后第14天,治療組和陰性對(duì)照組各指數(shù)均有一定程度上升,但與術(shù)后第1天比較變化較小;陽(yáng)性對(duì)照組各指數(shù)變化明顯,除goods_coverage外,其他指數(shù)均顯著上升,見(jiàn)表2和表3。組間分析顯示,陽(yáng)性對(duì)照組物種數(shù)目最少,治療組其次,陰性對(duì)照組較高,術(shù)后第14天陽(yáng)性對(duì)照組最高,陽(yáng)性對(duì)照組治療前后差異最大,增長(zhǎng)達(dá)到10倍,見(jiàn)圖1及圖2;治療組和陰性對(duì)照組菌群較為穩(wěn)定,陽(yáng)性對(duì)照組菌群波動(dòng)巨大,這種菌群波動(dòng)的差異可能與糖尿病具有相關(guān)性,同時(shí)對(duì)疾病的恢復(fù)有一定的影響。
表1 各組樣本測(cè)序純化處理前后的序列
圖1 樣本observed_species
圖2 組間observed_species
2.4門(mén)水平菌群結(jié)構(gòu) 在門(mén)水平上,完成研究的21例患者98%的菌群屬于以下5個(gè)門(mén):70%以上屬于厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、12%屬于變形菌門(mén)(Proteobacteria)、5%屬于放線菌門(mén)(Actinobacteria)和擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、約3%屬于藍(lán)藻門(mén)(Cyanobacteria),其余則屬于無(wú)法確定的分類(lèi)(如0D1、TM7等),見(jiàn)圖3。3組術(shù)后第1天及第14天組內(nèi)的菌群分布基本符合上述規(guī)律,厚壁菌門(mén)最豐富,變形菌門(mén)次之,放線菌門(mén)與擬桿菌門(mén)相當(dāng),藍(lán)藻門(mén)所占比重最少,但是陽(yáng)性對(duì)照組術(shù)后第1天組內(nèi)菌群分布明顯不同,除了厚壁菌門(mén)最豐富之外,藍(lán)藻門(mén)所占比重其次,其余3個(gè)菌門(mén)所占比重相當(dāng);術(shù)后第14天,治療組和陰性對(duì)照組厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)比重顯著增加,變形菌門(mén)比重顯著下降,放線菌門(mén)、藍(lán)藻門(mén)變化相對(duì)較小,陽(yáng)性對(duì)照組則厚壁菌門(mén)增加更為明顯,變形菌門(mén)比重與其他2組相反呈增加趨勢(shì),其他3個(gè)菌門(mén)不同程度下降,見(jiàn)表4。
表2 各樣本5個(gè)alpha多樣性指數(shù)
表3 各組5個(gè)alpha多樣性指數(shù)
圖3 門(mén)水平各樣品間菌群分布情況
2.5綱水平菌群結(jié)構(gòu) 除不明確的菌群外,主要是以下10個(gè)菌綱占優(yōu)勢(shì):厚壁菌門(mén)的Bacilli、Clostridia、Erysipelotrichi,變形菌門(mén)的Gammaproteobacteria、Betaproteobacteria、Alphaproteobacteria,放線菌門(mén)的Actinobacteria、Coriobacteriia,擬桿菌門(mén)的Bacteroidia以及藍(lán)藻門(mén)的Chloroplast。其中最為優(yōu)勢(shì)的是Bacilli及Clostridia菌綱,但在各樣品間的具體分布差異也相對(duì)較大,以Bacilli菌綱為例其在對(duì)應(yīng)樣品中所占比例為0.41%~90.94%,差異巨大,見(jiàn)圖4。3組中,治療組最優(yōu)勢(shì)菌綱為Bacilli,其次為Clostridia;陽(yáng)性對(duì)照組治療前后差異較大,術(shù)后第1天Bacilli比例最高、其次是Chloroplast,術(shù)后第14天Clostridia比例最高、其次是Bacilli;陰性對(duì)照組最優(yōu)勢(shì)的是Clostridia,其次是Bacilli;術(shù)后第14天,3組Bacilli、Clostridia均有不同程度提高,但陽(yáng)性對(duì)照組Clostridia成倍提高,明顯與其他2組不同;治療組和陰性對(duì)照組Bacteroidia均有提高,而陽(yáng)性對(duì)照組呈下降趨勢(shì);治療組和陰性對(duì)照組Gammaproteobacteria均有下降,而陽(yáng)性對(duì)照組則顯著上升;3組Chloroplast均下降,但陽(yáng)性對(duì)照組下降幅度尤為顯著,見(jiàn)表5。
2.6目水平菌群結(jié)構(gòu) 除不明確的菌群外,主要是以下12個(gè)目的菌群占總菌群98%以上:Lactobacillales、Clostridiales、Bacteroidales、Enterobacteriales、Streptophyta、Actinomycetales、Bifidobacteriales、Burkholderiales、Coriobacteriales、Erysipelotrichales、Rhizobiales、Bacillales。其中最為優(yōu)勢(shì)的是Lactobacillales、Clostridiales菌目。但在各樣品間的具體分布差異也相對(duì)較大,以Lactobacillales為例其在對(duì)應(yīng)樣品中所占比例為0.37%~90.7%,差異巨大。3組中,治療組最優(yōu)勢(shì)菌目為Bacilli中的Lactobacillales,其次為Clostridia中的Clostridiales;陽(yáng)性對(duì)照組治療前后差異較大,術(shù)后第1天Bacilli中的Lactobacillales比例最高、其次是Chloroplast中的Streptophyta,術(shù)后第14天Clostridia中的Clostridiales比例最高、其次是Bacilli中的Lactobacillales;陰性對(duì)照組最優(yōu)勢(shì)的是Clostridia中的Clostridiales,其次是Bacilli中的Lactobacillales。術(shù)后第14天,3組Bacilli中的Lactobacillales、Clostridia中的Clostridiales均有不同程度提高,但陽(yáng)性對(duì)照組Clostridia中的Streptophyta及Gammaproteobacteria中的Enterobacteriales成倍提高,明顯與其他2組不同;治療組和陰性對(duì)照組Bacteroidia中的Lactobacillales均有提高,而陽(yáng)性對(duì)照組呈下降趨勢(shì);治療組和陰性對(duì)照組Gammaproteobacteria中的Enterobacteriales均有下降,而陽(yáng)性對(duì)照組則顯著上升;3組Chloroplast中的Streptophyta均下降,但陽(yáng)性對(duì)照組下降幅度尤為顯著;治療組和陰性對(duì)照組Actinobacteria中的Bifidobacteriales變化不大,而陽(yáng)性對(duì)照組則顯著下降,見(jiàn)表6。
圖4 綱水平各樣品間菌綱分布情況
Taxon治療組術(shù)后第1天術(shù)后第14天陽(yáng)性對(duì)照組術(shù)后第1天術(shù)后第14天陰性對(duì)照組術(shù)后第1天術(shù)后第14天Firmicutes-Bacilli68.6669.8921.3426.4023.9928.35Firmicutes-Clostridia11.6512.6316.9537.0938.3244.22Bacteroidetes-Bacteroidia1.572.6113.642.973.524.77Actinobacteria-Actinobacteria2.231.6013.445.671.901.07Proteobacteria-Gammaproteobacteria6.042.645.1913.3015.683.61Cyanobacteria-Chloroplast0.110.0317.311.210.530.18Firmicutes;Other4.947.100.163.073.344.34Proteobacteria-Betaproteobacteria1.571.105.892.354.115.80Other;Other1.951.650.862.244.412.53Actinobacteria-Coriobacteriia0.090.030.431.511.692.56Firmicutes-Erysipelotrichi0.350.411.190.660.951.62Proteobacteria-Alphaproteobacteria0.470.182.752.950.710.61
表6 目水平3組術(shù)后不同時(shí)間菌目分布情況 %
2.7各分類(lèi)水平匯總分析 將門(mén)、綱、目、科、屬、種6個(gè)分類(lèi)水平數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總后,進(jìn)行分析得出餅圖5,可以直觀反映出各菌群之間的相對(duì)優(yōu)勢(shì)情況及菌群間的從屬關(guān)系。
圖5 6個(gè)分類(lèi)水平匯總餅圖
腸道微生態(tài)與人類(lèi)壽命、健康密切相關(guān),構(gòu)成腸道微生態(tài)的已知細(xì)菌達(dá)500余種,正常情況下這些微生物相互依存,又相互制約,保持?jǐn)?shù)量和比例的穩(wěn)定,共同維持腸道的微生態(tài)平衡,對(duì)人體的營(yíng)養(yǎng)吸收、免疫調(diào)節(jié)等生理功能有重要作用,對(duì)一些代謝性疾病和消化道腫瘤有一定拮抗作用[5-6]。
肛瘺術(shù)后創(chuàng)面直接與外界空氣、腸液等接觸,具有開(kāi)放式、污染式等特征,其有菌創(chuàng)面愈合的快慢可能與腸道菌群、飲食物過(guò)敏、炎性腸病、糖尿病等相關(guān)。糖尿病患者肛瘺術(shù)后創(chuàng)面難愈是臨床常見(jiàn)的一個(gè)難題,因此,本研究選取合并有糖尿病的肛瘺患者作為研究對(duì)象,探討創(chuàng)面局部微環(huán)境中菌群與肛瘺術(shù)后創(chuàng)面愈合情況的相關(guān)性。
近年來(lái),越來(lái)越多的研究認(rèn)為腸道菌群是控制體質(zhì)量和能量代謝的一個(gè)重要因素,并且與肥胖、2型糖尿病等代謝性疾病密切相關(guān)[7]。糖尿病患者由于長(zhǎng)期處于高糖狀態(tài),導(dǎo)致血漿滲透壓升高,吞噬細(xì)胞對(duì)病菌的殺傷及吞噬能力受到影響,自身免疫功能降低,腸道功能紊亂,導(dǎo)致腸道菌群失衡[8]。許小津等[9]認(rèn)為2型糖尿病患者腸道雙歧桿菌總菌數(shù)量減少,即雙歧桿菌整體數(shù)量減少。研究表明,糞擬桿菌、變異梭狀芽孢桿菌、大腸埃希菌、脫硫弧菌屬、加氏乳桿菌、變形鏈球菌和副流感嗜血桿菌等有促糖尿病發(fā)生的作用,而梭狀芽孢桿菌、直腸真桿菌、羅斯氏菌、疣微菌科、Akkermansiamuciniphila和普氏糞桿菌等有抗糖尿病的作用[10-11]。邵加慶[12]認(rèn)為,腸道菌群與能量貯存與代謝、腸道旁分泌與內(nèi)分泌均息息相關(guān),腸道菌群通過(guò)其基因、中間產(chǎn)物和代謝活力等影響著人體的代謝、活動(dòng)、體質(zhì)量、免疫等多方面,從而對(duì)健康和疾病產(chǎn)生雙向影響。而中醫(yī)研究表明,氣機(jī)的升降理論能調(diào)節(jié)腸道菌群,有維持腸道菌群的穩(wěn)態(tài)作用[13]。本研究選用的是我科聞茂康教授的經(jīng)驗(yàn)方芪參固托方,有補(bǔ)氣升提、健脾養(yǎng)血之功效。方中的黃芪、黨參、太子參、山藥等均有控制血糖的作用,全方可以在一定程度上調(diào)節(jié)患者血糖水平,從而影響患者基礎(chǔ)代謝環(huán)境,調(diào)節(jié)腸道菌群。
本研究發(fā)現(xiàn),在門(mén)水平3組術(shù)后第1天和術(shù)后第14天的菌群分布以厚壁菌門(mén)最豐富,變形菌門(mén)次之,放線菌門(mén)與擬桿菌門(mén)相當(dāng),藍(lán)藻門(mén)所占比重最少。術(shù)后第14天,陰性對(duì)照組厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)比重顯著增加,變形菌門(mén)比重顯著下降,放線菌門(mén)、藍(lán)藻門(mén)變化相對(duì)較??;陽(yáng)性對(duì)照組則厚壁菌門(mén)增加尤為明顯,增幅高達(dá)70%;變形菌門(mén)比重與其他2組相反,呈增加趨勢(shì);其他3個(gè)菌門(mén)不同程度下降。已有腸道菌群方面的研究認(rèn)為腸道優(yōu)勢(shì)菌門(mén)有5~9個(gè)[14],本研究中得出的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)為厚壁菌門(mén)等5個(gè)菌門(mén),與已有研究成果相符,而其中又以厚壁菌門(mén)最為突出,這可能與創(chuàng)面所在位置具有一定的相關(guān)性,由于其余腸道相通的特點(diǎn),因此其菌群受到腸道菌群的影響。而陽(yáng)性對(duì)照組的菌群結(jié)構(gòu)變化情況印證了已有的糖尿病腸道菌群方面的相關(guān)研究結(jié)果[15],厚壁菌門(mén)相較于陰性對(duì)照組偏低,擬桿菌門(mén)所占比重下降,放線菌門(mén)高于陰性對(duì)照組;但同樣是糖尿病患者,治療組的變化趨勢(shì)則不同于陽(yáng)性對(duì)照組,可能與中藥具有一定的相關(guān)性。
本實(shí)驗(yàn)通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)證實(shí)糖尿病復(fù)雜性肛瘺患者術(shù)后創(chuàng)面局部微環(huán)境中的菌群與不伴糖尿病患者的菌群多樣性和種群結(jié)構(gòu)明顯不同,特別是在門(mén)水平上;而補(bǔ)氣升提法可使糖尿病復(fù)雜性肛瘺患者術(shù)后創(chuàng)面局部微環(huán)境中的菌群物種、豐度分布發(fā)生變化,由門(mén)水平至目水平上將其調(diào)節(jié)到與不伴糖尿病患者菌群相似。由于本研究受樣本數(shù)量及時(shí)間限制,尚未對(duì)補(bǔ)氣升提法改善糖尿病復(fù)雜性肛瘺患者術(shù)后創(chuàng)面局部微環(huán)境中菌群的具體機(jī)制進(jìn)行研究,未來(lái)可加大樣本數(shù)量,進(jìn)一步研究探討。
現(xiàn)代中西醫(yī)結(jié)合雜志2018年25期