楊柏齡 侯 茜 胡 鋒 張 帆
(甘肅中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生物教研室 中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)學(xué)科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,甘肅 蘭州 730000)
衰老是由內(nèi)外環(huán)境和遺傳因素等諸多因素相互影響、相互作用而引起的生物學(xué)過程,主要表現(xiàn)為連續(xù)性并隨年齡而增的全身性、漸進(jìn)性、衰退性的形態(tài)變化和功能紊亂〔1〕,對(duì)人的生理病理甚至心理都產(chǎn)生著極大的影響。黨參是甘肅道地藥材,也是傳統(tǒng)的補(bǔ)益中藥〔2〕,具有增強(qiáng)記憶能力、學(xué)習(xí)能力;提高免疫力;抗疲勞、抗氧化等藥理作用〔3〕。目前,未見關(guān)于甘肅黨生水煎劑對(duì)衰老模型小鼠脾臟組織基因表達(dá)影響的研究,本實(shí)驗(yàn)用基因芯片研究甘肅黨參水煎劑對(duì)D-半乳糖致衰老模型小鼠脾臟組織基因表達(dá)的影響。
1.1動(dòng)物、藥品及試劑 2月齡SPF級(jí)小鼠30只(20±2)g,雄性,昆明種(甘肅中醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心提供),動(dòng)物合格證編號(hào):SCXK(甘)2011-0001。素花黨參(產(chǎn)自甘肅文縣,甘肅中醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系晉玲教授鑒定):制成黨參水煎劑(含生藥濃度為1 g/ml),置4℃冰箱備用;D-半乳糖購(gòu)自上海中秦試劑有限公司,批號(hào)為20120228。Trizol試劑(美國(guó)Invitrogen公司),批號(hào)為20110602;RNase試劑盒(美國(guó)Qiagen公司),批號(hào)為20120125;全基因組表達(dá)譜芯片(Agilent小鼠4X44K)、雜交試劑盒、溴乙啶,均購(gòu)自上??党缮锕?。
1.2方法
1.2.1分組及造模 將30只昆明種小鼠隨即分為3組:衰老模型組、空白對(duì)照組、黨參組,每組10只。于小鼠頸背部皮下注射5%D-半乳糖溶液,1 g·kg-1·d-1〔4〕,空白對(duì)照組小鼠每天注射等體積生理鹽水,共42 d。
1.2.2給藥 于造模第11天開始,黨參組灌服黨參水煎劑(15 g·kg-1·d-1)??瞻讓?duì)照組灌服等量生理鹽水,共計(jì)42 d。
1.2.3取材 頸椎脫臼處死小鼠,快速分離出脾臟,生理鹽水漂洗后即刻轉(zhuǎn)入-20℃冰箱冷凍備用。
1.2.4總mRNA的提取 采用Trizol法〔5〕分別提取空白對(duì)照組、黨參組及衰老模型組的脾臟細(xì)胞總mRNA,并進(jìn)行純化,確保沒有基因組DNA污染。
1.2.5探針制備 采用Agilent表達(dá)譜芯片配套的單色標(biāo)記芯片基因表達(dá)分析方法逆轉(zhuǎn)錄標(biāo)記cDNA探針并純化,分別標(biāo)記各組的總mRNA,并進(jìn)行等量混合。
1.2.6芯片雜交 將芯片滴上雜交液,放入密閉的雜交盒中,于65℃滾動(dòng)雜交17 h,用Agilent公司提供的洗液Ⅰ、Ⅱ洗滌,晾干(室溫),掃描。采用Agilent Scanner G2505B掃描芯片及GeneSpring GX v11.5.1 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,根據(jù)信號(hào)比值(Foldchange),篩選出表達(dá)顯著上調(diào)或下調(diào)的基因。
1.2.7實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證基因芯片結(jié)果 隨機(jī)選擇差異基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證基因芯片,選擇的目的基因?yàn)椋築cl2、TLR7、IL6RA,管家基因?yàn)椋篏APDH;引物通過ABIPrimerexPress6.0軟件設(shè)計(jì),由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(美國(guó)BIO-RAD公司)進(jìn)行檢測(cè),驗(yàn)證芯片結(jié)果。
2.1脾臟總mRNA的提取結(jié)果 各組提取的總mRNA經(jīng)紫外分光光度計(jì)分別測(cè)定純度,結(jié)果都符合D260/OD280 Ratio>1.8,OD260/OD230 Ratio>2(表1)。空白對(duì)照組、衰老模型組、黨參組小鼠總mRNA的提取質(zhì)控結(jié)果:從OD值分析mRNA甲醛變性凝膠電泳圖(圖1)可以得知,所得的mRNA完整性及純度均較好,沒有明顯降解,符合雜交檢驗(yàn)的要求。
表1 脾臟總mRNA的質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
圖1 各組脾臟mRNA甲醛變性凝膠電泳
2.2雜交結(jié)果 雜交芯片經(jīng)掃描儀掃描后獲得芯片掃描圖,圖中的亮點(diǎn)表示高表達(dá)的基因,暗點(diǎn)表示低表達(dá)的基因,三組同一位置放大的芯片掃描圖,表明芯片的雜交過程是成功的。見圖2。
2.3基因表達(dá)差異分析 在包括25 066個(gè)探針在內(nèi)的Agilent小鼠全基因組表達(dá)譜芯片上,以Fold Change≥2.0或≤0.5為篩選標(biāo)準(zhǔn),分別對(duì)空白對(duì)照組、衰老模型組和黨參組的數(shù)據(jù)進(jìn)行信號(hào)值比對(duì),得到各組上調(diào)及下調(diào)差異基因的總數(shù)目:衰老模型組與空白對(duì)照組比較2 463個(gè)(上調(diào)982個(gè),下調(diào)1 481個(gè));黨參組與衰老模型組比較1 540個(gè)(上調(diào)1 126個(gè),下調(diào)414個(gè));黨參組與空白對(duì)照組比較666個(gè)(上調(diào)416個(gè),下調(diào)250個(gè))。運(yùn)用生物信息學(xué)方法對(duì)衰老模型組與空白對(duì)照組、黨參組與空白對(duì)照組有顯著表達(dá)差異的基因從細(xì)胞凋亡及抗細(xì)胞凋亡、免疫應(yīng)答、氧化應(yīng)激應(yīng)答這三個(gè)方面進(jìn)行生物學(xué)功能分析,并通過黨參組與衰老模型組比較,衰老模型組與空白對(duì)照組比較,找出兩組比較中表達(dá)有差異的共同基因篩選黨參作用的靶基因,結(jié)果顯示:黨參組與衰老模型組比較及衰老模型組與空白對(duì)照組比較,表達(dá)有差異的共同基因有36個(gè),其中與細(xì)胞凋亡相關(guān)的基因16個(gè),其中10個(gè)上調(diào)分別為Bcl2(NM_177410.2)、BIRC5(NM_001012273.1)、RNF7(NM_011279.2)、MKL1(BC050941.1)、PLAGL2(NM_018807.5)、EIF5A(NM_181582.3)、BUB1B(NM_009773.3)、DCC(NM_007831.3)、LGALS7(NM_008496.4)、SQSTM1(NM_011018.2);6個(gè)下調(diào),分別為GZMB(NM_013542.2)、PERP(BC021772.1)、KRT8(NM_031170.2)、SEMA6A(NM_018744.2)、MAP3K5(NM_008580.4)、SPP1(NM_001204233.1);與免疫應(yīng)答相關(guān)的基因17個(gè),其中10個(gè)上調(diào)分別為CR2(NM_007758.2)、C1QA(NM_007572.2)、C1QB(NM_009777.2)、H2-DMA(NM_010386.3)、TAP1(NM_013683.2)、H2-Q6(NM_207648.1)、H2-AA(NM_010378.2)、H2-Q10(NM_010391.4)、OAS1B(NM_033541.4)、POU2F2(NM_001163556.1);7個(gè)下調(diào)分別IL6RA(NM_133211.3)、IL7(NM_008371.4)、CFH(NM_009888.3)、LY96(NM_016923.2)、TLR7(NM_133211.3)、CFD(NM_013459.2)、CCL11(NM_011330.3);與氧化應(yīng)激應(yīng)答相關(guān)的基因3個(gè),均為上調(diào)基因分別為GPX1(NM_008160.5)、GPX4(NM_008162.2)、TXNIP(NM_023719.2);黨參組與空白對(duì)照組比較,上述36個(gè)基因表達(dá)水平?jīng)]有明顯變化。結(jié)果表明,這36個(gè)基因的表達(dá)水平受到黨參用藥的影響。
2.4實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證基因芯片結(jié)果
2.4.1各組基因擴(kuò)增曲線 從圖3看出,拷貝數(shù)不同的模板隨著擴(kuò)增循環(huán)數(shù)的增加,逐漸增強(qiáng)其熒光強(qiáng)度,曲線經(jīng)過一段指數(shù)擴(kuò)增期后趨于平行(出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)),模板的拷貝數(shù)和熒光累積值的對(duì)應(yīng)關(guān)系在指數(shù)擴(kuò)增期形成了定量的基礎(chǔ),各基因擴(kuò)增曲線都有明顯的指數(shù)擴(kuò)增期且曲線平滑,說(shuō)明該檢測(cè)具有較好的敏感性。
2.4.2各組基因溶解曲線 圖4橫軸表示溫度,縱軸表示熒光強(qiáng)度,各基因溶解曲線均呈單一峰,且有較銳利的波,其他引物二聚體及非特異性熒光信號(hào)未被檢出,說(shuō)明PCR擴(kuò)增特異性較好。
空白對(duì)照組
衰老模型組
黨參組
圖3 各組基因的擴(kuò)增曲線
圖4 各組基因的溶解曲線
2.4.3分析結(jié)果 各基因擴(kuò)增曲線平滑且指數(shù)擴(kuò)增期明顯,說(shuō)明該檢測(cè)敏感性較好。各基因溶解曲線都呈單一峰,說(shuō)明擴(kuò)增的產(chǎn)物單一,表明有較好的擴(kuò)增特異性,檢測(cè)重復(fù)了3次,循環(huán)閾值(Ct) 由儀器自動(dòng)讀取,說(shuō)明方法穩(wěn)定,結(jié)果的重復(fù)性好,以Ct平均值作為最后的Ct測(cè)量結(jié)果,用△△Ct相對(duì)定量法進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量分析,所測(cè)目的基因在3組樣本中的2-△Ct的數(shù)值比較,見表2。黨參用藥后,基因Bcl2表達(dá)上調(diào)(在衰老模型組表達(dá)下調(diào)),IL6RA和TLR7表達(dá)下調(diào)(在衰老模型組表達(dá)上調(diào)),基因芯片的結(jié)果與實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果一致,說(shuō)明基因芯片結(jié)果可靠。
表2 衰老模型組、黨參組分別與空白對(duì)照組比較 Bcl2、 IL6RA、TLR7的2-△Ct數(shù)值比
延緩衰老和預(yù)防老年病在我國(guó)人口老齡化日趨顯著的背景下顯得尤為重要,對(duì)衰老機(jī)制的研究自古有之,中醫(yī)學(xué)提出了腎虛學(xué)說(shuō)、脾虛學(xué)說(shuō)等理論,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對(duì)衰老的機(jī)制也提出了免疫學(xué)說(shuō)、氧化自由基學(xué)說(shuō)、凋亡學(xué)說(shuō)等各種理論〔6〕。細(xì)胞凋亡是由基因控制的細(xì)胞自主的有序死亡,故又稱編程性細(xì)胞死亡。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,受黨參用藥影響的36個(gè)基因中有16個(gè)與細(xì)胞凋亡相關(guān),如Bcl-2是Bcl-2家族蛋白的重要成員,屬于抑制凋亡亞族成員,位于細(xì)胞的核膜、粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)及線粒體膜上,人體內(nèi)許多組織中如神經(jīng)元都存在著Bcl-2基因的表達(dá),并且許多組織在進(jìn)行包括細(xì)胞凋亡在內(nèi)的自我更新時(shí)也有Bcl-2基因的表達(dá),Bcl-2基因的表達(dá)具有抑制細(xì)胞凋亡、延長(zhǎng)細(xì)胞生存期的作用〔7〕。在衰老模型小鼠脾臟中該基因表達(dá)顯著下調(diào),而在黨參用藥后,該基因的表達(dá)顯著上調(diào),提示甘肅黨參可能通過控制細(xì)胞凋亡來(lái)延緩機(jī)體衰老。
衰老的免疫學(xué)說(shuō)認(rèn)為免疫系統(tǒng)的中樞器官是胸腺,它的衰退可以使T淋巴細(xì)胞減少,整體免疫功能下降,從而導(dǎo)致機(jī)體衰老。與機(jī)體免疫有關(guān)的另一個(gè)重要免疫器官是脾臟,脾臟的功能與機(jī)體的細(xì)胞免疫、體液免疫及非特異性免疫都密切相關(guān);中醫(yī)認(rèn)為脾為后天之本,氣血生化之源,在人體五臟中占有很重要的地位。本研究結(jié)果表明36個(gè)在衰老模型組中表達(dá)有明顯差異的基因,在空白對(duì)照組表達(dá)沒有明顯變化,表明這36個(gè)基因與衰老相關(guān),其中與免疫應(yīng)答相關(guān)的基因有17個(gè),如IL-6是一種多效能細(xì)胞因子,是由單核細(xì)胞、巨噬細(xì)胞及T淋巴細(xì)胞產(chǎn)生,在活化淋巴細(xì)胞產(chǎn)生抗體及免疫反應(yīng)信號(hào)傳導(dǎo)等方面起重要作用〔8〕。機(jī)體IL-6濃度的異常升高可引起一系列的神經(jīng)內(nèi)分泌和免疫功能的紊亂,加速衰老進(jìn)程,是動(dòng)脈粥樣硬化、老年癡呆等疾病的主要原因〔9〕。本研究中衰老小鼠脾臟組織IL-6基因表達(dá)顯著上調(diào),用甘肅黨參水煎劑干預(yù)后衰老小鼠脾臟細(xì)胞IL-6基因表達(dá)顯著下調(diào),揭示了甘肅黨參可能通過調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答來(lái)延緩機(jī)體的衰老。
自由基學(xué)說(shuō)是具有代表性的衰老學(xué)說(shuō)之一,隨著年齡不斷增長(zhǎng),自由基平衡逐漸遭到破壞,過量的自由基受到各種生物大分子過氧化作用攻擊,產(chǎn)生脂質(zhì)過氧化反應(yīng),使蛋白質(zhì)和核酸分子交聯(lián),基因突變或DNA復(fù)制異常,最終導(dǎo)致細(xì)胞的正常功能被嚴(yán)重破壞,以至衰老、死亡。本研究結(jié)果顯示,受黨參用藥影響的36個(gè)基因中有3個(gè)與氧化應(yīng)激相關(guān),如GPX-1,是細(xì)胞內(nèi)谷胱甘肽過氧化物酶1的基因,谷胱甘肽過氧化物酶可利用谷胱甘肽作為還原劑,將機(jī)體內(nèi)過氧化氫或脂質(zhì)過氧化物轉(zhuǎn)變?yōu)樗蜉^穩(wěn)定的脂類烴基化合物,阻斷活性氧對(duì)機(jī)體的損傷〔10〕,從而延緩衰老。本研究結(jié)果中,衰老小鼠脾臟細(xì)胞中GPX-1基因表達(dá)顯著下調(diào),經(jīng)黨參作用后衰老小鼠脾臟細(xì)胞GPX-1基因表達(dá)顯著上調(diào),揭示了甘肅黨參可能通過調(diào)節(jié)氧化應(yīng)激應(yīng)答來(lái)延緩機(jī)體的衰老進(jìn)程。