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    VDOD:一種基于KD樹(shù)的分布式離群點(diǎn)檢測(cè)算法?

    2018-04-16 08:08:19李子茂
    關(guān)鍵詞:離群數(shù)據(jù)量分布式

    李子茂 駱 慶 劉 晶

    (中南民族大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)學(xué)院 武漢 430074)

    1 引言

    離群點(diǎn)檢測(cè)是數(shù)據(jù)管理中的熱點(diǎn)問(wèn)題之一[1],在許多領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用,如信用卡詐騙、網(wǎng)絡(luò)入侵檢測(cè)等。在早期文獻(xiàn)[2]中,離群點(diǎn)被描述為:在一個(gè)數(shù)據(jù)集中,若某個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)與其他數(shù)據(jù)點(diǎn)的差距非常大以至于被懷疑是通過(guò)其他機(jī)制生成的,那么該數(shù)據(jù)點(diǎn)就被認(rèn)為是離群點(diǎn)。

    目前,絕大多數(shù)離群點(diǎn)算法都是針對(duì)集中式環(huán)境設(shè)計(jì)的。隨著物聯(lián)網(wǎng)、云計(jì)算和社交網(wǎng)絡(luò)等技術(shù)的興起,數(shù)據(jù)的種類(lèi)和規(guī)模正在不斷地增長(zhǎng)和積累,大數(shù)據(jù)時(shí)代到來(lái)。集中式算法處理效率有限,在多數(shù)情況下不能滿足用戶的需求。因此,一些學(xué)者開(kāi)始使用分布式算法并行計(jì)算離群點(diǎn),以提高計(jì)算效率。

    本文提出了一種基于方差的數(shù)據(jù)劃分方法,數(shù)據(jù)劃分過(guò)程中建立KD樹(shù),通過(guò)KD樹(shù)計(jì)算劃分后的數(shù)據(jù)塊的K近鄰將劃分后的數(shù)據(jù)塊均勻地分配到各個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn),同時(shí)能夠很好地保證同一計(jì)算點(diǎn)上數(shù)據(jù)的近鄰性?;谠搫澐炙惴?,提出了一種基于R樹(shù)的分布式離群點(diǎn)檢測(cè)算法-VDOD。最后通過(guò)使用真實(shí)數(shù)據(jù)集和人工合成數(shù)據(jù)集進(jìn)行實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證了本文提出的基于方差的數(shù)據(jù)劃分方法和VDOD算法的有效性。

    2 相關(guān)工作

    離群點(diǎn)檢測(cè)的研究最早始于統(tǒng)計(jì)領(lǐng)域[1],基于統(tǒng)計(jì)的離群點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)假定被檢數(shù)據(jù)符合某個(gè)概率分布模型,凡不符合該分布模型的數(shù)據(jù)點(diǎn)被視為離群點(diǎn)。自那以后,從事數(shù)理統(tǒng)計(jì)、機(jī)器學(xué)習(xí)和數(shù)據(jù)挖掘等領(lǐng)域研究的學(xué)者們分別從不同的角度提出了多種離群點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)和方法[2]。概括起來(lái),主要的離群點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)有:基于統(tǒng)計(jì)的方法、基于聚類(lèi)的方法、基于分類(lèi)的方法、基于距離[3]、基于密度[4]和基于信息熵的方法等,本文主要針對(duì)基于距離的離群點(diǎn)檢測(cè)方法。

    基于距離的離群點(diǎn)最早由Knorr等[5]提出,是一種目前被廣泛認(rèn)可的定義標(biāo)準(zhǔn)。Knorr提出了三個(gè)檢測(cè) DB(k,r)離群點(diǎn)的算法[6],分別是:基于索引的(Index-based)算法、嵌套循環(huán)(nested loop)算法和基于網(wǎng)格(cell-based)的算法。另外,Angiulli等[7]提出了一個(gè)基于k近鄰(KNN)度量離群程度的方法。Wu等[8]提出了一種基于抽樣的方法來(lái)考察被測(cè)對(duì)象與其近鄰的關(guān)系,即對(duì)每個(gè)對(duì)象,僅考察對(duì)象與一個(gè)較小的隨機(jī)抽樣的樣本集之間的關(guān)系,避免了對(duì)整個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行距離計(jì)算。還出現(xiàn)了針對(duì)特定應(yīng)用背景的離群點(diǎn)檢測(cè)算法,文獻(xiàn)[9]提出了不確定數(shù)據(jù)的基于距離的離群點(diǎn)檢測(cè)算法。

    在分布式環(huán)境中離群點(diǎn)檢測(cè)的相關(guān)研究主要有文獻(xiàn)[10~13]。其中文獻(xiàn)[10]所研究的問(wèn)題與本文相同,但提出的PENL算法采用的是基于數(shù)量的數(shù)據(jù)劃分方法,不考慮數(shù)據(jù)分布情況,對(duì)于數(shù)據(jù)集中任意一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn) p,在最壞情況下,必須與其他所有數(shù)據(jù)點(diǎn)計(jì)算距離,才能得到最終結(jié)果。因此當(dāng)數(shù)據(jù)規(guī)模較大時(shí),PENL算法需要大量的網(wǎng)絡(luò)開(kāi)銷(xiāo),計(jì)算效率不高。與本文研究問(wèn)題最為接近的工作有文獻(xiàn)[11],對(duì)PENL算法進(jìn)行改進(jìn)提出了BOD算法,采用基于空間的數(shù)據(jù)劃分。該算法中同一計(jì)算節(jié)點(diǎn)的數(shù)據(jù)有很好的近鄰性,網(wǎng)絡(luò)開(kāi)銷(xiāo)也大大降低,但是該算法分配到各個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)后數(shù)據(jù)量不均衡,并行計(jì)算效率不佳。另外 He Qing[12~13]等基于MapReduce計(jì)算離群點(diǎn)和構(gòu)建并行KD樹(shù)檢測(cè)離群點(diǎn)。

    3 問(wèn)題描述

    本文主要研究在分布式環(huán)境下,如何并行地計(jì)算出數(shù)據(jù)集內(nèi)所有的基于距離的離群點(diǎn)。下面形式化地給出基于距離的離群點(diǎn)的定義和介紹分布式框架。表1列出了本文使用的主要符號(hào)。

    3.1 基于距離的離群點(diǎn)檢測(cè)

    在以下的討論中,設(shè)數(shù)據(jù)集為 X={x1,x2,…,xi,…,xP},P 為數(shù)據(jù)集的大??;xi∈X ,為數(shù)據(jù)集X 中的數(shù)據(jù)點(diǎn),記為 (xi1,xi2,…,xij,…,xid)。每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)是一個(gè)類(lèi)型為 A=(A1,A2,…,Ad)的d元組,其中d為數(shù)據(jù)集維度,Aj為屬性,d(xi,xj)為度量數(shù)據(jù)對(duì)象xi,xj∈X的距離函數(shù)。其中

    定義1r鄰域。對(duì)任意實(shí)數(shù)r≥0,數(shù)據(jù)對(duì)象xi的 r-鄰域 Q(xi,r),定義為

    定義2DB(k,r)離群點(diǎn)。給定一個(gè)正整數(shù)k,如果數(shù)據(jù)點(diǎn) x的r鄰域的基數(shù)小于k,則 x是DB(k,r)離群點(diǎn)。

    3.2 分布式框架

    分布式環(huán)境如圖1所示,集群包含固定個(gè)數(shù)的計(jì)算節(jié)點(diǎn) N={n1,n2,…,n|N|}(|N|為節(jié)點(diǎn)個(gè)數(shù)),每個(gè)節(jié)點(diǎn)都存儲(chǔ)數(shù)據(jù)集X的一個(gè)子集,并包含一個(gè)查詢處理引擎,用于接收查詢參數(shù)和輸出結(jié)果,節(jié)點(diǎn)之間可以相互通信。

    表1 符號(hào)表

    圖1 分布式框架

    4 數(shù)據(jù)劃分

    4.1 塊的切分

    在介紹劃分方法之前,首先介紹下該方法的兩個(gè)主要輸入?yún)?shù):

    1)塊(block):即所需要切分的空間區(qū)域。對(duì)于d維空間內(nèi)的一個(gè)塊b,可以使用塊的下界點(diǎn)b.min、上界點(diǎn)b.max表示,記b=[b.min,b.max]。其中對(duì)于任意屬于塊b的數(shù)據(jù)點(diǎn)滿足?i∈[0,d-1],b.Min[i]≤ p[i]≤b.max[i]。

    2)切分維度。取值范圍為[0,d-1]整形變量,用于標(biāo)識(shí)將被切分的維度。

    總體上切分算法是一個(gè)遞歸調(diào)用的過(guò)程。對(duì)于一個(gè)d維數(shù)據(jù)塊b,需要h次劃分將其劃分為2h個(gè)數(shù)據(jù)量相等的子塊,h滿足2h≥N2≥2h-1。劃分?jǐn)?shù)據(jù)塊時(shí)從方差最大的第i維的中值點(diǎn)Node-data處進(jìn)行切分,分成2個(gè)數(shù)據(jù)量相等的子塊bleft,bright。其中bleft的下界點(diǎn)bleft.min與b的下界點(diǎn)b.min相同,bleft的上界點(diǎn)的第i維值 bleft.max[i]=Node-data[i],? j∈[0,d-1]且 j≠ I,bleft.max[j]=b.max[j]。相應(yīng)的 bright.max=b.max,bright.min[i]=Node-data[i],?j∈[0,d-1]且 j≠ I,bright.min[j]=b.min[j]。算法1描述了切分的具體過(guò)程。

    算法1 spilt(block b,dimension D)

    1)記切分次數(shù)為h,h初始為0;

    2)WHILE(2h<N2)DO;

    3)FOR所有子塊;

    4)計(jì)算數(shù)據(jù)集在0到d-1維上各自的方差,取最大方差維作為spilt;

    5)數(shù)據(jù)點(diǎn)集在第spilt維進(jìn)行排序,位于中間的那個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)被選為Node-data;

    6)沿著Node-data進(jìn)行垂直spilt維的切割,計(jì)算切割后左右子塊的b.min,b.max;

    7)END FOR;

    8)h=h+1;

    9)ENDWHILE。

    4.2 塊的分配

    當(dāng)切分結(jié)束后,最終得到的塊的集合表示為B={b1,b2,…,bn},顯然塊的數(shù)目大于N,需要根據(jù)劃分時(shí)建立的KD樹(shù)[14]來(lái)分配數(shù)據(jù)塊。通過(guò)計(jì)算各個(gè)數(shù)據(jù)塊的幾何中心的距離,可以得出數(shù)據(jù)塊的K近鄰數(shù)據(jù)塊。每次分配數(shù)據(jù)塊將數(shù)據(jù)塊按照標(biāo)記進(jìn)行排序,將第一個(gè)數(shù)據(jù)塊和它的p近鄰或p-1近鄰分配到同一計(jì)算節(jié)點(diǎn)。重復(fù)該過(guò)程,直至所有數(shù)據(jù)塊被分配完。

    5 VDOD算法

    5.1 局部離群點(diǎn)計(jì)算

    算法首先通過(guò)R樹(shù)[15]結(jié)構(gòu)對(duì)數(shù)據(jù)點(diǎn)進(jìn)行批量過(guò)濾,在本文的計(jì)算中,限定每個(gè)R樹(shù)葉子節(jié)點(diǎn)包含的數(shù)據(jù)點(diǎn)的個(gè)數(shù)的范圍為[k,3k]。具體過(guò)濾方法如下:

    方法一:如果點(diǎn) x到MBR m1的最小距離Min_dist(m1,x)>r,則 m1中不存在 x 的近鄰點(diǎn)。

    方法二:如果已經(jīng)計(jì)算出數(shù)據(jù)點(diǎn)的近鄰點(diǎn)的個(gè)數(shù)超過(guò)k個(gè),那么繼續(xù)查找它的近鄰是沒(méi)有意義的,因?yàn)樵摂?shù)據(jù)點(diǎn)已經(jīng)可以判定為非離群點(diǎn)。

    具體過(guò)程如算法2所示。

    算法2VDOD局部算法

    輸入:數(shù)據(jù)集X,考察的近鄰個(gè)數(shù)k,距離閾值r

    輸出:所有的局部離群點(diǎn)集S,部分全局離群點(diǎn)O

    1)初始化堆H為空;

    2)nn(p,r)→ 計(jì)算 p以r為半徑的鄰居數(shù)目;

    3)FOR X中的每一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)xi;

    4)R樹(shù)根節(jié)點(diǎn)的孩子節(jié)點(diǎn)加入到H中;

    5)WHILE(H不為空)DO;

    6)取H首元素h;

    7)IF(Min_dist(xi,h)>r)DO;

    8)h的孩子節(jié)點(diǎn)加入到H中;

    9)END IF;

    10)ELSE;

    11)計(jì)算h中 xi的近鄰點(diǎn)數(shù)目nn(xi,r);

    12)IF(nn( xi,r)≥ k)DO;

    13)停止計(jì)算離群點(diǎn),并將xi從X中移除;

    14)END IF;

    15)ELSE;

    16)IF(?j∈[0,d-1],xi[j]-b.min[j]≥ r且b.max[j]-xi[j] ≥ r)DO;

    17)將 xi移除到O中;

    18)END IF;

    19)END ELSE;

    20)END ELSE;

    21)ENDWHILE;

    22)END FOR;

    23)X中剩余的數(shù)據(jù)點(diǎn)為局部離群點(diǎn)集S,輸出S、O。

    5.2 全局離群點(diǎn)計(jì)算

    如5.1節(jié)所述,如果節(jié)點(diǎn)n中存在局部離群點(diǎn),則節(jié)點(diǎn)n需要與其相鄰的節(jié)點(diǎn)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)通信。KD樹(shù)上的兩個(gè)數(shù)據(jù)塊,若其中一個(gè)數(shù)據(jù)塊的b.min或b.max在另一數(shù)據(jù)塊的空間范圍內(nèi),則這兩個(gè)數(shù)據(jù)塊一定相鄰。對(duì)于節(jié)點(diǎn)n的任意塊b可求得其它節(jié)點(diǎn)上與其相鄰的塊的集合neig(b)。算法3展示了全局離群點(diǎn)計(jì)算的具體過(guò)程。

    算法3 outlier_judgement()。

    輸入:塊b中的局部離群點(diǎn)集S,其它節(jié)點(diǎn)上與b相鄰的塊集合neig(b)

    輸出:S中的全局離群點(diǎn)

    1)FOR集合neig(b)中的每一個(gè)塊 b′DO;2)初始化集合send_(b→b′);

    3)FOR S中的每一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)p DO;

    4)IFmin_dist(p,b′)≤r THEN;

    5) send_(b→b′)→ p;

    6) END IF;

    7)END FOR;

    8)將send_(b→ b′)發(fā)送到 b′所在的節(jié)點(diǎn);

    9)END FOR。

    VOOD算法復(fù)雜度分析:算法2的復(fù)雜度下界為Ω(d*|X|*log(|X|)),最差情況為O(d*|X|*|X|)。在算法3中,記局部離群點(diǎn)的個(gè)數(shù)為|S|,每個(gè)局部離群點(diǎn)都需要在其它塊進(jìn)行k次查找,則算法4的復(fù)雜度下界為Ω(k * d*|S|*log(|S|) ) ,最差情況為O(k*d*|S|*|S|)。

    6 實(shí)驗(yàn)分析

    6.1 真實(shí)數(shù)據(jù)集

    本小節(jié)主要使用真實(shí)數(shù)據(jù)集來(lái)測(cè)試VDOD算法性能。試驗(yàn)中使用的集群包括8個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn),每個(gè)節(jié)點(diǎn)的配置為Intel Core i5 2400 3.10GHz CPU,8GB內(nèi)存,500GB硬盤(pán),操作系統(tǒng)為Red Hat Linux 6.1。算法采用JAVA語(yǔ)言編寫(xiě),JDK版本為1.8.3,數(shù)據(jù)集為UCI提供的home sensors for home activity monitoring數(shù)據(jù)集(鏈接地址為http://archive.ics.uci.edu/Ml/datasets),共包括919438條真實(shí)數(shù)據(jù),每條數(shù)據(jù)包括5維可度量屬性。實(shí)驗(yàn)中的對(duì)比算法為BOD算法,主要的衡量標(biāo)準(zhǔn)為查詢處理時(shí)間和通信量(以網(wǎng)絡(luò)間傳輸?shù)臄?shù)據(jù)點(diǎn)個(gè)數(shù)來(lái)度量)。表2描述了相關(guān)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

    表2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果(真實(shí)數(shù)據(jù))

    如表2所示,本文提出的VDOD算法和BOD算法相比,檢測(cè)離群點(diǎn)的處理時(shí)間和通信量都明顯減少。另一方面,通過(guò)對(duì)表2中1~4行實(shí)驗(yàn)結(jié)果的比較,容易發(fā)現(xiàn):隨著查詢半徑r的增大,數(shù)據(jù)集中的離群點(diǎn)表少,BOD和VDOD算法的處理時(shí)間和通信量都隨之減少;當(dāng)查詢閾值k增大時(shí),離群點(diǎn)變多,導(dǎo)致BOD算法和VDOD算法的處理時(shí)間和通信量都增加。

    6.2 人工數(shù)據(jù)集

    由于真實(shí)數(shù)據(jù)集規(guī)模有限,且無(wú)法變化數(shù)據(jù)維度等參數(shù),因此本小節(jié)使用人工合成數(shù)據(jù)進(jìn)一步地對(duì)算法進(jìn)行測(cè)試。合成數(shù)據(jù)集為聚簇分布數(shù)據(jù),各維的取值范圍為0~10000。具體生成方法如下:對(duì)于包含a個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的數(shù)據(jù)集,隨機(jī)生成a/1000聚簇點(diǎn),每個(gè)聚簇內(nèi)平均包含1000個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)。在每個(gè)聚簇內(nèi),數(shù)據(jù)點(diǎn)以聚簇點(diǎn)為中心呈高斯分布[16]。實(shí)驗(yàn)相關(guān)變量的默認(rèn)值和變化范圍如表3所示。

    表3 參數(shù)設(shè)置

    本小節(jié)主要在分布式環(huán)境下對(duì)比了VDOD算法與BOD算法的性能。圖2描述了集群規(guī)模對(duì)算法性能的影響??梢钥闯鲭S著集群規(guī)模的擴(kuò)大,集群的計(jì)算能力提高,VDOD和BOD算法的處理時(shí)間都隨之減少,說(shuō)明這兩種算法都有很好的性能加速比。另外在圖3中,節(jié)點(diǎn)個(gè)數(shù)的增加也導(dǎo)致了局部離群點(diǎn)的增多。VDOD算法的通信量輕微增加,而對(duì)于BOD算法,更多的節(jié)點(diǎn)意味著更多的數(shù)據(jù)劃分,因此網(wǎng)絡(luò)傳輸量也隨之增加。

    圖2 集群規(guī)模與處理時(shí)間

    圖3 集群規(guī)模與通信量

    圖4、5描述了數(shù)據(jù)量對(duì)算法性能的影響。隨著數(shù)據(jù)量的增加,VDOD和BOD算法都需要消耗更多的系統(tǒng)時(shí)間,也會(huì)產(chǎn)生更多的網(wǎng)絡(luò)開(kāi)銷(xiāo)。但通過(guò)對(duì)比容易發(fā)現(xiàn),VDOD算法的處理時(shí)間和網(wǎng)絡(luò)開(kāi)銷(xiāo)明顯低于BOD算法,而且增長(zhǎng)速度緩慢。

    圖4 數(shù)據(jù)量與時(shí)間

    圖5 數(shù)據(jù)量與通信量

    7 結(jié)語(yǔ)

    本文研究了分布式環(huán)境下基于距離的離群點(diǎn)檢測(cè)問(wèn)題。首先,提出了一種新型的基于方差的數(shù)據(jù)劃分方法,劃分過(guò)程中建立KD樹(shù)。該方法對(duì)維度不敏感,減少了對(duì)數(shù)據(jù)近鄰性的破壞,同時(shí)數(shù)據(jù)基本上實(shí)現(xiàn)了均勻分配,提高了并行計(jì)算的效率?;趧澐址椒?,提出了VDOD離群點(diǎn)計(jì)算算法,該算法包括兩個(gè)步驟:在每個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)本地,基于R樹(shù)索引進(jìn)行批量過(guò)濾,剪枝掉了大部分的不必要計(jì)算,最終快速地計(jì)算出局部離群點(diǎn);進(jìn)一步地,利用KD樹(shù)快速確定需要通信的相鄰塊,并計(jì)算輸出最終結(jié)果。最后通過(guò)大量的實(shí)驗(yàn)說(shuō)明了本文提出的VDOD算法的正確性和有效性。

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