油棕果實性狀QTL定位和候選基因研究

棕油是世界油脂市場的重要組成部分，約占世界油脂市場的1/4。油棕(Elaeis guineensisJacq)果實是棕油的來源，其重量從8～20 g不等，果實中棕油的含量約為45%～50%(按重量計)，中果皮(果肉)與果實比例與油脂產(chǎn)量呈正相關(guān)。馬來西亞棕油局(MPOB)的Ting NC等人研究報道了與產(chǎn)量相關(guān)的2個組分，即果實和中果皮含量相關(guān)的數(shù)量性狀位點(QTL)。利用31個標(biāo)記(17個SNP和14個SSR)對12 cM(6.7 Mbp)的QTL置信區(qū)間進(jìn)行精細(xì)定位，其中，20個來自母本、6個來自父本和5個共分離標(biāo)記。在對比油棕樹后代基因型時發(fā)現(xiàn)：父本等位基因的遺傳導(dǎo)致油棕樹后代的果實和中果皮重量存在較大差異。通過在油棕EG5基因組上定位標(biāo)記，從QTL區(qū)域挖掘候選基因和轉(zhuǎn)錄因子。在此QTL區(qū)間內(nèi)，在假染色體3上鑒定到與花器官發(fā)育、開花、光合作用、微管形成、氮和脂質(zhì)代謝等多種生物過程相關(guān)的假定基因和轉(zhuǎn)錄因子。利用這種基因組的方法，可以識別一些與油棕果實和中果皮重量相關(guān)的潛在候選基因標(biāo)記，這些標(biāo)記可以進(jìn)一步用于分子標(biāo)記輔助育種。