植物共生信號(hào)的文獻(xiàn)計(jì)量分析

楊紅玉,王明元,*,游曉朝,劉建福

1 華僑大學(xué)園藝系,廈門 3610212 華僑大學(xué)園藝科學(xué)與工程研究中心,廈門 361021

學(xué)術(shù)信息與動(dòng)態(tài)

植物共生信號(hào)的文獻(xiàn)計(jì)量分析

楊紅玉1,王明元1,*,游曉朝1,劉建福2

1 華僑大學(xué)園藝系,廈門 3610212 華僑大學(xué)園藝科學(xué)與工程研究中心,廈門 361021

利用Science Citation Index引文數(shù)據(jù)庫(kù)檢索2006—2015年間植物共生信號(hào)研究的文獻(xiàn),分別從植物共生信號(hào)研究的國(guó)家、機(jī)構(gòu)的發(fā)文量、被引頻次、高被引論文及研究方向等進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,從文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的角度分析近10年來(lái)植物共生信號(hào)研究的發(fā)展?fàn)顩r。結(jié)果顯示2006—2015年間共有植物共生信號(hào)文獻(xiàn)3724篇,近10年來(lái)文獻(xiàn)量逐漸增多,主要研究方向是植物科學(xué)、微生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、遺傳學(xué)等。美國(guó)、法國(guó)、德國(guó)等國(guó)家在該領(lǐng)域內(nèi)影響力大,中國(guó)近幾年在該領(lǐng)域的研究動(dòng)態(tài)也比較活躍,但距離世界先進(jìn)水平還有一定的差距。由此可見(jiàn),植物共生信號(hào)研究日益引起人們的關(guān)注,美國(guó)等發(fā)達(dá)國(guó)家在該領(lǐng)域占有絕對(duì)優(yōu)勢(shì),中國(guó)還處在起步階段,應(yīng)進(jìn)一步提高對(duì)該領(lǐng)域研究的關(guān)注和研究水平。

植物共生信號(hào)；Web of Science；文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)

植物與土壤微生物的共生關(guān)系在自然界中普遍存在,共生是生物適應(yīng)自然環(huán)境的一種必然現(xiàn)象,得到了國(guó)內(nèi)外學(xué)者廣泛的研究[1]。共生體的形成對(duì)改善植物水分吸收、礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)、代謝調(diào)節(jié)以及增強(qiáng)抗逆性等均有一定的促進(jìn)作用[2- 3]。在自然界不良環(huán)境因素對(duì)農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)的影響日趨增多的今天,植物與微生物的共生關(guān)系成為學(xué)者越來(lái)越多的研究領(lǐng)域,利用二者共生的技術(shù)也逐步投入實(shí)際應(yīng)用。

為了解國(guó)際對(duì)植物共生關(guān)系研究的總體水平以及我國(guó)與世界先進(jìn)水平的差距,了解該領(lǐng)域的發(fā)展趨勢(shì)及研究動(dòng)態(tài),方便科技工作者掌握本領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀,面對(duì)海量的研究文獻(xiàn),使用傳統(tǒng)的綜述方法很難進(jìn)行全面分析,最好的手段就是用系統(tǒng)、精準(zhǔn)的文獻(xiàn)計(jì)量方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析[4]。文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)以其嚴(yán)謹(jǐn)?shù)臄?shù)量分析方法、令人信服的分析結(jié)果被公認(rèn)為定量測(cè)度基礎(chǔ)科學(xué)活動(dòng)、學(xué)科布局以及學(xué)科發(fā)展動(dòng)態(tài)的重要方法之一[5]。Web of Science(WOS)是美國(guó)Thomson Reuters公司基于web平臺(tái)開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品,是全球最大、覆蓋學(xué)科最多的綜合性學(xué)術(shù)信息資源,收錄了自然科學(xué)、工程技術(shù)、生物醫(yī)學(xué)等各個(gè)研究領(lǐng)域超過(guò)12000多種最具影響力的核心學(xué)術(shù)期刊。利用WOS豐富而強(qiáng)大的檢索功能進(jìn)行文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)統(tǒng)計(jì)分析,可以全面把握某一學(xué)科、某一課題最新的研究信息,跟蹤國(guó)際學(xué)術(shù)前沿、科研立項(xiàng),以及在課題研究過(guò)程中及時(shí)了解國(guó)際動(dòng)態(tài)[6]。目前已應(yīng)用于各學(xué)科分析,安嘉璐等用于合成生物學(xué)研究[7]；Fu等用于固態(tài)廢棄物方面研究[8]；Behrens等用于數(shù)學(xué)學(xué)科分析[9]；趙慶齡等用于土壤重金屬污染研究[10]；劉彬等用于園藝學(xué)基礎(chǔ)研究發(fā)展?fàn)顩r分析等[11],得到了廣大學(xué)者的認(rèn)可。

本文使用引文數(shù)據(jù)庫(kù)WOS檢索2006—2015年有關(guān)植物共生信號(hào)的文獻(xiàn),對(duì)植物共生信號(hào)在世界范圍內(nèi)研究居前的國(guó)家(地區(qū))、高被引論文、研究機(jī)構(gòu)等進(jìn)行文獻(xiàn)計(jì)量分析,以了解對(duì)植物共生信號(hào)的國(guó)際研究動(dòng)態(tài),從而對(duì)我國(guó)在該方面的研究提供參考依據(jù)。

1 數(shù)據(jù)來(lái)源和統(tǒng)計(jì)分析

本文以WOS中的Science Citation Index Expanded為數(shù)據(jù)來(lái)源,以“plant AND symbiont OR symbiosis AND signal”作為主題詞,時(shí)間限定在2006—2015年進(jìn)行檢索文獻(xiàn)。使用美國(guó)科學(xué)情報(bào)研究所(ISI)出版的期刊引證報(bào)告JCR(Journal Citation Reports)統(tǒng)計(jì)功能和excel,以文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的方法分別從植物共生信號(hào)研究的國(guó)家、研究方向、機(jī)構(gòu)、年代等方面對(duì)檢出的文獻(xiàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。其中,發(fā)文量：科研工作者、科研機(jī)構(gòu)或國(guó)家在一定時(shí)間內(nèi)的總發(fā)文量。被引頻次：科研工作者、科研機(jī)構(gòu)或國(guó)家在一定時(shí)間內(nèi)的總引用篇次。篇均被引頻次：科研工作者、科研機(jī)構(gòu)或國(guó)家在一定時(shí)間內(nèi)的被引頻次與發(fā)文量的比值。H指數(shù)(H-index)：科研工作者、科研機(jī)構(gòu)或國(guó)家在一定時(shí)間內(nèi),發(fā)表的論文至少有H篇的被引頻次大于或等于H次。

2 結(jié)果與分析

2.1 植物共生信號(hào)文獻(xiàn)產(chǎn)出前10位國(guó)家分析

在SCI-Expanded中,2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的文獻(xiàn)共檢索到5449篇。從文獻(xiàn)的國(guó)家/地區(qū)分布(表1)可以看出,美國(guó)、法國(guó)、德國(guó)為發(fā)文量前三甲國(guó)家,其中美國(guó)處于領(lǐng)先地位,其論文產(chǎn)出量約占發(fā)表總數(shù)的19.46%,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他國(guó)家和地區(qū)。中國(guó)的論文產(chǎn)出數(shù)量為187篇,約占發(fā)表總數(shù)的3.44%,排名第6,不及美國(guó)的1/6。2006—2010年間,中國(guó)排名在此10個(gè)國(guó)家/地區(qū)之后,與美國(guó)差距甚大,但是在2011—2015年間,中國(guó)躍居第4名,說(shuō)明近幾年中國(guó)在該領(lǐng)域的研究比較活躍,科研能力不斷提高。

表1 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄文獻(xiàn)量排名前10位的國(guó)家

2.2 文獻(xiàn)的研究方向分析

通過(guò)對(duì)文獻(xiàn)研究方向的分析,可以了解植物共生信號(hào)的主要研究?jī)?nèi)容。經(jīng)統(tǒng)計(jì),在2006—2015年間,該領(lǐng)域研究方向較多的是植物科學(xué)(2029篇)、微生物學(xué)(1564篇)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)(1554篇)、遺傳學(xué)(1480篇)、環(huán)境及生物科學(xué)(758篇)和細(xì)胞生物學(xué)(723篇)(表2)。

文獻(xiàn)被引用次數(shù)常被用來(lái)作為文獻(xiàn)學(xué)術(shù)水平和影響力的評(píng)價(jià)指標(biāo)[12],從篇均被引次數(shù)和h指數(shù)可以看出,2011—2015年間在此6個(gè)研究方向文獻(xiàn)數(shù)量增加的同時(shí),文獻(xiàn)的質(zhì)量明顯的降低。此外, 2006—2015年間,在該領(lǐng)域文獻(xiàn)記錄數(shù)排名前10位的國(guó)家,在植物科學(xué)、微生物學(xué)、生物化學(xué)及分子生物學(xué)3個(gè)研究方向的分布也有一定的差異(表3)。在植物科學(xué)方面,美國(guó)、法國(guó)和德國(guó)的文獻(xiàn)占文獻(xiàn)總數(shù)的5%以上,而中國(guó)僅有2.57%；在微生物學(xué)方面,美國(guó)所占的比例最高,其他國(guó)家均在1%—3%左右；在生物化學(xué)與分子生物學(xué)方面,美國(guó)與法國(guó)所占的比例較高。其中,中國(guó)在該3個(gè)研究方向中,植物科學(xué)方面的文獻(xiàn)數(shù)較高,說(shuō)明中國(guó)在應(yīng)用研究中所做的工作相對(duì)較多。

表2 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄文獻(xiàn)量排名前6的研究方向

2.3 植物共生信號(hào)文獻(xiàn)產(chǎn)出前10位機(jī)構(gòu)分析

通過(guò)對(duì)文獻(xiàn)所屬機(jī)構(gòu)進(jìn)行分析,可以發(fā)現(xiàn)有關(guān)植物共生信號(hào)研究的高產(chǎn)出大學(xué)及研究機(jī)構(gòu),從而有利于機(jī)構(gòu)間的合作。按機(jī)構(gòu)的發(fā)文量進(jìn)行排序(表4),從表中可以看出植物共生信號(hào)文獻(xiàn)產(chǎn)出前8位的機(jī)構(gòu)中有一半來(lái)自法國(guó),是植物共生信號(hào)研究機(jī)構(gòu)最多的國(guó)家,其次是美國(guó),西班牙在該領(lǐng)域中也占有一席之地。其中法國(guó)的國(guó)家科學(xué)研究院表現(xiàn)最為突出,發(fā)文量多達(dá)245篇,h指數(shù)高達(dá)48,無(wú)論是發(fā)文量還是h指數(shù)均居于首位,顯示出其在植物共生信號(hào)研究的絕對(duì)領(lǐng)先地位。而篇均被引次數(shù)最多的是法國(guó)的圖盧茲大學(xué),也充分顯示了該研究機(jī)構(gòu)在此領(lǐng)域的重要影響力。

表3 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄文獻(xiàn)量排名前10位的國(guó)家在部分研究方向的文獻(xiàn)比例分布/%

在中國(guó),發(fā)文量最高的科研機(jī)構(gòu)是中國(guó)科學(xué)院,發(fā)文量為49篇,超過(guò)第2的南京農(nóng)業(yè)大學(xué)34篇(表5)。篇均引用次數(shù)超過(guò)10的科研機(jī)構(gòu)只有兩家,分別是中國(guó)科學(xué)院(11.02)和浙江大學(xué)(12.15),與表4中其他國(guó)家科研機(jī)構(gòu)的篇均引用次數(shù)比起來(lái)還有一定的差距,說(shuō)明中國(guó)的植物共生信號(hào)文獻(xiàn)的整體質(zhì)量水平不高。結(jié)合篇均引用次數(shù)和h指數(shù)分析,中國(guó)科學(xué)院在植物共生信號(hào)研究上綜合實(shí)力較強(qiáng)。

表4 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄文獻(xiàn)量世界排名前8位的研究機(jī)構(gòu)

表5 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄文獻(xiàn)數(shù)中國(guó)排名前5位的研究機(jī)構(gòu)

2.4 植物共生信號(hào)高被引文獻(xiàn)分析

被引頻次反映了科研論文被其他國(guó)家、機(jī)構(gòu)、學(xué)者的認(rèn)可度,被引頻次越高,說(shuō)明論文的影響力越大,學(xué)術(shù)水平和論文質(zhì)量越高[13- 14]。高被引論文有利于追蹤某個(gè)領(lǐng)域最熱門的研究專業(yè)領(lǐng)域和最新的發(fā)展方向[4]。由表6可知,美國(guó)高被引論文所占比例以35.45%,居10個(gè)國(guó)家之首,德國(guó)以16.41%的比例居第2,這2個(gè)國(guó)家的高被引論文所占比例均總值超過(guò)世界總值的一半,法國(guó)和英國(guó)高被引論文所占比例也均超過(guò)世界平均水平。

2.5 植物共生信號(hào)文獻(xiàn)年度分布

文獻(xiàn)產(chǎn)出的數(shù)量在一定程度上可反映學(xué)科領(lǐng)域科學(xué)研究和發(fā)展的活躍度[15]。按年份統(tǒng)計(jì)(表7),植物共生信號(hào)文獻(xiàn)量每年呈明顯上升趨勢(shì),2006—2015年間,世界文獻(xiàn)總量從239篇增加到480篇,增幅為100%。其中中國(guó)文獻(xiàn)總量從6篇增加到43篇,增加了近6倍,遠(yuǎn)高于整體增幅,占世界植物共生信號(hào)文獻(xiàn)總量的比例也從3.21%上升到23%,也就是說(shuō),在2015年全球大約每4篇植物共生信號(hào)文獻(xiàn)中,就有一篇來(lái)自中國(guó)。

表6 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄高被引論文數(shù)世界排名前10位的國(guó)家

Table 6 The top 10 most productive countries of highly cited papers on signal in plant symbiosis published in SCI-indexed journals in 2006—2015

國(guó)家Country記錄數(shù)Recordaccount比例/%Percent篇均被引次數(shù)Averagecitedtimesh指數(shù)h-index美國(guó)USA6735．45167．0548德國(guó)Germany3116．41153．5226法國(guó)France3015．88178．3327英國(guó)England2814．82148．9624日本Japan1910．06121．1118荷蘭Netherlands189．53214．7217西班牙Spain115．82120．9110瑞士Switzerland105．30204．809澳大利亞Australia105．30161．9010蘇格蘭Scotland94．77117．788

表7 2006—2015年以植物共生信號(hào)為主題的SCI收錄文獻(xiàn)量年度排布

3 結(jié)論與討論

通過(guò)對(duì)Web of Science中2006—2015年植物共生信號(hào)文獻(xiàn)的主要國(guó)家、主要研究機(jī)構(gòu)、研究方向、高被引文獻(xiàn)、年發(fā)文量進(jìn)行分析,得出以下結(jié)論：

近年來(lái)植物共生信號(hào)相關(guān)研究文獻(xiàn)逐漸增多,引起世界各國(guó)的重視。

從國(guó)家、機(jī)構(gòu)的發(fā)文量和被引頻次看,國(guó)家科研機(jī)構(gòu)和高校是植物共生信號(hào)發(fā)文量的主角,且美國(guó)、法國(guó)、德國(guó)在該領(lǐng)域的研究處于世界領(lǐng)先地位。高被引論文數(shù)排行前三的是美國(guó)、德國(guó)與法國(guó),在植物共生信號(hào)研究領(lǐng)域有著非常強(qiáng)的國(guó)際影響力和話語(yǔ)權(quán)。美國(guó)的發(fā)文數(shù)量和發(fā)文質(zhì)量均居榜首,研究機(jī)構(gòu)較多。而中國(guó)是植物共生信號(hào)研究起步較晚的國(guó)家,與美國(guó)差距甚大。近幾年中國(guó)在該領(lǐng)域的研究動(dòng)態(tài)較活躍,發(fā)文數(shù)量躍居世界第四,但是論文的篇均被引頻次及高被引文獻(xiàn)數(shù)均遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后,缺乏高質(zhì)量、高影響力的論文。國(guó)內(nèi),從植物共生信號(hào)文獻(xiàn)的質(zhì)量來(lái)看,無(wú)論是篇均引用頻次還是h指數(shù),質(zhì)量較高的是中國(guó)科學(xué)院,但是國(guó)際綜合影響力和競(jìng)爭(zhēng)力離世界先進(jìn)水平還有一定的差距,亟待通過(guò)加強(qiáng)經(jīng)費(fèi)投入、人才引進(jìn)、加強(qiáng)國(guó)際合作,推動(dòng)我國(guó)植物共生信號(hào)的研究,縮短與國(guó)際水平的差距,提高我國(guó)在該領(lǐng)域的影響力。

從研究方向上來(lái)看,植物共生信號(hào)研究目前的熱點(diǎn)是植物科學(xué)。由于學(xué)科交叉性,植物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)等生物學(xué)各個(gè)研究領(lǐng)域甚至其他學(xué)科的學(xué)者都可以進(jìn)行植物共生信號(hào)的相關(guān)研究,導(dǎo)致了該領(lǐng)域的研究力量的相對(duì)分散。同時(shí),學(xué)科的交叉也意味著該領(lǐng)域的研究成果可以在多種學(xué)科的專業(yè)期刊上發(fā)表。

Web of Science數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了全球12000余種世界權(quán)威的、高影響力的學(xué)術(shù)期刊,最早可以回溯至1900年,是獲取全球?qū)W術(shù)信息重要的數(shù)據(jù)庫(kù)[16]。該數(shù)據(jù)庫(kù)以其具有的強(qiáng)大的統(tǒng)計(jì)與分析功能,在快速鎖定高影響力論文、發(fā)現(xiàn)國(guó)內(nèi)外同行權(quán)威所關(guān)注的研究方向、揭示課題的研究趨勢(shì)、選擇合適的期刊投稿等方面顯示出很強(qiáng)的優(yōu)勢(shì),能夠幫助科研人員更好地把握研究的突破與創(chuàng)先點(diǎn),及時(shí)跟蹤科研動(dòng)態(tài),已經(jīng)越來(lái)越廣泛的被科研人員所采用[4]。

[1] Balestrini R, Bonfante P. Cell wall remodeling in mycorrhizal symbiosis: a way towards biotrophism. Frontiers in Plant Science, 2014, 201(4): 237.

[2] 趙青華, 孫立濤, 王玉, 丁兆堂, 李敏. 叢枝菌根真菌和施氮量對(duì)茶樹(shù)生長(zhǎng)、礦質(zhì)元素吸收與茶葉品質(zhì)的影響. 植物生理學(xué)報(bào), 2014, 50(2): 164- 170.

[3] Fellbaum C R, Mensah J A, Cloos A J, Strahan G E, Pfeffer P E, Kiers E T, Bücking H. Fungal nutrient allocation in common mycorrhizal networks is regulated by the carbon source strength of individual host plants. New Phytologist, 2014, 203(2): 646- 656.

[4] 張娟, 王寧, 張以民, 李云霞. 基于Web of Science的國(guó)際柑橘黃龍病文獻(xiàn)計(jì)量分析. 果樹(shù)學(xué)報(bào), 2014, 31(6): 1139- 1146.

[5] 邱均平. 文獻(xiàn)計(jì)量學(xué). 武漢: 武漢大學(xué)出版社, 1988.

[6] 齊青. Web of Science的檢索和應(yīng)用. 圖書(shū)館工作與研究, 2013, 1(2): 110- 112.

[7] 安嘉璐, 田玲, 周艷玲, 陳丹霞, 鹿子康. 基于Web of Science的合成生物學(xué)文獻(xiàn)計(jì)量分析. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展, 2015, 15(1): 139- 144, 170- 170.

[8] Fu H Z, Ho Y S, Sui Y M, Li Z S. A bibliometric analysis of solid waste research during the period 1993- 2008. Waste Management, 2010, 30(12): 2410- 2417.

[9] Behrens H, Luksch P. Mathematics 1868—2008: a bibliometric analysis. Scientometrics, 2011, 86(1): 179- 194.

[10] 趙慶齡, 路文如. 土壤重金屬污染研究回顧與展望——基于web of science數(shù)據(jù)庫(kù)的文獻(xiàn)計(jì)量分析. 環(huán)境科學(xué)與技術(shù), 2010, 33(6): 105- 111.

[11] 劉彬, 鄧秀新. 基于文獻(xiàn)計(jì)量的園藝學(xué)基礎(chǔ)研究發(fā)展?fàn)顩r分析. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué), 2015, 48(17): 3504- 3514.

[12] 楊俊麗. 基于SCI的河南農(nóng)業(yè)大學(xué)科技論文統(tǒng)計(jì)分析. 科技管理研究, 2012, 32(11): 132- 135.

[13] 張靜. 引文、引文分析與學(xué)術(shù)論文評(píng)價(jià). 社會(huì)科學(xué)管理與評(píng)論, 2008, (1): 33- 38.

[14] 楊蘋(píng), 顧東蕾, 馬世平. 基于Web of Science的罕用藥文獻(xiàn)計(jì)量分析. 上海醫(yī)藥, 2015, 36(11): 50- 53

[15] 楊金鳳, 張纓. 基于Web of Science的PM2.5文獻(xiàn)計(jì)量分析. 衛(wèi)生職業(yè)教育, 2015, 33(18): 154- 156.

[16] 袁飛, 李瓏. 小議Web of Science檢索技巧——以SCIE為例. 現(xiàn)代情報(bào), 2013, 33(5): 62- 65.

國(guó)家自然科學(xué)基金(31101512)

2016- 04- 23; 網(wǎng)絡(luò)出版日期:2017- 03- 02

10.5846/stxb201604230770

*通訊作者Corresponding author.E-mail: w_mingyuan@163.com.

楊紅玉,王明元,游曉朝.植物共生信號(hào)的文獻(xiàn)計(jì)量分析.生態(tài)學(xué)報(bào),2017,37(14):4913- 4918.