SAS軟件在醫(yī)療機(jī)構(gòu)傳染病信息報(bào)告質(zhì)量調(diào)查中的應(yīng)用

無錫市錫山區(qū)疾病預(yù)防控制中心(214000)

李 杰△ 顧 月 邵佳奇 呂 莉 孫鳳妹 黃 琦

·計(jì)算機(jī)應(yīng)用·

SAS軟件在醫(yī)療機(jī)構(gòu)傳染病信息報(bào)告質(zhì)量調(diào)查中的應(yīng)用

無錫市錫山區(qū)疾病預(yù)防控制中心(214000)

李 杰△顧 月 邵佳奇 呂 莉 孫鳳妹 黃 琦

隨著國家疾病預(yù)防控制信息化建設(shè)的發(fā)展，自2004年我國傳染病網(wǎng)絡(luò)直報(bào)系統(tǒng)運(yùn)行以來，需定期對(duì)各類醫(yī)療機(jī)構(gòu)的傳染病監(jiān)測(cè)報(bào)告質(zhì)量進(jìn)行檢查。國內(nèi)已有不少學(xué)者發(fā)表過關(guān)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)傳染病報(bào)告質(zhì)量現(xiàn)狀調(diào)查的相關(guān)文獻(xiàn)[1-2]，但幾乎所有文獻(xiàn)的調(diào)查方法均為分層抽樣結(jié)合人工審查的方式，勢(shì)必帶來抽樣誤差、涵蓋范圍窄、工作量大等問題。而醫(yī)院信息系統(tǒng)(hospital information system，HIS)的開發(fā)雖然實(shí)現(xiàn)了對(duì)病人診療信息數(shù)據(jù)的電子化收集、存儲(chǔ)和處理[3]，但迄今沒有統(tǒng)計(jì)軟件專門模塊來實(shí)現(xiàn)網(wǎng)報(bào)質(zhì)量評(píng)價(jià)指標(biāo)的自動(dòng)計(jì)算功能。本文主要初步探討利用SAS軟件編程法對(duì)醫(yī)療機(jī)構(gòu)HIS系統(tǒng)門診日志自動(dòng)核查，發(fā)現(xiàn)遲報(bào)、漏報(bào)、信息不一致等情況并計(jì)算相應(yīng)的評(píng)價(jià)指標(biāo)，同時(shí)自動(dòng)生成詳細(xì)Excel報(bào)表[4-5]。

資料與方法

1.資料來源

病人診療信息來源于各醫(yī)療機(jī)構(gòu)HIS系統(tǒng)(版本、格式不一定相同)提供的門診日志信息，包含姓名、性別、年齡、診斷名稱、發(fā)病日期、診斷日期等基本資料。疫情資料來源于中國疾病監(jiān)測(cè)信息報(bào)告管理系統(tǒng)。

2.評(píng)價(jià)指標(biāo)

傳染病信息報(bào)告質(zhì)量主要評(píng)價(jià)指標(biāo)包括[6]，①報(bào)告率/漏報(bào)率：某時(shí)間段內(nèi)網(wǎng)絡(luò)報(bào)告(漏報(bào))傳染病數(shù)/同期確診傳染病總數(shù)×100%；②及時(shí)率：某時(shí)間段內(nèi)及時(shí)報(bào)告的傳染病數(shù)/同期網(wǎng)絡(luò)報(bào)告?zhèn)魅静】倲?shù)×100%；③完整率：某時(shí)間段內(nèi)填寫完整紙質(zhì)報(bào)告卡數(shù)/同期網(wǎng)報(bào)卡片總數(shù)；④一致率：某時(shí)間段內(nèi)姓名、性別、年齡等信息一致的網(wǎng)報(bào)卡片數(shù)/同期網(wǎng)報(bào)卡片總數(shù)；⑤邏輯準(zhǔn)確率：某時(shí)間段內(nèi)邏輯準(zhǔn)確卡片數(shù)/同期網(wǎng)報(bào)卡片總數(shù)；⑥綜合指數(shù)：(報(bào)告率+及時(shí)率+完整率+準(zhǔn)確率+一致率)/5。

3.SAS編程與說明

主要通過SAS 9.3版軟件的BASE模塊、SQL模塊及宏程序等功能來實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的整理、拼接、篩選和報(bào)表輸出等[7-9]。

(1)數(shù)據(jù)的整理

考慮到不同醫(yī)療機(jī)構(gòu)的HIS系統(tǒng)導(dǎo)出的門診日志信息大相徑庭，如變量名稱、個(gè)數(shù)、出現(xiàn)的順序、輸入輸出格式等；同時(shí)中國疾病監(jiān)測(cè)信息報(bào)告管理系統(tǒng)導(dǎo)出的病人資料(以下稱為網(wǎng)報(bào)信息)的數(shù)據(jù)格式不能直接用于SAS軟件的處理，因此，在進(jìn)行統(tǒng)計(jì)處理前需利用%label宏程序?qū)υ既罩竞途W(wǎng)報(bào)信息進(jìn)行數(shù)據(jù)的整理，包含數(shù)據(jù)導(dǎo)入、變量提取、規(guī)格化命名及賦予標(biāo)簽、數(shù)據(jù)格式的轉(zhuǎn)化等[10]。

%macro label(path=,mz=,zl=,yymc=,name=);/*path是數(shù)據(jù)集存放路徑，mz是門診日志或網(wǎng)報(bào)信息存放的sheet，zl是變量標(biāo)簽存放的sheet，yymc是醫(yī)療機(jī)構(gòu)名稱，name是輸出sas數(shù)據(jù)集名稱*/

proc import datafile=“&path&yymc..xls” out=__mzrz replace;sheet=“&mz”;run;

proc import datafile=“&path變量標(biāo)簽表.xls” out=__var_label replace;sheet=“&zl”;run;

/*變量標(biāo)簽表第一列為原始變量名稱，第二列為標(biāo)準(zhǔn)化變量名稱，第三列為變量標(biāo)簽*/

proc sql;select count(*)into:num from__var_label;quit;

data__var_label(drop=blm var label);attrib_blm length=$40_var length=$40_label length=$40;set__var_label;_blm=blm;_var=var;_label=label;run;

proc sql;select_blm,_var,_label into:blm1-:blm%trim(%left(&num)),:var1-:var%trim(%left(&num)),:label1-:label%trim(%left(&num))from__var_label;quit;

data_mzrz;attrib yljg_name length=$40;set__mzrz;

%do i=1%to #

&&&var&i=&&&blm&i;

label &&&var&i=“&&&label&i” yljg_name=“醫(yī)療機(jī)構(gòu)名稱”;

yljg_name=“&yymc”;

keep &&&var&i yljg_name;

%end;

run;

%if “&mz”=“門診”%then%do;

data &name.(rename=(jzrq_mz1=jzrq_mz fbrq_mz1=fbrq_mz));

set _mzrz;jzrq_mz1=DHMS(input(substr(jzrq_mz,1,10),yymmdd10.),0,0,input(substr(jzrq_mz,12,20),hhmmss.));

fbrq_mz1=MDY(substr(fbrq_mz,6,2),substr(fbrq_mz,9,2),substr(fbrq_mz,1,4));

drop jzrq_mz fbrq_mz;

format jzrq_mz1 datetime.fbrq_mz1 DATE9.;

label jzrq_mz1=“&mz.診斷日期” fbrq_mz1=“&mz.發(fā)病日期”;

run;

%end;

%else%if “&mz”=“網(wǎng)報(bào)”%then%do;

data &name.(rename=(jzrq_wb1=jzrq_wb));

set _mzrz;jzrq_wb1=DHMS(input(substr(jzrq_wb,1,10),yymmdd10.),0,0,input(substr(jzrq_wb,12,20),hhmmss.));

drop jzrq_wb;

format jzrq_wb1 datetime.fbrq_wb DATE9.;

label jzrq_wb1=“&mz.日期”;

run;

%end;

proc datasets;delete _:;run;quit;

%mend;

(2)數(shù)據(jù)的拼接、篩選和報(bào)表輸出

%HIS宏程序能夠輸出醫(yī)療機(jī)構(gòu)某時(shí)間段內(nèi)單個(gè)傳染病的遲報(bào)、漏報(bào)情況，同時(shí)輸出傳染病報(bào)卡與門診日志項(xiàng)目的一致性情況，包含職業(yè)、年齡、現(xiàn)住址、性別、發(fā)病日期等。最后以Excel的形式展示詳細(xì)信息[11]，生成的Excel包含4個(gè)sheet，分別為遲報(bào)信息、漏報(bào)信息、準(zhǔn)確報(bào)告信息、項(xiàng)目一致性信息。前3個(gè)sheet表格包含患者姓名、性別、年齡、醫(yī)生姓名、診斷名稱、診斷日期和網(wǎng)報(bào)日期等項(xiàng)目，能夠進(jìn)一步追溯原因，責(zé)任到人。自動(dòng)生成的Word簡(jiǎn)略報(bào)告，包含報(bào)告率、及時(shí)率、一致率等評(píng)價(jià)指標(biāo)。

%macro HIS(path=,disease=,type=,yymc=,date=,lb=,cb=,zq=,tot=);/*path是Excel匯總表存放路徑，disease是核查傳染病名稱，type是傳染病類別(甲類2小時(shí)內(nèi)，乙丙類24小時(shí)內(nèi))，yymc是醫(yī)療機(jī)構(gòu)名稱，date是查詢時(shí)間段，lb是漏報(bào)，cb遲報(bào)，zq準(zhǔn)確報(bào)告*/

proc sql;

create table &tot as

select mzrz.*,wbxx.*

from mzrz

left join wbxx

on mzrz.name_mz=wbxx.name_wb

where mzrz.zd_mz contains “&disease”

order by mzrz.name_mz,mzrz.jzrq_mz;

quit;/*首先按疾病名稱篩選，再按姓名和就診日期排序，最后以姓名進(jìn)行數(shù)據(jù)集的橫向拼接*/

data _null_;

if “%trim(%left(&type))”=“甲類” then call symput(“time”,7200);

else if “%trim(%left(&type))”^=“甲類” then call symput(“time”,86400);

run;/*甲乙丙類報(bào)告時(shí)限不同，分別對(duì)宏變量time賦值*/

data &lb &cb &zq;

set &tot;

second=intck(′second′,jzrq_mz,jzrq_wb);

by name_mz jzrq_mz;

if first.name_mz and first.jzrq_mz and name_wb=“ ” then do;/*first.var和last.var是SAS的兩個(gè)臨時(shí)變量，表示組內(nèi)的第一個(gè)和最后一個(gè)變量。一般要跟在proc sort后，根據(jù)by后的變量使用*/

ps=“&disease.-漏報(bào) ”;

keep yljg_name name_mz sex_mz age_mz jzrq_mz zd_mz ys_mz ks_mz jzrq_wb PS;

label PS=“備注”;

output &lb;

end;/*篩選出漏報(bào)情況*/

else if first.name_mz and first.jzrq_mz and second>&time then do;

ps=“&disease.-遲報(bào)”;

keep yljg_name name_mz sex_mz age_mz jzrq_mz zd_mz ys_mz ks_mz jzrq_wb PS;

label PS=“備注”;

output &cb;

end;/*篩選出遲報(bào)情況*/

else if first.name_mz and first.jzrq_mz then do;

ps=“&disease.-報(bào)告及時(shí)準(zhǔn)確”;

keep yljg_name name_mz sex_mz age_mz jzrq_mz zd_mz ys_mz ks_mz jzrq_wb PS;

label PS=“備注”;

output &zq;

end;

run;

proc sql;

select count(*)into:num_lb from &lb;

select count(*)into:num_cb from &cb;

select count(*)into:num_yb from &zq;

quit;/*遲報(bào)人數(shù)、漏報(bào)人數(shù)賦予宏變量*/

data _&tot;

attrib job length=$40 age length=$40 xzz length=$40 sex length=$40 fbrq length=$40;

set &tot;

by name_mz jzrq_mz;

if first.name_mz and first.jzrq_mz and name_wb^=“ ”;

if job_mz^=job_wb then job=“不一致”;else if job_mz=job_wb then job=“一致”;

if age_mz^=age_wb then age=“不一致”;else if age_mz=age_wb then age=“一致”;

if xzz_mz^=xzz_wb then xzz=“不一致”;else if xzz_mz=xzz_wb then xzz=“一致”;

if sex_mz^=sex_wb then sex=“不一致”;else if sex_mz=sex_wb then sex=“一致”;

if fbrq_mz^=fbrq_wb then fbrq=“不一致”;else if fbrq_mz=fbrq_wb then fbrq=“一致”;

label job=“職業(yè)一致性” age=“年齡一致性” xzz=“現(xiàn)住址一致性” sex=“性別一致性” fbrq=“發(fā)病日期一致性”;

if job^=“一致” or age^=“一致” or xzz^=“一致” or sex^=“一致” or fbrq^=“一致”;

keep name_mz zd_wb job sex age xzz fbrq;

run;

proc sql;

select count(*)into:wtnum from _&tot;

select count(*)into:jobnum from _&tot where job^=“一致”;

select count(*)into:agenum from _&tot where age^=“一致”;

select count(*)into:xzznum from _&tot where xzz^=“一致”;

select count(*)into:sexnum from _&tot where sex^=“一致”;

select count(*)into:fbrqnum from _&tot where fbrq^=“一致”;

quit;

libname myexcel “&path&yymc.&date.期間&disease.報(bào)告情況.xls”;

data myexcel.“漏報(bào)%eval(&num_lb)例”n(dblabel=YES);set &lb;run;

data myexcel.“遲報(bào)%eval(&num_cb)例”n(dblabel=YES);set &cb;run;

data myexcel.“準(zhǔn)確報(bào)告%eval(&num_yb)例”n(dblabel=YES);set &zq;run;

data myexcel.“項(xiàng)目一致性”n(dblabel=YES);set _&tot;run;

libname myexcel clear;

/*導(dǎo)出Excel含4個(gè)sheet，分別為遲報(bào)、漏報(bào)、準(zhǔn)確報(bào)告及項(xiàng)目一致性情況*/

options nodate nonumber;

ods listing close;

ods rtf file=“&path&yymc.&date.期間&disease.報(bào)告情況.doc” bodytitle style=FONTS;

title “&yymc.&disease.報(bào)告情況”;

data _null_;

File print;

put “ &yymc.在&date.期間，共診斷%eval(&num_lb+&num_cb+&num_yb)例&disease.,其中漏報(bào)%eval(&num_lb)例,遲報(bào)%eval(&num_cb)例,準(zhǔn)確及時(shí)報(bào)告%eval(&num_yb)例。報(bào)告率和及時(shí)率分別為%sysfunc(round(%sysevalf((&num_cb+&num_yb)/(&num_lb+&num_cb+&num_yb)*100),0.01))%NRSTR(%%和)%sysfunc(round(%sysevalf(&num_yb/(&num_cb+&num_yb)*100),0.01))%NRSTR(%%。)&yymc.在&date.期間，共網(wǎng)報(bào)%eval(&num_cb+&num_yb)例&disease.，網(wǎng)報(bào)信息一致%eval(&num_cb+&num_yb-&wtnum)人，一致率為%sysfunc(round(%sysevalf((&num_cb+&num_yb-&wtnum)/(&num_cb+&num_yb)*100),0.01))%NRSTR(%%。)其中，%eval(&jobnum)人職業(yè)與網(wǎng)報(bào)不一致，%eval(&agenum)人年齡與網(wǎng)報(bào)不一致，%eval(&xzznum)人現(xiàn)住址與網(wǎng)報(bào)不一致，%eval(&sexnum)人性別與網(wǎng)報(bào)不一致，%eval(&fbrqnum)人發(fā)病日期與網(wǎng)報(bào)不一致。詳細(xì)情況見&yymc.&date.期間&disease.報(bào)告情況.xls”;

run;/*輸出單個(gè)病種日志信息*/

ods rtf close;

ods listing;

%mend;

(3)自動(dòng)核查多個(gè)傳染病情況

%HISall宏程序則是針對(duì)醫(yī)療機(jī)構(gòu)某時(shí)間段內(nèi)的門診日志，指定多個(gè)傳染病病種進(jìn)行遲報(bào)、漏報(bào)、一致性的分析，如手足口病、水痘、流行性腮腺炎，每個(gè)疾病輸出一個(gè)Excel，包含遲報(bào)、漏報(bào)、準(zhǔn)確報(bào)告及一致性情況四個(gè)sheet，最終將各病種Excel分類匯總。

%macro HISall(path1=,path2=,yymc=,date=);/*path1是存放待核查傳染病病種的路徑，path2是輸出Excel報(bào)表的路徑*/

proc import datafile=“&path1核查傳染病名稱.xls” out=_diseasename replace;sheet=“disease”;run;/*核查傳染病名稱Excel中包含疾病名稱和類型，如手足口病，丙類*/

proc sql;select count(*)into:num_disease from _diseasename;

proc sql;

select disease,type into:dis1-:dis%trim(%left(&num_disease)),:typ1-:typ%trim(%left(&num_disease))from _diseasename;

quit;

data _lb _cb _zq _yz;set _null_;run;

%do i=1%to &num_disease;

%HIS(path=&path2,disease=&&dis&i,type=&&typ&i,yymc=&yymc,date=&date,lb=__lb&i,cb=__cb&i,zq=__zq&i,tot=_tot&i);/*調(diào)用單個(gè)傳染病核查%HIS宏程序*/

……

/*部分報(bào)表輸出程序與3(2)部分程序雷同，不再贅述*/

%mend;

實(shí)例與分析

通過HIS系統(tǒng)導(dǎo)出2015年4家醫(yī)療機(jī)構(gòu)的門診日志數(shù)據(jù)，中國疾病監(jiān)測(cè)信息報(bào)告管理系統(tǒng)導(dǎo)出同期網(wǎng)報(bào)信息，數(shù)據(jù)資料僅用于驗(yàn)證程序，不代表真實(shí)情況。提交運(yùn)行%label、%HISall宏程序(醫(yī)療機(jī)構(gòu)A為例，病種選擇手足口病、水痘和流行性腮腺炎)：

%label(path=C:UsershpDesktop醫(yī)療機(jī)構(gòu)A,mz=門診,zl=門診變量標(biāo)簽表,yymc=醫(yī)療機(jī)構(gòu)A,name=mzrz);

%label(path=C:UsershpDesktop醫(yī)療機(jī)構(gòu)A,mz=網(wǎng)報(bào),zl=網(wǎng)報(bào)變量標(biāo)簽表,yymc=醫(yī)療機(jī)構(gòu)A,name=wbxx);

%HISall(path1=C:UsershpDesktop醫(yī)療機(jī)構(gòu)A,path2=C:UsershpDesktop醫(yī)療機(jī)構(gòu)A報(bào)告情況,yymc=醫(yī)療機(jī)構(gòu)A,date=2015.1-2015.12);

部分結(jié)果見表1～3，個(gè)人隱私信息采用*表示，項(xiàng)目一致率較低，未放入表1。選擇各醫(yī)療機(jī)構(gòu)中所有遲報(bào)、漏報(bào)情況進(jìn)行人工核查，無明顯錯(cuò)誤。抽取20%的不一致項(xiàng)目、準(zhǔn)確及時(shí)報(bào)告卡片進(jìn)行人工核查，也無錯(cuò)誤，可以認(rèn)為該宏程序能夠正確讀取、整理、核查及輸出所需結(jié)果。

表1 4家醫(yī)療機(jī)構(gòu)2015年部分法定傳染病的網(wǎng)報(bào)質(zhì)量情況

*：未接診流行性腮腺炎病人。

表2 醫(yī)療機(jī)構(gòu)2015年部分法定傳染病的遲報(bào)、漏報(bào)詳細(xì)情況

表3 醫(yī)療機(jī)構(gòu)2015年部分法定傳染病的網(wǎng)報(bào)一致性情況

討 論

本研究中宏程序的優(yōu)點(diǎn)在于能夠自動(dòng)讀取Excel文件中的病人診療信息、網(wǎng)報(bào)信息、待核查傳染病病種，進(jìn)而規(guī)范化數(shù)據(jù)格式，實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)的批量核查門診日志中指定傳染病的遲報(bào)、漏報(bào)、信息不一致情況，并計(jì)算評(píng)價(jià)指標(biāo)，同時(shí)自動(dòng)生成詳細(xì)Excel報(bào)表。

該宏程序也存在一定的局限性：①醫(yī)療機(jī)構(gòu)HIS系統(tǒng)和中國疾病監(jiān)測(cè)信息報(bào)告管理系統(tǒng)導(dǎo)出的Excel文件變量名稱均為中文，而SAS軟件不能識(shí)別中文的變量名，會(huì)自動(dòng)命名為_COL0、_COL1等，需在變量標(biāo)簽表中列出對(duì)應(yīng)關(guān)系，如_COL2-name_mz-患者姓名，意思為將_COL2變量名稱改成name_mz，標(biāo)簽為患者姓名。不同醫(yī)療機(jī)構(gòu)HIS系統(tǒng)導(dǎo)出的Excel中變量名稱順序不一定相同，需要根據(jù)實(shí)際情況調(diào)整變量標(biāo)簽表中的blm列。②傳染病監(jiān)測(cè)報(bào)告質(zhì)量有6個(gè)主要評(píng)價(jià)指標(biāo)[6]，本文僅實(shí)現(xiàn)了漏報(bào)率、遲報(bào)率和一致率的軟件自動(dòng)獲得，而完整率涉及紙質(zhì)報(bào)告卡，未能實(shí)現(xiàn)軟件自動(dòng)生成，邏輯準(zhǔn)確率的邏輯關(guān)系較為復(fù)雜，待今后進(jìn)一步完善。③法定傳染病共有39種，少數(shù)病種的網(wǎng)報(bào)特性可能導(dǎo)致不適用此宏程序(如麻疹)，因?yàn)樵擃惣膊〈龑?shí)驗(yàn)室確診后診斷名稱及確診日期可能會(huì)有改變，如疑似麻疹實(shí)驗(yàn)室確診后修改為風(fēng)疹或其他疾病。④SQL查詢功能需要每一例觀測(cè)有唯一的識(shí)別碼，如果網(wǎng)報(bào)信息中出現(xiàn)兩名不同病人的姓名且診斷名稱相同的情況，可能會(huì)導(dǎo)致%HIS宏程序運(yùn)行失敗。⑤該宏程序針對(duì)同一病人多次就診僅需初次報(bào)告的情況(如梅毒)，已做特殊處理，不會(huì)對(duì)結(jié)果造成影響。但不適用于同一病人二次發(fā)病均需報(bào)告的情況，如同一病人一年內(nèi)診斷并報(bào)告兩次手足口病。

通過SAS軟件編寫宏程序可以在一定程度上為傳染病信息報(bào)告質(zhì)量的現(xiàn)狀調(diào)查提供便利，簡(jiǎn)化工作流程。定期運(yùn)行上述SAS宏程序?qū)︶t(yī)療機(jī)構(gòu)門診日志資料進(jìn)行自動(dòng)核查，實(shí)時(shí)了解各級(jí)醫(yī)療機(jī)構(gòu)法定傳染病網(wǎng)絡(luò)直報(bào)工作完成質(zhì)量，針對(duì)具體情況提出整改意見，及時(shí)掌握傳染病的發(fā)病動(dòng)態(tài)和流行趨勢(shì)，為采取相應(yīng)的預(yù)防和控制措施提供有效保障。

[1]尚曉鵬，吳晨，吳昊澄，等.浙江省醫(yī)療機(jī)構(gòu)傳染病報(bào)告質(zhì)量調(diào)查.浙江預(yù)防醫(yī)學(xué),2015,27(6):635-637.

[2]郭青，蘇雪梅，王曉風(fēng)，等.2013年全國醫(yī)療機(jī)構(gòu)法定傳染病報(bào)告率調(diào)查分析.中華疾病控制雜志,2015,19(7):683-687.

[3]王曉宇，張志平.基于HIS系統(tǒng)的傳染病報(bào)告管理的實(shí)踐與體會(huì).中國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè),2016,13(1):105-107.

[4]高惠璇主編.SAS系統(tǒng)BaseSAS軟件使用手冊(cè).第1版.北京:中國統(tǒng)計(jì)出版社,1997,160-173.

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(責(zé)任編輯：劉 壯)

△通信作者：李杰，E-mail:lijie880531@sina.com