季錸 譚振江 張純紅
摘 要:分子印跡聚合物(MIPs)是利用分子印跡技術(shù)(MIT)制備的能夠“記憶”目標(biāo)分子的形狀、大小和特定的官能團(tuán)的一種新型智能材料。本文以磺胺嘧啶(SDZ)為模板分子,采用量子化學(xué)的模擬方法對(duì)SDZ印跡預(yù)組裝體系進(jìn)行模擬計(jì)算。通過(guò)計(jì)算模板分子與功能單體形成復(fù)合物之間的相互作用力,篩選出合適的功能單體以及確定識(shí)別位點(diǎn),對(duì)MIPs的制備提供了一定的理論指導(dǎo),有助于理解印跡體系。
關(guān)鍵詞:分子印跡聚合物;量子化學(xué);磺胺嘧啶
近10年來(lái),關(guān)于分子印跡聚合物(MIPs)的研究在應(yīng)用領(lǐng)域和先進(jìn)制備方法發(fā)面均取得了豐碩的成果,然而對(duì)于分子印跡聚合物的合成相關(guān)的識(shí)別機(jī)理研究甚少。
本文以磺胺嘧啶(SDZ)為模板分子,采用量子化學(xué)模擬方法對(duì)SDZ印跡預(yù)組裝體系進(jìn)行模擬。主要通過(guò)模擬模板分子和功能單體形成的復(fù)合物的作用方式來(lái)確定模板與單體之間的相互作用力進(jìn)而篩選單體以及確定識(shí)別位點(diǎn)。
1 模擬過(guò)程
本文選取了磺胺類MIPs制備中最常用的三種功能單體(甲基丙烯酸(Methacrylicacid MAA),丙烯酰胺(Acrylamide AM)和4-乙烯基吡啶(4-vinyl pyridine 4VP))對(duì)可能形成的復(fù)合物形式進(jìn)行量子化學(xué)模擬,考察可能形成的識(shí)別位點(diǎn)的情況。本研究針對(duì)SDZ沿用了雙功能單體。研究的內(nèi)容為模版-單體復(fù)合物的結(jié)合能分析。
為了增加計(jì)算的可靠性和準(zhǔn)確性,采用了三種量子化學(xué)方法分別進(jìn)行計(jì)算,包括從頭的Hatree-Fock(HF)法、DFT中應(yīng)用最廣泛的B3LYP法及DFT中重點(diǎn)考慮弱相互作用(如范德華力)的WB97XD法。模擬所使用的服務(wù)器裝配有頻率2.10GHz的IntelXeon E5-2620處理器,16GB內(nèi)存,64位Windows操作系統(tǒng)和高斯09軟件。作業(yè)類型為“Opt+Fre”,方法分別為基態(tài)下的DFT中受限制的WB97XD?;M均采用6-331G,所有模擬均在真空條件下進(jìn)行。
另外,由于量子化學(xué)計(jì)算中相互作用的分子之間會(huì)因有限基礎(chǔ)的重疊而發(fā)生誤差,所以在計(jì)算的同時(shí)采用平衡校正法來(lái)消除這些誤差。具體步驟模擬如下:
1)分別采用三種量子化學(xué)方法對(duì)SDZ分子和MAA、AM、4VP三種功能單體進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化,使其達(dá)到最低能量構(gòu)象,同時(shí)計(jì)算分子的NBO(自然鍵軌道理論)電荷。當(dāng)計(jì)算達(dá)到收斂條件后計(jì)算完成,可以得到分子的能量、頻率等信息。判斷計(jì)算達(dá)到收斂條件為:最大力小于0.00045,最大位移小于0.0018,最大均方根小于0.0003,最大位移均方根小于0.0012。
2)將達(dá)到最低能量構(gòu)象的SDZ和功能單體分子根據(jù)圖2.1討論得到的四種結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行匹配模板-單體復(fù)合物。SDZ與4VP、MAA和AM組成的復(fù)合物分別有2種、4種和4種。然后將這些復(fù)合物分別用三種量子化學(xué)方法進(jìn)行模擬計(jì)算,計(jì)算的同時(shí)采用平衡校正方法以消除基組重疊誤差(basis set superposition error,BSSE)。達(dá)到收斂條件計(jì)算完成。
3)經(jīng)BSSE矯正后的模板-單體相互作用的結(jié)合能(ΔE)可用下式計(jì)算得到。
ΔE=Ecomplex-ESDZ-Emonomer+EBSSE
其中,Ecomplex指未經(jīng)過(guò)BSSE矯正的模板-單體復(fù)合物的能量,ESDZ指模板分子SDZ的能量,Emonomer指功能單體MAA、AM或4VP的能量,EBSSE指BSSE矯正能量。
2 結(jié)果討論與分析
結(jié)果得到三種不同量子化學(xué)計(jì)算方法得到的SDZ-功能單體復(fù)合物結(jié)合能。三種方法計(jì)算得到的結(jié)合能存在著一定的差別,另外EBSSE值相比于結(jié)合能并不小,這也說(shuō)明了平衡校正法消除基組重疊誤差的重要性。
對(duì)于SDZ一號(hào)結(jié)合位點(diǎn),三種計(jì)算方法得到的SDZ-AM結(jié)合能均要大于或非常接近等于SDZ-4VP結(jié)合能,這不利于疏水性功能單體的引入;而SDZ-MAA結(jié)合能均要小于SDZ-4VP結(jié)合能,有利于4VP與SDZ在一號(hào)位點(diǎn)組裝。
對(duì)于SDZ二號(hào)位點(diǎn),由于AM與MAA均能與SDZ形成兩個(gè)經(jīng)典氫鍵作用,所以4VP很難與之競(jìng)爭(zhēng);而在此位點(diǎn)處SDZ-MAA復(fù)合物之間的相互作用能明顯高于SDZ-AM復(fù)合物相互作用能,有利于印跡體系的穩(wěn)定。
對(duì)于SDZ三號(hào)位點(diǎn),三種計(jì)算方法均表明SDZ-MAA的結(jié)合能均高于SDZ-AM結(jié)合能;
而對(duì)于SDZ四號(hào)位點(diǎn),SDZ-MAA的結(jié)合能低于SDZ-AM的結(jié)合能。
綜合SDZ四處結(jié)合位點(diǎn)三種計(jì)算方法模擬結(jié)果來(lái)看,MAA對(duì)4VP與SDZ作用所形成的競(jìng)爭(zhēng)較小,且與其他結(jié)合位點(diǎn)處結(jié)合力更強(qiáng)進(jìn)而利于印跡體系的穩(wěn)定,所以MAA用作SDZ水相共用單體效果優(yōu)于AM。因此本文通過(guò)量子化學(xué)計(jì)算確定4VP和MAA為SDZ印跡共用功能單體組合。
3 結(jié)語(yǔ)
本文以SDZ為模板分子,通過(guò)計(jì)算模板分子與功能單體形成的相互作用力來(lái)篩選單體以及確定識(shí)別位點(diǎn)。模擬的結(jié)果和分析表明:4VP、MAA共用功能單體組合相比于4VP、AM共用功能單體組合更加適用于SDZ-MIPs的制備。MAA對(duì)SDZ-4VP相互作用影響相對(duì)較小,而且與非4VP作用位點(diǎn)處結(jié)合能力更強(qiáng)。
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*通訊作者:
譚振江(1965-),男,吉林東豐人,教授,博士,碩士生導(dǎo)師,研究方向:計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)。