莊雄標(biāo), 陳淑珍, 黎豐華, 劉獻(xiàn)棠, 吳印愛, 王志偉
原發(fā)性肝癌(primary liver cancer,PLC)是我國常見的惡性腫瘤,其中85%~90%為肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)[1-2]。雖然目前HCC的治療方法較多,但5年復(fù)發(fā)率仍高達(dá)75%~100%[3]。研究HCC發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,尋找新的可用于預(yù)測HCC轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)和靶向治療的標(biāo)志物,具有重要意義。
脯氨酸、谷氨酰胺剪接因子(splicing factor proline and glutamine rich, SFPQ),又名多聚嘧啶區(qū)結(jié)合蛋白(polypyrimidine tract-binding protein,PTB)相關(guān)剪接因子(PTB-associated splicing factor,PSF),是果蠅行為/人類剪切(drosophila behavior human splicing,DBHS)蛋白家族的一員,它與剪接調(diào)控蛋白PTB一起,參與前體mRNA的剪接過程,并因此得名[4]。然而,SFPQ蛋白的功能不盡于此。研究發(fā)現(xiàn),絕大部分SFPQ蛋白定位于細(xì)胞核漿,不與PTB結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA鏈的解旋和配對中發(fā)揮重要作用[5]。同時(shí),SFPQ蛋白參與構(gòu)成一種目前功能未知的結(jié)構(gòu)Paraspeckles[6-7]。此外,SFPQ還參與了腫瘤細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的調(diào)控[8-9]。在增殖期細(xì)胞,SFPQ的表達(dá)較靜止期細(xì)胞提高兩倍[8]。在前列腺癌組織中,SFPQ蛋白的表達(dá)較癌旁組織下調(diào),其低表達(dá)與前列腺癌的進(jìn)展顯著相關(guān)[10]。而在結(jié)直腸癌中,雖然SFPQ參與結(jié)直腸癌的生長和轉(zhuǎn)移進(jìn)程,但與癌旁組織相比,其在癌組織中的表達(dá)并無顯著改變[11]。
本研究擬通過免疫組織化學(xué)染色檢測SFPQ蛋白在HCC患者癌與癌旁組織中的表達(dá),并利用Oncolnc數(shù)據(jù)庫分析SFPQ在HCC患者預(yù)后判斷中的價(jià)值。同時(shí)通過小干擾RNA技術(shù)體外敲低SFPQ在肝癌細(xì)胞株BEL-7402中的表達(dá),探討SFPQ對肝癌細(xì)胞增殖、遷移侵襲、EMT等生物學(xué)特性的影響及其在HCC發(fā)生發(fā)展中可能的作用。
1.1材料
1.1.1組織標(biāo)本 組織標(biāo)本來自2013—2016年筆者醫(yī)院普通外科行HCC根治性切除術(shù)的30名患者,所有患者術(shù)前均未接受抗腫瘤治療。癌組織為距病灶邊緣<1 cm的組織,術(shù)后經(jīng)病理學(xué)檢查證實(shí)為HCC;癌旁組織為腫瘤邊緣>2 cm的組織。
1.1.2試劑 SFPQ兔多克隆抗體(貨號(hào):15585-1-AP,美國 Proteintech 公司);檸檬酸抗原修復(fù)液(貨號(hào):ZLI-9065,北京中杉金橋公司)、免疫組織化學(xué)一步法檢測系統(tǒng)(貨號(hào):PV-6000,北京中杉金橋公司)、二氨基聯(lián)苯胺(DAB)顯色劑(貨號(hào):ZLI-9018,北京中杉金橋公司);RNAiso試劑(貨號(hào):9180)、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(RR036A)和熒光定量PCR試劑盒(RR420A)(日本Takara公司);Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑(貨號(hào):11668-019,美國Invitrogen公司);DMEM培養(yǎng)基(貨號(hào):12100046,美國Gibco公司)、胎牛血清(貨號(hào):10270160,美國Gibco公司);CCK8細(xì)胞增殖檢測試劑盒(貨號(hào):BB4202,南京貝博公司);Matrigel基質(zhì)膠(貨號(hào):356234,美國Cornirng公司)、Transwell培養(yǎng)板(貨號(hào):3415,美國Cornirng公司);結(jié)晶紫粉末(C6158,美國 Sigma 公司);E-cadherin,N-cadherin,Vimentin,Snail和GAPDH 兔多克隆抗體(貨號(hào):A3044,A3045,A5544,A2666,AC001,美國Abclonal公司);HRP標(biāo)記山羊抗兔二抗(貨號(hào):D110058,上海生工公司)。
1.1.3儀器 LightCycler 480 II System(5015278001型,瑞士Roche公司);Western-blot蛋白檢測系統(tǒng)(1645050型,美國Bio-rad公司)。
1.2方法
1.2.1免疫組織化學(xué)法檢測SFPQ蛋白在肝細(xì)胞癌組織中的表達(dá) 石蠟標(biāo)本制作成4 μm厚度切片,常規(guī)烤片,二甲苯脫蠟,梯度酒精水化,微波修復(fù)10 min,3%過氧化氫阻斷內(nèi)源性過氧化氫酶15 min,4 ℃過夜孵育一抗(1∶200),次日經(jīng)PBS充分洗滌,孵育二抗30 min,DAB鏡下顯色,蘇木精復(fù)染細(xì)胞核,氨水返藍(lán)后常規(guī)封片。
免疫組織化學(xué)結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn):按著色強(qiáng)度將無著色、輕度著色、中度著色及深度著色記為0,1,2和3分;按陽性肝癌細(xì)胞占總肝癌細(xì)胞比例,將0%,1%~25%,26%~50%,51%~75%%及≥76%記為0,1,2,3及4分;兩者的乘積代表組織SFPQ蛋白的表達(dá)水平,總分為0~12分[12]。
1.2.2OncoLnc數(shù)據(jù)庫進(jìn)行在線生存分析 利用OncoLnc數(shù)據(jù)庫(http://www.oncolnc.org/)中的HCC數(shù)據(jù)集,按照推薦設(shè)置(Top33%:Bottom33%)進(jìn)行不同SFPQ表達(dá)水平患者間的生存分析[13]。
1.2.3細(xì)胞培養(yǎng) 肝癌細(xì)胞BEL-7402使用含10% 胎牛血清DMEM高糖培養(yǎng)基,置于含體積分?jǐn)?shù)為0.05%的CO2、37 ℃飽和濕度環(huán)境中進(jìn)行培養(yǎng)。siRNA轉(zhuǎn)染BEL-7402細(xì)胞委托上海吉瑪公司設(shè)計(jì)并合成siRNA序列,分別為:
siRNA-1 sense:GCAAAGGATTCGGATTTAT
antisense:GCAGGATTCGGATTAATAT
siRNA-2 sense:CCTTTCTGTTCGTAATCTT
antisense:CCTCTGTTCGTAATTTCTT
陰性對照 sense:CCAGCAGCAAGAAAGGCAT
antisense:CCAACGAAAGAGGACGCAT
轉(zhuǎn)染前1天將對數(shù)生長期的BEL7402細(xì)胞按照每孔4×105接種至6孔板,常規(guī)培養(yǎng)至融合度達(dá)60%~70%,按照Lipofectamine 2000說明書進(jìn)行siRNA細(xì)胞轉(zhuǎn)染,實(shí)驗(yàn)設(shè)置分為:空白組(Blank),陰性對照組(negative control,NC),siRNA-1組(KD1)及siRNA-2組(KD2)。
1.2.4熒光定量PCR法驗(yàn)證SFPQ低表達(dá)細(xì)胞模型 細(xì)胞轉(zhuǎn)染48 h后,按照RNAiso試劑說明書提取細(xì)胞總RNA,以所提取的總RNA為模板按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),采用 SYBR Green I 法進(jìn)行熒光定量PCR反應(yīng),反應(yīng)條件為預(yù)變性95 ℃,30 s→變性95 ℃,5 s→退火60 ℃,30 s,變性和退火共45個(gè)循環(huán),溶解曲線和降溫條件按照說明書進(jìn)行設(shè)置。引物由上海生工公司設(shè)計(jì)并合成,SFPQ序列為:
forward:5′-TGGCTGAAATTGCCAAAGCC-3′
reverse:5′-GGCGCAAAAGATTTGCCTGA-3′
以GAPDH為內(nèi)參,序列為:
forward:5′- CTCTGCTCCTCCTGTTCGAC-3′
reverse:5′-GCGCCCAATACGACCAAATC-3′
1.2.5CCK8法檢測SFPQ表達(dá)敲低后BEL-7402細(xì)胞增殖能力的變化 細(xì)胞轉(zhuǎn)染24 h后,按每孔1×103接種于96孔板,分別在0,24,48,72,96 h加入10 μL CCK8試劑,37 ℃孵育2 h,選擇450 nm波長測定吸光度,繪制生長曲線。
1.2.6Transwell法檢測SFPQ表達(dá)敲低后BEL-7402細(xì)胞遷移和侵襲能力的變化
1.2.6.1細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞轉(zhuǎn)染48 h后,收集并以無血清培養(yǎng)基重懸細(xì)胞,按照每孔5×104接種于Transwell 上室,下室加入含10%胎牛血清的培養(yǎng)基,常規(guī)培養(yǎng)24 h后,4%多聚甲醛固定細(xì)胞20 min,結(jié)晶紫染色著色25 min,取出小室,用棉簽輕柔拭去小室內(nèi)側(cè)膜細(xì)胞,顯微鏡下隨機(jī)選擇5個(gè)視野進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)并拍照記錄。
1.2.6.2細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn) 提前以50 μL 10% Matrigel基質(zhì)膠包被小室,余方法同上。
1.2.7Western-blot檢測SFPQ表達(dá)敲低后BEL-7402細(xì)胞EMT相關(guān)蛋白表達(dá)量的變化 細(xì)胞轉(zhuǎn)染72 h后,RIPA法提取細(xì)胞總蛋白,BCA法測定蛋白濃度,蛋白經(jīng)變性后,取30 μg進(jìn)行10% SDS-PAGE 蛋白電泳,常規(guī)轉(zhuǎn)膜,5%脫脂牛奶封閉非特異性抗原,加入SFPQ(1∶500),E-Cadherin(1∶1 000),N-Cadherin(1∶1 000),Vimentin(1∶1 000),Snail(1∶1 000)和 GAPDH(1∶2 000)等抗體工作液,置于4 ℃冰箱孵育過夜。次日,PBST洗滌3遍,分別加入辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記山羊抗兔二抗(1∶10 000)室溫孵育1 h。PBST洗滌3遍后,ECL化學(xué)發(fā)光法顯像并拍照記錄。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用GraphPad Prism 5.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。采用Student’st檢驗(yàn)比較癌組織和癌旁組織SFPQ蛋白的染色評(píng)分;多組數(shù)據(jù)比較采用單因素方差分析,組間比較采用Dunnet-t檢驗(yàn);檢驗(yàn)水準(zhǔn)為P<0.05,采用雙側(cè)性檢驗(yàn)。
2.1HCC組織 SFPQ蛋白的表達(dá)特點(diǎn) SFPQ蛋白表達(dá)主要定位于肝細(xì)胞細(xì)胞核,表現(xiàn)為細(xì)胞核呈棕褐色染色(圖1)。根據(jù)組織化學(xué)染色評(píng)分方法,癌組織評(píng)分(5.37±0.64)明顯高于癌旁組織[(3.27±0.43),P<0.01,圖2],說明SFPQ蛋白高表達(dá)于HCC組織。
SFPQ:脯氨酸、谷氨酰胺剪接因子. A:評(píng)分12分;B:評(píng)分0分.圖1 SFPQ蛋白在肝細(xì)胞癌組織中的表達(dá)特點(diǎn)( ×400)Fig 1 Expression of SFPQ protein in HCC tissues( ×400)
SFPQ:脯氨酸、谷氨酰胺剪接因子.圖2 30例肝細(xì)胞癌組織和癌旁組織SFPQ蛋白免疫組織化學(xué)染色評(píng)分Fig 2 IHC score of 30 paires of HCC tissues and adjacent tissues
2.2SFPQ的表達(dá)量和HCC患者預(yù)后的關(guān)系 OncoLnc數(shù)據(jù)庫HCC數(shù)據(jù)集包含360名患者的總生存數(shù)據(jù),在線生存分析表明,SFPQ表達(dá)水平與患者預(yù)后有顯著相關(guān)性,SFPQ高表達(dá)組(Top33%,n=118)的生存期較低表達(dá)組(Bottom33%,n=118)顯著縮短(圖2,P<0.001),提示SFPQ可能是HCC患者的預(yù)后不良因素。
SFPQ:脯氨酸、谷氨酰胺剪接因子.圖3 SFPQ表達(dá)量和肝細(xì)胞癌患者總生存時(shí)間的關(guān)系Fig 3 Relationship between SFPQ expression and overall survival of HCC patiens
2.3SFPQ-siRNA對BEL-7402細(xì)胞中SFPQ表達(dá)水平的影響 熒光定量PCR結(jié)果顯示,與Blank組比較,KD1和KD2組SFPQ mRNA表達(dá)水平均呈明顯下調(diào)(圖3A,P<0.05),Western-blot 進(jìn)一步證實(shí)SFPQ蛋白的表達(dá)水平也明顯下調(diào)(圖3B),說明兩對siRNA序列均有理想的基因敲低作用,SFPQ低表達(dá)細(xì)胞模型構(gòu)建成功。
Blank:空白組; NC:陰性對照組; KD1:siRNA1組; KD2:siRNA2組. A:mRNA水平; B:蛋白水平. △:與Blank組比較,P<0.01.圖4 siRNA對BEL-7402 細(xì)胞中SFPQ表達(dá)量的敲低效果Fig 4 Expression of SFPQ in BEL-7402 was knocked down by siRNA
2.4敲低SFPQ表達(dá)對BEL-7402細(xì)胞增殖能力的影響 生長曲線表明,KD1和KD2組細(xì)胞的生長速度均較Blank組明顯減慢(P<0.05,圖5),提示敲低SFPQ表達(dá)抑制BEL-7402細(xì)胞的增殖能力。
2.5敲低SFPQ表達(dá)對BEL-7402細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響 細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,KD1和KD2組穿膜細(xì)胞數(shù)均較Blank組顯著減少(P<0.05),其中KD1組穿膜細(xì)胞數(shù)為(110.6±10.9),KD2組為(104.0±10.6),NC組為(227.4±26.6),Blank組為(239.2±45.2);侵襲實(shí)
Blank:空白組; NC:陰性對照組; KD1:siRNA1組; KD2:siRNA2組. 與Blank組比較,△:P<0.01.圖5 敲低SFPQ表達(dá)后BEL-7402細(xì)胞的生長曲線Fig 5 Growth curve of BEL-7402 cells after knockdown of SFPQ
驗(yàn)結(jié)果顯示,KD1和KD2組與Blank組相比較,2組發(fā)生侵襲的細(xì)胞數(shù)也明顯減少(P<0.05,圖6),其中KD1組細(xì)胞穿膜細(xì)胞數(shù)為(99.4±16.3),KD2組為(86.6±9.1),NC組為(235.2±20.0),Blank組為(235.8±16.1),說明敲低SFPQ表達(dá)可以同時(shí)抑制Bel-7402細(xì)胞的遷移和侵襲能力。
2.6敲低SFPQ表達(dá)對BEL-7402細(xì)胞EMT進(jìn)程的影響 Western-blot 結(jié)果顯示,KD1和KD2組上皮細(xì)胞標(biāo)志物E-cadherin表達(dá)較Blank組明顯升高,而間質(zhì)細(xì)胞標(biāo)志物N-cadherin和Vimentin及抑制上皮特性的轉(zhuǎn)錄因子Snail的表達(dá)均較Blank組明顯降低(圖7),表明敲低SFPQ表達(dá)可以逆轉(zhuǎn)Bel-7402細(xì)胞的EMT進(jìn)程。
Blank:空白組; NC:陰性對照組; KD1:siRNA1組; KD2:siRNA2組.圖6 敲低SFPQ后BEL-7402細(xì)胞遷移和侵襲數(shù)量的變化Fig 6 Migrated and invaded BEL-7402 cells after knockdown of SFPQ
本研究通過免疫組織化學(xué)染色法證實(shí),SFPQ蛋白在HCC患者癌組織的表達(dá)顯著高于其對應(yīng)的癌旁組織。此外,利用Oncolnc數(shù)據(jù)庫對不同SFPQ mRNA表達(dá)水平的患者進(jìn)行生存分析,發(fā)現(xiàn)高表達(dá)SFPQ mRNA的患者術(shù)后總生存時(shí)間更短。體外細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),敲低SFPQ表達(dá)后,腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移侵襲能力均顯著下調(diào),EMT進(jìn)程受到阻滯,說明SFPQ在HCC中參與了肝癌細(xì)胞生長與轉(zhuǎn)移的調(diào)控。
OncoLnc數(shù)據(jù)庫包含了TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)庫的21種癌癥、8 647例患者的生存資料和mRNA、miRNA測序數(shù)據(jù)及MiTranscriptome beta數(shù)據(jù)庫的lncRNA測序數(shù)據(jù)。通過對基因的表達(dá)水平進(jìn)行分組,可以直接得到不同基因表達(dá)水平的患者Kaplan-Meier生存分析結(jié)果[13]。數(shù)據(jù)庫共有360名HCC患者的生存資料,按照推薦的設(shè)置進(jìn)行生存分析,每組樣本量仍達(dá)118例,因此所得的生存分析結(jié)果可靠性強(qiáng),提示SFPQ可能是HCC患者的預(yù)后不良因素。
SFPQ眾多的結(jié)構(gòu)域賦予了它多種多樣的功能,而目前關(guān)于SFPQ在腫瘤中表達(dá)及功能的研究還很有限。研究發(fā)現(xiàn),SFPQ在前列腺癌中較癌旁組織低表達(dá),且低表達(dá)SFPQ與前列腺癌進(jìn)展顯著相關(guān),但預(yù)后分析結(jié)果顯示,不同表達(dá)水平的患者術(shù)后無瘤生存時(shí)間和總生存時(shí)間均無顯著差異[10]。在結(jié)直腸癌組織中,SFPQ的表達(dá)較非癌組織無顯著改變[11]。而本研究結(jié)果顯示,SFPQ蛋白在HCC組織中較非癌組織明顯上調(diào),并且高表達(dá)SFPQ的患者術(shù)后預(yù)后不良的可能性更高。這與在前列腺癌和結(jié)直腸癌中的研究結(jié)果截然不同,提示在HCC中,SFPQ可能通過其特有的分子機(jī)制影響著HCC的發(fā)生發(fā)展。
Blank:空白組; NC:陰性對照組; KD1:siRNA1組; KD2:siRNA2組.圖7 敲低SFPQ表達(dá)后BEL-7402細(xì)胞EMT相關(guān)蛋白表達(dá)量的變化Fig 7 Expression of EMT related proteins in BEL-7402 cells after knockdown of SFPQ
SFPQ蛋白氨基酸序列中存在兩個(gè)RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RNA-binding domain, RBD),SFPQ蛋白與RNA結(jié)合后,對PTBP2蛋白的調(diào)控作用可能受到影響[14-15]。Ji等在結(jié)直腸癌中發(fā)現(xiàn),已在多種腫瘤中均被證實(shí)與腫瘤進(jìn)展相關(guān)的長鏈非編碼RNA MALAT1可與SFPQ相結(jié)合,導(dǎo)致癌基因PTBP2從SFPQ/PTBP2復(fù)合物中游離出來,從而促進(jìn)結(jié)直腸癌的進(jìn)展[11]。此外,還有研究發(fā)現(xiàn),SFPQ可與長鏈非編碼RNA GAPLINC結(jié)合,在一定程度上削弱GAPLINC對結(jié)直腸癌細(xì)胞侵襲的促進(jìn)作用[16]。EMT是指上皮細(xì)胞失去其上皮表型,轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂休^強(qiáng)遷移和侵襲能力的間質(zhì)表型細(xì)胞的生物學(xué)過程[17-19],是腫瘤發(fā)生轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)的關(guān)鍵步驟。EMT在分子水平的重要標(biāo)志性事件是相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子(如snail1/2,ZEB1/2等)上調(diào),上皮表型E-cadherin表達(dá)下調(diào),間質(zhì)表型N-cadherin和Vimentin表達(dá)上調(diào)[18]。本研究發(fā)現(xiàn),利用siRNA敲低SFPQ的表達(dá)后,HCC細(xì)胞株的增殖、遷移侵襲能力均有所下降,EMT進(jìn)程也受到阻滯,說明不同于結(jié)直腸癌,SFPQ在HCC中可能主要作為癌基因發(fā)揮作用,其中存在著未知的分子機(jī)制,有待進(jìn)一步探究。
總之,本研究發(fā)現(xiàn),SFPQ在HCC中呈高表達(dá),并且高表達(dá)的SFPQ參與調(diào)控了HCC的增殖、遷移侵襲以及EMT進(jìn)程,SFPQ有望成為肝癌患者預(yù)后的預(yù)測指標(biāo)。但本研究也存在眾多的不足之處,如在免疫組織化學(xué)染色階段納入的樣本量不足,無法分析SFPQ蛋白的表達(dá)與患者臨床病理參數(shù)間的關(guān)系;此外,SFPQ通過何種分子機(jī)制調(diào)控HCC的進(jìn)展,也需要深入研究。
[1] Chen W,Zheng R,Zeng H,etal. The incidence and mortality of major cancers in China, 2012[J].ChinJCancer,2016,35(1):73.
[2] Lafaro K J,Demirjian A N,Pawlik T M. Epidemiology of hepatocellular carcinoma[J].SurgOncolClinNAm,2015,24(1):1-17.
[3] Tung-Ping P R,Fan S T,Wong J. Risk factors, prevention, and management of postoperative recurrence after resection of hepatocellular carcinoma[J].AnnSurg,2000,232(1):10-24.
[4] Patton J G,Porro E B,Galceran J,etal. Cloning and characterization of PSF, a novel pre-mRNA splicing factor[J].GenesDev,1993,7(3):393-406.
[5] Meissner M,Dechat T,Gerner C,etal. Differential nuclear localization and nuclear matrix association of the splicing factors PSF and PTB[J].JCellBiochem,2000,76(4):559-566.
[6] Fox A H,Lamond A I. Paraspeckles[J].ColdSpringHarbPerspectBiol,2010,2(7):687.
[7] Fox A H,Lam Y W,Leung A K,etal. Paraspeckles: a novel nuclear domain[J].CurrBiol,2002,12(1):13-25.
[8] Shav-Tal Y,Zipori D. PSF and p54(nrb)/NonO--multi-functional nuclear proteins[J].FEBSLett,2002,531(2):109-114.
[9] Yarosh C A,Iacona J R,Lutz C S,etal. PSF: nuclear busy-body or nuclear facilitator[J]?WileyInterdiscipRevRNA,2015,6(4):351-367.
[10] Jiang F N,He H C,Zhang Y Q,etal. An integrative proteomics and interaction network-based classifier for prostate cancer diagnosis[J].PLoSOne,2013,8(5):e63941.
[11] Ji Q,Zhang L,Liu X,etal. Long non-coding RNA MALAT1 promotes tumour growth and metastasis in colorectal cancer through binding to SFPQ and releasing oncogene PTBP2 from SFPQ/PTBP2 complex[J].BrJCancer,2014,111(4):736-748.
[12] Nilsson R,Jain M,Madhusudhan N,etal. Metabolic enzyme expression highlights a key role for MTHFD2 and the mitochondrial folate pathway in cancer[J].NatCommun,2014,5:3128.
[13] Anaya J. OncoLnc: linking TCGA survival data to mRNAs, miRNAs, and lncRNAs[J].PeerJComputerScience,2016,2:67.
[14] Wang G,Cui Y,Zhang G,etal. Regulation of proto-oncogene transcription, cell proliferation, and tumorigenesis in mice by PSF protein and a VL30 noncoding RNA[J].ProcNatlAcadSciUSA,2009,106(39):16794-16798.
[15] Li L,Feng T,Lian Y,etal. Role of human noncoding RNAs in the control of tumorigenesis[J].ProcNatlAcadSciUSA,2009,106(31):12956-12961.
[16] Yang P,Chen T,Xu Z,etal. Long noncoding RNA GAPLINC promotes invasion in colorectal cancer by targeting SNAI2 through binding with PSF and NONO[J].Oncotarget,2016,7(27):42183-42194.
[17] Thiery J P,Acloque H,Huang R Y J,etal. Epithelial-mesenchymal transitions in development and disease[J].Cell,2009,139(5):871-890.
[18] Yilmaz M,Christofori G. Mechanisms of motility in metastasizing cells[J].MolecularCancerResearch,2010,8(5):629-642.
[19] Lamouille S,Xu J,Derynck R. Molecular mechanisms of epithelial-mesenchymal transition[J].NatureReviewsMolecularCellBiologyv,2014,15(3):178-196.