科學(xué)家繪制褐牙鲆全基因組精細(xì)圖譜

科學(xué)家繪制褐牙鲆全基因組精細(xì)圖譜

近日，中國水產(chǎn)研究院黃海水產(chǎn)研究所研究員陳松林領(lǐng)導(dǎo)的研究組與上海海洋大學(xué)、德國維爾茨堡大學(xué)、葡萄牙阿爾加夫大學(xué)、深圳華大基因研究院等單位合作，破譯了褐牙鲆全基因組序列，通過與半滑舌鰨全基因組比較分析，初步揭示了比目魚變態(tài)發(fā)育的分子機(jī)制。該研究成果發(fā)表于《自然—遺傳學(xué)》。

通過與半滑舌鰨全基因組比較，研究發(fā)現(xiàn)褐牙鲆和半滑舌鰨兩者的基因組存在高達(dá)85%的相似性。比較其基因組學(xué)后，篩選到153個比目魚類特異的基因家族以及12個比目魚擴(kuò)張的基因家族與細(xì)胞分裂和凋亡、眼睛大小調(diào)控、視網(wǎng)膜神經(jīng)遞質(zhì)、軟骨重構(gòu)等比目魚變態(tài)過程中的生物學(xué)現(xiàn)象密切相關(guān)。值得一提的是，hipk基因家族的擴(kuò)張可能參與了比目魚變態(tài)過程中眼睛的移動。此外，研究還鑒定出106個比目魚的正選擇基因，這些基因與體軸發(fā)育、神經(jīng)模式、骨骼肌重建、甲狀腺激素、視黃酸信號通路等密切相關(guān)。

研究揭示的甲狀腺激素和視黃酸信號通路在比目魚變態(tài)中的協(xié)同調(diào)控作用與昆蟲變態(tài)發(fā)育過程中的蛻皮激素和保幼激素的協(xié)同作用具有異曲同工之妙。研究人員認(rèn)為，核受體轉(zhuǎn)錄因子和萜類化合物在無脊椎動物到脊椎動物的變態(tài)發(fā)育過程中具有一定的功能保守性。該研究為生產(chǎn)中防止比目魚白化現(xiàn)象提供了一定的指導(dǎo)意義。

(來源：中國科學(xué)報)