李 凡,阿 繼,嚴 州,陳天祥,張 斌,湯 承*
(1.西南民族大學生命科學與技術(shù)學院,四川 成都 610041;2.四川省若爾蓋縣農(nóng)業(yè)畜牧和水務局,四川 若爾蓋 624500)
一起犢牦牛腹瀉病的病原學診斷
李 凡1,阿 繼2,嚴 州2,陳天祥2,張 斌1,湯 承1*
(1.西南民族大學生命科學與技術(shù)學院,四川 成都 610041;2.四川省若爾蓋縣農(nóng)業(yè)畜牧和水務局,四川 若爾蓋 624500)
四川省若爾蓋縣某養(yǎng)殖戶的犢牦牛出現(xiàn)以腹瀉為主要特征的疾病,傳播迅速,發(fā)病率為100%,為弄清病因,我們采集了6份腹瀉樣本,分別用Trizol法和酚氯仿法提取腹瀉糞便的總RNA和DNA,再用牦牛輪狀病毒(RV)、牛冠狀病毒(BcoV)、牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)、沙門氏菌(Salmonella)、產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(ETEC)特異的PCR方法進行病原檢測,結(jié)果得出這5種病原的檢出數(shù)分別為6、0、6、0、5,可見該地區(qū)犢牦牛腹瀉主要由RV、BVDV和ETEC混合感染引起。
牦牛腹瀉;病原;牦牛輪狀病毒;牛病毒性腹瀉病毒
犢牦牛腹瀉是指新生犢牦牛所發(fā)生的一種以腹瀉為主要癥狀的消化道疾病,該病一年四季均可發(fā)生,尤其以初春及夏末秋初氣候多變季節(jié)多發(fā),病犢牛以精神沉郁,體溫升高,腹脹、腹痛,廢食,呼吸短促,糞便惡臭,間或混有血絲氣泡,急性大量水瀉,脫水,自體中毒及心力衰竭為主要臨床特征,是造成犢牛死亡、生長發(fā)育不良最嚴重的疾病之一,給養(yǎng)牛業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失[1]。
當前引起犢牛腹瀉的原因極其復雜,包括感染性因素(病毒、細菌和寄生蟲)和非感染性因素(營養(yǎng)因素和環(huán)境因素)[2-3]。其中,病原微生物感染是造成犢牛腹瀉的重要原因,常見的引起犢牛腹瀉的病原主要有RV、BcoV、BVDV、Salmonella以及ETEC等[4-5],其臨床癥狀及病理剖檢很相似,需要通過實驗室檢測才能確診。本試驗對2016年采自若爾蓋縣某牦牛養(yǎng)殖戶的6份腹瀉樣本進行了RV、BCoV、BVDV、Salmonella和ETEC的PCR檢測,以確診到底是何種病原引起的腹瀉,現(xiàn)將結(jié)果報告如下。
1.1 被檢樣本及試劑 6份無菌采集的犢牦牛腹瀉糞便樣本,2016年8月采于若爾蓋縣某養(yǎng)殖戶的3月齡發(fā)病犢牦牛,臨床表現(xiàn)為腹瀉,排出灰白色、深綠色糞便和血便,脫水。
試劑:2×Taq PCR Master Mix(擎科公司),DNA Marker II、Marker DL2000(北京天根公司),RNAiso Plus、PrimeScriptTM等均購自寶生物工程(大連)股份有限公司;DEPC試劑購自Sigema生物公司。
1.2 參考毒株 牦牛RV分離株、BCoV陽性樣本、BVDV分離株、沙門氏菌分離株及ETEC分離株均為西南民族大學動物醫(yī)學實驗室保存。
1.3 引物 牦牛RV、BVDV和Ecoli.K99的檢測引物均參照文獻,由大連寶生物工程有限公司合成,引物信息見表1。
表1 RT-PCR引物信息
1.4 方法
1.4.1 被檢樣本處理與核酸提取 將6份腹瀉樣本用0.1mol/L PBS緩沖液按1∶3(m/v)比例稀釋,渦旋混勻,-80℃冰箱中反復凍融3次,以12000r/min離心15min,取上清,然后按照Trizol Reagent說明書提取總RNA,并按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書合成cDNA。反應體系為:5×buffer 4μL,Random primer 2μL,PrimeScript RTase 1 μL,ddH2O 9 μL;反轉(zhuǎn)錄條件為:37℃ 15 min,85℃ 15 s,16℃ 1min,-20℃保存?zhèn)溆?。DNA的提取采用酚氯仿法。
1.4.2 PCR擴增 用 RV、BCoV、BVDV、Salmonella和ETEC的引物對67份樣本的cDNA和DNA模板進行PCR擴增。反應體系為:cDNA 2.0 μL,2×Taq PCR Master Mix 12.5μL,上、下游引物各1.0 μL,ddH2O 8.5μL,總體積共25μL。PCR擴增條件為:95℃5min,95℃ 30s,52℃ 45s,72℃ 45s,72℃ 10 min。取擴增產(chǎn)物5μL在2%瓊脂糖凝膠板上點樣,100V電壓下電泳40min,于凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。將RV、BCoV、BVDV、Salmonella和ETEC檢測呈陽性的PCR產(chǎn)物送至生物工程(上海)股份有限公司測序。
2.1 被檢樣本的RT-PCR檢測結(jié)果 電泳結(jié)果顯示:在PCR擴增產(chǎn)物電泳中分別擴增出約231bp、230 bp、498 bp的條帶,分別為牦牛RV、BVDV和Ecoli.K99的特異條帶,BCoV與Salmonella僅有陽性對照擴增出條帶,結(jié)果見圖1~圖5。將擴增出的陽性產(chǎn)物送至生物工程(上海)股份有限公司測序,結(jié)果顯示:牦牛RV與NCBI上所登錄序列的同源性為100%,BVDV同源性為90.6%,Ecoli.同源性為98%。
圖1 牦牛RV擴增結(jié)果
圖2 牦牛BCoV擴增結(jié)果
圖3 牦牛BVDV擴增結(jié)果
圖4 牦牛Salmonella擴增結(jié)果
圖5 牦牛ETEC擴增結(jié)果
2.2 陽性檢出率及混合感染情況 6份臨床腹瀉樣本中,牦牛RV的陽性檢出率為100%(6/6),BCoV的陽性檢出率為 0,BVDV的陽性檢出率為 100%(6/6),Salmonella的陽性檢出率為0,ETEC的陽性檢出率為83.3%(5/6)?;旌细腥韭蕿?3.3%。
實驗室檢測結(jié)果結(jié)合臨床癥狀分析,本次若爾蓋縣養(yǎng)殖戶的犢牦牛腹瀉病呈混合感染,主要是由牦牛RV、BVDV和ETEC混合感染所致。
2016年周芳等[6]在青藏高原地區(qū)進行了BRV病原流行病學調(diào)查,發(fā)現(xiàn)BRV在云南、青海、四川和西藏的腹瀉樣本的感染率分別為90%、95%、85.19%和60%,證明BRV是引起牦牛腹瀉的重要病原。2016年陳新諾等[11]對青藏高原地區(qū)四個省的牦牛腹瀉樣本進行了BVDV病原流行病學調(diào)查,發(fā)現(xiàn)BVDV感染在青藏高原地區(qū)的牦牛中普遍存在。達娃次仁等[12]從西藏地區(qū)的240份牦牛腹瀉病料中分離到200株牦牛源大腸桿菌。郝一妹等[13]對26份牦牛腹瀉糞便樣本和部分健康糞便樣本進行產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(ETEC)的分離和檢測,結(jié)果表明產(chǎn)腸毒素大腸桿菌在牦牛腹瀉樣本中的檢出率顯著高于外表健康的牦牛,說明產(chǎn)腸毒素大腸桿菌在牦牛糞便中廣泛存在。
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Pathogen Diagnosis of a Case of Yak Diarrhea
Li Fan1,A Ji2,Yan Zhou2,et al.
(1.College of Life Science and Technology,Southwest University for Nationalities,Sichuan Chengdu 610041;2.Agriculture and Animal Husbandry and Water Authority of Ruoergai County,Sichuan Ruoergai 624500,China)
There were some prominent feature of the diseases with diarrhea in yak of some farmers at Ruoergai area,Sichuan province,which spreaded rapidly and its incidence rate was 100%.In order to find out the causes,6 diarrhea samples were collected,Trizol regent kit and phenol-chloroform extraction methods were used to extract total RNA and DNA of diarrhea feces,then yak rotavirus(RV),bovine coronavirus(BcoV),bovine viral diarrhea virus(BVDV),Salmonella,enterotoxigenic escherichiacoli(ETEC)were detected by specific PCR methods.The results showed that the amount of the five kinds of pathogens were 6,0,6,0,5,which meaned that yak diarrhea was mainly caused by mixed infection of yak RV,BVDV and ETEC.
Yak diarrhea;Pathogen;Yak rotavirus;Bovine viral diarrhea virus
S858.234.43
:B
:1001-8964(2017)02-0029-03
2016-11-29
“十三五”國家重點研發(fā)計劃(2016YFD0500907)
李凡(1992-),女(壯族),云南文山人,研究生,主要從事動物病原分子生物學研究。
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:湯承,博士,教授。