畜禽DNA甲基化研究進(jìn)展

林威敏　肖天放*　福建農(nóng)林大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院　福州　350002

畜禽DNA甲基化研究進(jìn)展

林威敏肖天放*福建農(nóng)林大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院福州350002

基因組甲基化是通過(guò)甲基轉(zhuǎn)移酶催化胞嘧啶轉(zhuǎn)化為5-甲基胞嘧啶，是表觀遺傳學(xué)的重要組成部分，對(duì)許多生理活動(dòng)具有重要影響。文中主要從甲基化在畜禽上的研究進(jìn)展，以及近幾年在長(zhǎng)鏈非編碼RNA等研究進(jìn)展，概述DNA甲基化研究的發(fā)展。

甲基化表觀遺傳學(xué)畜禽

表觀遺傳學(xué)是指DNA序列無(wú)變化的、可遺傳的基因表達(dá)改變。其中，DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)中一個(gè)重要的修飾形式［1］?；蚪M水平的DNA甲基化是在 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶 （DNA methyltransferase，DNMT）的作用下，以硫腺苷甲硫氨酸（adenosine methionine sulfur，SAM）作為甲基供體，將一個(gè)甲基添加到胞嘧啶的5′-碳原子上，形成5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine，5mC）［2］。DNA甲基化對(duì)于許多生理過(guò)程包括遺傳、繁殖、發(fā)育以及疾病等方面具有重要的影響。文中主要從動(dòng)物生產(chǎn)方面尤其是畜禽生產(chǎn)方面，對(duì)DNA甲基化研究進(jìn)展進(jìn)行整理概括。

1　畜禽DNA甲基化的研究概況

1.1DNA甲基化酶系統(tǒng)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶（DNA methyltransferase，DNMT）是DNA甲基化的主要催化因子。目前在哺乳動(dòng)物中，常見(jiàn)的DNMT有Dnmt1、Dnmt2、Dnmt3a、Dnmt3b和Dnmt3L［3］，其中對(duì)DNMT系統(tǒng)中Dnmt2的研究獲得了大量成果。其廣泛分布在各種生物中，包括哺乳動(dòng)物、鳥類、魚類、昆蟲、植物、真菌等［4］。雖然Dnmt2對(duì)DNA甲基化作用的研究仍然沒(méi)有一個(gè)廣泛被認(rèn)可的結(jié)論，但是現(xiàn)有的認(rèn)識(shí)主要集中在以下幾點(diǎn)：（1）Dnmt2不是一種DNA甲基化酶，而是一種RNA甲基化酶；（2）Dnmt2具有廣泛的內(nèi)源RNA甲基化活性，并且在表觀遺傳中起重要作用［5］；（3）Dnmt2有可能是古老的病源防疫機(jī)制的因子之一［6］。此外，有研究表明，Dnmt1、Dnmt3a和Dnmt3b在低氧環(huán)境下對(duì)于小鼠大腦皮質(zhì)具有重要的保護(hù)作用。其對(duì)DNA甲基化的催化作用，對(duì)機(jī)體的正常生理維護(hù)具有重要作用［7］。

1.2DNA甲基化生物學(xué)作用DNA甲基化參與多種生命調(diào)節(jié)形式，對(duì)正常生理調(diào)控起著重要作用。

1.2.1參與基因的表達(dá)調(diào)控大量研究表明，無(wú)論是在啟動(dòng)子區(qū)域的CpG島中，亦或是基因內(nèi)部，DNA的甲基化水平越高，基因的表達(dá)越少，呈現(xiàn)一種明顯的負(fù)相關(guān)關(guān)系。較低的甲基化水平，卻與轉(zhuǎn)錄活性呈正相關(guān)關(guān)系，對(duì)基因的轉(zhuǎn)錄、染色體構(gòu)型等方面產(chǎn)生影響，進(jìn)而影響基因的表達(dá)［8］。有觀點(diǎn)認(rèn)為，甲基化有利于異常染色質(zhì)的生成，對(duì)機(jī)體的遺傳發(fā)育產(chǎn)生影響。

1.2.2對(duì)發(fā)育分化產(chǎn)生影響生物發(fā)育過(guò)程中，基因的序列是不變的。但是在個(gè)體發(fā)育的不同時(shí)期，基因的表達(dá)卻是有相對(duì)規(guī)律性的；相關(guān)的基因與DNA甲基化關(guān)系密切。胚胎階段，通過(guò)DNA的甲基化與去甲基化，形成新的甲基化模式，并且能夠產(chǎn)生具有發(fā)育潛質(zhì)的細(xì)胞［9］。甲基化對(duì)機(jī)體正常發(fā)育起到重要作用。

1.2.3DNA甲基化與基因組印記哺乳動(dòng)物性細(xì)胞形成或產(chǎn)生合子時(shí)，親本基因產(chǎn)生專一性修飾，使后代體細(xì)胞源于親本的基因表達(dá)活性差別不同，這就是基因組印記。研究表明，產(chǎn)生這種情況的主要原因是因?yàn)橛H本等位基因被甲基化造成的［10］。

1.3DNA甲基化檢測(cè)方法DNA甲基化常用的檢測(cè)方法主要分為全基因組DNA甲基化水平檢測(cè)與DNA甲基化位點(diǎn)檢測(cè)。

1.3.1全基因組DNA甲基化檢測(cè)常用的全基因組DNA甲基化檢測(cè)方法往往有：（1）酶切法：常用的甲基化限制性內(nèi)切酶有HapⅡ、MspⅠ、NotⅠ、Bst UⅠ等。利用這些限制性內(nèi)切酶對(duì)5mC端的敏感性差異，可以把那些沒(méi)有甲基化的基因組DNA切成小片段，而甲基化的基因組DNA則不受影響。往往酶切法可以將甲基化片段切割為大小不一的片段，然后再進(jìn)行檢測(cè)，這種方法操作簡(jiǎn)便，成本低，效果顯著。但是會(huì)出現(xiàn)假陽(yáng)性現(xiàn)象，干擾結(jié)果［11］。（2）免疫共沉淀即亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)換法：由于酸性亞硫酸鹽可以使未甲基化的胞嘧啶（C）脫氫基變?yōu)槟蜞奏ぃ║），而甲基化的胞嘧啶（C）則不受影響。之后利用PCR對(duì)處理過(guò)后的DNA模板鏈進(jìn)行擴(kuò)增，胸腺嘧啶（T）與處理得到的尿嘧啶（U）互補(bǔ)。在測(cè)序中由于亞硫酸鹽處理過(guò)后的DNA鏈（克里克鏈 BSC）與互補(bǔ)鏈（沃森鏈BSW）無(wú)法互補(bǔ)，就出現(xiàn)四種不同的序列。經(jīng)過(guò)片段分離，檢查出甲基化的胞嘧啶（C），利用芯片或是大規(guī)模測(cè)序可以獲得所需要的結(jié)果。但是亞硫酸轉(zhuǎn)化法會(huì)出現(xiàn)C/T不匹配的問(wèn)題，需保證完全配對(duì)，而且工作量較大。

目前新一代甲基化檢測(cè)方法有全基因組亞硫酸氫鈉測(cè)序法 （whole-genome shotgun bisulphate sequencing，WGBS），是可以完全實(shí)現(xiàn)全基因組單堿基分辨率的甲基化檢測(cè)方法。該方法多用于多組織、多樣本的DNA甲基化檢測(cè)。但是該方法也存在費(fèi)用昂貴且經(jīng)亞硫酸鹽處理過(guò)的序列復(fù)雜度降低等問(wèn)題［3］。

另外還有其他性價(jià)比較為可觀的方法，包括限制性內(nèi)切酶的測(cè)序方法 （MRE-Seq）［12］、5-甲基胞嘧啶單克隆抗體的測(cè)序方法（MeDIP-Seq）以及簡(jiǎn)化過(guò)的亞硫酸氫鈉測(cè)序技術(shù)（reduced representation bisulfite sequencing，RRBS）等［13］。

1.3.2DNA甲基化位點(diǎn)檢測(cè)某個(gè)DNA甲基化位點(diǎn)的檢測(cè)方法一般采用以下方法：（1）亞硫酸氫鹽測(cè)序PCR（Bisulfite sequencing PCR，BSP）或是甲基化特異性PCR（Methylation-Specific PCR，MSP）等方法，均利用亞硫酸鹽對(duì)未發(fā)生甲基化的胞嘧啶（C）進(jìn)行脫氫作用，再利用PCR對(duì)處理過(guò)的序列進(jìn)行擴(kuò)增，判斷是否發(fā)生甲基化。這兩種方法準(zhǔn)確度高，但也存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的問(wèn)題。（2）甲基化位點(diǎn)特異性結(jié)合的層析法，利用與甲基化特異性結(jié)合的蛋白，使之與甲基化位點(diǎn)特異性結(jié)合。一般是把特異結(jié)合蛋白的一端和凝膠結(jié)合，另一端則暴露出來(lái)，用于檢測(cè)DNA片段上的甲基化位點(diǎn)，甲基化的DNA就可以被特異性結(jié)合蛋白檢測(cè)出。（3）熒光定量PCR（Fluorescence Quantitative PCR）：利用經(jīng)過(guò)亞硫酸鹽處理過(guò)的甲基化片段可與設(shè)計(jì)的探針序列特異性結(jié)合的特點(diǎn)，在探針的5'末端連接一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)（比如FAM），在其3'末端連接一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)（比如TAMRA），之后進(jìn)行PCR擴(kuò)增。如果探針可與DNA片段雜交，由于Taq DNA聚合酶的作用，5'末端的熒光基團(tuán)被切下，而失去了淬滅熒光基團(tuán)的抑制，就會(huì)出現(xiàn)熒光現(xiàn)象。通過(guò)每次循環(huán)熒光的強(qiáng)度測(cè)定，就可以得到DNA甲基化的強(qiáng)度［14］。這種方法操作簡(jiǎn)單，靈敏度較高，但是也存在易受環(huán)境影響，不能得到較完全的甲基化信息的不足。

1.4DNA甲基化在畜禽上的研究進(jìn)展DNA甲基化在畜禽生產(chǎn)上的研究也已經(jīng)取得大量成果。

在乳牛上的DNA甲基化研究，主要集中在相關(guān)的乳牛生產(chǎn)及疾病預(yù)防中，有研究表明，乳牛金黃色葡萄球菌性乳房炎能夠促使乳腺組織DNA再甲基化，DNA再甲基化可能是乳牛乳房炎急性期的一種普遍調(diào)控［15］。另外，根據(jù)已有的研究可知，烯脂酰輔酶A水合酶短鏈1（enoyl-CoA hydratase short chain 1，ECHS1）的表達(dá)對(duì)機(jī)體的正常生長(zhǎng)發(fā)育有著重要的維持作用。因此，王鳳武等利用BS-Seq方法檢測(cè)了ECHS1的甲基化模式圖，得到在荷斯坦乳牛459 bp的ECHS1片段中有28個(gè)CpG位點(diǎn)，其中多個(gè)位點(diǎn)對(duì)β-氧化有重要的調(diào)控作用［16］。

在試驗(yàn)小鼠的研究過(guò)程中，Lee Y M等通過(guò)應(yīng)用DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶制劑5-aza-dC（5-aza-2'-deoxycytidine，10 μmol/L～5 μmol/L）對(duì)小鼠胚胎進(jìn)行實(shí)時(shí)定量（Q-PCR）處理，得到5-aza-dC干預(yù)修飾微小RNA（microRNA）的概況，以及在小鼠桑椹胚至囊胚階段對(duì)象識(shí)別提供信息，用來(lái)探索生育以及microRNA的調(diào)控和表觀遺傳干預(yù)之間的關(guān)系［17］。

對(duì)于豬的DNA甲基化研究，李明洲等構(gòu)建了豬的脂肪和肌肉DNA甲基化圖譜，因?yàn)樨i是一種和人類生理活動(dòng)十分接近的模式動(dòng)物，除了可以獲得不同部位的豬肉脂肪沉積的差異，還可以為人類破解肥胖問(wèn)題提供相應(yīng)的基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)，具有重大的參考價(jià)值［18］。另外，白小青等人以榮昌豬為實(shí)驗(yàn)動(dòng)物，利用HPLC法檢測(cè)了不同體重，閹割后榮昌豬的心臟、肝臟、橫膈膜三種組織中的基因組DNA的甲基化水平，結(jié)果顯示不同體重對(duì)基因組DNA甲基化具有重要影響［19］。借鑒了小鼠成纖維細(xì)胞重編程為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞（iPSCs）的研究，魏可等研究了35日齡豬胎兒的干細(xì)胞多能性相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化情況，結(jié)果顯示體細(xì)胞重編程為iPSCs的過(guò)程伴隨著多能基因啟動(dòng)子甲基化程度的降低，為理解iPS重編程中多能性相關(guān)基因的DNA去甲基化過(guò)程和了解控制多能性相關(guān)基因的表觀遺傳調(diào)節(jié)提供基礎(chǔ)［20］。

另外，根據(jù)研究得知，不同年齡的仔豬，其抗原處理相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)體1（Transported associated with antigen processing，TAP1）基因的啟動(dòng)子區(qū)域，存在三個(gè)潛在的調(diào)控位點(diǎn)，分別是 CpG-4、CpG-13以及CpG-15，對(duì)TAP基因的甲基化具有一定的調(diào)控作用。另外，TAP1基因啟動(dòng)子區(qū)域CpG島甲基化對(duì)TAP1的表達(dá)具有負(fù)相關(guān)作用 （P＜0.05），其mRNA的表達(dá)隨著日齡的增加而增加。進(jìn)而隨著日齡增加，影響TAP1蛋白，從而對(duì)仔豬的肺水腫與腹瀉產(chǎn)生影響［21］。

另外根據(jù)Dong W等人的研究，利用重亞硫酸鹽測(cè)序PCR（Bisulfite Sequencing PCR）和熒光定量PCR（Fluorescence Quantitative PCR）分別對(duì)CpG島中 TAP1（Transported associated with antigen processing，TAP）基因啟動(dòng)子的甲基化狀態(tài)和從出生到斷奶年齡的蘇太仔豬空腸的TAP1基因的表達(dá)進(jìn)行研究，方差分析顯示，不同年齡對(duì)于CpG島中的甲基化水平具有顯著性影響（P＜0.05）［21］。

最近的一些有關(guān)甲基化的研究已經(jīng)開(kāi)始集中在對(duì)于一些不表達(dá)的但是有證據(jù)顯示對(duì)機(jī)體的正常生理活動(dòng)具有重要意義的基因組，即非編碼基因。長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNAs）是基因組中一個(gè)主要的未開(kāi)發(fā)的基因組件，能夠?qū)染色體的沉默，染色質(zhì)修飾，轉(zhuǎn)錄激活，轉(zhuǎn)錄干擾核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控產(chǎn)生影響。周等人通過(guò)已知的甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序（MeDIP-seq），利用民豬和長(zhǎng)白豬重新構(gòu)建豬脂肪和肌肉中的lncRNAs甲基化模式。表明，不同日齡間民豬與大白豬背標(biāo)甲基化存在差異；民豬和大白豬在150和180日齡之間出現(xiàn)去甲基化現(xiàn)象，其次是在180和210日齡［22］。該結(jié)果有助于理解lncRNAs基因參與脂肪沉積與肌肉發(fā)育的作用。

另外還有新的研究指出，不同濃度的微量元素對(duì)于基因組中的甲基化具有一定的影響。根據(jù)Karweina D等以54頭仔豬為實(shí)驗(yàn)對(duì)象，隨機(jī)分為三組，只對(duì)鋅濃度進(jìn)行分梯次控制的研究。結(jié)果表明DNA甲基化作為一種ZIP4（ZRT，IRT-like protein，ZIP）基因維持鋅平衡的調(diào)控機(jī)制，ZIP4基因甲基化對(duì)高濃度的鋅（Zin）的調(diào)控效果很低，但可能影響替代鋅反應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合［23］。

2　甲基化的發(fā)展趨勢(shì)

隨著表觀遺傳學(xué)的發(fā)展，人們探究甲基化的步伐將繼續(xù)深入。已知的研究中，對(duì)于甲基化的作用機(jī)理已經(jīng)有了一定的認(rèn)識(shí)，但是這些認(rèn)識(shí)還是十分淺顯的。今后的研究中，關(guān)于甲基化和人類疾病之間的相互關(guān)系，將仍然會(huì)是一個(gè)熱門的研究方向。甲基化的檢測(cè)將成為作為人類疾病的診斷的一種手段。尤其是在人類早期癌癥的診斷上，具有重要的作用。一般來(lái)說(shuō)，人體的原癌基因因?yàn)楦鞣N作用被限制，其中就有甲基化作用，抑制了原癌基因的表達(dá)。同時(shí)，抑癌基因充分表達(dá)，提高機(jī)體自身的抑癌機(jī)制。但是，原癌基因會(huì)因?yàn)槟承┰?，包括環(huán)境與生理原因，出現(xiàn)去甲基化現(xiàn)象，導(dǎo)致原癌基因被激活。然而，抑癌基因卻出現(xiàn)甲基化現(xiàn)象，從而導(dǎo)致癌癥的發(fā)生。研究表明，當(dāng)機(jī)體的總體甲基化水平下降，而個(gè)別位點(diǎn)的甲基化水平明顯上升時(shí)，往往是早期癌癥發(fā)生的信號(hào)。基于此，甲基化水平的檢測(cè)可以成為人類疾病的一種有效的診斷方式，提高人類的健康水平。

同時(shí)，長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lincRNAs）的甲基化與去甲基化對(duì)于相關(guān)疾病的影響，也是一個(gè)重要的研究熱點(diǎn)。已經(jīng)獲得的研究成果表明，一些lincRNAs的甲基化調(diào)控，可以作為某些癌癥輔助治療的潛在靶點(diǎn)，例如HOTAIR［Homeobox（HOX）transcript antisense RNA］，可以作為小細(xì)胞肺癌耐藥性的輔助靶點(diǎn)［24］。

此外，也有一些學(xué)者已經(jīng)開(kāi)始著手于將全基因組關(guān)聯(lián)分析 （Genome-Wide Analysis Study，GWAS）技術(shù)應(yīng)用于甲基化的研究，將整個(gè)個(gè)體的全基因組作為一個(gè)研究對(duì)象，不再著眼于某一個(gè)或是某幾個(gè)基因組的甲基化對(duì)于某種特定的生理狀況作用的研究。此外，根據(jù)已經(jīng)完成的某些物種的de novo測(cè)序結(jié)果，篩查出具有潛在甲基化的區(qū)域，進(jìn)一步研究該區(qū)域?qū)τ趥€(gè)體具體的生物學(xué)作用。

3　問(wèn)題與展望

基因組甲基化作為表觀遺傳學(xué)的重要組成部分，在近些年的發(fā)展中，已經(jīng)取得了較為豐富的成功。但是，關(guān)于甲基化對(duì)機(jī)體具體的生理功能的作用機(jī)制與產(chǎn)生原因仍然不是十分清楚，依舊不能提供較為深入的解釋。例如各種人類癌癥中，為什么原癌抑癌基因會(huì)出現(xiàn)甲基化與去甲基化？環(huán)境與生理原因的對(duì)甲基化與去甲基化的作用機(jī)理是什么？甲基化與去甲基化二者之間相互轉(zhuǎn)化的作用機(jī)制是什么？控制機(jī)體產(chǎn)生甲基化現(xiàn)象的基因又在哪里？它的作用機(jī)理又是什么？這些問(wèn)題都還沒(méi)有具體的研究成果。因此，今后的甲基化研究將繼續(xù)深入探討相關(guān)生理活動(dòng)包括疾病的發(fā)生與作用機(jī)制。同時(shí)，對(duì)于非編碼RNA對(duì)于DNA甲基化的作用，也將進(jìn)一步深入。此外，在動(dòng)物生產(chǎn)方面，也將為動(dòng)物育種飼養(yǎng)等方面提供理論基礎(chǔ)，為人來(lái)帶來(lái)新的經(jīng)濟(jì)效益。

［1］楊雅冉，王鵬翔，方向東，等.表觀遺傳學(xué)在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用研究進(jìn)展［J］.法醫(yī)學(xué)雜志，2012，：28（5）：366-370.

［2］周建生，楊生生，繆明永，等.DNA甲基化/去甲基化與癌癥［J］.生命的化學(xué)，2013，33（4）：381-388.

［3］宋穎，邴旭文，曹哲明，等.水產(chǎn)動(dòng)物DNA甲基化的研究進(jìn)展［J］.淮海工學(xué)院學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版），2013，22（4）：82-87.

［4］Schaefer M，Lyko F.Solving the Dnmt2 enigma［J］.Chromosoma，2010，119（1）：35-40.

［5］呂丹，張連峰.動(dòng)物中DNA甲基轉(zhuǎn)移酶2研究進(jìn)展［J］.中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志，2015，25（2）：46-49.

［6］Durdevic Z，Schaefer M.Dnmt2 methyltransferases andimmunity：an ancient overlooked connection between nucleotidemodification and host defense［J］.Bioessays，2013，35 （12）：1044-1049.

［7］周成江，張姝，姜樹原，等.DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1、3A和3B在低氧預(yù)適應(yīng)小鼠大腦中的表達(dá) ［J］.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床，2012，34（2）：151-154.

［8］Hovestadt V，Jones D T，Picelli S，et al.Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing［J］.Nature，2014，510（7506）：537-541.

［9］Wang R，Xu J，F(xiàn)u H，et al.Genomic DNA methylation and histone methylation［J］.YiChuan，2014，36（3）：191-199.

［10］哈斯木其爾，胡鑫，王國(guó)富，等.DNA甲基化及其在動(dòng)物遺傳育種上的研究進(jìn)展［J］.內(nèi)蒙古民族大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版），2015，35（4）：320-322.

［11］邱崢艷，郭將，楊春，等.DNA甲基化在動(dòng)物遺傳育種上的研究進(jìn)展［J］.中國(guó)畜牧獸醫(yī)，2012，39（7）：173-178.

［12］Brunner A L，Johnson D S，Kim S W，et al.Distinct DNA methylation patterns characterize differentiated human embryonic stem cells and developing human fetal liver［J］. Genome Res，2009，19：1044-1056.

［13］凡時(shí)財(cái)，李承哲.人類基因組DNA甲基化數(shù)據(jù)分析的研究現(xiàn)狀［J］.中國(guó)科學(xué)：生命科學(xué)，2015，45（5）：450-459.

［14］Lister R，Pelizzola M，Dowen R H，et al.Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences［J］.Nature，2009，462：315-322.

［15］劉利，高雪.DNA甲基化在乳牛金黃色葡萄球菌性乳房炎中的調(diào)控［J］.畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào)，2012，43（10）：1554-1558.

［16］王鳳武，姜明德，付紹印，等.荷斯坦乳牛β-氧化關(guān)鍵酶ECHS1基因甲基化分析 ［J］.畜牧與飼料科學(xué)，2014，35 （12）：7-9.

［17］Lee Y M，Chen H W，Maurya P K，et al.MicroRNA regulation via DNA methylation during the morula to blastocyst transition in mice［J］.MHR：Basic Sci Reprod Med，2012，18（4）：184-193.

［18］Li Mingzhou，Wu Honglong，Luo Zonggang，et al.An Atlas of DNA Methylomes in Porcine Adipose and Muscle Tissues［J］.Nature Communications，2012，22（3）：850.

［19］白小青，王金勇，陳英，等.榮昌豬基因組DNA甲基化水平分析［J］.西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版），2010，38 （2）：31-35.

［20］魏可，陳方兵，范聰麗，等.豬誘導(dǎo)多能干細(xì)胞多能性相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化檢測(cè) ［J］.農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)，2014，22（2）：141-149.

［21］Dong Wenhua，Yin Xuemei，Sun Li，et al.Age-associated methylation change of TAP1 promoter in piglet［J］.Gene，2015，573（1）：70-74.

［22］Zhou ZhongYin，Li Aimin，Wang Ligan，et al.DNA methylation signatures of long intergenic noncoding RNAs in porcine adipose and muscle tissues［J］.Scientific Reports，2015，23（5）：15435.

［23］Karweina D，Kreuzer-Redmer S，Müller U，et al.The Zinc Concentration in the Diet and the Length of the Feeding Period Affect the Methylation Status of the ZIP4 Zinc Transporter Gene in Piglets［J］.PLoS One，2015，10（11）：e0143098.

［24］Fang S，Gao H Y，Tong Y，et al.Long noncoding RNAHOTAIR affects chemoresistance by regulating HOXA1 methylation in small cell lung cancer cells［J］.Lab Invest，2016，96（1）：60-68.

Research progress on DNA methylation of livestock and poultry

LinWeimin XiaoTianfang*
（College of animal science，F(xiàn)ujian agriculture and forestry university，F(xiàn)uzhou 350002）

Genome methylation is an important parts of Epigenetics，through methyltransferase catalyzes the Cytosine to the 5-methylcytosine，and significantly effects on many bioactives.This paper summarizes the developments in study of DNA methylation，during the progress in the study of methylation in livestock，and long noncoding RNA in recently years.

Methylation Epigenetics Livestock and poultry

A

1003-4331（2016）04-0035-04

科技部科技基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)（2014FY120800）資助。

林威敏（1992-），男，研究生。E-mail：
957760184@qq.com。
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肖天放（1964-），男，教授。E-mail：tfxiao@163. com。