王增良,楊 歡
(臨汾市疾病預(yù)防控制中心,山西臨汾 041000)
277例手足口病樣本病原學(xué)檢測(cè)報(bào)告
王增良,楊歡
(臨汾市疾病預(yù)防控制中心,山西臨汾041000)
目的:了解2015年臨汾市手足口病病原學(xué)特征,為手足口病防控提供病原學(xué)依據(jù)。方法:使用Realtime PCR檢測(cè)方法對(duì)腸道病毒進(jìn)行核酸檢測(cè)和型別鑒定,并對(duì)未能分型的腸道病毒的VP2基因片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)其進(jìn)行測(cè)序和比對(duì)鑒定,得出病毒型別。結(jié)果:277例手足口病臨床診斷病例中,檢測(cè)到腸道病毒核酸陽(yáng)性201例,陽(yáng)性率為71.6%,其中,腸道病毒71型7例,占陽(yáng)性樣本3.5%;柯薩奇病毒A16型62例,占陽(yáng)性樣本30.8%;CA6型94例,占陽(yáng)性樣本46.8%;CA10型3例,占陽(yáng)性樣本1.5%;柯薩奇病毒B5型1例,占陽(yáng)性樣本0.5%;??刹《?型1例,占陽(yáng)性樣本0.5%;CA4/CA6混合型2例,占陽(yáng)性樣本1%;未分型腸道病毒(EV)33例,占陽(yáng)性樣本16.4%。結(jié)論:2015年臨汾市手足口病流行的病原體主要是CA6型,其次是CA16和其他未分型腸道病毒。
手足口病;病原學(xué);腸道病毒;CoxA 6
手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)是由多種腸道病毒感染引起,以發(fā)熱和手、足、口腔等部位的皮疹或皰疹為主要特征的兒童常見(jiàn)傳染病。HFMD由腸道病毒EV71型和柯薩奇病毒A4、A5、A7、 A9、A10、A16、B2、B3、B4、B5、B7等多種病毒引起[1]。為探討2015年臨汾市手足口病病原學(xué)特征,提供防控手足口病的病原學(xué)依據(jù),收集2015年臨汾市手足口病臨床診斷病例樣本277例,進(jìn)行了病原學(xué)檢測(cè),現(xiàn)將檢測(cè)結(jié)果報(bào)告如下。
1.1病例來(lái)源
277例病例樣本來(lái)源于臨汾市各縣區(qū)哨點(diǎn)監(jiān)測(cè)醫(yī)院首次就診的HFMD病例,其診斷和分類參照國(guó)家《手足口病診斷指南》(2010版)病例定義。
1.2樣本采集
按照《手足口病預(yù)防控制指南》(2009版)要求,采集2015年全年手足口病臨床診斷病例樣本277例,其中,咽拭子標(biāo)本219份,糞便樣本58份,均來(lái)自于不同的病例。采集樣本保存于2~3 mL儲(chǔ)存液中,4℃運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室后,24 h內(nèi)完成熒光定量PCR檢測(cè),剩余樣本分裝保存于-80℃冰箱用于后續(xù)檢測(cè)。
1.3腸道病毒Real-time PCR檢測(cè)
用QIAamp Viral RNA Mini Kit(Qiagen公司)進(jìn)行病毒RNA提取。使用腸道通用型EV、EV71、CA16、CA6、CA10等熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒(江蘇碩世公司)進(jìn)行病原學(xué)檢測(cè),結(jié)果判讀參考試劑盒說(shuō)明書(shū)。腸道病毒通用型核酸陽(yáng)性EV,而已有病毒類型核酸檢測(cè)不能分型者,為未知型。
1.4未知型腸道病毒的VP2基因片段的PCR擴(kuò)增及序列測(cè)定
對(duì)未知型樣本做進(jìn)一步分型。參考美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)數(shù)據(jù)庫(kù)中腸道病毒基因組,針對(duì)未知型腸道病毒VP2基因組的部分片段(長(zhǎng)度為794bp,與NCBI編號(hào)為HE572907的VP1序列相對(duì)參考位置為58bp-851bp)設(shè)計(jì)特異性引物,上游引物為601F(5`-3`):ATATC(C/T)CGGGTGACCGCAGC,下游引物為607R(5`-3`):TC(G/A)GTTGCAGTGTTAG(T/ C)TATTGTTTG;使用One Step RT-PCR Kit(Qiagen公司)進(jìn)行RT-PCR檢測(cè),使用QIAxcel毛細(xì)管電泳儀(Qiagen公司)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行分析。擴(kuò)增產(chǎn)物由梓熙生物公司進(jìn)行雙向測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果提交NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST比對(duì)復(fù)核。
1.5統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
統(tǒng)計(jì)結(jié)果使用Micrsoft Excel 2007建立數(shù)據(jù)庫(kù),使用SPSS 15.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)差異分析,計(jì)數(shù)資料用百分率表示,組間比較用χ2檢驗(yàn),以P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1病原學(xué)監(jiān)測(cè)
277例手足口病臨床診斷病例標(biāo)本,經(jīng)用熒光定量PCR檢測(cè),并對(duì)未知型樣本再用VP2分型方法進(jìn)行型別鑒定,結(jié)果腸道病毒陽(yáng)性樣本201例,陽(yáng)性率為71.6%。腸道病毒型別鑒定結(jié)果分別為腸道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)7例,占陽(yáng)性樣本3.5%;柯薩奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CA16)62例,占陽(yáng)性樣本30.8%;CA6型94例,占陽(yáng)性樣本46.8%;CA10型3例,占陽(yáng)性樣本1.5%;柯薩奇病毒B5型(Coxsackievirus B5,CB5)1例,占陽(yáng)性樣本0.5%;??刹《?型(Echo9)1例,占陽(yáng)性樣本0.5%;CA4/CA6混合型2例,占陽(yáng)性樣本1%;未分型腸道病毒(EV)33例,占陽(yáng)性樣本16.4%。
2.2不同性質(zhì)標(biāo)本腸道病毒檢出情況
277份樣本中,咽拭子標(biāo)本219份,糞便標(biāo)本58份。在219份咽拭子標(biāo)本中,檢測(cè)出腸道病毒核酸陽(yáng)性148份,陽(yáng)性率67.6%。在58份糞便標(biāo)本中,檢測(cè)出腸道病毒核酸陽(yáng)性53份,陽(yáng)性率91.4%。糞便樣本陽(yáng)性檢出率(91.4%)高于咽拭子樣本陽(yáng)性檢出率(67.6%)(χ2=13.2,P<0.05),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見(jiàn)表1。
表1 不同性質(zhì)標(biāo)本腸道病毒檢出情況n(%)
2.3人群分布
收集的277例樣本中,男155例,腸道病毒陽(yáng)性118例,陽(yáng)性檢出率76.1%;女122例,腸道病毒陽(yáng)性83例,陽(yáng)性檢出率68%,男女比例:1.27∶1,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=2.31,P>0.05)。檢測(cè)出的201例陽(yáng)性樣本中,手足口病患者年齡最小5個(gè)月,最大28歲,在0~3歲年齡組182例;其他年齡組19例。見(jiàn)表2、表3。
表2 不同性別患者陽(yáng)性檢出率n(%)
表3 不同性別患者陽(yáng)性檢出率n(%)
2.4時(shí)間分布統(tǒng)計(jì)
201份陽(yáng)性樣本中,4~7月檢測(cè)的HFMD腸道病毒陽(yáng)性數(shù)量最高,呈現(xiàn)夏季高發(fā)特點(diǎn)。4月份起檢測(cè)陽(yáng)性數(shù)開(kāi)始上升,5~7月份呈現(xiàn)一個(gè)明顯高峰,8月份陽(yáng)性檢測(cè)數(shù)開(kāi)始有所下降。見(jiàn)圖1。
圖1 2015年HFMD檢測(cè)陽(yáng)性份數(shù)時(shí)間分布圖
277例手足口病病例樣本的EV型別鑒定結(jié)果,以腸道病毒CA6型陽(yáng)性率為最高,陽(yáng)性率33.9%(94/ 277),其次,為腸道病毒CA16型,陽(yáng)性率22.4%(62/ 277)。據(jù)報(bào)道,2012年以來(lái),腸道病毒CA6型逐漸成為中國(guó)大陸HFMD的重要病原,其曾在歐洲和東南亞等世界多地引起過(guò)暴發(fā)流行[2]。這與本次檢測(cè)結(jié)果相一致。
我國(guó)HFMD易感人群多為5歲以下兒童,男性發(fā)病率高于女性。HFMD發(fā)病高峰期主要為每年的3~7月[3]。從表3、表4和圖1可看出,在201例陽(yáng)性樣本中,男性118例,女性83例。0~3歲年齡陽(yáng)性檢出率較高。陽(yáng)性檢出例數(shù)3~7月較多。與報(bào)道基本相同。
本次監(jiān)測(cè)還發(fā)現(xiàn)了EV71和A16型以外的其他型別,包括CA6型,CA10型,柯薩奇病毒B5型,??刹《?型,CA4/CA6混合型等。這幾種病原型別,在山西省地區(qū)未見(jiàn)有報(bào)道。不同種類的人腸道病毒所引起的HFMD癥狀有所不同,且嚴(yán)重程度及病情進(jìn)展也不完全相同,而至今尚無(wú)有效疫苗[4]。近年來(lái),許多國(guó)家都報(bào)道了由EV71和CA16型以外的其他腸道病毒引起HFMD爆發(fā)的疫情,且由其他腸道病毒引起的患者容易發(fā)生并發(fā)癥,如脫甲癥、脫皮現(xiàn)象等[5]。這就提示,引起HFMD病毒型別是在不斷變化的,在今后HFMD的防控工作中,要注意,有可能會(huì)出現(xiàn)新的腸道病毒來(lái)取代原有的病毒。因此,做好對(duì)HFMD病原的檢測(cè),掌握引起HFMD的腸道病毒型別分布和構(gòu)成,從源頭上主動(dòng)對(duì)HFMD進(jìn)行預(yù)防和控制,顯得尤為重要。
[1]劉克洲,陳智.人類病毒性疾?。跰].北京:人民衛(wèi)生出版社,2010.
[2]曾漢日,陸靖,李暉,等.廣東省2008-2009年柯薩奇A6型腸道病毒的流行及其基因特征分析[J].中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志,2014,34(10):742-746.
[3]胡躍華,肖革新,郭瑩,等.中國(guó)大陸手足口病流行特征分析[J].中華疾病控制雜志,2014,8(18):693-697,747.
[4]林虹,馬江濤,陳慧,等.寧夏回族自治區(qū)2013-2014年手足口病病原學(xué)分析[J].中國(guó)公共衛(wèi)生,2015,31(11):1489-1492.
[5]王作梅,王淑珍,李俊紅,等.82例成人手足口病的臨床特點(diǎn)分析[J].現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2012,12(27):5363-5365.
本文編輯:王知平
R446.5
B
1671-0126(2016)02-0023-03
王增良,男,副主任技師,從事疾病預(yù)防檢驗(yàn)工作
山西衛(wèi)生健康職業(yè)學(xué)院學(xué)報(bào)2016年2期