產(chǎn)褥期陰道微生態(tài)研究

張群英 王黎 陳祖云 陳歡? 方序

產(chǎn)褥期陰道微生態(tài)研究

張群英 王黎 陳祖云 陳歡? 方序

目的 應(yīng)用細菌基因測序技術(shù)了解陰道內(nèi)微生物種群的分布情況。方法 采集10例產(chǎn)褥期婦女陰道分泌物（pH值、清潔度、膿球、滴蟲、霉菌等）測定雌激素，提取微生物總基因組，擴增16S rRNA 測序。另選擇正常育齡婦女為對照，比較兩組結(jié)果了解產(chǎn)褥期陰道微生態(tài)情況，菌種組成情況和生理情況。結(jié)果 正常婦女陰道中的乳桿菌屬（Lactobacillus）的含量是產(chǎn)褥期婦女的>100倍，早期產(chǎn)婦，乳酸桿菌顯著下降，這導(dǎo)致其抵抗力下降。不動桿菌屬在產(chǎn)婦早期的的陰道中含量上升，表明其抵抗力下降。結(jié)論 產(chǎn)褥期孕婦的微生態(tài)呈現(xiàn)一個動態(tài)的過程，早期產(chǎn)褥婦女與正常婦女有顯著差異，而在產(chǎn)褥后期的微生態(tài)基本與正常婦女一致。16S rRNA測序可以較好的揭示陰道微生態(tài)的變化，其有希望成為一個新的、系統(tǒng)的評估手段。不僅可以分析產(chǎn)婦陰道微生態(tài)的恢復(fù)情況，還能用于檢測和評估其綜合情況。

陰道微生態(tài) 16S rRNA 高通量測序 乳酸桿菌 不動桿菌

正常陰道內(nèi)有多種細菌存在，這種微生態(tài)的形成對阻止泌尿生殖系統(tǒng)疾病的發(fā)生起著至關(guān)重要的作用，如乳酸桿菌維持陰道正常的酸性環(huán)境，抑制其它病原體生長。研究發(fā)現(xiàn)，產(chǎn)褥期婦女陰道微生態(tài)失調(diào)占75.31%，陰道炎占9.1%［1］。陰道微生態(tài)的評價方法中，宏基因技術(shù)相比傳統(tǒng)的培養(yǎng)有明顯的優(yōu)越性［2］。為更好的了解我國婦女在產(chǎn)褥期陰道微生態(tài)的變化，作者采集產(chǎn)褥期婦女和正常育齡婦女的陰道分泌物，應(yīng)用細菌基因測序技術(shù)以期了解陰道內(nèi)微生物種群的分布情況。

1 臨床資料

1.1 一般資料 收集2013年9月至2014年11月本院10例產(chǎn)褥期婦女（產(chǎn)后6～8周）陰道分泌物（標記為T）為觀察組，年齡25～38歲，平均年齡33.5歲。以6周為界，＜42d為產(chǎn)褥期早期（6例），42～56d為產(chǎn)褥期晚期（4例）。另收集正常育齡婦女的陰道分泌物（10例，標記為N）為對照組，年齡21～47歲，平均年齡35歲。納入標準：所有入選婦女近＜3d均無性生活；無陰道分泌物異常、接觸性出血；無宮頸手術(shù)史、無妊娠；無盆腔放射治療史；年齡差異無統(tǒng)計學意義。

1.2 方法 （1）標本采集：所有婦女均用無菌刮板及長棉簽從陰道上1/3處獲取陰道分泌物。（2）無菌刮板檢測pH值、清潔度、膿球、滴蟲、霉菌等檢查和雌激素測定。（3）DNA提取：長棉簽采集的微生物懸浮于0.5ml滅菌PBS溶液中，加入50μl溶菌酶（10mg/ml），6μl變?nèi)芫兀?5000 U/ ml；Sigma-Aldrich），3μl溶葡球菌酶（4000 U/ ml；Sigma-Aldrich），和41μl TE50緩沖液（10 mM Tris·HCL和50 mM EDTA，pH 8.0），37℃消化1h。然后利用細菌基因組提取試劑盒（Cat No. D-6000A，Gentra，USA）提取DNA。（4）高通量16S rDNA測序： 對細菌的V4區(qū)，利用Miseq進行測序，擴增引物為：F：5'-AYTGGGYDTAAAGNG-3'，R：5'-TACNVGGGTATCTAATCC-3'，采用Illumina MiSeq測序平臺進行。（5）測序結(jié)果的分析：測序所得結(jié)果根據(jù)不同的Barcode對序列的來源進行分類，舍棄無連接的序列。對連接上的序列進行過濾（連續(xù)相同堿基＜6，模糊堿基N＜1），獲得最終序列［2］。應(yīng)用QIIME，根據(jù)序列的相似度，將序列歸為多個OTU（操作分類單元）［3］，同時應(yīng)用mothur軟件中的uchime的方法去嵌合體序列［4］。

1.3 統(tǒng)計學方法 QIIME調(diào)用uclust對序列進行聚類，選取每個類最長的序列為代表序列。采用blast的方法對silva數(shù)據(jù)庫進行比對，獲得每個OTU分類學信息。OTU產(chǎn)出后，統(tǒng)計各個樣品含有OTU情況及每個OTU中含有序列的數(shù)目，并采用T-test進行統(tǒng)計學測驗發(fā)現(xiàn)差異OTU。

2 結(jié)果

2.1 陰道微生態(tài)狀況 觀察組中，陰道微生態(tài)正常6例（60.00%）；陰道微生態(tài)失調(diào)4例（40.00%）。包括BV患者3例（75.00%）；外陰陰道假絲酵母菌?。╒VC）患者1例（25.00%）。對照組中，陰道微生態(tài)正常7例（70.00%）；其余為陰道微生態(tài)失調(diào)3例（30.00%），包括BV患者2例（66.67%）；外陰陰道假絲酵母菌?。╒VC）患者1例（33.33%）；兩組年齡及陰道分泌物pH值比較差異無統(tǒng)計學意義。觀察組雌激素均值為99.94pmol/L，對照組雌激素均值為522.84pmol/L，兩組比較差異有統(tǒng)計學意義。

2.2 陰道微生態(tài)菌群狀況 （1） 測序情況統(tǒng)計：本資料對20例樣本的16S rDNA進行測序，其中N3和N5兩個樣本測序失敗，未納入后期分析（見表1）。（2）陰道微生態(tài)菌種在產(chǎn)褥期和正常生育期的OTU數(shù)目統(tǒng)計：應(yīng)用QIIME，根據(jù)序列的相似度＞97%歸為一個OTU。結(jié)果發(fā)現(xiàn)絕大部分的OTU在正常婦女和產(chǎn)褥期婦女中均有檢測，占全部OTU的63%。在正常樣本中特異性檢測到OTU189個，而在產(chǎn)褥期樣本中特異性檢測到318個。（3）陰道微生態(tài)菌種在產(chǎn)褥期和正常生育期的生物多樣性分析：在群落豐富度的指數(shù)（Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)）的分析發(fā)現(xiàn)，兩組樣本無差異，同時用群落多樣性的指數(shù)（Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)）也未發(fā)現(xiàn)差異。結(jié)果表明無論是產(chǎn)褥期的婦女，還是正常的婦女，其陰道微生態(tài)的生物多樣性不會有顯著性的變化，起變化的可能僅是部分菌在數(shù)量上的差異（見表2）。（4）兩組樣本的主成分分析：采用偏最小二乘方判別分析（PLS-DA）過濾與模型分類不相關(guān)信號即正交信號，獲得PLSDA模型，其模型質(zhì)量參數(shù)為，R2X=0.423，R2Y=0.9，Q2=0.138。結(jié)果顯示，正常樣本很好的聚為一類，而產(chǎn)褥期的婦女則分為三組，Ⅰ組（T1和T4），Ⅱ組（T2，T5，T6，T7），以及Ⅲ組（T3，T8，T9，T10）。Ⅲ組和正常孕婦聚為一類。（5） 產(chǎn)褥期和正常生育期主要的差異菌：根據(jù)PCA的分析結(jié)果，為避免干擾，將除Ⅲ組之外的產(chǎn)褥期的樣本（即Ⅰ和Ⅱ組）和正常樣本進行比較，發(fā)現(xiàn)差異的菌屬。根據(jù)文獻報道，健康婦女陰道常駐菌包括乳桿菌（lactobacillus）、假絲酵母菌、B族鏈球菌（Group B Streptococcus）、表皮葡萄球菌（staphylococcus）、梭狀桿菌（Clostridium Septicum）、糞鏈球菌（Streptococcus faecalis）、消化球菌（peptococcus）、類桿菌（bacteroid），而過路菌主要為金黃色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）、腸桿菌（enterobacteria）、丙酸桿菌（Propionibacterium）、消化鏈球菌（peptostreptococcus）和韋榮球菌（Veillonella）［4］。本資料中兩組主要的差異微生物（見表3）。正常婦女的陰道中的乳桿菌屬的含量是產(chǎn)褥期婦女的＞100倍。進一步分析乳酸桿菌的種類（見表4），此次試驗中主要鑒定到的乳桿菌屬為Lactobacillus iners和s-未能鑒定的種，這兩種菌的含量和在產(chǎn)褥期孕婦中顯著降低，另外鑒定到的Lactobacillus brevis和Lactobacillus coleohominis差異不顯著，原因可能與其含量較少相關(guān)。在產(chǎn)褥期婦女樣本中Clostridiales，Peptoniphilus，Acinetobacter等幾類菌有顯著的升高（見表2）。

表1 樣品序列數(shù)統(tǒng)計表

表2 生物多樣性指標

表3 兩組婦女陰道中菌屬比較

表4 兩組婦女的陰道中乳桿菌屬比較

3 討論

正常婦女的微生態(tài)一致性較好，基本歸為一類，表明在正常婦女的陰道微生態(tài)以相當穩(wěn)定的形式存在。相對于正常孕婦，產(chǎn)褥期孕婦的陰道微生態(tài)卻以3組形式存在，結(jié)合采樣時間，作者分析Ⅲ組的采樣時間為產(chǎn)褥期的后期，因此，其微生態(tài)的結(jié)構(gòu)特征已經(jīng)傾向于正常婦女，而Ⅰ組和Ⅱ組為相對早期，因此，其微生態(tài)與正常婦女有顯著差異。表明婦女在產(chǎn)后，其陰道微生態(tài)也存在一個逐漸修復(fù)的過程，這是一個動態(tài)的過程，而這種修復(fù)的機制目前尚未明確。

產(chǎn)褥期婦女和正常婦女陰道乳桿菌的差異表明，早期產(chǎn)褥期婦女的陰道微生態(tài)有明顯的改變。陰道的健康和乳桿菌的數(shù)量變化及pH變化均密切相關(guān)［5］。乳桿菌是陰道正常菌群中最重要的益生菌成員，其能維持陰道內(nèi)較低的酸度，從而抑制部分病原菌的生長，維持陰道自凈及抗感染中起著關(guān)鍵作用，乳桿菌數(shù)量的下降和pH上升會提升早產(chǎn)以及感染性傳播疾病的風險。因此，產(chǎn)褥期的婦女尤其要注意避免引起產(chǎn)褥期菌群失調(diào)的行為，如產(chǎn)褥期性生活行為、不良陰道清潔方式等［6］。

臨床標本中常能分離到的不動桿菌屬細菌有醋酸鈣不動桿菌、洛菲不動桿菌、溶血不動桿菌、鮑曼不動桿菌、瓊氏不動桿菌、約翰遜不動桿菌，最常見的是鮑曼不動桿菌。由不動桿菌引起的醫(yī)院內(nèi)感染近10年來增高的趨勢明顯，且多是多重耐藥菌株。最常見的分離部位是呼吸道、尿道和傷口，所致的疾病包括肺炎、心內(nèi)膜炎、腦膜炎、皮膚和傷口感染、腹膜炎、尿路感染等。在產(chǎn)褥期婦女樣本中發(fā)現(xiàn)這類菌的水平升高，表明產(chǎn)褥期的婦女的陰道抗菌能力的下降。

綜上，通過婦女陰道的細菌菌群的豐度信息可以增進對細菌菌群和健康之間關(guān)系的了解。早期只能通過qPCR或者培養(yǎng)對有限的菌群進行相對定量，而現(xiàn)在我們通過16S rDNA測序的方式，可以更為直接的獲取相對完整的陰道細菌群落結(jié)構(gòu)的信息并很好的揭示陰道微生態(tài)的變化，它有希望成為一個新的、系統(tǒng)的評估手段。不僅可以分析產(chǎn)婦產(chǎn)褥期陰道單一群落恢復(fù)情況，而且還能用于檢測和評估其綜合健康情況。

1 張群英，薛映辛，張艷玲，等.482例產(chǎn)褥期陰道微生態(tài)調(diào)查.中國微生態(tài)學雜志，2011，23：552～553.

2 Ravel J， Gaer P， Abdo Z，et al. Aginal microbiome of reproductive-age women. Proc Natl Acad Sci USA， 2011， 108： 4680～4687.

3 Magoc T， Salzberg SL. FLASH： fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies. Bioinformatics 2011， 27（21）：2957～2963.

4 Caporaso JG， Kuczynski J， Stombaugh J， et al. QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data. Nature methods 2010，7（5）：335～336.

5 Edgar RC， Haas BJ， Clemente JC，et al. UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection. Bioinformatics 2011， 27（16）：2194～2200.

6 李蘭娟.感染微生態(tài)學.北京：人民出版社，2002：422～424.

Objective The use of a bacterial gene sequencing technology to understand the distribution of vaginal microbial populations. Methods Changxing County randomly selected MCH 42-56 days postpartum women for vaginal secretions （pH value，cleanliness，pus ball，trichomoniasis，mold，etc.） inspection and measurement of estrogen and extracted total microbial genome amplified 16S rRNA sequencing. At the same time，randomly selected control group of normal women of childbearing age，for vaginal secretions （pH value，cleanliness，pus ball，trichomoniasis，mold，etc.） inspection and measurement of estrogen extracted total microbial genome sequencing of 16S rRNA amplification. Compare two Results thus understand postpartum vaginal microfl ora： The species composition and physiological condition. Results By sequencing experiments，we found that in women with normal vagina， the content of Lactobacillus （Lactobacillus） is more than 100 times for puerperal women，at an early maternal，their lactobacilli signifi cantly decreased，which caused the decrease in the protective ability. We also found Acinetobacter species of early maternal vaginal content increased，which also caused the decrease of protective ability. Conclusion Postpartum maternal microfl ora present a dynamic process，early and normal have signifi cant differences in their late microecological consistent with normal women. 16S rRNA sequencing may well reveal changes in vaginal microfl ora，which promises to be a new assessment tools，system ，which can be used not only to analyze the recovery of maternal vaginal microfl ora，but to detect and assess its overall situation.

Vaginal microfl ora 16S rDNA High-throughput sequencing Lactobacillus Acinetobacter.

浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生科技項目（2012KYB202）

313100 浙江省長興縣婦幼保健院 （張群英 王黎 陳祖云）

310012 浙江省微生物研究所（陳歡 方序）