全基因組測(cè)序揭示水源性土拉菌病

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全基因組測(cè)序揭示水源性土拉菌病

KARADENIZLI及其同事采用全基因組測(cè)序進(jìn)行土耳其境內(nèi)（錫瓦斯，昆侖以及科賈埃利?。┛谘什客晾”┌l(fā)流行的研究。這次暴發(fā)流行波及178人，經(jīng)典的流行病學(xué)已經(jīng)提示飲用水污染為暴發(fā)流行的可能原因，然而缺乏分子層面的證實(shí)。

33例首發(fā)病例中12例的咽拭子培養(yǎng)分離到土拉桿菌亞種holarctica，同時(shí)從暴發(fā)流行地區(qū)未經(jīng)消毒的飲用水水源收集的140份水樣中有5份分離出該亞種。全基因組測(cè)序顯示有6株分離株屬于B.12型。土拉菌遺傳變異非常少，因此傳統(tǒng)的分子生物學(xué)方法不能鑒別菌株的型別，但是全基因組測(cè)序可以解決該問(wèn)題。全基因組測(cè)序結(jié)果顯示所檢測(cè)的菌株有2個(gè)新基因簇，與已知的土拉桿菌基因組序列至少有20和26 個(gè)堿基多態(tài)性的差異。

研究者指出，該病流行區(qū)域的水庫(kù)入水口都暴露在外，輸送飲用水的管道也無(wú)覆蓋。因此，水源易受污染。

經(jīng)皮下注射或吸入＜10個(gè)細(xì)菌，或口服要求＞106個(gè)細(xì)菌可導(dǎo)致感染，提示本次暴發(fā)土拉菌病的主要原因是流行地區(qū)的水源被高度污染。美國(guó)，每年約有100例土拉菌病，多數(shù)為散發(fā)病例，但并無(wú)飲用水被污染導(dǎo)致發(fā)病的證據(jù)。

研究者指出將土拉菌蓄意污染飲用水水源具有可能作為生物武器的風(fēng)險(xiǎn)。

In the literature. Waterborne tularemia：whole-genome sequencing nails it. Clin Infect Dis， 2015：61（1October）.

高 瓊摘譯 黃海輝審校

Waterborne tularemia： whole-genome sequencing nails it

2015-12-02