貴州苗族人群15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性研究

劉應(yīng)喜趙 陽辛 陽

（1 貴州省公安廳刑偵總隊(duì) 貴州 貴陽 550005；2 沈陽市公安局皇姑分局 遼寧 沈陽 110036；3 中國刑警學(xué)院 遼寧 沈陽 110035）

貴州苗族人群15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性研究

劉應(yīng)喜1趙 陽2辛 陽3

（1 貴州省公安廳刑偵總隊(duì) 貴州 貴陽 550005；2 沈陽市公安局皇姑分局 遼寧 沈陽 110036；3 中國刑警學(xué)院 遼寧 沈陽 110035）

應(yīng)用STR分型技術(shù)研究貴州地區(qū)苗族的D3S1358、TH01、D21S11、D18S51、PentaE、D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、FGA等15個(gè)基因座的遺傳多態(tài)性，探討其在法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定中的應(yīng)用。

苗族 STR 遺傳多態(tài)性 貴州

應(yīng)用PowerPlex16?HS熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)對207例貴州地區(qū)苗族無關(guān)個(gè)體血樣DNA進(jìn)行15個(gè)STR基因座的復(fù)合擴(kuò)增，用ABI3130遺傳分析儀對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測，用Genemapper軟件進(jìn)行基因分型，并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，獲得了群體遺傳學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)，為個(gè)人識(shí)別和親權(quán)鑒定等法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 對象與方法

1.1 DNA樣本

采集貴州黔東南苗族侗族自治州苗族207例健康無關(guān)個(gè)體血樣，采用Chelex-100法[1]提取樣本DNA。

1.2 PCR擴(kuò)增

用PowerPlex16?HS Kit（Promega，美國），按照操作說明書給出的程序?qū)悠愤M(jìn)行常染色體STR復(fù)合擴(kuò)增，檢測Amelogenin及 15個(gè) STR基因座（D3S1358、 TH01、 D21S11、 D18S51、 PentaE、D5S818、 D13S317、 D7S820、 D16S539、 CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、FGA）。PCR反應(yīng)在9700擴(kuò)增儀（ABI，美國） 上進(jìn)行。

1.3 擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳及檢測

分型檢測在ABI-3130遺傳分析儀（ABI，美國）上進(jìn)行。應(yīng)用3130 Data Collection v3.0與GeneMapper ID v3.2分析軟件處理數(shù)據(jù)。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算各基因座的基因型、基因頻率，采用 Powerstats2.0Software（http：//www.promega. com） 統(tǒng)計(jì)分析15個(gè)基因座多態(tài)性數(shù)據(jù)，得到多態(tài)信息含量（PIC）、個(gè)人識(shí)別率（DP）、非父排除率（PE）。按文獻(xiàn)[2]的方法進(jìn)行Hardy—Weinberg平衡檢驗(yàn)。

2 結(jié)果與討論

貴州地區(qū)苗族人群無關(guān)個(gè)體15個(gè)STR基因座等位基因頻率和群體多態(tài)性指標(biāo)見表1和表2。

表1 貴州地區(qū)苗族人群15個(gè)STR基因座等位基因頻率

等位基因 D18S51 Penta E D21S11FGA TH01 TPOX vWA D16S539 5 0.0374 6 0.1525 7 0.2584 8 0.0093 0.0406 0.4703 0.3822 8.3 0.0020 9 0.0140 0.4812 0.0911 0.1228 9.3 0.0337 10 0.0010 0.0467 0.0317 0.0149 0.1376 11 0.0020 0.1542 0.4020 0.2040 12 0.0386 0.0748 0.0218 0.1030 13 0.1564 0.0701 0.0426 14 0.2248 0.0701 0.3465 0.0069 14.20.0010 0.0010 15 0.1762 0.1168 0.0020 0.0149 16 0.1683 0.1729 0.1277 16.2 0.0010 17 0.0584 0.0561 0.1723 17.2 0.0020 18 0.0723 0.0467 0.0158 0.2376 19 0.0436 0.0374 0.0446 0.0851 19.2 0.0010 20 0.0109 0.0514 0.0446 0.0139 21 0.0089 0.0280 0.1059 0.0010 21.2 0.0020 22 0.0139 0.1604 22.2 0.0040 23 0.0079 0.0047 0.1386 0.0010 23.2 0.0040 24 0.0099 0.0093 0.1990 24.2 0.0228 25 0.0020 0.1426 25.2 0.0109 26 0.0802 26.2 0.0030 27 0.0010 0.0168 28 0.0307 0.0020 28.2 0.0040 29 0.2376 30 0.2465 0.0010 30.2 0.0069 30.3 0.0010 31 0.1069 31.2 0.0901 32 0.0287 32.2 0.1545 33 0.0059 33.2 0.0782 34.2 0.0079

表2 貴州地區(qū)苗族人群15個(gè)STR基因座群體多態(tài)性指標(biāo)

遺傳標(biāo)記的多態(tài)性程度及其應(yīng)用價(jià)值可用多態(tài)信息量（PIC）、個(gè)體識(shí)別力（DP）和非父排除率（PE）來衡量。按文獻(xiàn)介紹的方法對基因型的觀察值和期望值進(jìn)行卡方檢驗(yàn)，符合 Hardy-Weinberg平衡定律（P＞0.05），說明了本次調(diào)查資料的可靠性。

聯(lián)合檢測15個(gè)STR基因座提高了檢材的利用率，擴(kuò)大了信息量，簡化了檢驗(yàn)程序，縮短了檢驗(yàn)時(shí)間?？蔀橛H緣鑒定和個(gè)體識(shí)別提供非?？煽康姆ㄡt(yī)學(xué)證據(jù)，是具有高識(shí)別力的人類遺傳標(biāo)記系統(tǒng)。本實(shí)驗(yàn)表明這15個(gè)STR基因座可適用于法醫(yī)物證學(xué)檢驗(yàn)，實(shí)用價(jià)值高，同時(shí)也為群體遺傳學(xué)、人類遺傳學(xué)、基因連鎖分析及疾病遺傳學(xué)等的研究提供了一定的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

[1]W alsh P S， Metzger D A， Higuchi R. Chelex-100 asmedium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material[J].Biotechniques，1991，10：506.

[2]Hou Y，Prinz M，Staak M.Comparison of differenttests fordeviation from Hardy-Weinberg equilibrium of AMPFLP population data[A].In：Bar W， Fiori A， Rossi U， eds.Advances in Forensic Haemogenetic 5th Berlin[C].Springer-Verlag，1994：511-514.

（責(zé)任編輯：于 萍）

DF795.2

A

2095-7939(2015)02-0074-02

2014-12-29

劉應(yīng)喜（1977-），男，貴州貴陽人，貴州省公安廳刑偵總隊(duì)技術(shù)處主檢法醫(yī)師，學(xué)士，主要從事法醫(yī)物證、法醫(yī)病理與法醫(yī)臨床研究。