劉祥,俱雄,陳春琳
(陜西理工學(xué)院生物科學(xué)與工程學(xué)院,陜西 漢中 723001)
大腸埃希菌(Escherichia coli)廣泛存在于自然環(huán)境中,按其致病機理可分為產(chǎn)腸毒素性、腸道侵襲性、腸道致病性、腸集聚黏附性和腸出血性5種[1],可引起人畜共患病[2],包括腹瀉[3]、腦膜炎[4]、尿道感染[5]、食物中毒[6]等;由其導(dǎo)致的奶牛乳房炎發(fā)病率呈逐年上升趨勢,給奶制品生產(chǎn)及品質(zhì)帶來重大影響[7–8]。大腸埃希菌外膜蛋白酶 T(outer membrane protease T, OmpT)位于細(xì)菌外膜,是大腸埃希菌的主要毒力相關(guān)因子之一[9],可提高細(xì)菌抵抗宿主免疫系統(tǒng)的能力[10–11],也是細(xì)菌進(jìn)入中樞神經(jīng)的黏附因子[4],并介導(dǎo)細(xì)菌在尿路上皮細(xì)胞的定植[12]。此外,OmpT具有很高的免疫原性,能有效提高小鼠對致病性大腸埃希菌的免疫抵抗能力[13],所以,OmpT有望成為候選的蛋白亞單位疫苗。本研究中利用分子克隆方法獲得大腸埃希菌OmpT蛋白表達(dá)菌株;純化OmpT蛋白,免疫小鼠,制備小鼠OmpT抗血清;通過正交試驗確定OmpT適宜的表達(dá)條件與培養(yǎng)條件,旨在為OmpT工業(yè)發(fā)酵與疫苗開發(fā)提供參考。
1.1.1 菌株與質(zhì)粒
E. coli K12菌株、E. coli DH5a菌株、E. coli BL21菌株和pET–32a質(zhì)粒均由陜西理工學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)實驗室保存。
1.1.2 主要試劑
DNA聚合酶、連接酶及內(nèi)切酶購于大連寶生生物工程公司;質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒均購于上海生物工程有限公司;IPTG購于BBI公司;二抗購于Sigma公司,基因測序在北京奧科鼎盛生物科技有限公司進(jìn)行。引物由北京奧科鼎盛生物科技有限公司合成。其他試劑均為國產(chǎn),分析純。
1.2.1 重組載體的構(gòu)建
依據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫公布的E. coli K12的全基因組序列設(shè)計 ompT 基因引物。引物序列為Sense和Anti– sense Primer(5′–gctctcgagttaaaatgtgtactta ag–3′)(下劃線分別表示限制性內(nèi)切酶的位點BamHⅠ和Xho Ⅰ)。PCR反應(yīng)體系(25 μL):PCR緩沖液2.5 μL,10 mmol/L dNTP 2 μL,25 μmol/L引物各1 μL,模板DNA 10 μL,Taq 酶0.2 μL,補水至25 μL。PCR循環(huán)參數(shù):94℃預(yù)變性3min,然后進(jìn)行30個循環(huán)(94℃變性45 s,55℃退火45 s,72℃延伸90 s),最后72℃充分延伸10min,4℃保溫。用PCR產(chǎn)物和pET–32a質(zhì)粒載體進(jìn)行雙酶切,用連接酶連接后轉(zhuǎn)化E. coli DH5a,并對重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切和測序鑒定,最后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E. coli BL21表達(dá)菌株,進(jìn)行OmpT表達(dá)[14]檢測。
1.2.2 重組蛋白的表達(dá)檢測與純化
選取經(jīng)鑒定后的重組菌接入LB(Amp)液體培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),以1∶100轉(zhuǎn)接到新鮮LB培養(yǎng)基中,待OD600nm約為0.5時,加入終濃度0.5 mmol/L 的IPTG,37℃誘導(dǎo)5 h,收集菌體,用蛋白電泳檢測OmpT表達(dá)情況。利用SDS–PAGE電泳方法[15]對OmpT進(jìn)行蛋白純化。
1.2.3 小鼠多克隆抗體制備
將每只昆明鼠免疫OmpT蛋白50μg,第1次采用弗氏完全佐劑,免疫14 d后進(jìn)行第2次免疫,第2次免疫7 d后,進(jìn)行第3次免疫。第3次免疫7 d后于小鼠眼部取血,將血清置于4℃冰箱中過夜析出,離心取上清,–80℃冰箱中保存?zhèn)溆肹15]。
1.2.4 蛋白抗體的效價與特異性檢測
用ELISA法檢測抗血清效價,主要步驟為:將OmpT蛋白溶解至0.05μg/μL,在對應(yīng)的96孔板中加入100 μL抗原,37℃孵育3 h;倒空液體,清洗3次,加入300 μL封閉液,37℃孵育2 h,加100 μL不同稀釋度小鼠抗血清(每種稀釋度均有3個重復(fù)),37℃孵育30min;充分洗滌后加入100 μL二抗(1∶3 000稀釋),37℃孵育30min;充分洗滌后,每孔加入50 μL底物A與50 μL底物B的混合液,37℃避光顯色10min,迅速加入終止液,酶標(biāo)儀[16]450 nm讀數(shù)。
采用Western blotting方法檢測OmpT小鼠抗血清特異性[17],主要步驟為:將大腸埃希菌過夜培養(yǎng),收集菌體,SDS–PAGE蛋白電泳,轉(zhuǎn)NC膜,加入不同稀釋度的小鼠抗血清(對照加入陰性抗血清),洗滌后,加入二抗(1∶3 000稀釋)孵育,洗滌后DAB顯色。
1.2.5 OmpT 蛋白氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹
利用NCBI數(shù)據(jù)庫中已公布的細(xì)菌OmpT氨基酸序列,通過 MEGA5.02 軟件進(jìn)行聚類分析,并采用Neighbour–Joining 方法[14]構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。
1.2.6 重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化
選用L9(34)正交試驗確定蛋白誘導(dǎo)表達(dá)的適宜條件。正交試驗分為培養(yǎng)條件與蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件兩部分[18],試驗的因子與水平見表1和表2。
表1 表達(dá)菌株培養(yǎng)條件正交試驗的因子與水平 Table 1 Factors and levels of orthogonal experiment for cultural condition of strain expression
表2 蛋白誘導(dǎo)條件正交試驗的因子與水平 Table 2 Factors and levels of orthogonal experiment for protein induced condition
OmpT表達(dá)菌株培養(yǎng)條件優(yōu)化的正交試驗:將重組菌株置于LB(Amp)液體培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),以1∶100(體積)轉(zhuǎn)接入新鮮培養(yǎng)基,按照正交試驗?zāi)P鸵笈囵B(yǎng),并記錄所得菌液的OD600nm。
OmpT表達(dá)菌株誘導(dǎo)條件優(yōu)化的正交試驗:根據(jù)表達(dá)菌適宜培養(yǎng)條件試驗結(jié)果,依照正交試驗?zāi)P鸵蟮牟煌瑮l件培養(yǎng)至合適OD600nm,加入不同終濃度的IPTG誘導(dǎo)相應(yīng)時間。分別吸取1mL菌液離心,將沉淀加入200 μL的2×SDS 上樣緩沖液中,沸水煮樣,并上樣10 μL 進(jìn)行SDS–PAGE電泳。使用Phoretix 1D軟件對獲得的蛋白電泳條帶進(jìn)行光密度分析。
圖1 大腸埃希菌ompT基因的PCR擴增電泳結(jié)果 Fig.1 PCR amplification electrophoresis of E. Tgene
從大腸埃希菌基因組中PCR擴增到約1 000 bp的片段,片段大小與預(yù)期大小一致(圖1)。將由PCR 擴增得到的目的基因與pET–32a質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,通過連接酶連接轉(zhuǎn)化DH5a菌株,提取重組質(zhì)粒,雙酶切,獲得約1 000 bp的片段,片段大小與預(yù)測大小一致(圖2)?;驕y序結(jié)果表明,構(gòu)建的ompT基因的序列與NCBI公布的序列相同,證明重組質(zhì)??寺〕晒?。
圖2 重組質(zhì)粒的雙酶切結(jié)果 Fig.2 Results of recombinant plasmid digested by restriction enzyme
為檢測重組蛋白的表達(dá)情況,將重組菌株經(jīng)IPTG誘導(dǎo),蛋白電泳獲得相對分子質(zhì)量約56 000的蛋白條帶,其中包含約35 000的OmpT蛋白和20 400 的融合蛋白標(biāo)簽,其大小與預(yù)期大小一致;采用SDS–PAGE蛋白電泳切膠純化獲得的OmpT蛋白如圖3所示。
圖3 OmpT蛋白的表達(dá)與純化電泳圖譜 Fig. 3 Expression and purification electrophoresis of OmpT protein
對獲得的小鼠OmpT抗血清采用ELISA法檢測,發(fā)現(xiàn)其抗體效價可以達(dá)到1∶1 600(圖4)。Western blotting方法的分析結(jié)果表明,不同稀釋度OmpT抗血清出現(xiàn)明顯條帶,而對照無對應(yīng)條帶(圖5),表明OmpT抗血清可與OmpT蛋白特異性結(jié)合,OmpT蛋白小鼠多克隆抗體被成功制備。
圖4 OmpT 多克隆抗體效價的測定結(jié)果 Fig.4 Polyclonal antibody titer of the OmpT
圖5 OmpT 多克隆抗體特異性的Western blotting 檢測結(jié)果 Fig.5 Specificity of OmpT polyclonal antibody identification using Western blotting
由圖6可見,不同種大腸埃希菌有聚在一起的趨勢,間接說明OmpT蛋白在不同種大腸埃希菌間具有同源性,可能存在交叉的免疫保護(hù)作用。
圖6 OmpT 氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹 Fig.6 Phylogenetic tree from OmpT amino acid sequences
2.5.1 菌株最適培養(yǎng)條件的正交試驗結(jié)果
由正交試驗結(jié)果(表3)的極差值(表4)可以看出,各因子對表達(dá)菌株生長的影響從大到小依次為培養(yǎng)基裝液量、葡萄糖濃度、轉(zhuǎn)速。由極差分析獲得的表達(dá)菌培養(yǎng)的最優(yōu)組合為a1b3c1(葡萄糖濃度為0,轉(zhuǎn)速為230 r/min,培養(yǎng)基裝液量為50mL)。表5方差分析結(jié)果顯示,葡萄糖濃度、轉(zhuǎn)速及裝液量對表達(dá)菌株培養(yǎng)的影響達(dá)到顯著水平。
表3 表達(dá)菌株的培養(yǎng)結(jié)果 Table 3 Results of the cultural experiment for strain expression
表4 表達(dá)菌株培養(yǎng)條件的極差分析結(jié)果 Table 4 Range results of cultural condition for strain expression
表5 表達(dá)菌株不同培養(yǎng)條件下OD600 nm 的方差分析結(jié)果 Table 5 Variance analysis of cultural condition for strain expression
2.5.2 OmpT 蛋白適宜誘導(dǎo)表達(dá)條件的正交試驗結(jié)果
將正交試驗獲得的表達(dá)菌株進(jìn)行SDS–PAGE電泳(圖7),用Phoretix 1D軟件分析電泳條帶圖譜,獲得蛋白條帶的光密度值如表6所示。由表7中的極差分析結(jié)果可知,各因子對OmpT蛋白誘導(dǎo)表達(dá)的影響從大到小依次為誘導(dǎo)溫度、IPTG誘導(dǎo)時菌體OD600nm、IPTG誘導(dǎo)終濃度、誘導(dǎo)時間。由極差分析獲得最適宜OmpT蛋白表達(dá)的組合為e3f2g2h2(加IPTG誘導(dǎo)菌液的OD600nm為1.0,IPTG終濃度為0.3 mmol/L,誘導(dǎo)時間為8 h,誘導(dǎo)溫度為32℃)。表8中的方差分析結(jié)果顯示,加IPTG菌液濃度、IPTG誘導(dǎo)濃度及誘導(dǎo)溫度3個因子對OmpT蛋白表達(dá)的影響達(dá)到顯著水平。
圖7 正交試驗獲得的OmpT 表達(dá)菌株SDS–PAGE 電泳圖譜 Fig.7 SDS–PAGE electrophoresis of OmpT strain expression from orthogonal experiment
s表6 OmpT 蛋白表達(dá)各試驗的光密度值 Table 6 Value of optical density from different expression experiments of OmpT protein
表7 OmpT 蛋白表達(dá)各試驗光密度值的極差分析結(jié)果 Table 7 Range analysis on the value of optical density from different expression experiments of OmpT protein
表8 OmpT 蛋白表達(dá)各因子光密度值的方差分析結(jié)果 Table 8 Variance analysis on the value of optical density from different expression experiments of OmpT protein
大腸埃希菌是導(dǎo)致奶牛乳房炎疾病的主要細(xì)菌之一,給奶制品業(yè)帶來的損失巨大[7–8]。OmpT蛋白是大腸埃希菌主要的外膜蛋白之一,具有顯著的免疫保護(hù)作用[13],有望制備成奶牛乳房炎疾病的候選蛋白疫苗。本研究中構(gòu)建大腸埃希菌OmpT表達(dá)菌株,獲得純化的OmpT蛋白,免疫小鼠制備了特異性較好的OmpT多克隆抗體,為OmpT功能研究奠定基礎(chǔ)。此外,本研究發(fā)現(xiàn)OmpT氨基酸序列在不同種類大腸埃希菌間具有同源性,可能為不同種類的大腸埃希菌感染提供交叉免疫保護(hù)作用。
本試驗結(jié)果表明:未誘導(dǎo)時,菌體適宜培養(yǎng)條件為葡萄糖濃度0 %,轉(zhuǎn)速230 r/min,裝液量50mL。有研究發(fā)現(xiàn)充足的氧氣以及合適的轉(zhuǎn)速有利于菌體的生長[19]。這與本實驗證實提高培養(yǎng)基轉(zhuǎn)速,減少裝液量,可增加細(xì)菌對氧氣、營養(yǎng)的充分吸收結(jié)果一致。在菌株IPTG誘導(dǎo)后,適宜OmpT蛋白誘導(dǎo)條件為:誘導(dǎo)時IPTG菌液OD600nm為1.0,IPTG終濃度0.3 mmol/L,誘導(dǎo)時間8 h,誘導(dǎo)溫度32℃。IPTG是β–半乳糖苷酶的活性誘導(dǎo)物質(zhì),高濃度的IPTG具有一定的細(xì)胞毒性,抑制蛋白的表達(dá)[20–21]。本試驗結(jié)果進(jìn)一步證實低濃度IPTG(0.3 mmol/L)有利于蛋白的表達(dá)。
[1] Rosano G L,Ceccarelli E A.Recombinant protein expression in Escherichia coli : Advances and challenges[J].Fronties in Microbiology,2014,5:172.
[2] Hussein A H,Ghanem I A,Eid A A,et al.Molecular and phenotypic characterization of Escherichia coli isolated from broiler chicken flocks in Egypt[J].Avian Dis Avian,2013,57(3):602–611.
[3] Premjani V , Tilley D , Gruenheid S , et al. Enterohemorrhagic Escherichia coli OmpT regulates outer memb biogenesis[J].FEMS Microbiol Lett,2014,355(2):185–192.
[4] Wan L,Guo Y,Hui C Y,et al.The surface protease ompT serves as Escherichia coli K1 adhesin in binding to human brain micro vascular endothelial cells[J].Pak J Pharm Sci, 2014,27(3):617–624.
[5] Obaid J M,Mansour S R,Elshahedy M S,et al. Uropathogenic Escherichia coli isolates with different virulencegenes content exhibit similar pathologic influence on Vero cells[J].Pol J Microbiol,2014,63(1):43–49.
[6] Rawa S V,Sarreal C Z,Mandrell R E. Strain differences in fitness of Escherichia coli O157:H7 to resist protozoan predation and survival in soil[J]. PloS One,2014,9(7):e102412.
[7] 余婷,安慧慧,吳聰明,等.奶牛乳房炎分離大腸桿菌的耐藥性及脈沖場凝膠電泳分型研究[J].中國獸醫(yī)雜志,2013,49(9):6–11.
[8] 徐繼英,劉俊林,李先波,等.我國部分地區(qū)奶牛乳房炎源大腸桿菌生物學(xué)特性及耐藥性分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報,2012,20(9):1035–1041.
[9] 惠長野,郭研,吳書馳,等.大腸桿菌 K1 致病株外膜蛋白 T 體外功能[J].微生物學(xué)報,2010,50(1):48–53.
[10] Hui C Y,Guo Y,He Q S,et al.Escherichia coli outer membrane protease OmpT confers resistance to urinary cationicpeptides[J] . Microbiol Immunol ,2010,54(8):452–459.
[11] Koprivnjak T , Peschel A . Bacterial resistance mechanismanginst host defense peptides[J].Cell Mol Life Sci,2011,68(13):243–2254.
[12] Premjani V , Tilley D , Gruenheid S , et al. Enterohemorrhagic Escherichia coli OmpT regulates outer membrane vesicle biogenesis[J].FEMS Microbiol Lett,2014,355(2):185–192.
[13] 佟春玉,李潤婷,呼瑞,等.重組大腸桿菌外膜蛋白OmpT 對小鼠免疫保護(hù)作用的研究[J].中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報,2013,35(8):658–662.
[14] 劉祥.福氏志賀菌2型外膜蛋白A的原核表達(dá)及多克隆抗體的制備[J].動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2015,36(5):6–10.
[15] 陳春琳,劉祥,王成富,等.重組銅綠假單胞菌外膜蛋白 OprI 的原核表達(dá)及多克隆抗體制備[J].生物技術(shù),2015,25(1):23–27.
[16] 劉祥,陳春琳,王揚科,等. 小鼠骨橋蛋白的原核表達(dá)及多克隆抗體的制備與鑒定[J].中國蓄牧獸醫(yī),2015,42(5):1069–1075.
[17] 劉祥,陳春琳,牟歡,等.重組人骨硬化蛋白的表達(dá)、純化及多克隆抗體制備[J].生物技術(shù),2014,24(6):68–72.
[18] 劉祥.溶藻弧菌附著定植因子ACFA 原核載體構(gòu)建、表達(dá)條件優(yōu)化及多克隆抗體制備[J].華北農(nóng)學(xué)報,2015,30(1):35–41.
[19] Xua M , Suna Q , Sua J , et al . Microbial transformation ofgeniposide in Gardenia jasminoides Ellis intogenipin by Penicillium nigricans[J].Enzyme and Microbial Technology,2008,42(5):440–444.
[20] Yildirim N,Mackey M C.Feedback regulation in the lactose operon:A mathematical modeling study and comparison with experimental data[J] . Biophysical Journal,2003,84(5):2841–2851.
[21] 劉祥.銅綠假單胞菌外膜蛋白 F 原核載體構(gòu)建、表達(dá)條件優(yōu)化及免疫保護(hù)作用研究[J].中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志,2015,25(11):12–16.