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    香蕉MaPIP2-6基因的克隆、亞細(xì)胞定位及表達(dá)分析

    2015-07-04 11:14:44侯曉婉徐碧玉金志強(qiáng)
    西北植物學(xué)報 2015年3期

    侯曉婉,胡 偉,顏 彥,徐碧玉,金志強(qiáng)*

    (1 海南大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,海口570228;2 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所,農(nóng)業(yè)部熱帶作物生物學(xué)與遺傳資源利用重點(diǎn)實驗室,???71101)

    香蕉是熱帶和亞熱帶發(fā)展中國家最重要的作物之一,具有很高的營養(yǎng)、經(jīng)濟(jì)和藥用價值,被聯(lián)合國糧農(nóng)組織列為世界第四大糧食作物。因其特有的淺根和需要大量水份維持的永久性綠色樹冠,香蕉對任何條件引起的水份缺失異常敏感[1]。很多非生物脅迫,如低溫、干旱、鹽害均可能導(dǎo)致細(xì)胞脫水,因此研究香蕉如何響應(yīng)非生物脅迫的危害顯得尤為重要。

    水是任何生命細(xì)胞最重要的組成成分,是所有有機(jī)體中的主要溶劑。水在植物體不同組織之間通過質(zhì)外體和共質(zhì)體途徑完成運(yùn)輸[2]。質(zhì)外體途徑運(yùn)輸主要是通過環(huán)境因素,如土壤、植物、大氣之間水電位的變化實現(xiàn)的[3];而共質(zhì)體途徑運(yùn)輸則主要是通過水通道蛋白(aquaporin,AQP)亞家族實現(xiàn)的[4]。AQP通過增加膜的滲透性有效地促進(jìn)了高等植物體內(nèi)水分子在膜之間的運(yùn)輸,調(diào)節(jié)著種子的萌發(fā)、細(xì)胞伸長、氣孔的開閉和韌皮部的裝載和卸載、生殖生長和植物的脅迫響應(yīng)[5-6]。

    在植物中,AQP 屬于膜內(nèi)嵌蛋白(a class of major intrinsic proteins,MIP)的一個大的亞家族,被劃分為4個分支,分別為質(zhì)膜內(nèi)嵌蛋白(the plasma membrane intrinsic proteins,PIPs)、液泡膜內(nèi)嵌蛋白(the tonoplast intrinsic proteins,TIPs)、小堿性膜內(nèi)嵌蛋白(the recently characterized small basic intrinsic proteins,SIPs)和 類nodulin 26膜內(nèi)嵌蛋白(the NOD-26-like intrinsic proteins,NIPs)[7-9]。所 有4 個分支均有高度保守的結(jié)構(gòu)域——6個跨膜α螺旋被連接在N 端和C 端總是朝向細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)的5個短環(huán)上[2]。在水份選擇通道形成中起重要作用的保守天冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸元件存在于其中兩個短環(huán)上[10]。在水稻、擬南芥等物種中已證明AQP 家族基因能在轉(zhuǎn)錄水平受逆境脅迫誘導(dǎo),在植物對逆境脅迫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用[11-12],但在香蕉中AQP家族基因的研究還非常有限。

    本研究從香蕉中克隆出一個MaPIP2-6基因,并對其在逆境脅迫及ABA 處理下的表達(dá)模式作研究,為進(jìn)一步研究MaPIP2-6基因功能奠定基礎(chǔ)。

    1 材料和方法

    1.1 材 料

    生長正常的巴西蕉(MusaAAA Cavendish cv.Brazilian)和粉蕉(MusaABB Pisang Awak)的五葉一心期幼苗,取自中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院儋州組培中心。

    1.2 目的基因的獲得

    從香蕉A 基因組測序數(shù)據(jù)庫中得到一個AQP家族基因(GSMUA_Achr1T02360),根據(jù)ORF 序列設(shè)計1 對引物MaPIP2-6F1 和MaPIP2-6R1(表1),擴(kuò)增MaPIP2-6cDNA 全長序列。PCR 擴(kuò)增程序為:95℃預(yù)變性5s;94℃變性40s;55℃退火40 s;72℃延伸1min 30s;共35個循環(huán)。按照分子克隆實驗指南進(jìn)行PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物回收、連接、轉(zhuǎn)化,挑取單克隆在LB 液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)并進(jìn)行PCR 鑒定[13]。對已鑒定的陽性克隆進(jìn)行測序分析。

    1.3 生物信息學(xué)分析

    在NCBI中利用BLASTX 進(jìn)行序列同源性分析,從中選取相似性較高的同源序列用DNAMAN軟件進(jìn)行氨基酸序列的多重比對,利用MEGA 5.0軟件對水稻AQP基因家族和克隆出的MaPIP2-6基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

    1.4 MaPIP2-6亞細(xì)胞定位分析

    1.4.1 瞬時表達(dá)載體構(gòu)建 根據(jù)目的基因MaPIP2-6序列設(shè)計帶有NcolⅠ/SpeⅠ酶切位點(diǎn)且不含終止子的引物MaPIP2-6F2和MaPIP2-6R2(表1)。以正常生長的巴西蕉幼苗葉片cDNA 為模版進(jìn)行擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物回收后連接到克隆載體pMD18-T(Takara公司)上,獲得重組質(zhì)粒,陽性克隆測序正確后,用NcolⅠ/SpeⅠ進(jìn)行雙酶切并回收目的片段。同時,利用NcolⅠ/SpeⅠ雙酶切并回收的pCAMBIA1302 載體大片段。利用購自BioLab試劑公司的T4連接酶將目的片段和載體片段進(jìn)行連接,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α(天根生化科技有限公司)感受態(tài)細(xì)胞后,挑取單克隆擴(kuò)大培養(yǎng),經(jīng)PCR 和質(zhì)粒雙酶切驗證后,進(jìn)行測序分析,構(gòu)建成植物表達(dá)載體pCAMBIA1302-MaPIP2-6-GFP。將測序正確的陽性克隆的質(zhì)粒以及pCAMBIA1302空載體質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌LBA4404中。

    1.4.2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的亞細(xì)胞定位 利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的瞬時轉(zhuǎn)化法將pCAMBIA1302-MaPIP2-6-GFP和空載體(pCAMBIA1302-GFP)導(dǎo)入洋蔥表皮細(xì)胞中[14]。隨后將洋蔥表皮放在鋪有濾紙的MS培養(yǎng)基上,25℃暗培養(yǎng)16~24h,然后制作裝片,通過FluoViewTMFV1000激光掃描共聚焦顯微鏡觀察熒光信號。

    表1 PCR 擴(kuò)增所用引物及其序列Table 1 Primers and sequences required in PCR amplification

    1.5 基因的表達(dá)分析

    將生長一致的五葉一心期的巴西蕉和粉蕉幼苗分別分成4組。第1組將300 mmol/L 甘露醇(上海生工生物工程有限公司)持續(xù)澆在放置香蕉幼苗的托盤中,處理7、10、15、17d;第2組將300mmol/L NaCl持續(xù)澆在放置香蕉幼苗的托盤中,處理8、12、24、32d;第3組將香蕉幼苗放置在8℃的低溫培養(yǎng)箱中,持續(xù)往托盤中澆清水,冷害下處理10、22、47h,之后將處理47h的幼苗置于人工氣候培養(yǎng)箱中恢復(fù)1周;第4組用100μmol/L ABA 噴灑香蕉幼苗,處理2、6、12、24h。參照淦國英改良的CTAB 法[15]提取每個處理時間點(diǎn)的香蕉葉片RNA,用自帶DNA 消化酶的cDNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Takara公司)反轉(zhuǎn)成cDNA。以反轉(zhuǎn)錄的cDNA第一鏈為模板,用TaKaRa 公司的實時熒光定量PCR 試劑盒中的SYBR Green、ROX 染料進(jìn)行實時熒光定量PCR 擴(kuò)增,反應(yīng)在吉泰生物科技有限公司Mx3005P熒光定量PCR 儀上進(jìn)行。以香蕉RPS2基因為內(nèi)參,定量方法為2-ΔΔCt法[16]。設(shè)計引物參考TaKaRa實時熒光定量標(biāo)準(zhǔn)說明書。為了保證引物的特異性,在非翻譯區(qū)設(shè)計引物MaPIP2-6F3/MaPIP2-6R3及MuRPS2F/MuRPS2R(表1),PCR產(chǎn)物的長度維持在300bp 以內(nèi),并進(jìn)行了測序分析。引物交由上海生工生物工程有限公司合成。熒光定量PCR 的反應(yīng)程序如下:95℃預(yù)變性3min;95℃變性10s,50℃退火15s,72℃延伸30s,循環(huán)40次。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 MaPIP 2-6的克隆及序列分析

    圖1 MaPIP2-6與水稻AQP家族成員的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig.1 Phylogenetic tree of MaPIP2-6 and AQP proteins from rice

    以正常生長的巴西蕉幼苗葉片cDNA 為模版、MaPIP2-6F1和MaPIP2-6R1為引物,從香蕉栽培品種巴西蕉中克隆到一個AQP 家族基因,其ORF為849bp,編碼282個氨基酸。從GENBANK 中選擇水稻的全部33 個AQP 家族成員及獲得的香蕉AQP基因推測的氨基酸序列,利用MEGA 5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1),結(jié)果表明本研究得到的香蕉AQP基因所編碼的氨基酸序列與OsPIP2-6具有較近的親緣關(guān)系,故將該基因命名為MaPIP2-6。BLASTX 分析表明,MaPIP2-6 編碼的氨基酸序列與姜花HcPIP2(AEF32110.1)、野生稻Ob-PIP2-6(XP_006664814.1)、海棗PdPIP2-6(XP_008809438.1)編碼的氨基酸序列具有較高的一致性,分別為93%、89%和87%(圖2)。多序列比對分析表明,MaPIP2-6編碼的蛋白具有PIP 亞家族蛋白的基本特征,其氨基酸序列同樣有6個保守的跨膜螺旋,5 個短環(huán),一個高度保守的氨基酸序列‘HINPAVTFG’和2 個‘NPA’元件。另外,在MaPIP2-6中也觀察到了所有PIP 成員中共有的保守序列(R/K)DYX(E/D)PP(P/R)X3-4(E/D)XXELXXWSF(Y/W)R。這些結(jié)果表明獲得的MaPIP2-6為香蕉PIP亞家族的成員(圖2)。

    2.2 MaPIP2-6蛋白的亞細(xì)胞定位分析

    以構(gòu)建的MaPIP2-6 基因的植物表達(dá)載體pCAMBIA1302-MaPIP2-6-GFP,利用農(nóng)桿菌介 導(dǎo)的瞬時轉(zhuǎn)化法將其和空載體(pCAMBIA1302-GFP)導(dǎo)入洋蔥表皮細(xì)胞中,對MaPIP2-6蛋白在植物亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的分布進(jìn)行研究,25℃暗培養(yǎng)16~24h后,在激光共聚焦顯微鏡下觀察綠色熒光蛋白信號在細(xì)胞內(nèi)的分布,結(jié)果顯示35S:GFP綠色熒光蛋白在洋蔥表皮細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和細(xì)胞膜上均有表達(dá)(圖3,A),而35S:MaPIP2-6-GFP僅在洋蔥表皮細(xì)胞的細(xì)胞膜上表達(dá)(圖3,B),表明MaPIP2-6蛋白定位在細(xì)胞膜上。

    2.3 MaPIP 2-6基因在非生物逆境脅迫及ABA 處理下的表達(dá)分析

    利用實時定量PCR 的方法對MaPIP2-6基因在甘露醇、低溫、NaCl、ABA 處理下表達(dá)模式的分析結(jié)果表明,在甘露醇處理下,與對照相比,巴西蕉中MaPIP2-6基因的表達(dá)在處理7d被抑制,處理7~15d呈逐漸上升趨勢,隨后在處理17d后下降;粉蕉中MaPIP2-6 基因的表達(dá)趨勢與在巴西蕉中相似,但是在0、10、15、17d處理時間點(diǎn)的表達(dá)量都高于巴西蕉(圖4,A)。在低溫處理下,巴西蕉中MaPIP2-6基因的表達(dá)與對照相比在處理10h、22 h和恢復(fù)5d沒有明顯變化,處理47h顯著降低;粉蕉中MaPIP2-6基因的表達(dá)與對照相比在處理10 h、22h和恢復(fù)5d明顯降低,但在處理47h沒有明顯變化(圖4,B)。在NaCl 處理下,巴西蕉中,MaPIP2-6基因的表達(dá)在處理8d顯著降低,處理12d升高,隨后在處理24d下降;粉蕉中MaPIP2-6基因的表達(dá)趨勢與在巴西蕉中相似,但是在每個處理時間點(diǎn)的表達(dá)量都低于巴西蕉(圖4,C)。在ABA處理下,與對照相比,巴西蕉中,MaPIP2-6基;因的表達(dá)在處理2~12h 顯著被誘導(dǎo);粉蕉中,MaPIP2-6基因的表達(dá)在處理2~24h顯著被抑制(圖4,D)。

    圖3 MaPIP2-6亞細(xì)胞定位結(jié)果Fig.3 Subcellular localization of MaPIP2-6fused with GFP

    圖4 不同處理下MaPIP2-6基因的相對表達(dá)量Fig.4 Relative expression of MaPIP2-6after different treatments

    3 討 論

    近年來AQP 家族基因的功能已經(jīng)廣泛被報道,但是關(guān)于香蕉中AQP 家族基因的研究非常有限。本研究從香蕉中克隆了一個AQP 基因(MaPIP2-6),該基因編碼的氨基酸序列具有AQP家族蛋白的基本特征,與其它物種中AQP 家族成員具有較高的一致性,與水稻OsPIP2-6具有較近的進(jìn)化關(guān)系。亞細(xì)胞定位分析表明,MaPIP2-6編碼蛋白定位于細(xì)胞膜上,與MaPIP1;1和TaAQP7等AQP基因編碼蛋白的細(xì)胞定位結(jié)果一致[17-18],進(jìn)一步說明了MaPIP2-6具有PIP蛋白的特征。因此,可以推測本研究所克隆的基因是AQP 家族中PIP2亞類中的一個成員。

    大量的研究表明AQP家族基因能夠調(diào)節(jié)植物體內(nèi)水分的平衡,在植物對逆境脅迫的應(yīng)答中發(fā)揮著重要作用。在煙草中過表達(dá)的TaAQP7、Ta-AQP8增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株對干旱、高鹽和低溫脅迫的耐受性[18-21]。在擬南芥中過表達(dá)的TaNIP和杜鵑花的AQP增強(qiáng)了植株高鹽和低溫的耐受性[20-22]。而且,這些基因都能在轉(zhuǎn)錄水平受相關(guān)非生物逆境脅迫誘導(dǎo)。因此,本研究運(yùn)用實時熒光定量PCR 的方法研究了香蕉MaPIP2-6基因在轉(zhuǎn)錄水平對甘露醇、低溫、高鹽和ABA 的應(yīng)答。結(jié)果表明,在甘露醇和高鹽脅迫處理下,巴西蕉和粉蕉的表達(dá)趨勢基本一致,在處理早期輕微下降,隨后被誘導(dǎo)并達(dá)到最大值,然后下降。這一結(jié)果表明,該基因在響應(yīng)滲透脅迫的過程中,可能在早期出現(xiàn)了一個‘Shock’,隨后呈現(xiàn)出被誘導(dǎo)的趨勢。這一誘導(dǎo)的趨勢 與Lei等[23]報 道OsPIP1-1 和OsPIP2-5 在PEG-6000脅迫下的表達(dá)趨勢一致,而且OsPIP1-1在轉(zhuǎn)基因擬南芥中的過表達(dá)增強(qiáng)了其對鹽和干旱的耐受性。

    在低溫處理下,粉蕉中MaPIP2-6基因的表達(dá)量在處理前期下降,但之后又增加,在處理47h增加到接近0h處理的表達(dá)量。這一表達(dá)趨勢與Gao等報道TaNIP在低溫脅迫下的表達(dá)趨勢一致[20]。巴西蕉中MaPIP2-6基因的表達(dá)在處理47h達(dá)到最小值,在處理的其它時間點(diǎn)沒有顯著變化。因此,巴西蕉和粉蕉中MaPIP2-6的表達(dá)趨勢相反,說明該基因在巴西蕉和粉蕉中的作用方式可能不同。在擬南芥中,低溫脅迫能夠誘導(dǎo)AtPIP2;5 和At-PIP2;6 基因表達(dá),但是卻抑制了AtPIP1;1,At-PIP1;2,AtPIP1;5,AtPIP2;2,AtPIP2;3,At-PIP2;4和AtPIP2;7 基因的表達(dá)[24]。因此,AQP家族成員對低溫脅迫的響應(yīng)表現(xiàn)出不同的模式。而且,在非生物逆境脅迫下,相同的AQP基因在不同品種中也具有不同的表達(dá)模式和不同的功能。因此,MaPIP2-6在巴西蕉和粉蕉中的抗逆功能仍有待于進(jìn)一步研究。

    在ABA 處理下,與處理0h對照相比較,巴西蕉和粉蕉中MaPIP2-6 的表達(dá)趨勢完全相反,MaPIP2-6在巴西蕉中顯著被誘導(dǎo),在粉蕉中則顯著被抑制。巴西蕉中MaPIP2-6的表達(dá)趨勢與Lei研究的水稻在ABA 處理后葉片中OsPIP1-1、Os-PIP1-2、OsPIP2-1、OsPIP2-3、OsPIP2-4 和Os-PIP2-5的表達(dá)趨勢一致[23]。粉蕉中MaPIP2-6的表達(dá)趨勢與Lei研究的水稻在ABA 處理后根中OsPIP1-1、OsPIP1-3、OsPIP2-2、OsPIP2-3、Os-PIP2-4和OsPIP2-5的表達(dá)趨勢一致[23]。這些結(jié)果表明,MaPIP2-6 在巴西蕉和粉蕉中對ABA 的響應(yīng)方式不同。

    綜上所述,本研究克隆到的MaPIP2-6基因是AQP家族PIP2亞類中的一個,具備PIP2亞家族蛋白的結(jié)構(gòu)特征。實時熒光定量PCR 實驗表明MaPIP2-6在轉(zhuǎn)錄水平響應(yīng)了甘露醇、低溫、NaCl和ABA 信號。這些結(jié)果表明MaPIP2-6能夠參與非生物逆境脅迫應(yīng)答,為進(jìn)一步研究MaPIP2-6基因的功能奠定了基礎(chǔ)。

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