全文檢索引擎技術(shù)在電子病歷中的應(yīng)用

趙景越++徐松青++蔡連忠

摘要：針對(duì)醫(yī)院臨床電子病歷數(shù)據(jù)大量積累無(wú)法快速、高效地服務(wù)于臨床醫(yī)療、醫(yī)學(xué)科研、以及病例管理的現(xiàn)象，提出研究更高效的電子病歷檢索方法，采用全文索引搜索引擎技術(shù)，以關(guān)鍵字為索引，把電子病歷統(tǒng)一轉(zhuǎn)換成XML形式，最后生成病歷檢索索引文件方式，建立電子病歷全文檢索系統(tǒng)。系統(tǒng)通過(guò)實(shí)際數(shù)據(jù)測(cè)試表明，該檢索方法準(zhǔn)確率較高、檢索速度快。

關(guān)鍵詞：電子病歷 全文檢索 XML

中圖分類號(hào)：R197.324 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：1007-9416（2014）12-0089-02

1 引言

隨著信息化技術(shù)的飛速發(fā)展，計(jì)算機(jī)技術(shù)越來(lái)越多地應(yīng)用到了醫(yī)療領(lǐng)域。近年來(lái)醫(yī)療行業(yè)大力加強(qiáng)信息化建設(shè)，建立和完善以電子病歷為核心的醫(yī)院信息系統(tǒng)。電子病歷作為臨床信息的載體以及醫(yī)院信息系統(tǒng)的核心構(gòu)成了醫(yī)療衛(wèi)生決策等系統(tǒng)的基礎(chǔ)。目前很多醫(yī)院患者電子病歷內(nèi)容存儲(chǔ)比較分散，例如醫(yī)囑、手術(shù)信息存儲(chǔ)在HIS里、檢驗(yàn)結(jié)果存儲(chǔ)在LIS系統(tǒng)，手麻等檢查報(bào)告存儲(chǔ)在相應(yīng)檢查系統(tǒng)中，如果要獲取患者全部病歷信息只能通過(guò)患者ID號(hào)來(lái)查詢，然后通過(guò)病歷的存儲(chǔ)規(guī)則來(lái)找到相應(yīng)的病歷，再通過(guò)顯示規(guī)則加以排列顯示。每次得到的信息都是分散的，而且存儲(chǔ)方式各不相同，存在于病歷文本中的大量非結(jié)構(gòu)化的信息也不能作為檢索條件，因而很多醫(yī)療數(shù)據(jù)不能為醫(yī)療工作者充分利用，大大降低臨床數(shù)據(jù)利用效率。因此，為了滿足醫(yī)生臨床診療需求、科研輔助需要，醫(yī)院電子病歷管理系統(tǒng)的現(xiàn)行檢索查詢處理方式問(wèn)題亟待解決。為此，我們提出了，將所有病歷文件統(tǒng)一轉(zhuǎn)換，統(tǒng)一識(shí)別，再采用以基于關(guān)鍵字的全文檢索引擎技術(shù)，建立電子病歷全文檢索系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)方便、快捷地為臨床醫(yī)療、醫(yī)學(xué)科研及病歷管理等方面工作提供服務(wù)。

2 全文檢索引擎簡(jiǎn)介

全文檢索是指計(jì)算機(jī)索引程序通過(guò)掃描文章中的每一個(gè)詞，并收集文章內(nèi)容到本地，對(duì)文章內(nèi)容及分詞建立索引，經(jīng)過(guò)加工處理建立信息數(shù)據(jù)庫(kù)和索引數(shù)據(jù)庫(kù)，指明該詞在文章中出現(xiàn)文章和次數(shù)，當(dāng)用戶查詢時(shí)，檢索程序就根據(jù)事先建立的索引進(jìn)行查找，并將查詢結(jié)果反饋給用戶的檢索方式，從而對(duì)用戶提出的各種檢索作出響應(yīng)，提供用戶所需的信息或相關(guān)指針。

3 電子病歷數(shù)據(jù)處理

目前由于醫(yī)院意識(shí)到電子病歷在醫(yī)院信息系統(tǒng)建設(shè)中的核心重要性，紛紛加強(qiáng)電子病歷信息化建設(shè)，實(shí)現(xiàn)病歷記錄貫穿于患者在醫(yī)院就診的各個(gè)環(huán)節(jié)中，實(shí)現(xiàn)以統(tǒng)一視圖方式展現(xiàn)患者臨床病歷信息。但由于國(guó)內(nèi)醫(yī)療信息化建設(shè)歷史原因，很多醫(yī)院病人電子病歷內(nèi)容存儲(chǔ)比較分散，例如醫(yī)囑、手術(shù)信息存儲(chǔ)在HIS里、檢驗(yàn)結(jié)果存儲(chǔ)在LIS系統(tǒng)，手麻等檢查報(bào)告存儲(chǔ)在相應(yīng)檢查系統(tǒng)中；為此有必要進(jìn)行統(tǒng)一整合，將分散在院內(nèi)各系統(tǒng)的電子病歷信息轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一形式的文件存儲(chǔ)于電子病歷庫(kù)中。

可擴(kuò)展標(biāo)記語(yǔ)言（eXtensible Markup Language，簡(jiǎn)稱XML）就是建立并實(shí)現(xiàn)該統(tǒng)一轉(zhuǎn)換模型的一個(gè)有效手段。XML是一種置標(biāo)語(yǔ)言，置標(biāo)指計(jì)算機(jī)所能理解的信息符號(hào)，通過(guò)此種標(biāo)記，計(jì)算機(jī)之間可以處理包含各種信息的文章等。它與HTML一樣，都是SGML（標(biāo)準(zhǔn)通用標(biāo)記語(yǔ)言）。XML是互聯(lián)網(wǎng)環(huán)境中跨平臺(tái)的，依賴于內(nèi)容的技術(shù)，是當(dāng)前處理結(jié)構(gòu)化文檔信息的有力工具。XML同時(shí)也是一種簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)語(yǔ)言，使用一系列簡(jiǎn)單的標(biāo)記描述數(shù)據(jù)，而這些標(biāo)記可以用方便的方式建立。

為此將要先定義、規(guī)范病歷內(nèi)容的結(jié)構(gòu)，然后將臨床各系統(tǒng)中關(guān)于患者的病歷數(shù)據(jù)進(jìn)行抽取、整合、轉(zhuǎn)換成電子病歷架構(gòu)的符合格式，生成描述患者病歷的XML文件，作為患者病歷存儲(chǔ)檢索管理的基本單位。

4 系統(tǒng)設(shè)計(jì)（ 圖1）

系統(tǒng)將來(lái)自各系統(tǒng)（HIS、電子病歷、LIS等）的臨床科研數(shù)據(jù)進(jìn)行采集，并生成對(duì)應(yīng)的XML格式，再根據(jù)XML格式數(shù)據(jù)建立全文索引，形成全文索引庫(kù)；完成臨床科研數(shù)據(jù)積累；完成數(shù)據(jù)收集后，系統(tǒng)提供全文索引查詢功能，根據(jù)查詢結(jié)果，系統(tǒng)可以直接顯示該病歷文件詳細(xì)信息，還可以關(guān)聯(lián)顯示該患者對(duì)應(yīng)的病案，方便科研人員隨時(shí)調(diào)閱分析。

5 系統(tǒng)測(cè)試

5.1 服務(wù)器端軟件環(huán)境

服務(wù)器采用Sun公司的JDK 1.5.0版本，應(yīng)用容器采用開(kāi)源免費(fèi)JBOSS4.0.4版本。

服務(wù)器操作系統(tǒng)采用微軟的Windows Server 2008企業(yè)版。

服務(wù)器數(shù)據(jù)庫(kù)采用SQL Server 2008企業(yè)版及SQL JDBC驅(qū)動(dòng)。

客戶端支持通用瀏覽器，本案例測(cè)試中采用了IE8。

5.2 服務(wù)器端硬件環(huán)境

服務(wù)器采用的CPU為Inter Core2 Quad CPU Q8200 2.33GHz，內(nèi)存4GB，硬盤1TGB

5.3 測(cè)試結(jié)果

針對(duì)醫(yī)院測(cè)試庫(kù)中2萬(wàn)名患者，約120萬(wàn)份電子病歷文件，轉(zhuǎn)換生成XML文件，建立索引，形成全文索引庫(kù)，輸入條件“男”、“骨折”、“髖部”，如圖2：

系統(tǒng)在2秒左右時(shí)間搜索到滿足條件的文檔78761份，并按檢索條件關(guān)聯(lián)度進(jìn)行排序，以患者姓名、性別、年齡、病歷類別作為標(biāo)題，同時(shí)簡(jiǎn)略顯示關(guān)鍵詞在文件中位置并加以警示；單擊標(biāo)題便可以瀏覽病歷詳細(xì)信息。通過(guò)上述查詢測(cè)試可以看出，本系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)了電子病歷一體化，檢索定位準(zhǔn)確率高，達(dá)到了系統(tǒng)應(yīng)用的性能要求。

6 結(jié)語(yǔ)

根據(jù)以上測(cè)試結(jié)果可以看出系統(tǒng)性能出眾，滿足當(dāng)前設(shè)計(jì)要求；不僅能基于關(guān)鍵字快速檢索，大大提高病歷檢索速度，同時(shí)實(shí)現(xiàn)查詢結(jié)果與電子病歷無(wú)縫對(duì)接，直接通過(guò)滿足條件的查詢結(jié)果可以打開(kāi)病歷文件，瀏覽該患者病案內(nèi)容（護(hù)理文書、醫(yī)師病歷、檢查結(jié)果、檢驗(yàn)結(jié)果、醫(yī)囑等），大大提高臨床科研效率。

參考文獻(xiàn)

[1]基于語(yǔ)義的電子病歷智能全文檢索[J].醫(yī)療衛(wèi)生裝備，2008.