復(fù)制蛋白A是目前國(guó)內(nèi)外研究細(xì)胞 DNA損傷修復(fù)的熱點(diǎn)之一。RPA 是真核細(xì)胞中主要的單鏈結(jié)合蛋白,包含RPA1,RPA2和RPA3三個(gè)亞單位。RPA在 DNA復(fù)制和修復(fù)過(guò)程中起著重要的作用。DNA復(fù)制時(shí),RPA具有解鏈、結(jié)合單鏈模板并維持 DNA 連續(xù)復(fù)制的功能;DNA 損傷時(shí),RPA與具有染色體結(jié)構(gòu)維持、保護(hù)、修復(fù)功能的蛋白質(zhì)聚集在DNA損傷位點(diǎn),共同完成對(duì) DNA 損傷的檢測(cè)并進(jìn)行修復(fù)。因此RPA對(duì)于細(xì)胞調(diào)控DNA修復(fù)過(guò)程至關(guān)重要。目前肝癌的發(fā)生機(jī)制尚未完全闡明,但其發(fā)生與DNA的損傷積累密切相關(guān)。誘發(fā)肝癌的主要危險(xiǎn)因素包括乙型肝炎病毒,黃曲霉毒素B1,亞硝胺等,這些誘因不僅能夠引起肝細(xì)胞DNA的損傷,而且能直接或間接影響損傷修復(fù)系統(tǒng),使DNA修復(fù)障礙,從而導(dǎo)致肝癌的發(fā)生。本文就RPA在DNA損傷修復(fù)中起到的重要作用及其肝癌DNA損傷修復(fù)的關(guān)系作一綜述。
1復(fù)制蛋白A的結(jié)構(gòu)
復(fù)制蛋白A(replication protein A,RPA)是真核細(xì)胞單鏈DNA(single stranded DNA,ssDNA)結(jié)合蛋白,ssDNA是細(xì)胞中普遍存在且相對(duì)重要的物質(zhì),在ssDNA形成過(guò)程中RPA發(fā)揮重要作用。RPA共由70,34和14-kDa 3個(gè)亞單位組成,通常各自稱為RPA1,RPA2,RPA3。每個(gè)亞單位都含有至少一個(gè)DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA binding domain,DBD)。RPA1含有4個(gè)DBD結(jié)構(gòu)域,分別稱為,DBDA,DBDB,DBDC和DBDF。其中DBDA,DBDB的DNA結(jié)合活性最強(qiáng),DBDC與其他兩個(gè)亞單位形成復(fù)合物過(guò)程中起著非常重要的作用。兩個(gè)較小的亞單位RPA2和RPA3分別含有DBDD和DBDE,有較弱的DNA 結(jié)合活性。RPA1,RPA2含有磷酸化位點(diǎn),正常細(xì)胞周期中可被細(xì)胞周期蛋白與細(xì)胞周期依賴性蛋白激酶(cyclin and cycle dependent kinase,cyclin-CDK)磷酸化[1]。
2復(fù)制蛋白 A與DNA損傷及修復(fù)
DNA是機(jī)體生命活動(dòng)中最重要的遺傳物質(zhì),其結(jié)構(gòu)完整性和穩(wěn)定性的保持對(duì)于細(xì)胞的正常生理活動(dòng)具有重要意義。但是DNA面臨來(lái)自于生物體內(nèi)部和外部的侵襲,內(nèi)外各種因素的作用下可不斷出現(xiàn)DNA損傷。盡管如此,細(xì)胞仍能保持正常的生長(zhǎng)、分裂和繁殖,說(shuō)明基因組處于有效的監(jiān)控之下。生物體基因組完整性和穩(wěn)定性的維持依賴于體內(nèi)DNA修復(fù)系統(tǒng)。細(xì)胞通過(guò)周期阻滯修復(fù)DNA或者細(xì)胞凋亡對(duì)DNA損傷產(chǎn)生反應(yīng)。而如果細(xì)胞對(duì)DNA損傷異常反應(yīng)將導(dǎo)致疾病的發(fā)生,例如腫瘤。
2.1 DNA損傷修復(fù)DNA損傷修復(fù)是保持細(xì)胞基因組完整性的重要機(jī)制。DNA損傷修復(fù)是一個(gè)多因素、多步驟的復(fù)雜過(guò)程。針對(duì)不同形式的損傷其修復(fù)方式也大不相同,DNA修復(fù)方式主要有以下幾種:堿基切除修復(fù)(base excision repair,BER),主要負(fù)責(zé)切除或替換由內(nèi)源性化學(xué)物質(zhì)引起的堿基修飾或單鏈斷裂;核苷酸切除修復(fù)(nucleotide excision repair,NER),針對(duì)DNA鏈螺旋扭曲損傷、鏈內(nèi)交聯(lián)及某些形式的氧化損傷;錯(cuò)配修復(fù)(DNA mismatch repair,MMR),主要針對(duì)一些由DNA損傷試劑引起堿基錯(cuò)配以及在DNA復(fù)制和重組過(guò)程中單個(gè)堿基的錯(cuò)配和小的插入或缺失;雙鏈斷裂修復(fù)(double strand break,DSB repair),主要針對(duì)DNA雙鏈斷裂的修復(fù)。
2.2復(fù)制蛋白 A和核苷酸切除修復(fù)當(dāng)DNA出現(xiàn)損傷時(shí),RPA參與DNA損傷識(shí)別,RPA與著色性干皮病A蛋白(Xeroderma Pigmentosum GroupA,XPA)形成RPA-XPA復(fù)合物,此復(fù)合物與受損DNA的結(jié)合能力要強(qiáng)于RPA或者XPA,且此復(fù)合物與受損的DNA的結(jié)合能力要強(qiáng)于未受損的DNA[2]。他們招募通用轉(zhuǎn)錄因子 (transcription repair factor IIH,TFIIH)到達(dá)損傷部位。然后TFIIH的兩個(gè)亞基XPB和XPD打開(kāi)損傷的DNA,然后由DNA切除修復(fù)交叉互補(bǔ)基因和DNA修復(fù)基因F異二聚體(ERCCI/XPF)切除損傷DNA的5'端,DNA修復(fù)基因XPG切除3'端,去除包含損傷部位的寡核苷酸片段,隨后由DNA聚合酶填充于該間隙,合成新的DNA,最后由DNA連接酶補(bǔ)平缺口[3]。
2.3復(fù)制蛋白 A和堿基切除修復(fù)RPA在堿基切除途徑中的作用尚不明確,已經(jīng)證實(shí)的是RPA在堿基切除修復(fù)途徑中與細(xì)胞核內(nèi)尿嘧啶DNA糖苷酶(UNG2) 和 DNA修復(fù)酶hMYH相互作用,從而定位受損的DNA位置。在堿基切除修復(fù)的最后階段,RPA起到激活DNA連接酶Ⅰ的作用[4]。
2.4復(fù)制蛋白A和DNA錯(cuò)配修復(fù)Lin YL等[5]研究顯示,RPA1結(jié)構(gòu)上的點(diǎn)突變形成的突變型RPA并不支持MMR,但卻支持NER,此研究表明RPA有多種途徑與相關(guān)蛋白相互作用從而對(duì)DNA修復(fù)產(chǎn)生影響。在MMR中,RPA可以結(jié)合ssDNA防止核酸酶的降解。當(dāng)堿基錯(cuò)配發(fā)生時(shí),RPA還可以激活Exo1途徑進(jìn)行DNA修復(fù),當(dāng)修復(fù)完成后,RPA隨即終止此途徑[6]。Guo等[7]證實(shí),在MMR途徑中RPA與ssDNA結(jié)合后,磷酸化后的RPA2與RPA1的 DBD F結(jié)構(gòu)域結(jié)合,從而降低與ssDNA結(jié)合能力。
2.5復(fù)制蛋白 A與DNA雙鏈斷裂修復(fù)當(dāng)DNA雙鏈斷裂時(shí),首先是 MRN 復(fù)合物(Mrell-Rad50-Nbsll)切割雙鏈斷裂的 DNA (DNA double-strand breaks, DSBs)末端產(chǎn)生 3′ 突出。RPA與ssDNA形成的復(fù)合物會(huì)聚集在斷裂部位的3′端,保護(hù)DNA阻止二級(jí)結(jié)構(gòu)形成,隨后RPA通過(guò)與Rad52蛋白相互作用形成RPA-Rad52復(fù)合物,RPA-Rad52復(fù)合物提高了結(jié)合ssDNA的能力。此復(fù)合物在Rad52上形成含有Arg-Gln-Lys序列的結(jié)構(gòu)域,隨后Rad52與RPA2的C端相互作用,在Rad52上形成酸性結(jié)構(gòu)域,此酸性結(jié)構(gòu)域?qū)NA修復(fù)至關(guān)重要,并且Rad52上的酸性結(jié)構(gòu)域可以調(diào)節(jié)此復(fù)合物與ssDNA的結(jié)合能力[8]。在Rad52的調(diào)控下RPA從ssDNA上脫離,然后Rad51結(jié)合在ssDNA的3′端,促進(jìn)同源 DNA間進(jìn)行鏈交換,修復(fù)可能的缺失并連接DNA 鏈的斷裂,隨后RPA磷酸化。磷酸化的RPA更頻繁的與Rad51 和Rad52相互作用,結(jié)果是降低與RPA與ssDNA的結(jié)合能力。
3肝癌與 DNA 損傷
人體細(xì)胞經(jīng)常受到多種體內(nèi)外因子的影響,這些因素中會(huì)造成各種各樣的 DNA損傷,如果損傷被正確修復(fù),細(xì)胞存活,如果修復(fù)過(guò)程中出現(xiàn)缺失插入等不正確的修復(fù),這些異常堿基的累積就可能導(dǎo)致癌癥的發(fā)生。目前肝癌的發(fā)生機(jī)制尚未完全闡明,但其發(fā)生與DNA的損傷積累密切相關(guān)。誘發(fā)肝癌的主要危險(xiǎn)因素包括乙丙型肝炎病毒,黃曲霉毒素B1(Aflatoxin B1,AFB1),亞硝胺,氧化應(yīng)激等,這些誘因不僅能夠引起肝細(xì)胞DNA的損傷,而且能直接或間接影響損傷修復(fù)系統(tǒng),使DNA修復(fù)障礙,從而導(dǎo)致肝癌的發(fā)生。其中HBV表達(dá)的HBx是一個(gè)多功能蛋白,它具有調(diào)控細(xì)胞凋亡,基因穩(wěn)定性等作用,它是 HCC 發(fā)生的一個(gè)重要影響因子。它能與TFIIH結(jié)合,抑制DNA修復(fù)并且引起DNA損傷以及損傷積累,最終導(dǎo)致肝癌的發(fā)生。氧化應(yīng)激則是導(dǎo)致體內(nèi)高活性分子如活性氧自由基產(chǎn)生過(guò)多,氧化系統(tǒng)和抗氧化系統(tǒng)失衡,從而導(dǎo)致組織損傷。AFB1的作用機(jī)制主要是誘導(dǎo)AFB1-DNA結(jié)合物的形成并且引起DNA鏈斷裂,DNA堿基突變以及氧化損傷,進(jìn)而導(dǎo)致癌癥的發(fā)生[9]。因此,對(duì)于致癌因素的發(fā)生機(jī)制已經(jīng)有所了解,但是還未完全闡明,在以后的研究中還需著手于信號(hào)通路的研究,從其發(fā)生本質(zhì)上研究,為以后肝癌的治愈提供理論基礎(chǔ)。
4RPA的臨床研究
腫瘤患者體內(nèi)會(huì)出現(xiàn)識(shí)別腫瘤相關(guān)抗原的自身抗體。J.E.Tomkiel等[10]采用ELISA方法檢測(cè)乳腺癌患者及對(duì)照正常人血清中的RPA2的自身抗體,結(jié)果顯示801例乳腺癌患者中有87例表達(dá)顯著升高,39例原位癌患者中有4例RPA表達(dá)明顯升高,65例正常人中無(wú)1例RPA2表達(dá)異常。因此他們認(rèn)為RPA2在乳腺癌中是一種自身抗原,可以作為腫瘤診斷指標(biāo)。但RPA2的表達(dá)水平與患者的預(yù)后,腫瘤轉(zhuǎn)移臨床特征等沒(méi)有相關(guān)性。同時(shí)他們又用同樣的方法檢測(cè)了22例肺癌患者和35例頭頸部腫瘤患者的RPA2抗體表達(dá)情況,結(jié)果有1例肺癌患者及2例頭頸部腫瘤患者RPA2抗體表達(dá)異常升高。Nikolaos Givalos等[11]運(yùn)用免疫組化法檢測(cè)RPA1、RPA2在130例結(jié)腸癌中的表達(dá),結(jié)果顯示RPA1、RPA2在癌組織中高表達(dá),且與患者的臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及不良預(yù)后有關(guān)。他們推測(cè)RPA在臨床分期高的組織中表達(dá)越高的原因是RPA參與DNA的修復(fù),臨床分期越高的腫瘤組織中DNA損傷越多,故RPA反饋性的表達(dá)升高。RPA在結(jié)腸癌組織中的高表達(dá)可能不是RPA基因突變的結(jié)果,Popandaet等[12]發(fā)現(xiàn)RPA蛋白在結(jié)腸癌組織中的氨基酸序列沒(méi)有改變。Levidou G等[13]報(bào)道RPA1和RPA2在膀胱癌中同樣過(guò)度表達(dá)。有趣的是,隨著腫瘤的臨床分期的升高,RPA的表達(dá)越少。他們推測(cè)RPA在腫瘤形成的早期有著重要作用,隨著腫瘤的進(jìn)展RPA的作用逐漸減弱,這與先前RPA在其他腫瘤中的表達(dá)情況相反。國(guó)內(nèi)于大海等[14]檢測(cè)RPA1和RPA2在食管癌中的表達(dá)情況,RPA1和RPA2在食管癌組織中高表達(dá),與臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、組織分級(jí)等病理特征具有相關(guān)性,得出RPA有望成為預(yù)測(cè)食管癌患者預(yù)后的指標(biāo)。這些有關(guān)RPA的臨床研究表明,RPA有可能成為預(yù)測(cè)腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要指標(biāo)。
參考文獻(xiàn):
[1]Nuss JE, Patrick SM, Oakley GG, et al. DNA damage induced hyperphosphorylation of replication protein A. 1. Identification of novel sites of phosphorylation in response to DNA damage[J]. Biochemistry, 2005, 44(23):8428-8437.
[2]Patrick SM, Turchi JJ. Xeroderma pigmentosum complementation group A protein (XPA) modulates RPA-DNA interactions via enhanced complex stability and inhibition of strand separation activity[J]. J Biol Chem, 2002, 277(18):16096-16101.
[3]Overmeer RM, Moser J, Volker M, et al. Replication protein A safeguards genome integrity by controlling NER incision events[J]. J Cell Biol, 2011, 192(3):401-415.
[4]Ranalli TA, DeMott MS, Bambara RA. Mechanism underlying replication protein a stimulation of DNA ligase I[J]. J Biol Chem, 2002, 277(3):1719-1727.
[5]Lin YL, Shivji MK, Chen C, et al. The evolutionarily conserved zinc finger motif in the largest subunit of human replication protein A is required for DNA replication and mismatch repair but not for nucleotide excision repair[J]. J Biol Chem, 1998, 273(3):1453-1461.
[6]Genschel J, Modrich P. Functions of MutLalpha, replication protein A (RPA), and HMGB1 in 5'-directed mismatch repair[J]. J Biol Chem, 2009, 284(32):21536-21544.
[7]Guo S, Zhang Y, Yuan F, et al. Regulation of replication protein A functions in DNA mismatch repair by phosphorylation[J]. J Biol Chem, 2006, 281(31):21607-21616.
[8]Jiang G, Zou Y, Wu X. Replication-mediated disassociation of replication protein A-XPA complex upon DNA damage: implications for RPA handing off[J]. Cell Biol Int, 2012, 36(8):713-720.
[9]Long XD, Ma Y, Zhou YF, et al. XPD codon 312 and 751 polymorphisms, and AFB1 exposure, and hepatocellular carcinoma risk[J]. BMC Cancer, 2009, 9:400.
[10]Tomkiel JE, Alansari H, Tang N, et al. Autoimmunity to the M(r) 32,000 subunit of replication protein A in breast cancer[J]. Clin Cancer Res, 2002, 8(3):752-758.
[11]Givalos N, Gakiopoulou H, Skliri M, et al. Replication protein A is an independent prognostic indicator with potential therapeutic implications in colon cancer[J]. Mod Pathol, 2007, 20(2):159-166.
[12]Shen L, Kondo Y, Rosner GL, et al. MGMT promoter methylation and field defect in sporadic colorectal cancer[J]. J Natl Cancer Inst, 2005, 97(18):1330-1338.
[13]Levidou G, Gakiopoulou H, Kavantzas N, et al. Prognostic significance of replication protein A (RPA) expression levels in bladder urothelial carcinoma[J]. BJU Int, 2011, 108(2 Pt 2):E59-65.
[14]Dahai Y, Sanyuan S, Hong L, et al. A relationship between replication protein A and occurrence and prognosis of esophageal carcinoma[J]. Cell Biochem Biophys, 2013, 67(1):175-180.
編輯/哈濤