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    地衣芽孢桿菌高產2,3-丁二醇菌株的選育和發(fā)酵研究

    2014-04-09 08:37:43郭文逸孫慶惠宋麗娜高松松楊洪江
    生物技術通報 2014年8期
    關鍵詞:丁二醇發(fā)酵液芽孢

    郭文逸 孫慶惠 宋麗娜 高松松 楊洪江

    (天津科技大學生物工程學院 工業(yè)微生物教育部重點實驗室 天津市工業(yè)微生物重點實驗室,天津 300457)

    地衣芽孢桿菌高產2,3-丁二醇菌株的選育和發(fā)酵研究

    郭文逸 孫慶惠 宋麗娜 高松松 楊洪江

    (天津科技大學生物工程學院 工業(yè)微生物教育部重點實驗室 天津市工業(yè)微生物重點實驗室,天津 300457)

    目前2,3-丁二醇生產菌株大部分為致病菌,對人類健康和環(huán)境具有一定威脅。從牛奶樣品中分離到1株產2,3-丁二醇的芽孢桿菌127-7,分析其16S rRNA基因序列,確定該菌株為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)。進一步對菌株127-7進行紫外誘變,篩選耐受高濃度葡萄糖和高產乙偶姻的菌株。搖瓶發(fā)酵結果顯示,突變株BL41的2,3-丁二醇產量較出發(fā)菌株127-7提高了41.1%。對發(fā)酵副產物分析發(fā)現(xiàn),不控制發(fā)酵液pH可以顯著降低乳酸產量,2,3-丁二醇產量在72 h達到81.4 g/L。進一步調整補糖策略,維持最低殘?zhí)菨舛葹?0 g/L,菌株BL41產2,3-丁二醇83.4 g/L,最高產率為1.9 g/L·h,發(fā)酵時間縮短至46 h。結果表明,地衣芽胞桿菌BL41可以作為候選菌株,用于工業(yè)規(guī)模2,3-丁二醇的生產。

    地衣芽孢桿菌 2,3-丁二醇 紫外誘變 耐受葡萄糖

    2,3-丁二醇是一 種重要的化工原料,廣泛用于食品、化妝品、藥物、塑料、衛(wèi)生保健和能源等領域[1]。2,3-丁二醇脫水形成的甲乙酮是有效的燃料添加劑,并且其自身具有極高的燃燒值(27 198 J/g),優(yōu)于甲醇(22 081 J/g)和乙醇(29 005 J/g),因此有望成為新能源的替代品[2,3],但其化學合成工藝繁瑣、污染嚴重,不符合綠色化工和低碳環(huán)保的要求。微生物法生產2,3-丁二醇是一種新型工業(yè)發(fā)展模式,對緩解我國目前的資源、能源及環(huán)境危機具有重要作用[4,5]。

    目前,常見的生產2,3-丁二醇的菌種為肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae),產酸克雷伯氏菌(Klebsiella oxytoca),產氣腸桿菌(Enterobacter aerogenes),粘質沙雷氏菌(Serratia marcescens),陰溝腸桿菌(Enterobacter cloacae),地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis),解淀粉芽孢桿菌(Bacillusamyloliquefaciens),多粘類芽孢桿菌(Bacillus polymyxa)等[3]。其中以產酸克雷伯氏菌的研究較多,然而其為致病菌,對環(huán)境安全構成一定威脅[5]。

    本研究首先分離產2,3-丁二醇的芽孢桿菌,然后進行紫外誘變,篩選到一株高產2,3-丁二醇的突變株,并進行發(fā)酵條件的優(yōu)化,旨在進一步提高微生物法生產2,3-丁二醇的水平,篩選到更適于工業(yè)化生產的菌株。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    LB培養(yǎng)基(g/L):酵母粉5,蛋白胨10,氯化鈉10,pH7.0。肌酸篩選培養(yǎng)基(g/L):底層包括葡萄糖 10,蛋白胨 10,玉米漿 5,硫酸錳 0.05,丙酮酸鈉 5,氯化鈉 5,瓊脂20;上層培養(yǎng)基在底層培養(yǎng)基的基礎上補加0.5%(W/V)的肌酸3 mL和7.5%(W/V)的甲萘酚3 mL,肌酸和甲萘酚在培養(yǎng)基滅菌后冷卻至50℃左右時加入,用于篩選產乙偶姻菌株。葡萄糖篩選培養(yǎng)基(g/L):酵母粉5,蛋白胨10,氯化鈉10,瓊脂1.5,葡萄糖分別為170、180、190、200、210、220、230、240和250,pH7.0,用于篩選耐高糖菌株。MR-VP培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨7,葡萄糖5,磷酸氫二鉀5,pH7.0,用于紫外誘變后,篩選高產乙偶姻菌株。種子培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖40,酵母粉10,硫酸銨1,K2HPO41,pH7.0。發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖100,酵母粉5,蛋白胨12,MnSO40.025,K2HPO43,硫酸鎂0.2,乙酸鈉5,pH7.0。除特殊說明,所有培養(yǎng)均在37℃條件下進行。

    1.2 方法

    1.2.1 產2,3-丁二醇芽孢桿菌的篩選 將牛奶樣品80℃保溫20 min,系列稀釋后涂布在LB平板上,分離芽孢桿菌。將分離的單菌落點接在肌酸篩選平板的下層培養(yǎng)基上,培養(yǎng)48 h后,倒入上層培養(yǎng)基,約30 min后觀察菌落顏色[6,7]。用接種針小心剝去上層培養(yǎng)基,挑選紅色較深的菌落[8],發(fā)酵培養(yǎng)72 h,利用氣相色譜法,分析上清液中2,3-丁二醇含量。

    1.2.2 分離菌株的分子鑒定 提取菌株基因組DNA[9],以此作為模板,利用通用引物27F和1492R,擴增分離菌株的16S rRNA 基因片段[10]。PCR產物經純化后進行序列測定,將所得DNA序列通過BLAST 檢索,在GenBank的已知序列中進行同源性分析,確定與分離菌株同源程度最高的序列。

    1.2.3 紫外誘變篩選高產2,3-丁二醇菌株 過夜培養(yǎng)分離菌株,菌液稀釋后分別涂布在葡萄糖濃度為0-250 g/L的LB平板上,各濃度3個平行,確定分離菌株葡萄糖耐受濃度。將分離菌株進行紫外誘變,誘變后菌液稀釋涂布于葡萄糖篩選平板上,黑布包裹培養(yǎng)24 h。選取直徑較大的菌株接種到MR-VP培養(yǎng)基中,分別取18 h和36 h的發(fā)酵液,通過肌酸比色法計算乙偶姻產量[11]。篩選乙偶姻產量高的菌株進行發(fā)酵培養(yǎng),利用氣相色譜法測定48 h和72 h發(fā)酵液中2,3-丁二醇產量,篩選2,3-丁二醇高產菌株。

    1.2.4 pH對2,3-丁二醇產量的影響 調節(jié)培養(yǎng)基酸堿度,分析發(fā)酵液pH與乳酸產量的關系。根據酸堿度,將培養(yǎng)基分為3組:第1組發(fā)酵液初始pH值為7.0,發(fā)酵過程中不控制pH值;第2組發(fā)酵液pH值維持在6.0;第3組發(fā)酵液pH值維持在7.0,發(fā)酵過程中每隔3 h,利用鹽酸或氫氧化鈉,調節(jié)發(fā)酵液的pH不變。試驗在搖瓶中進行,兩級種子培養(yǎng)后,轉接于30 mL發(fā)酵培養(yǎng)基,150 r/min培養(yǎng)30 h。

    根據上述試驗結果,在5 L發(fā)酵罐中進行分批補料發(fā)酵,裝液量為3 L,接種量為5%,通氣量為2 vvm。高攪拌轉速利于細胞的生長,然而2,3-丁二醇發(fā)酵是微好氧過程,不利于2,3-丁二醇的積累[12],因此采用兩步攪拌轉速法,前期為400 r/min,14 h后降低轉速,為200 r/min[13]。通過補加一定量的葡萄糖,使殘?zhí)菨舛染S持在15 g/L左右。

    1.2.5 殘?zhí)菨舛葘?,3-丁二醇發(fā)酵的影響 底物濃度對發(fā)酵過程具有顯著影響,提高發(fā)酵液中殘?zhí)撬?,維持葡萄糖濃度為20-30 g/L時,可能有利于生成2,3-丁二醇[14]。為了確認這一猜測,在5 L發(fā)酵罐上進行分批補料發(fā)酵,其它條件不變,殘?zhí)菨舛染S持在30 g/L,分析2,3-丁二醇發(fā)酵水平的變化。

    1.2.6 分析檢測方法 使用紫外分光光度計測定OD600。將發(fā)酵液過濾后稀釋100倍,采用生物傳感分析儀SBA-40C測定葡萄糖、乳酸濃度。采用Aglient 7890A氣相色譜儀檢測2,3-丁二醇濃度,其中柱子型號:HP-INNOWax1909IN-213,色譜條件:起始柱溫95℃保留2 min;然后以6℃/min升到150℃,保留0 min;最后100℃/min升到220℃,保留2 min;氮氣、氫氣和空氣流速分別是2、30和300 mL/min。進樣口和氫氣火焰檢測器的溫度是260℃。

    2 結果

    2.1 產2,3-丁二醇的菌株篩選及鑒定

    將LB平板上形成的菌落點接在肌酸平板上進行分析,12個菌落紅色較深。將其發(fā)酵48 h,測量2,3-BD產量。結果(表1)顯示,菌株127-7產2,3-丁二醇水平較高,為48.2 g/L。利用PCR方法擴增該菌株16S rRNA基因,測序后利用NCBI網站的BLAST軟件進行比對,發(fā)現(xiàn)菌株127-7與多株B. licheniformis菌株高度同源,達到99%-100%,因此確定菌株127-7為地衣芽胞桿菌。將16S rRNA序列上傳至GenBank,獲得序列號為KF935264。

    2.2 紫外誘變篩選高產2,3-丁二醇菌株

    出發(fā)菌株127-7在葡萄糖濃度為250 g/L的LB平板上無菌落長出,此濃度作為篩選葡萄糖耐受菌株的條件。繪制菌株127-7的紫外致死曲線,紫外誘變時間為30 s,致死率達到87.1%。采用該條件,對菌株127-7進行誘變,涂布在含有250 g/L葡萄糖的篩選平板上,共得到2 406株突變子。

    挑選菌落直徑較大(>1.5 mm)的突變子105株,進行肌酸比色試驗,分別取發(fā)酵18 h和36 h的發(fā)酵液進行測定,分析乙偶姻含量。選取10株乙偶姻含量高的菌株,進一步分析2,3-丁二醇的產量。48 h發(fā)酵結果(圖1)顯示,突變子BL41、BL18、BL16、BL37、BL35和BL21,它們2,3-丁二醇產量均高于出發(fā)菌株127-7,占所挑選菌株的60.0%。其中,BL41的2,3-丁二醇產量比出發(fā)菌株高41.1%,轉化率達到理論值的60.5%。

    2.3 pH對2,3-丁二醇產量的影響

    乳酸是2,3-丁二醇發(fā)酵過程中主要的副產物,為了分析培養(yǎng)基酸堿度與菌株BL41產乳酸水平的關系,進行了搖瓶試驗。結果(表2)顯示,將發(fā)酵過程pH始終控制在7.0 時,生成大量乳酸(21.0 g/L);pH始終在6.0時,乳酸產量則顯著減少,30 h后僅為0 g/L;培養(yǎng)基初始pH為7.0,發(fā)酵過程中不控制酸堿度,隨著發(fā)酵的進行,pH不斷下降,乳酸產量最終也為0 g/L。

    所以在分批補料發(fā)酵中,選擇發(fā)酵液初始pH值為7.0,發(fā)酵過程中不控制酸堿度這一條件。結果(圖2)顯示,72 h僅得到3 g/L的乳酸,2,3-丁二醇的產量則達到81.4 g/L。

    2.4 殘?zhí)菨舛葘?,3-丁二醇產量的影響

    葡萄糖濃度對2,3-丁二醇發(fā)酵具有一定的影響。圖2顯示,在葡萄糖濃度為30 g/L時2,3-丁二醇產率最高,為1.9 g/L·h,而隨著葡萄糖濃度降低,產率也隨之下降,推測發(fā)酵液中較低的葡萄糖濃度導致葡萄糖利用緩慢,產率下降,周期延長。為了驗證這一假設,我們在分批補料發(fā)酵中,將殘?zhí)菨舛染S持在30 g/L。結果(圖3)顯示,2,3-丁二醇產量在46 h時即達到最高,為83.4 g/L,產率在22 h后一直維持在1.9 g/L·h左右,發(fā)酵時間明顯縮短。發(fā)酵過程中,只有很低水平的乳酸產生。因此持續(xù)的高水平產率導致發(fā)酵時間變短。

    3 討論

    地衣芽孢桿菌是常見的2,3-丁二醇生產菌株,它被美國食品藥品監(jiān)督管理局(US Food and Drug Administration)認定為GRAS(generally recognized as safe)菌株,由于其不具有致病性,可以安全的用于大規(guī)模工業(yè)生產[13]。此外,地衣芽孢桿菌具有產生淀粉酶和木聚糖酶的能力,可以利用農業(yè)廢棄物為原料發(fā)酵生產2,3-丁二醇,不僅可以降低生產成本,而且不與人類爭奪資源[16]。但從目前報道來看,其生產能力普遍低于2,3-丁二醇生產優(yōu)勢菌克雷伯氏菌和粘質沙雷氏菌[17]。因此,努力提高芽孢桿菌生產2,3-丁二醇產量具有重要意義。

    近年來,對2,3-丁二醇發(fā)酵菌種的選育,主要圍繞著菌種的誘變篩選和基因工程的改造等[18]。本研究使用紫外誘變育種,是菌種選育研究中最常采用的方法,該方法操作簡便,并且安全[19]。有研究表明提高菌株的耐糖性不僅可以提高2,3-丁二醇產量,還可以縮短發(fā)酵時間[20]。所以紫外誘變后,首先進行耐高糖菌株的篩選。乙偶姻是2,3-丁二醇的前體物質,通過篩選乙偶姻高產菌株,進而得到2,3-丁二醇高產菌株,而采用肌酸比色法分離篩選高產乙偶姻的菌株,大大減少了篩選的工作量。由此獲得突變株BL41,通過搖瓶試驗,2,3-丁二醇產量較出發(fā)菌株127-7提高了41.1%。

    發(fā)酵過程中pH是代謝活動的綜合指標,是發(fā)酵過程中重要控制參數[21],在混和酸發(fā)酵過程中,pH對發(fā)酵產物組成的影響尤其顯著,直接影響碳源的代謝流向。堿性條件下,發(fā)酵有利于有機酸的形成,從而導致2,3-丁二醇合成量的減少。而酸性條件下,2,3-丁二醇的合成量較堿性條件下有明顯上升,有機酸量則明顯下降[22]。不同研究中,對培養(yǎng)基及發(fā)酵過程中的pH值采取了不同控制策略,可能會對2,3-丁二醇的產量產生影響[13,14]。而乳酸在pH為7.0-8.0是主要產物,在pH5.0-6.5時,2,3-丁二醇是主要的產物[1]。本研究中,控制pH為7.0時產生大量乳酸,而在pH為6.0和自然pH條件下,乳酸產量則顯著減少。在分批補料發(fā)酵條件下,發(fā)酵過程中不控制pH,副產物乳酸的產量很低,碳源更多地流向2,3-丁二醇途徑,產量達到81.4 g/L,顯著地提高了2,3-丁二醇的生產效率。

    采用不同的補料方式,對2,3-丁二醇的產量會產生不同的影響。針對菌株粘質沙雷氏菌H30的研究發(fā)現(xiàn),采用恒底物濃度發(fā)酵方式,高殘?zhí)菨舛龋?5-25 g/L)2,3-丁二醇的產量,高于低殘?zhí)菨舛龋? g/L)[23]。以肺炎克雷伯氏菌SDM為生產菌株,發(fā)現(xiàn)與脈沖補料、恒速補料和指數補料相比,將葡萄糖濃度控制在20-30 g/L的恒底物濃度補料策略最為有效[15]。而地衣芽孢桿菌10-1-A,能夠耐受高濃度葡萄糖,在殘?zhí)菨舛葹?0-70 g/L之間時,能夠維持2,3-丁二醇的較高產率[13]。本研究也發(fā)現(xiàn),在分批補料發(fā)酵中,將殘?zhí)菨舛染S持在30 g/L時,可以長時間維持2,3-丁二醇較高的產率,使發(fā)酵時間縮短了26 h,提高了生產效率。

    4 結論

    本研究從牛奶中分離到1株地衣芽孢桿菌,經紫外誘變后,突變子BL41合成2,3-丁二醇的能力顯著提高。進一步在5 L發(fā)酵罐中進行工藝優(yōu)化,發(fā)現(xiàn)不控制酸堿度,可以明顯減少乳酸的水平,碳源更多的流向2,3-丁二醇合成途徑。另外,提高殘?zhí)菨舛戎?0 g/L,2,3-丁二醇產量幾乎不變,但發(fā)酵時間縮短26 h。結果顯示,地衣芽胞桿菌BL41可以作為候選菌株,用于大規(guī)模生產2,3-丁二醇。

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    (責任編輯 馬鑫)

    Breeding and Fermentation Characterization of Mutants of Bacillus licheniformis for 2,3-Butanediol Production

    Guo Wenyi Sun Qinghui Song Lina Gao Songsong Yang Hongjiang
    (Key Laboratory of Industrial Microbiology,Ministry of Education,College of Biotechnology,Tianjin University of Science & Technology,Tianjin 300457)

    Currently, most isolated 2,3-butanediol producing strains are pathogens and they cause certain risks to public health and environments. In this work,Bacillussp. 127-7 was isolated for 2,3-butanediol(BD)production from raw milk samples. It was identified asBacillus licheniformisby analyzing its 16S rRNA gene sequence. By UV-mutagenesis, mutants that could endure high glucose concentrations and produce relatively high amounts of acetoin were isolated for further analysis. In shake-flask fermentations, 2,3-BD production was increased by 41.1% in mutant strain BL41 compared with the parent strain 127-7. Additionally, BL41 yielded much less amounts of lactate acid in the cultures without acidity control and 2,3-BD reached 81.4 g/L in the fed-batch fermentation. Moreover, the minimal residual glucose concentration was incre ased to 30 g/L in the culture, the fermentation time was significantly reduced to 46 h with 83.4 g/L 2,3-BD. The highest productivity is up to 1.9 g/L·h. The results showed thatB. licheniformisBL41 may be used as a candidate strain for industrial production of 2,3-butanediol.

    Bacillus licheniformis2,3-butanediol UV-mutagenesis Glucose tolerance

    2014-01-23

    郭文逸,女,碩士研究生,研究方向:工業(yè)微生物育種;E-mail: guowenyi000@163.com

    楊洪江,男,博士,教授,研究方向:工業(yè)微生物育種;E-mail: hongjiangyang@tust.edu.cn

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