賈博涵 周偉 趙羅迪 楊埔 茍敏
(四川大學(xué)建筑與環(huán)境學(xué)院,成都 610065)
一株產(chǎn)纖維素酶細(xì)菌的分離鑒定及酶學(xué)特性研究
賈博涵 周偉 趙羅迪 楊埔 茍敏
(四川大學(xué)建筑與環(huán)境學(xué)院,成都 610065)
從采集的含腐爛樹(shù)葉的土壤中,篩選到1株產(chǎn)纖維素酶能力較高的菌株JJ-3,經(jīng)16S rRNA基因序列分析,鑒定該菌株為產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌(Klebsiella oxytoca)。產(chǎn)酶條件及酶學(xué)特性研究表明:以濾紙為碳源、蛋白胨為氮源、初始pH為8.0的培養(yǎng)基中發(fā)酵3 d更利于纖維素酶的合成;菌株發(fā)酵液在中性和堿性條件下均有較高的濾紙酶活力,分別可達(dá)118.7 U/mL(pH7.0),167.8 U/mL(pH8.0)和120 U/mL(pH9.0);所產(chǎn)纖維素酶的最適酶反應(yīng)pH為7.0,最適酶反應(yīng)溫度為40℃,對(duì)溫度比較敏感,在pH7.0-8.0的范圍內(nèi)具有較好的穩(wěn)定性,能滿足中性和堿性纖維素酶的要求。
纖維素酶 產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌 產(chǎn)酶條件 酶學(xué)特性
利用秸稈等纖維素類生物質(zhì)生產(chǎn)清潔能源及化工原料,可有效地緩解環(huán)境污染與能源危機(jī)的雙重壓力[1]。利用微生物產(chǎn)生的纖維素酶來(lái)轉(zhuǎn)化纖維素成可發(fā)酵利用的還原糖,是纖維素資源化的有效途徑?,F(xiàn)有的纖維素酶大多來(lái)源于真菌和放線菌,這類菌繁殖周期長(zhǎng),且多產(chǎn)酸性纖維素酶[2]。
細(xì)菌產(chǎn)生的纖維素酶一般為中性或者堿性酶,因?yàn)槠鋵?duì)天然纖維素的水解能力較弱,因此對(duì)其重視不夠。近年來(lái),隨著中性和堿性纖維素酶在洗滌、造紙、紡織和廢水處理等行業(yè)的成功應(yīng)用,細(xì)菌纖維素酶已顯示出良好的經(jīng)濟(jì)價(jià)值[3]。然而,現(xiàn)有細(xì)菌纖維素酶的研究和應(yīng)用還處于起步階段,需求量較大,而且其水解活力較低,反應(yīng)成本高,難以實(shí)現(xiàn)工業(yè)化[4]。因此,篩選優(yōu)良的產(chǎn)纖維素酶的細(xì)菌資源對(duì)實(shí)現(xiàn)纖維素資源化具有重要意義。本研究從采集的含腐爛樹(shù)葉的土壤中篩選產(chǎn)纖維素酶能力高的菌株,旨在為獲得中性和堿性纖維素酶的菌株提供參考。
1.1 材料
1.1.1 試驗(yàn)材料 菌株分離自四川大學(xué)江安校區(qū)內(nèi)幾處腐爛樹(shù)葉下的表層土壤。
1.1.2 培養(yǎng)基 富集培養(yǎng)基:玉米秸稈1 g,濾紙1 g,報(bào)紙0.5 g,(NH4)2SO40.2 g,酵母粉0.05 g,NaCl 0.5 g,KH2PO40.4 g,CaCl2·6H2O 0.45 g,MgSO4· 7H2O 0.03 g,蒸餾水100 mL,pH調(diào)至8.0,滅菌。
初篩培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)0.2 g,(NH4)2SO40.2 g,酵母粉0.05 g,NaCl 0.5 g,KH2PO40.4 g,CaCl2·6H2O 0.45 g、MgSO4·7H2O 0.03 g,瓊脂2 g,蒸餾水100 mL,pH調(diào)至8.0,滅菌。
發(fā)酵產(chǎn)酶培養(yǎng)基:CMC-Na 0.2 g,(NH4)2SO40.2 g, 酵 母 粉0.05 g,NaCl 0.5 g,KH2PO40.4 g,CaCl2·6H2O 0.45 g、MgSO4·7H2O 0.03 g,Tween-80 0.02 g,蒸餾水100 mL,pH調(diào)至8.0,滅菌。
1.2 方法
1.2.1 纖維素酶產(chǎn)生菌的分離鑒定
1.2.1.1 纖維素酶產(chǎn)生菌的富集 配制0.9%(W/V)的NaCl溶液100 mL,將采集的土壤樣品混合均勻后懸浮于NaCl溶液中,并于30℃、150 r/min條件下振蕩2 h。取10 mL靜置后的上清液接種至100 mL富集培養(yǎng)基中培養(yǎng)3 d(30℃,150 r/min),再取10 mL培養(yǎng)液接種到新鮮培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng),重復(fù)多次富集。
1.2.1.2 纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選 用水解圈初篩,發(fā)酵復(fù)篩相結(jié)合的方法進(jìn)行纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選。將富集培養(yǎng)液涂布到初篩培養(yǎng)基平板上進(jìn)行菌種分離,并采用剛果紅染色法進(jìn)行初篩,挑選能夠產(chǎn)生較大透明圈的菌株。將初篩菌株接種到發(fā)酵產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,測(cè)定濾紙酶活性,取酶活最大的菌株(命名為JJ-3)進(jìn)一步研究。
1.2.1.3 菌株鑒定及16S rRNA基因序列分析 菌株JJ-3的種屬鑒定由上海生工完成,并將菌株的16S rRNA 基因序列提交到GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)。利用軟件Clustal X1.8進(jìn)行多序列比對(duì)后[5],采用軟件MEGA-3.1構(gòu)建菌株JJ-3的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),構(gòu)樹(shù)方法為鄰連法(Neighbor-Joining),bootstrap 檢測(cè)1 000 次[6]。
1.2.2 菌株JJ-3產(chǎn)酶條件的優(yōu)化
1.2.2.1 碳源對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 以1%(W/V)的 CMC-Na、濾紙、微晶纖維素、玉米秸稈和葡萄糖為唯一碳源的發(fā)酵產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,分別接種菌株JJ-3,發(fā)酵培養(yǎng)3 d,測(cè)定濾紙酶活性。
1.2.2.2 氮源對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 以1%(W/V)的濾紙為唯一碳源,在液體發(fā)酵培養(yǎng)基中分別加入0.25%(W/V)的不同氮源(硝酸鉀、酵母粉、蛋白胨、尿素和硫酸銨),接種菌株JJ-3發(fā)酵培養(yǎng)3 d,測(cè)定濾紙酶活性。
1.2.2.3 培養(yǎng)基pH對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 以濾紙和蛋白胨為唯一碳氮源,調(diào)節(jié)發(fā)酵培養(yǎng)基的初始pH為5.0-9.0,分別接種菌株JJ-3發(fā)酵培養(yǎng)3 d,測(cè)定濾紙酶活性。
1.2.2.4 發(fā)酵時(shí)間對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 以濾紙和蛋白胨為唯一碳氮源,調(diào)節(jié)發(fā)酵培養(yǎng)基的初始pH為8.0,接種菌株JJ-3分別發(fā)酵培養(yǎng)1-5 d,測(cè)定濾紙酶活性。
1.2.3 菌株JJ-3的濾紙酶酶學(xué)特性
1.2.3.1 溫度對(duì)酶活的影響及酶的熱穩(wěn)定性 將測(cè)定濾紙酶酶活的水浴反應(yīng)溫度分別設(shè)定為30℃-70℃,其它條件同1.2.4的方法測(cè)定酶活,以最高值為100%,獲得濾紙纖維素酶在不同pH條件下的相對(duì)酶活力。將粗酶液分別置于上述溫度中處理1 h后,測(cè)定剩余酶活力,以未處理的粗酶液作為對(duì)照,評(píng)價(jià)纖維素酶的熱穩(wěn)定性。
1.2.3.2 pH對(duì)酶活的影響及酶的pH穩(wěn)定性 利用磷酸緩沖液把濾紙酶酶活測(cè)定中底物溶液的pH 調(diào)節(jié)為4.0-9.0,其它條件同1.2.4的方法測(cè)定酶活,以最高值為100%,獲得濾紙纖維素酶在不同溫度下的相對(duì)酶活力。將粗酶液分別置于pH為4.0-9.0的磷酸緩沖溶液中處理1 h后,加入濾紙測(cè)定剩余酶活力,以未處理的粗酶液作為對(duì)照,評(píng)價(jià)纖維素酶的pH穩(wěn)定性。
1.2.4 纖維素酶活力的測(cè)定 菌株JJ-3以8%的接種量接種到發(fā)酵產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,于30℃、150 r/min培養(yǎng)3 d,取發(fā)酵液于4 000 r/min離心20 min,取上清(粗酶液)測(cè)定纖維素酶活性。通常采用濾紙纖維素酶(FPase)來(lái)衡量纖維素菌酶系的綜合降解能力[7]。以濾紙為底物,應(yīng)用二硝基水楊酸法在540 nm處測(cè)定吸光度值,每組做3個(gè)平行樣,計(jì)算
FPase活力[7]。在上述條件下,每分鐘由底物生成1 μmol還原糖所需酶量定義為一個(gè)酶活力單位,用U/mL表示。
2.1 纖維素酶產(chǎn)生菌的分離與鑒定
采用水解圈初篩,發(fā)酵復(fù)篩的方法從土壤中分離到6株產(chǎn)纖維素酶的菌株,其中菌株JJ-3合成纖維素酶的能力最高(平板培養(yǎng)3 d后,菌落直徑為0.6 cm,透明圈直徑1.3 cm,復(fù)篩時(shí)酶活為38.5 U/mL),作為后續(xù)研究的對(duì)象。
在固體培養(yǎng)基上,菌株JJ-3的菌落呈圓形,表面光滑,隆起,邊緣整齊,半透明,灰白色。經(jīng)鑒定,該菌株的16S rRNA基因序列與產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌(Klebsiella oxytoca)具有99%的序列相似性。將該序列登錄GenBank,獲得序列號(hào)為KJ801560,菌株JJ-3的系統(tǒng)發(fā)育位置見(jiàn)圖1。
圖1 菌株Klebsiella oxytoca JJ-3的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
2.2 菌株JJ-3發(fā)酵條件的優(yōu)化
2.2.1 碳源對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 在液體產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,分別以1%的 CMC-Na、濾紙、微晶纖維素、玉米秸稈和葡萄糖為唯一碳源,對(duì)菌株JJ-3進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng)。圖2-A顯示,上述底物存在時(shí),菌株JJ-3都具有纖維素酶活,以濾紙為唯一碳源時(shí)FPase活性最高(59.8 U/mL),其次為葡萄糖、玉米秸稈、微晶纖維素和CMC-Na。
2.2.2 氮源對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 考察了不同氮源(硝酸鉀、酵母粉、蛋白胨、尿素和硫酸銨)對(duì)菌株JJ-3產(chǎn)纖維素酶的影響。圖2-B顯示,以蛋白胨為氮源可獲得最大的FPase活性(182.8 U/mL),其次是酵母粉;以硝酸鉀和硫酸銨為氮源時(shí),F(xiàn)Pase活性分別只有以蛋白胨為氮源時(shí)的17%和24.8%;尿素存在時(shí)幾乎沒(méi)有FPase活性。
2.2.3 培養(yǎng)基pH對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 菌株JJ-3在不同pH值(5.0-9.0)的液體發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng),3 d后測(cè)定各自的纖維素酶活力。圖2-C表明,菌株JJ-3在pH值為5.0-9.0的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)時(shí),均具有一定的FPase酶活性,中性和弱堿性條件更有利于獲得高活性的FPase,pH值為8.0時(shí)纖維素酶活性最高(167.8 U/mL),其次是pH值為9.0時(shí)的120 U/mL和pH值為7.0時(shí)的118.7 U/mL。
2.2.4 發(fā)酵時(shí)間對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響 菌株JJ-3在以濾紙為碳源、蛋白胨為氮源、pH值為8.0的液體發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng)不同的天數(shù),確定最佳的發(fā)酵時(shí)間。圖2-D顯示,培養(yǎng)時(shí)間對(duì)FPase活性影響較大,發(fā)酵3 d和4 d時(shí)具有最大的FPase活性(約104 U/mL),繼續(xù)發(fā)酵則活性迅速降低,因此確定3 d是最佳的發(fā)酵時(shí)間。
2.3 菌株JJ-3的濾紙酶酶學(xué)特性
2.3.1 溫度對(duì)酶活的影響及酶的熱穩(wěn)定性 溫度對(duì)FPase酶反應(yīng)的影響(圖3)顯示,F(xiàn)Pase在30℃-50℃范圍內(nèi)具有一定活性,40℃為其最適酶反應(yīng)溫
度;溫度升高到50℃時(shí),剩余酶活僅為33.1%;溫度繼續(xù)升高,F(xiàn)Pase活性被完全抑制。粗酶液在不同溫度保溫1 h后FPase活性均有不同程度的下降,其熱穩(wěn)定性與溫度對(duì)酶反應(yīng)的影響具有相同的趨勢(shì)(圖3),表明菌株JJ-3的纖維素酶對(duì)溫度比較敏感。
圖2 菌株JJ-3的發(fā)酵條件優(yōu)化
圖3 溫度對(duì)酶活的影響及酶的熱穩(wěn)定性
2.3.2 pH對(duì)酶活的影響及酶的pH穩(wěn)定性 pH對(duì)FPase酶反應(yīng)的影響(圖4)顯示,F(xiàn)Pase在pH值為5.0-8.0的范圍內(nèi)具有一定活性,pH值為7.0時(shí)酶活性最高,當(dāng)pH為9.0時(shí)酶活性被完全抑制,表明菌株JJ-3的纖維素酶在中性環(huán)境能更好地降解纖維素。此外,菌株JJ-3的纖維素酶對(duì)酸有一定的耐受能力。用不同的pH緩沖液處理粗酶1 h后,在pH值為7.0-8.0的范圍內(nèi)仍有50%-53%的纖維素酶活,表現(xiàn)出較好的穩(wěn)定性,而當(dāng)pH>8.0時(shí)FPase活性完全喪失(圖4)。
從自然界篩選高效的纖維素酶生產(chǎn)菌是實(shí)現(xiàn)纖維素資源化的前提和基礎(chǔ)。剛果紅平板法是最常用的識(shí)別產(chǎn)纖維素酶菌株的方法,具有直觀、快捷的優(yōu)勢(shì)。一般認(rèn)為,纖維素酶活性與剛果紅染色的透明水解圈大小(或者水解圈與菌落的直徑比值Hc)呈正比,且水解圈出現(xiàn)越早,產(chǎn)酶越快。但也有研
究表明:不同菌株的最佳產(chǎn)酶條件存在差異,即使同一菌株在液體培養(yǎng)和固體培養(yǎng)時(shí)也表現(xiàn)出不同的生理特性,透明圈無(wú)法完全代表菌株的產(chǎn)酶能力[8]。因此,水解圈篩選后的液體發(fā)酵或?yàn)V紙條崩解等復(fù)篩驗(yàn)證過(guò)程必不可少[9]。采用水解圈初篩,發(fā)酵復(fù)篩的方法,本研究從校園土壤中獲得一株擁有較高纖維素酶活力的產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌。產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌屬于革蘭氏陰性菌,多數(shù)研究認(rèn)為該菌具有固氮能力[10],但對(duì)其降解纖維素的探討僅有零星報(bào)道。如蔡燕飛[11]從環(huán)境中分離出一株產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌株,對(duì)香蕉桿具有一定的降解效果。Wood等[12]發(fā)現(xiàn)產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌具有較好耐糖能力,因此利用其分解纖維素產(chǎn)生的葡萄糖來(lái)合成重要的化工原料2,3-丁二醇。因此,本研究獲得的菌株可為纖維素的利用提供有效的微生物資源。
圖4 pH對(duì)酶活的影響及酶的pH穩(wěn)定性
不同微生物生產(chǎn)纖維素酶的條件不同,因此優(yōu)化培養(yǎng)條件是提高纖維素酶產(chǎn)量的最直接有效途徑。據(jù)報(bào)道,大多數(shù)微生物來(lái)源的纖維素酶需要底物的誘導(dǎo)才能產(chǎn)生,而且容易利用碳源的存在(如葡萄糖等)會(huì)抑制纖維素酶的合成[13]。但菌株JJ-3以CMC-Na、濾紙、微晶纖維素、玉米秸稈和葡萄糖為唯一碳源時(shí),均檢測(cè)到一定的纖維素酶活性。而且以葡萄糖為碳源時(shí)具有較好的纖維素酶活性(49.1 U/mL),說(shuō)明葡萄糖對(duì)纖維素酶的合成并未表現(xiàn)出阻遏作用。這些結(jié)果推測(cè)菌株JJ-3的纖維素酶可能為組成型表達(dá),韓如旸等[14]報(bào)道菌株Clostridium sp. EVA1產(chǎn)生的纖維素酶也有類似結(jié)果。研究發(fā)現(xiàn)氮源對(duì)菌株JJ-3產(chǎn)酶能力的影響較大,蛋白胨是最佳的氮源,尿素幾乎完全抑制了纖維素酶的生成,說(shuō)明有機(jī)氮源比無(wú)機(jī)氮源更有利于纖維素酶的合成。也有研究發(fā)現(xiàn)纖維素降解菌Penicillium decumbens L-06的FPase活性在以蛋白胨為氮源時(shí)最高[15]。尿素為氮源會(huì)大大抑制Aspergillus sp. YN1中FPase的合成[16]。菌株JJ-3在不同pH值的發(fā)酵培養(yǎng)基中(5.0-9.0)均可合成纖維素酶,但中性和弱堿性條件獲得的FPase活性更高,基本具備作為中性和堿性纖維素酶的要求。酶學(xué)特性顯示菌株JJ-3合成的纖維素酶屬于中溫酶,在中性和弱堿性范圍內(nèi)表現(xiàn)出較好的穩(wěn)定性,但對(duì)溫度非常敏感。因此,后續(xù)研究可通過(guò)誘變或基因工程手段,來(lái)提高其對(duì)環(huán)境條件的耐受能力,以保證其在纖維素資源化中的應(yīng)用。
以秸稈、濾紙和報(bào)紙為原料,經(jīng)水解圈初篩和發(fā)酵復(fù)篩,從校園含腐爛樹(shù)葉的土壤中獲得一株生產(chǎn)纖維素酶的細(xì)菌菌株,鑒定其為產(chǎn)酸克雷伯氏桿菌(Klebsiella oxytoca),GenBank登錄號(hào)為KJ801560。產(chǎn)酶條件優(yōu)化結(jié)果顯示:菌株JJ-3的纖維素酶可能為組成型表達(dá),無(wú)需底物誘導(dǎo)就能產(chǎn)生;有機(jī)氮源和中性或堿性條件更利于纖維素酶的合成;且最優(yōu)產(chǎn)酶條件如下:碳源為濾紙,氮源為蛋白胨,培養(yǎng)基初始pH為8.0,發(fā)酵3 d。酶學(xué)特性結(jié)果顯示:FPase的最適酶反應(yīng)溫度為40℃,對(duì)溫度比較敏感;最適酶反應(yīng)pH為7.0,在pH值為7.0-8.0的范圍內(nèi)仍有50%-53%的纖維素酶活,表現(xiàn)出較好的穩(wěn)定性,基本滿足中性和堿性纖維素酶的要求。
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(責(zé)任編輯 馬鑫)
Isolation,Identification and Enzymatic Characterization of a Cellulase-Producing Bacteria
Jia Bohan Zhou Wei Zhao Luodi Yang Pu Gou Min
(College of Architecture and Environment,Sichuan University,Chengdu 610065)
A cellulase-producing bacteria strain JJ-3 with high activity was isolated from the soil containing rotted leaves, which was identified as Klebsiella oxytoca based on the 16S rRNA sequence analysis. The optimal enzyme-producing conditions of strain JJ-3 was investigated and was as follows:filter paper as carbon source, peptone as nitrogen source, pH8.0, three-day fermentation. And the fermentation culture had higher FPase activity under neutral and alkaline conditions, with 118.7 U/mL(pH7.0), 167.8 U/mL(pH8.0), 120 U/mL(pH9.0). The results of enzymatic characterization showed that the optimal pH and temperature for enzyme reaction was 7.0 and 40℃, respectively. FPase was sensitive to temperature, while it kept good stability during the pH7.0 to 8.0. This study suggested that the cellulase from strain JJ-3 meets the request of neutral and alkaline cellulase.
Cellulase Klebsiella oxytoca Enzyme-producing conditions Enzymatic characterization
2014-05-21
國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31200068)
賈博涵,男,研究方向:環(huán)境微生物工程;E-mail:jiabohanscu@163.com
茍敏,女,博士,碩士生導(dǎo)師,研究方向:有機(jī)廢棄物資源化;E-mail:gouminscu@163.com