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    心房顫動(dòng)的全基因組關(guān)聯(lián)研究進(jìn)展

    2014-03-08 04:03:55李延健綜述審校
    醫(yī)學(xué)綜述 2014年5期
    關(guān)鍵詞:心房房顫關(guān)聯(lián)

    李延健(綜述),佘 強(qiáng)(審校)

    (重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院心內(nèi)科,重慶 400010)

    心房顫動(dòng)(房顫)是臨床上十分常見的疾病,至今已報(bào)道了大量明確的致病危險(xiǎn)因素,包括高齡、男性、高血壓、糖尿病、心力衰竭、心肌梗死、心肌病[1-2],說明房顫是一個(gè)多因素疾病。基因背景在房顫的發(fā)病中起重要作用,早期的基于候選基因病例-對照的試驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn)了很多與房顫關(guān)聯(lián)的單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(single nucleotide polymorphisms,SNPs),但是這些試驗(yàn)參與人群數(shù)量較少且沒有進(jìn)一步的大規(guī)模的重復(fù)試驗(yàn),故說服力較差。近年來報(bào)道了許多應(yīng)用全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn)的房顫易患基因位點(diǎn),這些位點(diǎn)與房顫的關(guān)聯(lián)性也更加真實(shí)可信;這些易患位點(diǎn)也對認(rèn)識房顫的發(fā)病機(jī)制提供了很多有用的線索。

    1 房顫GWAS

    1.1易患區(qū)域4q25 2007年Gudbjartsson等[3]第一次應(yīng)用GWAS研究房顫。該研究從冰島人群中篩選出550例房顫(或心房撲動(dòng))患者和4476例對照者,用Illumina Hap300 BeadChip基因芯片測序,最終在4q25區(qū)域發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)與房顫強(qiáng)關(guān)聯(lián)的突變位點(diǎn),即rs2200733和rs2220464。二次重復(fù)試驗(yàn)在冰島人群(2251例房顫患者和13 238例對照者)以及兩個(gè)具有歐洲血統(tǒng)的人群(分別為來自瑞典的143例房顫患者和738例對照者以及美國的636例房顫患者和804例對照者)中進(jìn)行,亦證實(shí)了這種強(qiáng)關(guān)聯(lián)性。最后,他們將該位點(diǎn)在中國人群(333例房顫患者和2836例對照者)進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)也得到相同的結(jié)論。

    此后,K??b等[4]聯(lián)合來自歐洲和美國的4個(gè)隊(duì)列:Framingham Heart Study(FHS)、Rotterdam Study(RS)、Vanderbilt AF Registry、German Competence Network for Atrial Fibrillation(AFNet)共計(jì)3508例房顫患者和12 173例對照者進(jìn)行上述位點(diǎn)與房顫的病例-對照關(guān)聯(lián)試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)rs2200733在4個(gè)隊(duì)列人群中均與房顫存在強(qiáng)關(guān)聯(lián)性,但是rs10033464只是在FHS和AFNet隊(duì)列中證實(shí)與房顫關(guān)聯(lián)。有趣的是,無論是在Gudbjartsson等[3]還是K??b等[4]的研究中,與房顫最強(qiáng)關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)rs2200733似乎在年齡更小的患者中具有更強(qiáng)的效應(yīng)值[4]。Viviani Anselmi等[5]則在意大利人群(78例房顫或心房撲動(dòng)患者和348例對照者)中證實(shí)了rs2200733 T等位基因與房顫的強(qiáng)關(guān)聯(lián)性。Lee等[6]對中國臺(tái)灣人群篩選了200例房顫患者和158例對照者,應(yīng)用多重單堿基延伸的方法對5個(gè)SNPs,分別為rs2634043,rs2200733,rs13143308,rs2220427,rs10033464進(jìn)行基因分型,他們也證實(shí)了rs2200733與房顫的關(guān)聯(lián),但是否定了rs10033464與房顫的關(guān)聯(lián)??傊?,這些研究都一致顯示rs2200733與房顫的強(qiáng)關(guān)聯(lián)性,而rs10033464則在不同的人群中有不同的結(jié)果。2009年,Shi等[7]在中國漢族人群中應(yīng)用病例-對照的方法研究rs2200733與房顫的關(guān)聯(lián)性,也得出了陽性關(guān)聯(lián)結(jié)論,當(dāng)他們把房顫組進(jìn)一步分為孤立性房顫和其他類型房顫單獨(dú)分析時(shí)發(fā)現(xiàn),rs2200733與孤立性房顫的關(guān)聯(lián)較其他類型房顫更強(qiáng),這可能暗示遺傳對孤立性房顫較其他類型房顫作用更強(qiáng)。

    2010年Lubitz等[8]從美國馬薩諸塞州綜合醫(yī)院篩選了790例房顫患者和1177例對照者,在4q25區(qū)域選取了34個(gè)SNPs進(jìn)行基因分型并檢驗(yàn)它們與房顫的關(guān)聯(lián)。在這一區(qū)域他們鑒定出了兩個(gè)新的與房顫關(guān)聯(lián)的突變位點(diǎn),即rs17570669和rs3853445。隨后將這兩個(gè)新鑒定的位點(diǎn)放在來自German Competence Network for AF(AFNET),Atherosclerosis Risk in Communities Study(ARIC),Cleveland Clinic Lone AF Study(CCAF),Cardiovascular Health Study(CHS)和Rotterdam Study(RS)5個(gè)隊(duì)列共計(jì)5066例房顫患者和30 661例對照者中進(jìn)行房顫的關(guān)聯(lián)研究,結(jié)果均為陽性關(guān)聯(lián)。然而,他們研究中的受試者都是歐洲人群,這兩個(gè)SNPs與房顫的關(guān)聯(lián)能否在其他人種中得到證實(shí)仍不得而知。

    到目前為止還沒有一個(gè)已知基因是定位在包含了前面所述的突變位點(diǎn)的連鎖不平衡區(qū)域,位于上游毗鄰的連鎖不平衡區(qū)域的Pitx2是最靠近這些突變位點(diǎn)的一個(gè)基因[3]。研究證實(shí),Pitx2基因在自左心房肌延伸形成的肺靜脈肌袖的增殖分化過程中起著至關(guān)重要的作用,而來自肺靜脈的觸發(fā)活動(dòng)對于房顫的開始和維持起著決定性作用,提示Pitx2可能在房顫的發(fā)生中發(fā)揮著重要作用[9]。另外,有研究顯示Pitx2在心房肌表達(dá)不足會(huì)導(dǎo)致左心房和右心房的同等程度的擴(kuò)大[10],并且會(huì)導(dǎo)致骨形態(tài)發(fā)生蛋白10在左心房表達(dá)上調(diào)[11],而骨形態(tài)發(fā)生蛋白10的過度表達(dá)在調(diào)節(jié)生理性肥大方面有重要作用[12]。因此,這就支持一種假說:骨形態(tài)發(fā)生蛋白10在心房肌組織選擇性的上調(diào)是由Pitx2介導(dǎo)的,并進(jìn)一步導(dǎo)致了細(xì)胞增殖和心房腔擴(kuò)大。而心房擴(kuò)大已經(jīng)被認(rèn)可是房顫發(fā)生和維持的重要機(jī)制。最近,有報(bào)道稱Pitx2c在持續(xù)性房顫患者的心房組織表達(dá)降低[13]。但是,至今仍無直接證據(jù)顯示Pitx2c在人類心肌組織表達(dá)降低,是由于房顫相關(guān)聯(lián)的這些突變位點(diǎn)所致。

    1.2易患區(qū)域16q22 繼發(fā)現(xiàn)與房顫相關(guān)的突變區(qū)域4q25后,2009年Gudbjartsson等[14]再次在冰島人群中應(yīng)用GWAS發(fā)現(xiàn)了新的與房顫強(qiáng)相關(guān)的突變位點(diǎn),即位于16q22的rs7193343,但是在中國人群進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)時(shí)沒有達(dá)到應(yīng)有的統(tǒng)計(jì)效力。隨后Benjamin等[15]納入了來自Age,Gene/Environment Susceptibility Reykjavik Study (AGES),Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC),Cardiovascular Health Study(CHS),Framingham Heart Study(FHS)和Rotterdam Study(RS)5個(gè)隊(duì)列(共計(jì)896例持續(xù)房顫患者和15 768例對照以及2517例陣發(fā)房顫患者和21 337例對照者)進(jìn)行GWAS的Meta分析,發(fā)現(xiàn)位于16q22的rs2106261與房顫關(guān)聯(lián)。隨后他們將這一關(guān)聯(lián)在一個(gè)來自德國的隊(duì)列人群(145例房顫患者和4073例對照者)進(jìn)行了成功的重復(fù)驗(yàn)證。Li等[16]嘗試在中國人群重復(fù)這兩個(gè)突變位點(diǎn)與房顫的關(guān)聯(lián),他們選取了650例房顫患者和1447例對照者,研究證實(shí)了rs2106261與房顫的關(guān)聯(lián),但是rs7193343關(guān)聯(lián)沒有達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    16q22區(qū)域的突變位點(diǎn)處于ZFHX3基因內(nèi),而ZFHX3基因?qū)ι窠?jīng)細(xì)胞和骨骼肌細(xì)胞的分化及增殖發(fā)揮重要作用[14-15]。ZFHX3編碼的轉(zhuǎn)錄因子AT motif-binding factor 1(Atbf1)對Pituitary-specific positive transcription factor 1(POU1F1)早期的轉(zhuǎn)錄活性有重要影響[14-15]。而研究發(fā)現(xiàn)POU1F1可與Pitx2相互作用[15-16],Pitx2與房顫的關(guān)系在前文已經(jīng)述及,所以ZFHX3是否通過這一途徑導(dǎo)致房顫易患,需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。

    1.3易患區(qū)域1q21 孤立性房顫患者在沒有非遺傳患病風(fēng)險(xiǎn)因素時(shí)仍然發(fā)生房顫,那么這些患者肯定具有與常人不同的相關(guān)遺傳背景?;谶@種觀點(diǎn)Ellinor等[17]納入了來自German Atrial Fibrillation Network(AFNET),Heart and Vascular Health Study(HVH),Atherosclerosis Risk in Communities Study(ARIC),Cleveland Clinic以及Massachusetts General Hospital Atrial Fibrillation study(MGH)的共計(jì)1335例早發(fā)孤立性房顫患者和12 844例對照者進(jìn)行GWAS的Meta分析研究,結(jié)果鑒定出了一個(gè)全新的位于1q21的房顫易患位點(diǎn),即rs13376333。隨后他們在來自德國(977例房顫患者和3042例對照者)和美國(187例房顫患者和565例對照者)的兩個(gè)人群中進(jìn)行該位點(diǎn)與孤立性房顫的關(guān)聯(lián)研究,結(jié)果證實(shí)為陽性關(guān)聯(lián)。而Li等[16]在中國人群的重復(fù)試驗(yàn)顯示,該位點(diǎn)與房顫的關(guān)聯(lián)未達(dá)到統(tǒng)計(jì)意義。

    與房顫關(guān)聯(lián)的1q21區(qū)域中發(fā)現(xiàn)的最強(qiáng)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)rs13376333定位在KCNN3的第一內(nèi)含子[17]。KCNN3編碼鈣依賴性鉀離子通道SKCa2.3,這些通道對于可興奮組織至關(guān)重要。據(jù)報(bào)道它們已經(jīng)在腦[18]和心臟表達(dá)[19-20]。KCNN家族在心臟的作用并不十分清楚。在兔短陣超速起搏實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)SKCa通道阻滯劑可通過縮短肺靜脈和心房動(dòng)作電位時(shí)程而抑制超速起搏刺激誘發(fā)異位肺靜脈局灶點(diǎn)沖動(dòng),使起源于肺靜脈的激動(dòng)易于傳向左心房肌而形成折返導(dǎo)致房顫發(fā)生和維持[21]。但是,在短陣超速起搏實(shí)驗(yàn)中并沒有檢測到KCNN3表達(dá)量的變化,而另一個(gè)鈣離子依賴性鉀離子通道家族成員KCNN2卻顯示出了表達(dá)量增加[21]。KCNN2和KCNN3在體內(nèi)可聚合為多亞基通道復(fù)合物[22],這種多亞基通道復(fù)合物意義重大,因?yàn)楫?dāng)KCNN2被異位的表達(dá)于小鼠時(shí),它會(huì)抑制KCNN3的表達(dá),起搏細(xì)胞的動(dòng)作電位時(shí)程和自主節(jié)律都會(huì)被改變[23]。但是,至今也沒有直接的證據(jù)顯示這一突變位點(diǎn)可以導(dǎo)致人類心臟組織KCNN3表達(dá)的減少。

    1.4其他易患區(qū)域 2012年,Ellinor等[24]聯(lián)合多個(gè)歐洲人群(6707例房顫患者和52 426例對照者)應(yīng)用GWAS的Meta分析的方法發(fā)現(xiàn)了6個(gè)新的易患位點(diǎn),并且在一個(gè)獨(dú)立的歐洲人群(5381例房顫患者和10 030例對照者)進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)證實(shí)了陽性關(guān)聯(lián)。這些易患位點(diǎn)分別是1q24的rs3903239、7q31的rs3807989、9q22的rs10821415、10q22的rs10824026、14q23的rs1152591、15q24的rs7164883,與之相應(yīng)的候選基因則分別是PRRX1,CAV1,C9orf3,SYNPO2L,SYNE2,HCN4。這些基因大多與心臟起搏、離子通道以及心肺發(fā)育相關(guān),并進(jìn)而與房顫的發(fā)生機(jī)制產(chǎn)生聯(lián)系[25-28]。但這些SNPs是否會(huì)影響到鄰近基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),尚需后續(xù)試驗(yàn)證實(shí)。此外,這些位點(diǎn)除歐洲人群外尚無更多人群的重復(fù)試驗(yàn),這也需要后續(xù)多人群的重復(fù)試驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證。

    2 房顫SNPs的臨床應(yīng)用

    GWAS發(fā)現(xiàn)的這些與房顫相關(guān)的突變位點(diǎn)為人們理解房顫的分子機(jī)制提供了新的線索,并且在某些應(yīng)用領(lǐng)域也顯示出巨大的潛能,如房顫患病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測、預(yù)后評估、對抗心律失常治療的反應(yīng)評估等[29]。

    腦卒中是房顫最重要的并發(fā)癥之一。Gretarsdottir等[30]運(yùn)用基因芯片Infinium Human Hap300 chip對來自冰島的1661例腦卒中患者和10 815例健康對照者進(jìn)行基因分型,研究發(fā)現(xiàn)rs2200733和rs10033464與缺血性腦卒中具有顯著相關(guān)性,具有心源性卒中最強(qiáng)的危險(xiǎn)度。隨后他們將這一結(jié)果在共計(jì)含2224例缺血性腦卒中患者和2583例健康對照者的兩個(gè)大型的歐洲缺血性腦卒中組試驗(yàn)中得以驗(yàn)證。然而,Lemmens等[31]進(jìn)行了一項(xiàng)大型的病例-對照關(guān)聯(lián)研究,研究選取了6組分別來自澳大利亞、奧地利、比利時(shí)、波蘭、西班牙和瑞典的隊(duì)列共計(jì)4299例缺血性腦卒中患者和3750例對照者,他們認(rèn)為rs2200733和rs10033464與腦卒中的關(guān)聯(lián)僅局限于心源性腦卒中患者。隨著基因測序技術(shù)的進(jìn)步及成本大幅度降低,今后病因不明的腦卒中患者是否應(yīng)接受基因測序檢查?這就取決于未來更大量人群以及不同種族人群的深入的關(guān)聯(lián)研究結(jié)果[31]。

    房顫是心臟手術(shù)后最常見的并發(fā)癥,據(jù)估計(jì)其發(fā)病率為27%~40%[32]。Body等[32]在兩個(gè)獨(dú)立的心臟手術(shù)組進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),位于4q25區(qū)域的rs2200733和rs13143308能夠預(yù)測冠狀動(dòng)脈旁路移植術(shù)后房顫的發(fā)生,但是rs10033464與術(shù)后房顫沒有明確的關(guān)聯(lián)。并且他們的研究顯示,冠狀動(dòng)脈旁路移植術(shù)后的房顫風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測可能因聯(lián)合多個(gè)基因位點(diǎn)而得以改善預(yù)測效能。最近,Virani等[33]在來自TexGen genetic registry的1166例高加索房顫患者中發(fā)現(xiàn),rs2200733和rs10033464位點(diǎn)都與冠狀動(dòng)脈旁路移植術(shù)后房顫相關(guān)(OR=1.41,1.47)。他們也發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)位點(diǎn)與長時(shí)程房顫相聯(lián)系,風(fēng)險(xiǎn)比分別為1.32和1.28?;谏鲜鰞身?xiàng)研究結(jié)果推斷,應(yīng)用4q25的兩個(gè)突變位點(diǎn)既能預(yù)測冠狀動(dòng)脈旁路移植術(shù)后短期房顫也能預(yù)測長時(shí)程房顫風(fēng)險(xiǎn)。據(jù)此,醫(yī)師可以調(diào)整術(shù)后治療,提前篩選出術(shù)后高發(fā)房顫風(fēng)險(xiǎn)的患者并加強(qiáng)監(jiān)護(hù)、早期識別并治療。Husser等[34]入選了195例因藥物抵抗的陣發(fā)性或持續(xù)性房顫而行射頻消融治療的患者,他們對這些患者進(jìn)行了為期6個(gè)月的隨訪,發(fā)現(xiàn)rs2200733和rs10033464位點(diǎn)的任何突變的等位基因都會(huì)增加房顫早期復(fù)發(fā)(OR=1.994)和晚期復(fù)發(fā)(OR=4.182)的風(fēng)險(xiǎn)。Benjamin Shoemaker等[35]也對來自Vanderbilt AF Registry的378例房顫射頻消融術(shù)患者進(jìn)行隨訪觀察,證實(shí)了rs2200733可以獨(dú)立的預(yù)測術(shù)后房顫的復(fù)發(fā)。他們的研究表明,利用這些突變位點(diǎn)可在房顫患者行射頻消融治療前對患者進(jìn)行分層。也可被用在手術(shù)前預(yù)測風(fēng)險(xiǎn)或成功率,并制訂手術(shù)策略以及相應(yīng)的術(shù)后管理。

    3 房顫丟失的遺傳度

    盡管來自房顫的GWAS結(jié)果鼓舞人心,但是有關(guān)房顫的很大一部分遺傳度仍未能被解釋。一種可能是房顫丟失的遺傳度存在于未知數(shù)量的尚未被鑒定的突變位點(diǎn)內(nèi);第二種可能是房顫丟失的遺傳度存在于罕見的突變位點(diǎn),而這些位點(diǎn)還沒有完全的被目前的GWAS覆蓋?,F(xiàn)在人們已經(jīng)注意到突變位點(diǎn)的頻率與效應(yīng)值呈負(fù)相關(guān);罕見的突變位點(diǎn)往往含有較大的效應(yīng)值,而常見的突變位點(diǎn)只有較溫和的效應(yīng)值[36]。為了找到更多的與房顫相關(guān)聯(lián)的遺傳位點(diǎn),最直接的方式就是增加受試者數(shù)量,如在研究QT間期的GWAS試驗(yàn)中,一個(gè)包含了200例患者的隊(duì)列只定位到NOS1AP基因附近的一個(gè)突變位點(diǎn)[37],而在兩個(gè)獨(dú)立的隨訪試驗(yàn)中(分別包括13 685和15 842例患者),有10個(gè)不同的易患位點(diǎn)被定位出來[38-39]。這些具有較小的效應(yīng)值的突變位點(diǎn)只有在更大的標(biāo)本數(shù)量時(shí)才能被檢測出來。雖然只有有限的效應(yīng)值,但這些基因突變位點(diǎn)也能夠提供有用的與房顫相關(guān)的分子機(jī)制線索。

    4 房顫GWAS的后續(xù)研究

    未來的研究工作會(huì)放在更大規(guī)模的GWAS以發(fā)現(xiàn)更多相關(guān)突變位點(diǎn)。此外,有研究顯示在同一區(qū)域聯(lián)合多個(gè)房顫易患位點(diǎn)較單個(gè)易患位點(diǎn)預(yù)測房顫的患病風(fēng)險(xiǎn)效應(yīng)值明顯增加[9]。所以,最后的結(jié)果可能是需要更多的而不是少數(shù)的突變位點(diǎn)來最終解釋房顫的遺傳度。未來繼續(xù)在4q25和其他與房顫相關(guān)的GWAS區(qū)域測序可能有助于發(fā)現(xiàn)更多的與房顫相關(guān)的突變位點(diǎn),并且還可能發(fā)現(xiàn)與功能改變相關(guān)的突變而不僅只是一些SNPs遺傳路標(biāo)。以后房顫的GWAS也需要更多種族人群的參與。到目前為止,所有房顫的GWAS都是在歐洲人群進(jìn)行的。非洲和亞洲人群是否也會(huì)得到相同的結(jié)果仍不得而知。聯(lián)合來自多種族人群的信息是一個(gè)有效發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)聯(lián)的SNPs方法。另外,在鑒定了與房顫相關(guān)的突變位點(diǎn)后,未來大量的研究則需要闡明后續(xù)的功能學(xué)機(jī)制。很快研究的焦點(diǎn)將會(huì)由統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)轉(zhuǎn)向立足于實(shí)驗(yàn)室的研究。這些研究包括整合并表達(dá)已經(jīng)鑒定的SNPs到細(xì)胞系,設(shè)置剔除已知基因的動(dòng)物模型,以及研究突變通道蛋白的電生理學(xué)方面的變化。結(jié)合新一代的基因分型和作圖技術(shù)以及功能學(xué)的研究最終會(huì)闡明與房顫相關(guān)的SNPs導(dǎo)致房顫易患的機(jī)制,以及這些SNPs能有效預(yù)測臨床預(yù)后和治療效果的真正原因。

    5 小 結(jié)

    應(yīng)用GWAS,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)4q25、16q22、1q21等多個(gè)染色體區(qū)域的多個(gè)SNPs與房顫的易患性相關(guān)。部分SNPs可對房顫發(fā)病、并發(fā)腦卒中、復(fù)律治療效果作出有效預(yù)測。另外,這些SNPs也為實(shí)驗(yàn)室研究進(jìn)一步揭示房顫發(fā)病的分子機(jī)制提供了有益線索。后續(xù)研究需要繼續(xù)采用大樣本并納入多種族人群以增加檢驗(yàn)的效力和說服力。

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