2013版SNOMED CT頂層概念調整及屬性關系

董燕等

【摘要】 SNOMED CT是結構化的臨床術語集。介紹2013年版的SNOMED CT新增頂層概念 “SNOMED CT模型組件”及其亞類“連接概念”。概念含義的邏輯表示通過“定義屬性”定義，所有可用作“關系類型”的概念都歸在“連接概念”下：“|is a|關系”和“概念模型屬性”中的59個“屬性關系”。并詳細說明“關系”如何完整定義概念，以期為構建中醫(yī)臨床術語系統(tǒng)的研究工作提供參考。

【關鍵詞】 SNOMED CT； 臨床術語； 連接概念； 屬性關系

SNOMED CT（Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms，醫(yī)學系統(tǒng)命名法-臨床術語）是結構化的臨床術語集，每個概念有基于含義的邏輯表示，并有唯一標示的代碼。概念的邏輯定義通過建立概念間的“關系”來實現(xiàn)?！瓣P系”包括了：“|IS-A|關系”與“屬性關系”。而這些“關系”歸于“連接概念（Linkage concept）”下。SNOMED CT的頂層概念根據研究發(fā)展而調整。了解分類結構變化以及“關系”和概念定義，可為構建中醫(yī)臨床術語系統(tǒng)的提供參考和借鑒。

1 SNOMED CT頂層概念的調整

2010年1月時，在技術預覽中提出了“元數(shù)據層級”[1]。2013年公布的SNOMED CT新增的頂層概念是“SNOMED CT模型組件”（SNOMED CT Model Component），調整后的頂層概念仍是19個[2]，見表1。之前頂層概念“連接概念”以及“特殊概念”的亞類“命名空間概念”被移到“SNOMED CT模型組件”下作為亞類，

新增的“SNOMED CT模型組件”也被稱為“頂層元數(shù)據（Top Level Metadata）”，其下又包含4個亞類：“核心元數(shù)據概念”（Core metadata concept）、“基礎元數(shù)據概念”（Foundation metadata concept）、“連接概念”（Linkage concept）、“命名空間概念”（Namespace concept）。

“核心元數(shù)據概念”的子類可提供支持國際發(fā)布數(shù)據的結構信息。支持信息包括枚舉值集，這些枚舉值用于概念、描述和關系屬性?！盎A元數(shù)據概念”的子類為包括參考集在內的派生結構提供支撐元數(shù)據和結構信息?！懊臻g概念”每個子類概念有一個整數(shù)術語，是一種分配擴展名稱空間標識符。“連接概念”用于連接兩個或兩個以上的概念來表達組合含義。所有能被用來作為“關系類型”的概念都收在“連接概念”中。

2 連接概念

“連接概念”將兩個概念連起來，形成一個可以表達明確意義的短句，也就是說多個概念通過“連接概念”相連即可形成一個概念表達充分的醫(yī)學語句。批準使用的即為“概念模型屬性”。

“連接概念”下有兩個亞類：“連接聲明”（Link assertion）和“屬性關系”（Attribute）?！斑B接聲明”下有7個子類；“屬性關系”下的4個子類，見表2。其中“概念歷史屬性”下含7個子類，“概念模型屬性”下共含65個子類，“事實角色”下含1個子類，“未批準屬性”下共含196個子類。

“連接聲明”亞類允許SNOMED CT概念用于HL7語句之間的關系維護。目前，該內容支持英國國家衛(wèi)生服務部（NHS）衛(wèi)生聯(lián)絡機構為在英國實施HL7版本3的關系編碼要求。

“屬性”亞類的概念用于SNOMED CT概念間的關系構建，也稱為概念間的“關系類型”。一些“屬性”（即“關系類型”）可用來邏輯地定義一個概念，這稱為“定義屬性”。定義屬性示例：（1）“| is a |關系”。（2）|概念模型屬性|（Concept model attribute）：|偏側性|（Laterality），|操作部位|（Procedure site），|發(fā)現(xiàn)部位|（Finding site），|相關形態(tài)學|（Associated morphology）。

“屬性”下還包括“非定義屬性”，非定義屬性示例：（1）|未批準屬性|（Unapproved attribute）：|因……緩解|（Relieved by），|評估|（Has assessment）。（2）|概念歷史屬性|（Concept history attribute） ：|被……替代|（REPLACED BY），|與……相同|（SAME AS）。“概念模型屬性”下共含65個子類，不屬于“定義屬性”有6個[3]：|一般認為|（Commonly considered）、|有生活環(huán)境|（Has life circumstance）、|有生理狀態(tài)|（Has physiologic state）、|包括子標本|（Includes sub-specimen）、|部分|（Part of）、|信息主題|（Subject of information）。

3 定義屬性

“定義屬性”（即“關系類型”）用來邏輯地定義一個“概念”。SNOMED CT目前使用60個“定義屬性”來構建概念定義模型：“|is a|關系”（也稱為“父-子關系”或“上下位關系”）和“概念模型屬性”中的59個“關系類型”。

每個“定義屬性”通常屬于一個層級，有少數(shù)屬于多個層級，一個屬性可以應用的層級被稱為屬性的“域”（domain）。也就是說，“域”是特定的“關系類型”可應用的層級，例如：“臨床發(fā)現(xiàn)”是|相關形態(tài)學|的“域”。每個屬性可以被賦予一組有限的值，這個值域集被稱為屬性的“值域（范圍）”（range）。例如，|相關形態(tài)學|的“值域（范圍）”是|形態(tài)異常結構（形態(tài)學異常）|及其子類；|發(fā)現(xiàn)部位|的“值域（范圍）”是|身體結構|層級結構下的|解剖或獲得身體結構（身體結構）|及其子類。

同一個“關系類型”可以用于不同的“域”?！案拍钅Ｐ蛯傩浴敝械?9個“關系類型”應用的“域”的情況：“臨床所見”16個，“操作”23個，“操作”6個，“具有明確語境”6個，“事件”5個，“標本”5個，“藥物/生物制品”2個，“身體結構”1個，“物理性物體”1個。其中，應用于“事件”概念類的5個“關系類型”同時也用于 “臨床所見”；“has active ingredient”同時用于“物理性物體”和“藥品/生物制品”。

圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織

4 關系與概念定義

SNOMED CT中每個概念都有邏輯定義，通過“關系”與其他概念連接?！皘is a|關系”和“定義屬性關系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征，通過與其他概念建立“關系”，在邏輯上代表一個概念。

除了“根概念”，每個活躍概念至少有一個“|is a|關系”與其父概念關聯(lián)。“|is a|關系”是SNOMED CT的層次結構的基礎，見圖2。一個概念可以有不止一個“|is a|關系”與其他概念相連。在同一頂層結構下，一個概念可有多個父概念，子類型關系可以多層級化，見圖3。

“屬性關系”是兩個“概念”之間的關聯(lián)關系，用于指定某個概念的“定義特征”（源關系）。每個“屬性關系”有名稱（關系類型）和值（目標關系）。

“|is a|關系”和“屬性關系”（即“關系類型”）組合通過表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關聯(lián)。邏輯概念定義包括一個或多個“上位類型”（由“|is a|關系”描述）和一組“定義屬性”，以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細菌性肺炎（疾病）|表示見圖4，每一行表示一個有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來說明部分關系。

5 小結

SNOMED CT（2013）的頂層概念19個，新增一個頂層概念“SNOMED CT模型組件”，“連接概念”為其亞類。“連接概念”用來連接兩個概念，形成對某一概念的表達。每個概念是邏輯定義，通過“關系”與其他概念連接：“|is a|關系”用于連接一個“概念”與同類型的更一般的概念；“屬性關系”（例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|）用于連接“概念”與其他子類型中的相關值。需要特別注意，對“連接概念”的使用是非標準的，是探索性和試驗性的。

SNOMED CT的體系構建的原則與工作方法，適用于“中醫(yī)臨床術語集”的構建[4]?！爸嗅t(yī)臨床術語集”經過幾年的建設，目前也面臨著結構調整的需要，研究SNOMED CT的結構調整和概念間“關系”，將為中醫(yī)臨床術語系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。

參考文獻

[1]董燕，崔蒙，賈李蓉.SNOMED CT層次結構與標識符[J].中國數(shù)字醫(yī)學，2012，7（2）：68-72.

[2] IHTSDO.SNOMED CT Technical Implementation Guide January 2013 International Release （US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[3] IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release（US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[4]郭玉峰，劉保延，姚乃禮，等.基于SNOMED CT核心構架研究的中醫(yī)臨床術語集標準化特征要素初探[J].中國中醫(yī)藥信息雜志，2008，15（9）：96-97.

（收稿日期：2013-12-24） （本文編輯：歐麗）

圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織

4 關系與概念定義

SNOMED CT中每個概念都有邏輯定義，通過“關系”與其他概念連接?！皘is a|關系”和“定義屬性關系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征，通過與其他概念建立“關系”，在邏輯上代表一個概念。

除了“根概念”，每個活躍概念至少有一個“|is a|關系”與其父概念關聯(lián)。“|is a|關系”是SNOMED CT的層次結構的基礎，見圖2。一個概念可以有不止一個“|is a|關系”與其他概念相連。在同一頂層結構下，一個概念可有多個父概念，子類型關系可以多層級化，見圖3。

“屬性關系”是兩個“概念”之間的關聯(lián)關系，用于指定某個概念的“定義特征”（源關系）。每個“屬性關系”有名稱（關系類型）和值（目標關系）。

“|is a|關系”和“屬性關系”（即“關系類型”）組合通過表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關聯(lián)。邏輯概念定義包括一個或多個“上位類型”（由“|is a|關系”描述）和一組“定義屬性”，以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細菌性肺炎（疾病）|表示見圖4，每一行表示一個有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來說明部分關系。

5 小結

SNOMED CT（2013）的頂層概念19個，新增一個頂層概念“SNOMED CT模型組件”，“連接概念”為其亞類。“連接概念”用來連接兩個概念，形成對某一概念的表達。每個概念是邏輯定義，通過“關系”與其他概念連接：“|is a|關系”用于連接一個“概念”與同類型的更一般的概念；“屬性關系”（例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|）用于連接“概念”與其他子類型中的相關值。需要特別注意，對“連接概念”的使用是非標準的，是探索性和試驗性的。

SNOMED CT的體系構建的原則與工作方法，適用于“中醫(yī)臨床術語集”的構建[4]?！爸嗅t(yī)臨床術語集”經過幾年的建設，目前也面臨著結構調整的需要，研究SNOMED CT的結構調整和概念間“關系”，將為中醫(yī)臨床術語系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。

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[3] IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release（US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[4]郭玉峰，劉保延，姚乃禮，等.基于SNOMED CT核心構架研究的中醫(yī)臨床術語集標準化特征要素初探[J].中國中醫(yī)藥信息雜志，2008，15（9）：96-97.

（收稿日期：2013-12-24） （本文編輯：歐麗）

圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織

4 關系與概念定義

SNOMED CT中每個概念都有邏輯定義，通過“關系”與其他概念連接?！皘is a|關系”和“定義屬性關系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征，通過與其他概念建立“關系”，在邏輯上代表一個概念。

除了“根概念”，每個活躍概念至少有一個“|is a|關系”與其父概念關聯(lián)。“|is a|關系”是SNOMED CT的層次結構的基礎，見圖2。一個概念可以有不止一個“|is a|關系”與其他概念相連。在同一頂層結構下，一個概念可有多個父概念，子類型關系可以多層級化，見圖3。

“屬性關系”是兩個“概念”之間的關聯(lián)關系，用于指定某個概念的“定義特征”（源關系）。每個“屬性關系”有名稱（關系類型）和值（目標關系）。

“|is a|關系”和“屬性關系”（即“關系類型”）組合通過表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關聯(lián)。邏輯概念定義包括一個或多個“上位類型”（由“|is a|關系”描述）和一組“定義屬性”，以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細菌性肺炎（疾?。﹟表示見圖4，每一行表示一個有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來說明部分關系。

5 小結

SNOMED CT（2013）的頂層概念19個，新增一個頂層概念“SNOMED CT模型組件”，“連接概念”為其亞類?！斑B接概念”用來連接兩個概念，形成對某一概念的表達。每個概念是邏輯定義，通過“關系”與其他概念連接：“|is a|關系”用于連接一個“概念”與同類型的更一般的概念；“屬性關系”（例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|）用于連接“概念”與其他子類型中的相關值。需要特別注意，對“連接概念”的使用是非標準的，是探索性和試驗性的。

SNOMED CT的體系構建的原則與工作方法，適用于“中醫(yī)臨床術語集”的構建[4]?！爸嗅t(yī)臨床術語集”經過幾年的建設，目前也面臨著結構調整的需要，研究SNOMED CT的結構調整和概念間“關系”，將為中醫(yī)臨床術語系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。

參考文獻

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[3] IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release（US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[4]郭玉峰，劉保延，姚乃禮，等.基于SNOMED CT核心構架研究的中醫(yī)臨床術語集標準化特征要素初探[J].中國中醫(yī)藥信息雜志，2008，15（9）：96-97.

（收稿日期：2013-12-24） （本文編輯：歐麗）