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    國際生命條形碼計(jì)劃緣何受阻

    2014-01-23 02:56:20
    種業(yè)導(dǎo)刊 2014年3期
    關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)系統(tǒng)條形碼測序

    2010年,為進(jìn)一步推動DNA條形碼技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用,國際生命條形碼計(jì)劃(iBOL)啟動,這是世界上迄今最大的生物多樣性研究計(jì)劃,計(jì)劃在5年內(nèi)完成50萬種真核生物500萬份標(biāo)本的DNA條形碼參考數(shù)據(jù)庫。然而,由于缺乏良好的數(shù)據(jù)共享機(jī)制和數(shù)據(jù)管理方面的不規(guī)范,iBOL實(shí)施遇阻。

    260萬份標(biāo)本已經(jīng)測定。作為快速鑒定生物物種的新興生物分類學(xué)手段,DNA條形碼技術(shù)對于全球生物多樣性保護(hù)具有重要作用。截至目前,iBOL已經(jīng)完成將近20萬個(gè)物種260萬份標(biāo)本DNA條形碼的測定。

    共享機(jī)制尚需完善。建立全球共享的生命條形碼標(biāo)準(zhǔn)文庫是iBOL計(jì)劃現(xiàn)階段最重要的目標(biāo)。“但是,截止到目前,仍有近一半數(shù)據(jù)未公開?!敝袊茖W(xué)院昆明植物研究所所長李德銖告訴記者。

    其原因之一在于,根據(jù)2011年第四屆生命條形碼大會的決定,各國提供給生命條形碼數(shù)據(jù)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)在兩年后才能公開,因?yàn)檠芯咳藛T希望在數(shù)據(jù)分析或文章發(fā)表以后再公開。封閉的數(shù)據(jù)系統(tǒng)會阻礙整個(gè)iBOL計(jì)劃目標(biāo)的完成,且不利于數(shù)據(jù)、信息所支持的國際交流,進(jìn)而損害建立封閉系統(tǒng)的成員利益。

    從國家層面整合數(shù)據(jù)。在國外,DNA條形碼數(shù)據(jù)庫的建立有著總體的方案和執(zhí)行方針。而我國則是通過科研項(xiàng)目的形式支持不同領(lǐng)域DNA條形碼研究人員或特定應(yīng)用部門。

    根據(jù)國際生命條形碼數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)DNA條形碼都要有完整的憑證標(biāo)本信息、采集信息和測序峰圖的原始文件。但我國不少研究組和研究人員不能嚴(yán)格按要求和標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行,數(shù)據(jù)質(zhì)量大打折扣。中科院昆明植物所研究員高連明說,這會對大規(guī)模DNA條形碼測序及高質(zhì)量數(shù)據(jù)產(chǎn)出和條形碼數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化造成限制。馬俊才認(rèn)為,我國的數(shù)據(jù)積累已經(jīng)到達(dá)一定階段,應(yīng)在國家層面上,做好數(shù)據(jù)的規(guī)范管理,整合資源以促進(jìn)數(shù)據(jù)的規(guī)?;a(chǎn)出和有效利用。 在眾位專家的眼中,在國內(nèi)實(shí)施一批集中以標(biāo)準(zhǔn)DNA條形碼數(shù)據(jù)產(chǎn)出為目標(biāo)的項(xiàng)目,迫在眉睫。

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