朱小慧 盛德喬 康樂 伍仙鳳 邵文 劉曉艷
(三峽大學醫(yī)學院,宜昌 443002)
DEAF1(Deformed epidermal autoregulatory factor-1)最早是從果蠅的核抽提物中純化得到的,也是果蠅早期胚胎發(fā)育所必須的一種序列特異的DNA 結(jié)合蛋白,能特異地與變形效應(yīng)元件結(jié)合。與其它的轉(zhuǎn)錄因子一樣,DEAF1 也有幾個非常重要的功能結(jié)構(gòu)域——氨基端的丙氨酸富含區(qū),SAND(Sp100、AIRE-1、NucP41/75 及DEAF-1)結(jié)構(gòu)域,螺旋-環(huán)-螺旋基元,MYND(myeloid、Nervy 及Deaf-1)結(jié)構(gòu)域,核定位序列(Nuclear-localization sequence,NLS)和出核序列(Nuclear-export sequence,NES)[1]。SAND 結(jié)構(gòu)域是一個DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域;MYND 結(jié)構(gòu)域則含有兩個非DNA 結(jié)合的鋅指結(jié)構(gòu),它被認為可介導(dǎo)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用[2]。
最近的研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄因子DEAF1 在小鼠胰淋巴結(jié)中調(diào)控著一系列外周組織抗原(peripheral tissue antigen,PTA)基因的表達,而且,DEAF1 的功能異常與NOD 小鼠1 型糖尿病的發(fā)生密切相關(guān)[3,4]。最新研究發(fā)現(xiàn),DEAF1 在淋巴結(jié)基質(zhì)細胞還可以通過調(diào)控真核翻譯起始因子Eif4g3 的表達而在翻譯水平上調(diào)控很多PTA 基因的表達[5]。PTA 基因在淋巴結(jié)中的異位表達并有效提呈是外周免疫耐受建立的重要機制之一[6],DEAF1 可能在這個過程中發(fā)揮了重要作用。
本研究擬利用多克隆抗體制備技術(shù)來制備小鼠DEAF1 的多克隆抗體,旨在為研究小鼠淋巴結(jié)中內(nèi)源性DEAF1 的表達及DEAF1 調(diào)控外周組織抗原表達的分子機制奠定基礎(chǔ)。
帶有小鼠DEAF1 cDNA 的原核表達質(zhì)粒pET-28a(+)-mDF1 和真核表達質(zhì)粒p3xflag-CMV-10-mDF1 由本課題組構(gòu)建;Monoclonal ANTI-FLAG M2購自Sigma 公司;His-Tag(2A8)Mouse mAb 購于上海Abmart 公司;羊抗鼠IgG(H+L)-HRP 購于北京中杉金橋生物技術(shù)公司;293T 細胞株和Caski 細胞株由三峽大學分子生物研究所保存;BalB/C 小鼠購于三峽大學實驗動物中心。
1.2.1 原核蛋白的表達與純化 將小鼠DEAF1 的原核表達質(zhì)粒pET-28a(+)-mDF1 轉(zhuǎn)化原核表達菌株E.coli BL21;挑取單克隆,37℃恒溫培養(yǎng)12-16 h;按1∶50 比例轉(zhuǎn)接上一步得到的菌懸液至50 mL LB(Kan+)培養(yǎng)液中;37℃,220 r/min 培養(yǎng)2-3 h(菌液OD=0.4-0.6)即對數(shù)期時,加入誘導(dǎo)劑IPTG(終濃度為1 mmol/L);37℃,220 r/min 培養(yǎng)10-12 h。
4℃,5 000 r/min 離心10 min 收菌;棄上清,10 mL 1×PBS 重懸沉淀;冰浴超聲(功率400 W,超聲2 s,間隔2 s,工作60 次,循環(huán)6 次);12 000 r/min,4℃離心20 min;上清制樣,沉淀用于尿素梯度裂解。
1 mol/L Urea 5 mL 重懸沉淀,冰置裂解30 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣,沉淀用2 mol/L Urea 5 mL 重懸,冰置裂解20 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣,沉淀用3 mol/L Urea 5 mL 重懸,冰置裂解30 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣,沉淀用4 mol/L Urea 5 mL 重懸,冰置裂解10 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣,沉淀用5 mol/L Urea 2 mL 重懸,冰置裂解5 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣后余下的-20℃保存,沉淀用6 mol/L Urea 1 mL 重懸,冰置裂解5 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣后余下的-20℃保存,沉淀用7 mol/L Urea 1 mL重懸,冰置裂解5 min;12 000 r/min,4℃離心10 min;上清制樣后余下的-20℃保存,沉淀用8 mol/L Urea 1 mL 重懸;冰置裂解2 h,裂解產(chǎn)物制樣后-20℃保存。
將尿素梯度裂解純度較高的蛋白進行透析,逐步去除尿素;用Millipore 公司提供的50 mL 超濾管濃縮;最后利用全波長酶標儀以BSA 建立的標準曲線做參照,測定蛋白的濃度;所得蛋白-40℃保存。純化的蛋白用SDS-PAGE 檢測和Western blot 鑒定。
1.2.2 動物免疫及多克隆抗血清的制備 以純化獲得的小鼠DEAF1 重組蛋白為抗原與完全弗氏佐劑等體積混合;冰浴超聲乳化后,皮下多點注射4-6 周齡的Balb/C 小鼠4 只,每只小鼠50 μg 抗原蛋白。4周后,進行第2 次免疫:等體積混合抗原溶液與不完全弗氏佐劑;冰浴超聲乳化后,皮下多點注射,每只小鼠25 μg 抗原蛋白。2 周后,進行第3 次免疫,操作與第2 次免疫相同。1 周后,免疫小鼠斷尾取血,通過間接ELISA 法檢測其血清的效價。之后,眼球取血效價達標的Balb/C 小鼠,以獲得多克隆抗血清。
1.2.3 鼠抗DEAF1 多克隆抗血清用于Western blot檢測真核細胞表達的DEAF1 蛋白 瞬時轉(zhuǎn)染小鼠DEAF1 的真核表達質(zhì)粒p3xflag-CMV-10-mDF1 至人腎上皮細胞系293T 中;48 h 后裂解細胞收取總蛋白制樣。SDS-PAGE 電泳后轉(zhuǎn)膜,5%牛奶室溫封閉2 h;分別加入鼠抗DEAF1 多克隆抗血清(5%牛奶進行1∶5 000 稀釋),β-Actin 鼠源單抗(利用5%牛奶進行1∶3 000 稀釋)和Flag-Tag 單抗(利用5%牛奶進行1∶2 000 稀釋),4℃孵育過夜;加入TBST洗滌3 次(10 min/次);加入羊抗鼠IgG-HRP(利用TBST 進行1∶5 000 稀釋),室溫孵育1 h;加入TBST 洗滌3 次(10 min/次);ECL 顯影。
1.2.4 鼠抗DEAF1 多克隆抗血清用于免疫熒光 瞬時轉(zhuǎn)染p3xflag-CMV-10-DF1 至人的宮頸癌細胞株Caski 中;24 h 后 重 新 鋪24 孔 板;5% CO2培 養(yǎng) 箱37℃恒溫培養(yǎng)至細胞處于最佳狀態(tài),用于后續(xù)試驗。
1×PBS 漂洗3 次(5 min/次);4%多聚甲醛(500 μL/孔)固定15 min;1×PBS 漂洗3 次(5 min/次);0.5% Triton X-100(500 μL/孔)處理20 min;1×PBS 漂洗3 次(5 min/次);10%的山羊血清(500 μL/孔)37℃封閉20 min;吸去封閉液,加入制備的鼠抗DEAF1 多克隆抗血清(1×PBS 進行1∶500 稀釋)4℃孵育過夜(以1×PBS 作為空白對照,未經(jīng)免疫的Balb/C 小鼠的血清作為陰性對照);1×PBS漂洗3 次(5 min/次)。37℃避光加入熒光標記的二抗羊抗鼠Rhodamine(200 μL/孔)(1×PBS 進行1∶150 稀釋)孵育30 min;1×PBS 漂洗3 次(5 min/次);熒光倒置顯微鏡觀察分析,拍片記錄結(jié)果。
1.2.5 DEAF1 多克隆抗血清用于免疫沉淀 瞬時轉(zhuǎn)染小鼠p3xFlag-CMV-10-mDF1 至人的宮頸癌細胞株Caski 中;轉(zhuǎn)染48 h 后,胰酶消化收集細胞;加入Western blot 裂解液冰浴裂解獲得總蛋白;分組后,加入一抗,4℃孵育過夜。
取80 μL protein A 瓊脂糖珠儲存液;離心后棄上清,加入Western blot 裂解液洗滌沉淀3 次;加入80 μL Western blot 裂解液重懸沉淀;將重懸后的protein A 瓊脂糖珠加到蛋白樣品中(20 μL/份),4℃孵育4 h;離心棄上清后,加入Western blot 洗滌沉淀4 次;離心棄上清,沉淀制樣;Western blot 檢測免疫沉淀的結(jié)果。
大量誘導(dǎo)重組蛋白DEAF1 在E.coli BL 21 中表達10 h(圖1);收菌后超聲破碎細胞;離心后的沉淀逐級裂解;各級裂解的產(chǎn)物制樣后經(jīng)SDS-PAGE電泳鑒定濃度和純度,結(jié)果(圖2)顯示,經(jīng)尿素梯度裂解,8 mol/L Urea 裂解的產(chǎn)物中,重組蛋白DEAF1 的相對含量最高。
上樣誘導(dǎo)前后以及尿素梯度裂解包涵體7 mol/L尿素裂解的產(chǎn)物,進行SDS-PAGE 電泳;轉(zhuǎn)膜后于5%牛奶中室溫封閉2 h;加入6×His 鼠源單抗(5%牛奶進行1∶5 000 稀釋)4℃孵育過夜;TBST 洗滌3次(10 min/次);加入羊抗鼠IgG-HRP(TBST 進行1∶3 000 稀釋)室溫孵育1 h;TBST 洗滌3 次(10 min/次);暗室內(nèi)ECL 顯影,結(jié)果(圖3)顯示,誘導(dǎo)純化獲得的蛋白為重組的DEAF1 蛋白。
以純化獲得的小鼠DEAF1 重組蛋白包被96 孔酶標板(100 μL/孔)通過ELISA 法測定小鼠血清的效價。結(jié)果(圖4)顯示,經(jīng)過3 次免疫,4 只小鼠血清的效價均達到了較高的水平,以2 號小鼠血清的效價為最高,故將其用于后面的試驗中。
核表達的DEAF1蛋白
依據(jù)1.2.2 所述的方法將所制備的DEAF1 多克隆抗血清用于Western blot 檢測293T 細胞中DEAF1的表達情況,結(jié)果(圖5)顯示,所制備的鼠抗DEAF1 多克隆抗血清可有效結(jié)合真核表達的DEAF1蛋白,具有較高的特異性。
圖5 Western blot 檢測制備的鼠抗DEAF1 多克隆抗血清對于真核表達的DEAF1 蛋白的特異性和敏感性
將所制備的DEAF1 多克隆抗血清用于分析DEAF1 在Caski 細胞中的定位,結(jié)果(圖6)顯示,DEAF1 蛋白主要定位于細胞核中,與文獻報道相一致,表明所制備的DEAF1 多克隆抗血清具備較高的敏感性。
圖6 制備鼠抗DEAF1 多克隆抗體用于免疫熒光法分析人宮頸癌細胞株Caski 中DEAF1 蛋白的表達(1∶500)(400×)
除了特異性和敏感性,親和力也是衡量抗體質(zhì)量的一個重要指標。為此,本研究將所制備鼠抗DEAF1 多克隆抗血清用于免疫沉淀試驗。結(jié)果(圖7)顯示,該鼠抗DEAF1 多克隆抗血清的親和力足夠沉淀Caski 細胞中所表達的DEAF1 蛋白。
圖7 制備鼠抗DEAF1 多克隆抗血清通過免疫沉淀試驗檢測 Caski,Caski/DEAF1 中的DEAF1 蛋白
最新研究發(fā)現(xiàn),DEAF1 不僅可以直接控制幾百種基因的轉(zhuǎn)錄,而且可以通過控制真核翻譯起始因子Eif4g3 的表達間接控制多種基因的翻譯,其功能異常與T1DM 的發(fā)生密切相關(guān)[3-5]。
已有的關(guān)于DEAF1 表達變化的研究只是轉(zhuǎn)錄水平,其蛋白水平的變化還不清楚。目前商品化的抗體特異性和敏感性都不是很好,故本研究擬制備合適的DEAF1 抗體,為研究小鼠胰淋巴結(jié)中內(nèi)源性DEAF1 的表達及DEAF1 調(diào)控外周組織抗原表達的分子機制打下基礎(chǔ)。
本研究將小鼠DEAF1 的原核表達質(zhì)粒pET-28a(+)-mDF1 轉(zhuǎn)化感受態(tài)E. coli BL21 后,經(jīng)IPTG 誘導(dǎo)可高效表達出DEAF1 重組蛋白;但重組DEAF1蛋白以包涵體形式存在,所以采用了尿素梯度裂解包涵體的方法來純化重組DEAF1 蛋白;以此重組蛋白為抗原與弗氏佐劑等體積混合后,皮下多點注射Balb/C 小鼠,最終成功制備出鼠抗DEAF1 的多克隆抗血清,經(jīng)Western blot、免疫熒光、免疫沉淀分析鑒定,該鼠抗DEAF1 的多克隆抗血清具有較高的特異性、敏感度和親和力,可為進一步開展DEAF1 的蛋白水平研究奠定基礎(chǔ)。
另外,本研究所采用的尿素梯度裂解包涵體純化蛋白的方法是在參照文獻[8]的基礎(chǔ)上,依據(jù)本試驗的條件,自行摸索出來的方法。與其他蛋白純化的方法相比[9-14],該方法不僅操作簡單耗時短而且經(jīng)濟實用,所用的藥品試劑方便易取,目的蛋白的回收率也比較高。
本研究應(yīng)用分子克隆和原核表達技術(shù)獲得了原核表達的DEAF1 蛋白,利用改良的尿素梯度裂解法從包涵體中純化得到了重組DEAF1 蛋白,以此重組蛋白免疫小鼠,制備鼠抗DEAF1 多克隆抗血清。ELISA、Western blot、免疫熒光、和免疫沉淀的結(jié)果表明,該多克隆抗血清具有良好的特異性、敏感性和親和力,可用于內(nèi)源性DEAF1 的表達及熒光定位分析。
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