Platform HPC應(yīng)用模板定制

摘 要：本文探討如何在Platform HPC界面下定制非集成的應(yīng)用程序模板，讓所有只關(guān)注計(jì)算的用戶能夠透明地利用您的集群，使其無需任何集群專業(yè)知識(shí)而順利完成計(jì)算任務(wù)，同時(shí)也為運(yùn)維Platform HPC的管理人員提供參考。

關(guān)鍵詞：Platform HPC；仿真分析；高性能計(jì)算集群；應(yīng)用程序模板；LSF BSUB ACTRAN

中圖分類號(hào)：TP393.01

名詞解釋 Platform HPC：即Platform 公司推出的高性能計(jì)算集群系統(tǒng)。模板：這里指HPC界面下為仿真分析應(yīng)用軟件提供的配置腳本，管理人員可以通過定制或修改腳本，滿足自己要求。LSF：Platform公司開發(fā)的作業(yè)調(diào)度軟件。BSUB：LSF下提交作業(yè)的執(zhí)行程序。ACTRAN：仿真分析軟件。

Platform HPC是一個(gè)高性能計(jì)算集群套件，它包好LSF作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)、PMC Web門戶界面，各行業(yè)的仿真分析用戶能夠通過WEB界面部署、管理集群和完成作業(yè)調(diào)度，使其專注于計(jì)算，而不是基礎(chǔ)架構(gòu)。Platform HPC界面包含主流仿真分析應(yīng)用的作業(yè)模板，簡化了應(yīng)用程序集成，并使您能夠透明地利用您的集群，提高應(yīng)用程序工作負(fù)載。但還有眾多的應(yīng)用軟件沒有被集成，只能使用命令行提交作業(yè)，無法利用Web界面的優(yōu)勢(shì)，阻礙用戶的普及率。下面就探討如何定制作業(yè)模板，把所有仿真分析應(yīng)用集成進(jìn)Web門戶，提高用戶的使用率。

1 Platform HPC作業(yè)提交模板

定制Platform HPC作業(yè)提交模板，有兩種方式：

（1）編寫自己的模板腳本，使其滿足新應(yīng)用程序要求。這種方式需要熟練掌握腳本語言和了解Platform HPC界面接口，適合商業(yè)應(yīng)用公司來開發(fā)、定制復(fù)雜應(yīng)用。

（2）簡單調(diào)整、定制現(xiàn)有應(yīng)用程序的模板，使其適用于其它應(yīng)用。這種方式適合有讀和簡單編寫腳本程序能力，大多數(shù)的HPC管理人員，這里就采用此方式來實(shí)現(xiàn)。

以編寫Actran軟件作業(yè)提交模板為例：選擇Platform HPC界面集成的Abaqus應(yīng)用程序模板，另存為Actran模板。圖形編輯新生成的模板，結(jié)果如下圖1：

圖1

定制ACTRAN模板提交腳本。部分內(nèi)容如下：

（1）應(yīng)用程序參數(shù)

#Actran軟件路徑及變量

PATH_OF_PRODUCTLINE=\"--apl=/FFT/Actran_13.0\"

#每個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)的核數(shù)

SPAN=\"span[ptile=12]\"

export SPAN

#作業(yè)名選項(xiàng)同Abaqus

#內(nèi)存選項(xiàng)

if [ \"x$MEMORY\" ！= \"x\" ] ； then

ACTRAN_OPTIONS=\"$ACTRAN_OPTIONS -m $MEMORY\"

fi

#并行選項(xiàng)，空為串行，為ACTRAN特有，也是整個(gè)腳本部分的難點(diǎn)

if [ \"x$PARALLEL\" ！= \"x\" ]； then

PARALLEL_OPT=\"--parallel=$PARALLEL\"

ACTRAN_CMD=\"actranpy_mp\"

else

PARALLEL_OPT=\"\"

ACTRAN_CMD=\"actranpy\"

Fi

#Actran額外選現(xiàn)同Abaqus

（2）集群參數(shù)

#提醒選現(xiàn)同Abaqus

#CPU選項(xiàng)

if [ \"x$NCPU\" ！= \"x\" ]； then

NCPU_OPT=\"-n $NCPU\"

else

NCPU_OPT=\"\"

fi

#隊(duì)列選項(xiàng)

if [ \"x$QUEUE\" ！= \"x\" ]； then

SUB_QUEUE_OPT=\"-q $QUEUE\"

else

SUB_QUEUE_OPT=\"\"

fi

#輸入文件及選項(xiàng)，簡單替換或修改Abaqus

if [ \"x$EDAT_INPUT_FILE\" = \"x\" ]； then

echo \"You must specify an input （.edat） data file to submit an ACTRAN job.\" 1>2

exit 1

else

EDAT_INPUT_FILE=`echo $EDAT_INPUT_FILE | tr -d ＼\"`

if [ \"x$ACTRAN_OPTIONS\" = \"x\" ]； then

ACTRAN_OPTIONS=\"-i ＼\"$EDAT_INPUT_FILE＼\"\"

else

ACTRAN_OPTIONS=\"$ACTRAN_OPTIONS -i ＼\"$INP_INPUT_FILE＼\"\"

fi

fi

#BSUB執(zhí)行命令參數(shù)組合，注意各參數(shù)的順序，可參考應(yīng)用文檔。

JOB_RESULT=`/bin/sh -c \"bsub -B -N ${NCPU_OPT} ${OUTPUT_FILE_LOCATION_OPT} ${CWD_DIR} ${JOB_NAME_OPT} ${SUB_QUEUE_OPT} ${RUNHOST_OPT} ${MEMARC_OPT} ${EXTRA_PARAMS} ${ACTRAN_CMD} ${PATH_OF_PRODUCTLINE} ${ACTRAN_OPTIONS} ${PARALLEL_OPT} ${OTHER_OPTS} 2>1\"`

#執(zhí)行

export JOB_RESULT OUTPUT_FILE_LOCATION

${GUI_CONFDIR}/application/job-result.sh

其它部分如：輸出文件和位置，運(yùn)行主機(jī)等選項(xiàng)基本同abaqus，只是替換ABAQUS字符為ACTRAN，因此這些部分的內(nèi)容略。

在Platform HPC界面里可以提交測(cè)試作業(yè)，看最后產(chǎn)生的JOB_RESULT變量輸出的結(jié)果是否同命令行相同，如不同可以根據(jù)實(shí)際情況增減相應(yīng)變量或選項(xiàng)。這樣一個(gè)全新的Actran作業(yè)提交模板就形成了。

2 總結(jié)

Platform HPC界面作業(yè)提交模板，實(shí)際上就是把BSUB命令與仿真分析應(yīng)用軟件的腳本圖形化。定制的過程比較簡單，但也需要花費(fèi)點(diǎn)兒時(shí)間，一個(gè)個(gè)參數(shù)測(cè)，直到最后滿足要求。定制后的模板，使用方便、簡單，計(jì)算用戶不再需要了解計(jì)算軟件各種環(huán)境變量和參數(shù)，只需在界面添相應(yīng)的內(nèi)容即可，達(dá)到了使其更好地專注于計(jì)算的目的。

參考文獻(xiàn)：

[1]Actran 13.0 User’s Guide.Actran官方電子文檔.

[2]Platform HPC Guides.Platform官方電子文檔.

作者單位：長客股份，長春 201311