徐瑞斯,張 斌
(吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院 內(nèi)鏡中心,吉林 長春130033)
結(jié)腸癌(colon cancer)是世界上最常見的惡性腫瘤之一,每年死亡病例居各種惡性腫瘤第三位[1]。目前為止,根治結(jié)腸癌最有效的方法還是手術(shù)切除聯(lián)合化療,對于局部腫瘤5年生存率達(dá)到93%[2]。microRNA(miRNA)是一種大小19-24個(gè)核苷酸的非編碼單鏈小RNA分子,能夠通過排序這些基因的3’段非編碼區(qū)調(diào)整下游目標(biāo)基因,參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡等多種重要細(xì)胞活動(dòng)的調(diào)控[2]。迄今為止,人們發(fā)現(xiàn)了1500多種miRNA序列[3]。越來越多的證據(jù)表明miRNA在腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展中起著非常重要的作用[4,5],很多miRNA在腫瘤中的表達(dá)是上調(diào)的或者是下調(diào)的[6,7]。
miRNA-31在惡性腫瘤的發(fā)生中起著非常重要的作用。有報(bào)道稱miRNA-31結(jié)腸癌表達(dá)是顯著上調(diào),而且其表達(dá)水平在結(jié)腸癌的各個(gè)階段是相互關(guān)聯(lián)的[8,9]。有報(bào)道稱 miRNA-31與結(jié)腸癌的侵襲和轉(zhuǎn)移有關(guān),抑制miRNA-31的表達(dá)可以影響結(jié)腸細(xì)胞的遷移和侵襲[10]。RhoBTB是Rho家族小分子鳥苷酸三磷酸酶(Rho GT Pases),是RhoBTB亞家族成員。最近報(bào)道指出在頭頸癌中,RhoBTB1也是一種抑癌蛋白[11]。
1.1 細(xì)胞培養(yǎng) 人結(jié)腸癌細(xì)胞株HT-29來自于美國標(biāo)準(zhǔn)生物品收藏中心(ATCC),為復(fù)旦大學(xué)李志剛老師惠贈。90%RPMI1640培養(yǎng)基,10%胎牛血清,加100U/ml青霉素和100U/ml鏈霉素,于37℃,5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
1.2 細(xì)胞轉(zhuǎn)染 對照RNA和miR-31mimics分別轉(zhuǎn)染HT-29細(xì)胞。將細(xì)胞在轉(zhuǎn)染之前24h接種到24孔板上(2.5-3×104/well)。取1μl轉(zhuǎn)染試劑 Lipofectamine 2000(Invitrogen)加入50μl(不含抗生素及血清)培養(yǎng)液中,同時(shí)將1.25μlmiR-31mimics儲存液加入50μl(不含抗生素及血清)培養(yǎng)液中。將兩者混勻后加400μl(不含抗生素及血清)培養(yǎng)液,加入培養(yǎng)液清洗后的培養(yǎng)細(xì)胞上。37℃培養(yǎng)5-6h,換液。37℃5%CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)48h之后,收集細(xì)胞進(jìn)行檢測。
1.3 預(yù)測靶基因 使用在線miRNA靶基因預(yù)測數(shù)據(jù)庫(http://www.targetscan.org),我們假定RhoBTB1是miR-31的靶蛋白。(如圖1A)
1.4 熒光素酶報(bào)告基因載體的構(gòu)建 采用PCR方法擴(kuò)增RhoBTB1基因的3’UTR序列,并構(gòu)建其突變型序列,擴(kuò)增出來的序列經(jīng)酶切后,連入pGL3載體螢火蟲熒光素酶序列的3’端,所有構(gòu)建好的質(zhì)粒均經(jīng)DNA測序檢驗(yàn)。
1.5 熒光素酶基因報(bào)告分析 將培養(yǎng)好的細(xì)胞于轉(zhuǎn)染之前24h接種到24孔板中,將熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒與miR-31mimics共同轉(zhuǎn)染細(xì)胞,48h之后進(jìn)行熒光素酶活性的測定。
1.6 RT-PCR 用TRIzol試劑(Invitrogen)從細(xì)胞和腫瘤組織中提取總RNA。我們用莖環(huán)RT-PCR方法進(jìn)行miR-31的檢測。RhoBTB1mRNA的檢測使用M-MLA反轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)(Promega)將RNA逆轉(zhuǎn)錄 成cDNA。qRT-PCR的使用SYBR Green qPCR Master Mix(Tiangen)在 ABI 7300(Applied Biosystems,F(xiàn)oster,CA)。GAPDH作為內(nèi)參。
1.7 western-blotting 按指示轉(zhuǎn)染后,細(xì)胞收集并在RIPA裂解緩沖液(150mM NaCl,10mM Tris,pH7.5,1%NP40,1%脫氧膽酸鹽,0.1%SDS,蛋白酶抑制劑混合物(sigma))裂解和使用Bradford protein assay(Bio-Rad,Hercules,CA)測定總蛋白。等量的蛋白樣品進(jìn)行10%SDS-PAGE電泳,并轉(zhuǎn)移到PVDF膜(Millipore,Billerica,USA),室溫下在5%脫脂牛奶封閉30min,然后室溫下在anti-RhoBTB1(1∶2000,Abcam)中孵育2h,隨后室溫下加山葵過氧化物酶連接二抗孵育1h,使用ECL(Millipore,MA,USA)觀察。β-actin(1∶5000,Abcam)作為內(nèi)參。
1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
采用SSPS12.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,應(yīng)用統(tǒng)計(jì)方法t檢驗(yàn),P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 RhoBTB1是 microRNA-31的靶蛋白
由于miRNA的調(diào)控目標(biāo)基因mRNA的翻譯和凋亡是通過和靶基因3'UTR的直接結(jié)合而相互作用,我們試圖尋找miR-31的靶基因,以進(jìn)一步揭示其結(jié)腸癌發(fā)生機(jī)制中的影響。通過使用miRNA靶基因預(yù)測的數(shù)據(jù)庫(http://www.targetscan.org),我們假定 RhoBTB1為 miR-31的靶基因(圖1A)。研究RhoBTB1是否為miR-31的直接靶基因,我們應(yīng)用了熒光素酶報(bào)告基因檢測。
首先,我們構(gòu)建了熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒包含RhoBTB1 3'UTR序列(WT-RhoBTB1)或刪除預(yù)測的 miR-31的靶基因位點(diǎn)(mut-RhoBTB1)。如顯示在圖1B后,共同轉(zhuǎn)染的wt-RhoBTB1質(zhì)粒,與對照miR轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,miR-31轉(zhuǎn)染的細(xì)胞的熒光素酶活性的顯著減少,而與mut-RhoBTB1質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染的細(xì)胞熒光素酶的活性沒有改變。兩者合計(jì),這些結(jié)果表明了miR-31針 對3'UTR直接調(diào)控RhoBTB1。
圖1 A 靶基因預(yù)測數(shù)據(jù)庫中miR-31靶基因的預(yù)測結(jié)果
圖1 B miR-31轉(zhuǎn)染HT-29細(xì)胞后,熒光素酶的檢測結(jié)果
2.2 miR-31的下調(diào)RhoBTB1在HT29細(xì)胞中的表達(dá)
RhoBTB是Rho家族小分子鳥苷酸三磷酸酶,由3名成員組成,有報(bào)道稱兩名成員RhoBTB1和RhoBTB2為抑癌基因。我們發(fā)現(xiàn)RhoBTB1為人結(jié)腸癌細(xì)胞系HT29中miR-31的靶蛋白,接下來我們研究miR-31對RhoBTB1表達(dá)的影響。與轉(zhuǎn)染對照RNA的 HT29細(xì)胞相比,轉(zhuǎn)染miR-31mimics HT29細(xì)胞的RhoBTB1mRNA表達(dá)水平顯著下調(diào)(圖2A),western-blotting結(jié)果顯示miR-31表達(dá)抑制之后RhoBTB1蛋白表達(dá)水平上調(diào)(圖2B)。在結(jié)腸癌組織中miR-31的上調(diào)抑制RhoBTB1的表達(dá)。
圖2 A miR-31mimics轉(zhuǎn)染HT-29細(xì)胞,RhoBTB1的mRNA表達(dá)水平比較
圖2 B miR-31mimics轉(zhuǎn)染HT-29細(xì)胞,RhoBTB1的蛋白表達(dá)水平比較
miRNA是內(nèi)源性表達(dá)的小非編碼RNA,它控制目標(biāo)信使RNA基因的表達(dá)。據(jù)估計(jì),在人類,基因編碼的miRNA的數(shù)量約3%,這可能調(diào)節(jié)30%蛋白質(zhì)的編碼基因[12,13]。確實(shí)的證據(jù)說明,miRNA人類癌組織中表達(dá)異常,在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮著重要作用[14,15]。
為了確定 miR-31的靶基因,我們使用TargetScan sorftware,分析結(jié)果表明,腫瘤抑癌基因RhoBTB1的可能是miR-31的靶基因。RhoBTB1屬于RhoBTB亞家族。RhoBTB蛋白是Rho家族小分子鳥苷酸三磷酸酶的非典型成員。Rho GTP酶作為分子開關(guān)調(diào)節(jié)肌動(dòng)蛋白,被認(rèn)為是細(xì)胞骨架重構(gòu)的主要調(diào)節(jié)分子,越來越多的證據(jù)表明,他們也參與調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡,也有報(bào)道稱Rho GTP酶參與腫瘤的發(fā)展[16-18]。
RhoBTB亞家族被證實(shí)是在2001年在真核細(xì)胞盤基網(wǎng)柄菌的基因編碼Rho-相關(guān)蛋白的研究中。和其他典型的RhoGTPases不同,RhoBTB蛋白質(zhì)不是調(diào)節(jié)肌動(dòng)蛋白系統(tǒng)?,F(xiàn)在,RhoBTB的家族兩名成員,RhoBTB2和RhoBTB1,被認(rèn)為是腫瘤抑制蛋白。RhoBTB1,位于10q21,在(HNSCC)的發(fā)展有一定的作用。
我們的研究表明,抑癌蛋白RhoBTB1是miR-31的靶蛋白。microRNA-31能夠下調(diào)RhoBTB1在HT29細(xì)胞中的表達(dá)量。miRNA-31在調(diào)控腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中起著重要的作用。對miRNA的深入研究無疑能增進(jìn)對大腸癌發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)歸等機(jī)制的認(rèn)識,促進(jìn)診斷和治療的快速發(fā)展。闡明大腸癌相關(guān)miRNA的作用機(jī)制將可能豐富大腸癌的病因?qū)W及分子病理學(xué)理論,為大腸癌診斷治療提供新策略和思路。如能根據(jù)此研究研制出抗腫瘤新藥,給社會及經(jīng)濟(jì)方面帶來深遠(yuǎn)的影響。
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