摘要:以EMS誘變獲得的高油玉米(Zea mays L.)突變體ce03005為材料,對(duì)植株的穗位高和株高進(jìn)行了遺傳分析。通過隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)設(shè)計(jì),分析玉米167個(gè)BC1S1家系的穗位高和株高的變化。利用101對(duì)共顯性引物構(gòu)圖,構(gòu)圖長(zhǎng)度為1 611.7 cM,標(biāo)記間平均距離為15.9 cM。用復(fù)合區(qū)間作圖法進(jìn)行數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)分析,共檢測(cè)到3個(gè)控制穗位高的主效QTL和1個(gè)微效QTL,分別位于1號(hào)和2號(hào)染色體上,單個(gè)控制穗位高QTL的貢獻(xiàn)率變幅為4.42%~15.42%;檢測(cè)到2個(gè)控制株高的主效QTL和1個(gè)微效QTL,分別位于1號(hào)和4號(hào)染色體上,單個(gè)控制株高QTL的貢獻(xiàn)率變幅為7.89%~12.53%。
關(guān)鍵詞:玉米(Zea mays L.);突變體;SSR;數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL);穗位高;株高
中圖分類號(hào):S513;S336 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2012)07-1312-03
Ear Height and Plant Height QTL Mapping of High Oil Maize Mutant
ZHAO Wei
(Maize Research Institute,Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150086,China)
Abstract: A high oil corn mutant ce03005 obtained by EMS pollen mutagenesis was used for identifying QTLs of ear height and plant height. The variation of ear height and plant height of a BC1S1 population with 167 individuals was measured by random block design. A genetic linkage map with a length of 1 611.7 cM was constructed using 101 SSR markers while the average distance between loci was 15.9 cM. According to composite interval mapping, 3 major and 1 micro-effect QTLs of ear height respectively locating at chromosome 1 and 2 was identified, with their individual contribution to ear height ranging from 4.42% to 15.42%. 2 major and 1 micro-effect QTLs of plant height respectively locating at chromosome 1 and 4 was detected, the contribution of individual loci was 7.89%~12.53%.
Key words: maize(Zea mays L.); mutant; SSR; quantitative trait loci(QTL); ear height; plant height
玉米(Zea mays L.)耐密品種的篩選與抗倒伏性是密不可分的,所以玉米的穗位高和株高遺傳機(jī)制的研究重新得到人們的高度重視。對(duì)穗位高和株高的遺傳研究及QTL定位已有很多報(bào)道[1-3]。本研究對(duì)穗位高和株高的QTL進(jìn)行分析,旨在從分子水平上分析穗位高和株高的遺傳基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
以普通玉米自交系B73(黃色子粒)為母本,中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)國(guó)家玉米改良中心通過EMS花粉誘變獲得的高油玉米材料ce03005(白色子粒)為父本,組配F1雜交種。以ce03005為輪回親本F1進(jìn)行回交得到BC1果穗,人工自交授粉得到BC1S1,并測(cè)定BC1S1家系植株的穗位高和株高。
1.2 田間試驗(yàn)
采取隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),兩次重復(fù),每個(gè)小區(qū)單行種植,行長(zhǎng)3.0 m,行寬0.5 m,每行10株,田間管理同大田。散粉后測(cè)量穗位高、株高,每行隨機(jī)測(cè)量中間10株。
1.3 基因型分析
親本、F1和各BC1群體的葉片貯存在-80 ℃冰箱中,用改良CTAB法抽提并純化總DNA。從MaizeGDB(http://www.maizeGDB.org)選取均勻覆蓋全基因組的500對(duì)引物,并根據(jù)MaizeGDB中公布的引物序列,由北京奧克生物工程公司合成引物。利用在雙親間具有多態(tài)性的101對(duì)共顯性標(biāo)記對(duì)BC1群體進(jìn)行標(biāo)記分析。采用Saghai-maroof等[4]提出的方法,在中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)國(guó)家玉米改良中心分子實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行SSR分析。
1.4 數(shù)據(jù)分析和QTL定位
利用Excel等軟件對(duì)BC1S1家系進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,考察了正態(tài)分布、偏度、峰度、χ2測(cè)驗(yàn)等。廣義遺傳力及其置信區(qū)間計(jì)算按照Knapp等[5]的方法,H=1-1/F,其中F為基因型均方同基因型與環(huán)境互作均方的比值。利用復(fù)合區(qū)間作圖(Composite Interval Mapping)法,QTL Cartographer V2.0,進(jìn)行QTL定位和效應(yīng)估計(jì)[6]。根據(jù)公式hB2=■,計(jì)算植株的穗位高和株高的廣義遺傳力。
2 結(jié)果與分析
2.1 高油玉米突變體植株的穗位高和株高的遺傳分析
為了進(jìn)行QTL定位,對(duì)植株的穗位高和株高在BC1S1家系中的表現(xiàn)及分布情況進(jìn)行峰度和偏度的計(jì)算,結(jié)果表明,植株的穗位高和株高在BC1S1家系中的峰度和偏度的絕對(duì)值均小于1,說明植株的穗位高和株高分布符合正態(tài)分布,由此可見,植株的穗位高和株高屬于典型的數(shù)量性狀。兩個(gè)親本B73和ce03005的植株的穗位高分別是77.3 cm和70.5cm,株高分別是196.8 cm和180.2 cm。BC1S1家系穗位高平均值為75.6 cm,變幅為47.0~97.0 cm;BC1S1家系株高平均值為206.2 cm,變幅為156.0~238.0 cm。167個(gè)BC1S1家系穗位高和株高方差分析的結(jié)果(表1)表明:家系間穗位高和株高達(dá)到極顯著差異,重復(fù)間差異不顯著。BC1S1家系穗位高的廣義遺傳力為76.0%,株高的廣義遺傳力為82.5%。
2.2 SSR圖譜構(gòu)建
從500對(duì)SSR引物中共篩選獲得擴(kuò)增效果好、條帶差異明顯的128對(duì)共顯性引物。根據(jù)128對(duì)共顯性引物擴(kuò)增信息,利用Mapmaker 3.0構(gòu)建連鎖圖譜,圖譜上共擬合101對(duì)共顯性引物,構(gòu)圖長(zhǎng)度為1 611.7 cM,標(biāo)記間平均距離為15.9 cM。
2.3 QTL定位分析
利用復(fù)合區(qū)間作圖軟件對(duì)BC1S1家系的植株穗位高和株高進(jìn)行了QTL分析,根據(jù)Churchill等[7]的方法,設(shè)定QTL的顯著性水平為0.05,模擬運(yùn)算1 000次,共檢測(cè)到3個(gè)控制穗位高的主效QTL和1個(gè)微效QTL,分別位于1號(hào)和2號(hào)染色體上(圖1),單個(gè)控制穗位高QTL的貢獻(xiàn)率變幅為4.42%~15.42%;檢測(cè)到2個(gè)控制株高的主效QTL和1個(gè)微效QTL,分別位于1號(hào)和4號(hào)染色體上,單個(gè)控制株高QTL的貢獻(xiàn)率變幅為7.89%~12.53%?;虻淖饔梅绞蕉紴榧有孕?yīng)(表2)。
3 討論
隨著QTL定位研究在各種作物中的廣泛開展,人們對(duì)QTL定位的可靠性越來越關(guān)注。根據(jù)已有的研究報(bào)道來看,盡管不同研究者所使用的試驗(yàn)材料和群體不同,但對(duì)同一性狀的研究結(jié)果還是有相符之處的,特別是一些效應(yīng)較大的QTL,確實(shí)能在不同的試驗(yàn)群體中被檢測(cè)出來,而且定出的位置也比較相近。這說明QTL定位具有一定的可靠性。
QTL定位不區(qū)分效應(yīng)值的大小,即使是效應(yīng)值很小的QTL也可以檢測(cè)到。本研究采用SSR標(biāo)記分析的方法在(B73×ce03005)后代BC群體中發(fā)現(xiàn)了4個(gè)控制穗位高的QTL和3個(gè)控制株高的QTL,控制穗位高的QTL有3個(gè)主效QTL和1個(gè)非主效QTL,分別位于1號(hào)和2號(hào)染色體上;控制株高的QTL有2個(gè)主效QTL和1個(gè)非主效QTL,分別位于1號(hào)和4號(hào)染色體上,本試驗(yàn)所檢測(cè)到的4個(gè)穗位高QTL和3個(gè)株高QTL與其他的研究結(jié)果相似[8-10],說明本研究所定位到的QTL具真實(shí)性,同時(shí)也說明所采用的檢測(cè)方法具可靠性。但是2號(hào)染色體上的1個(gè)穗位高QTL和4號(hào)染色體上的2個(gè)株高QTL未找到相近的定位結(jié)果,可能為待發(fā)掘的控制玉米穗位高和株高的新數(shù)量性狀基因位點(diǎn)。
參考文獻(xiàn):
[1] JIANG C,EDMEADES G O,ARMSTEAD I , et al. Genetic analysis of adaptation differences between highlandand lowland tropical maize using molecular markers[J]. Theor Appl Genet,1999, 99(7) :1106-1119.
[2] AUSTIN D F , LEE M, VELDBOOM L R. Genetic mapping in maize with hybrid progeny across testers and generations: plant height and flowering[J].Theor Appl Genet,2001,102(1):163-176.
[3] SARI-GORLA M, KRAJEWSKI M, DI FONZO N, et al. Genetic analysis of drought tolerance in maize by molecular markers: Ⅱ. Plant height and flowering[J]. Theor Appl Genet,1999, 99(1):289-295.
[4] SAGHAI-MAROOF M A, SOLIMAN K M, JORGENSEN R A, et al. DNA spacer length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance,chromosomal location, and population, and population dynamics[J]. Proc Natl Acad Sci USA,1984, 81(24):8041-8018.
[5] KNAPP S J, STROUP W W, ROSS W M. Exact confidence intervals for heritability on a progeny mean basis[J]. Crop Sci,1984,25(1):192-194.
[6] ZENG Z B. Precision mapping of quantitative trait loci[J]. Genetics,1994,136:1457-1468.
[7] CHURCHILL G A, DOERGE R W. Empirical threshold values for quantitative trait mapping[J]. Genetics,1994,138:963-971.
[8] 蘭進(jìn)好.玉米株高和穗位高遺傳基礎(chǔ)的QTL剖析[J].遺傳,2005.27(6):925-934.
[9] L?譈EBBERSTEDT T,MELCHINGER A E,SCHON C C,et al.QTL mapping in testcrosses of European flint lines of maize:I.Comparison of different testers for forage yield traits[J]. Crop Sci ,1997,37(3):921-931.
[10] BERKE T G,ROCHEFORD T R. Quantitative trait loci for flowering ,plant and ear height,and kernel traits in maize[J]. Crop Sci,1995,35 (6):1542-1549.